Mesures de forma, estereoquímica
i estructura electrònica de compostos
de metalls de transició
Jordi Cirera Fernández
Aquesta tesi doctoral
està subjecta a la llicència
Reconeixement 4.0. Espanya de Creative
Commons
.
Esta tesis doctoral está sujeta a la licencia
Reconocimiento 4.0.
España de Creative
Commons
.
.,
UNIVERSITATDE BARCELONA
•
Departament
de
Química
Inorgánica
MESURES
DE
FORMA,
ESTEREOQUÍMICA
I ESTRUCTURA
ELECTRÓNICA
DE
COMPOSTOS
DE
METALLS
DE
TRANSICIÓ
UNIVERSITAT DE BARCELONA
DEPARTAMENT DE
QUÍMICA
INORGÁNICA
Programa
de Doctorat deQuímica
Inorgánica
Bienni
2002-2004MESURES
DE
FORMA,
ESTEREOQUÍMICA
I
ESTRUCTURA
ELECTRÓNICA
DE
COMPOSTOS
DE
METALLS DE
TRANSICIÓ
Memoria
presentada
per
enJordi
Cirera Femández
SANTIAGO
ÁL
VAREZ REVERTER. Catedrátic delDepartament
deQuímica
Inorgánica
de la Universitat de Barcelona.ELISEO RUIZ
SABÍN.
Professortitular delDepartament
deQuímica
Inorgánica
de la Universitat de Barcelona.CERTIFIQUEN:
Que
el treball titulat "Mesures deforma, esteroquímica
iestructura electrónica de
compostos
de metalls de transició" quepresesnta
Jordi CireraFemández,
peraspirar
al grau de Doctor enQuímica,
ha estatrealitzat sota laseva direcció en el
Departament
deQuímica
Inorgánica
de la Universitat deBarcelona.
Barcelona,
Setembre2006Després
de tant detemps
treballant i de tantes hores dedicades al tema, hi hamolta,
pero
que moltagent
ala quenopucmenys que dedicarunes líneas enpro de laposteritat.
Abans detot,
grácies
a tots els que noapareixeu
de formaexplícita.
Obviament,
aquests
agraíments
contenenmissatges
xifrats,
que esperosiguin
desvetllats per les futures
generacions,
ja
que sens dubteaquestes
seran lespagines
més consultades
d'aquesta
tesi.En
primer
lloc,
als meus directors detesi,
Santi i Eliseo. Per les moltes horesque m'han
dedicat,
pel
suport
il'esforc.
Perles mil i unacorreccions en elspósters,
presentacions
i, finalment,
en la tesi. Per encendre la llum de la curiositat quanaquesta
perd
intensitat,
i per ensenyar-me que laquímica
teórica no és calcular senseparar. Perousvull
agraír, sobretot,
que sou unsbons amics.Al David
Casanova,
per ser un bon amic. Per estar sempre(literalment)
aldespatx
quan l'he necessitat. Per fer el meutemps
al 243-E(per
noparlar
del'epoca
gloriosa
en quecompartíem
l'habitació de lesrates)
profitós
a nivellcientífic,
idivertit anivell
personal.
Perles consoles i lesverduretes,
ipe1
seuincreíble nivell detolerancia a l'humor
gruixut.
Al JesúsJover,
perallargar
la meya esperanca de vidaamb el seu
inigualable
sentit de l'humor. Pelsuport,
pels
sopars, per les festes deGracia,
per les"gromes",
pel
MarioKart(jo
cree que encara lipodem
donaralguna
volta
més),
i perl'ajuda
enqualsevol
cosaquehe necessitat.Espero
tomaracompartir
despatx
amb vosaltres dos.Ala
part
seniordel grup(senior
voldir amb el títol deDr.,
no ensofenguem).
Al
Gabriel,
al JaviIlI,
aenToniRodriguez,
alMiquel,
a laRosa,
i moltespecialment
aenPere
Alemany,
perl'ajut
donatanivell científic ipersonal,
ievidentment,
per lescurses
compartides.
Alapart
junior
del grup(junior
perque encara no soudoctors,
nous ho prengueu com un
elogi).
A enTommy
highfinger,
per les seves histories iAls companys del
departament
dequímica inorgánica,
Per lespractiques
compartides,
els exámensvigilats,
els sopars de Nadal,
elspícnics
i elspartits
de futbol. Voldriaagrair especialment
eltemps
dedicat perpart
del FranciscoLepe
i l'OscarMaqueda (los
vecinos deenfrente),
que amb les sevesvisiteshan amenitzat elmeu
temps
aldepartament.
To the
professor
Jens Kortus for his time and enthusiastic way of work.My
time in
Stuttgart
wasreally
great.
Thanks forteaching
memany otherthings
than howto work hard. Also my
aknowledgement
to Dra. Lilia Boeri and Dr. Luca Dell' Arma for their companyduring
mystay
inGermany.
ForzalaRepubblica.
Alos
colegas
del barrio. Por quenohay
que olvidarnunca de donde se viene.No habría
llegado
hastaaquí
sin vosotros, y aunque ahora estemos un poco máscalmados,
algunas
cosas nunca cambian.Quería
agradecer especialmente
aManu losincreiblesmomentos vividos
juntos.
A lameva família. Per la
paciencia.
Perhavercregut
enmi totaquest temps.
Pel
suport
anímic ino anímico Perosobretot,
per haver-meensenyat
moltes més cosesque les que s' aprenen fentundoctorat. Mil
grácies
de veritat.Als músics que m'han
acompanyat
totaquest temps.
Per ser lameva válvulade sortida en els
pitjors
moments. Perl'energia
renovadadesprés
decompartir
lesimprovisacions
ambvosaltres,
i per fer que la vidasigui
com el bonjazz.
Ambimprovisació,
molt millor.1 com que el millor sempre es deixa
pel
fmal,
no puc acabaraquestes
línies sense donartot elmeuagraíment
i reconeixement alapersoneta
que hafet, fa,
ifará,
que la mevavida(i
lamevafeina) tinguin
unabrillantorespecial (i espacial).
Grácies detotcorLidinha.....
puesto
que todo el mundo sabe que lamecánica cuántica y el cálculo no euclidiano
bastanpara que
cualquier
mente nopreparada
seresienta.H. P.
Lovecraft
The Dreams in
the Witch
House(1933)
Un
problema
és unaoportunitat
perquedoniselmillar detumateix.
Duke
Ellington
-lllomer,
aquí hay alguien
quepuede ayudarte!
-¿Batman?
-No,
uncientífico
ÍNDEX
Introducció 1 1. Introducció 1 2.Objectius
3 3. Formai simetria 4 4. Referéncies 6Capítoll:
Metodologia
deles Mesures Contínues de Forma1.1. Poliedres de referencia 9
1.2. Mesures contínues de forma 13
1.3. Cálcul de les mesures contínues de forma 15
1.4.
Mapes
de forma 161.5. Camins de mínima distorsió 18 1.6. Avaluació de la desviació
respecte
del camí de mínima distorsió 23 1.7. Coordenadageneralitzada
d'interconversióentrepoliedres
251.8. Conclusions 28
Annex 1.1. Taules 29
Annex1.2.
Dependencia
de les mesures de forma ambangles
idistancies
d'enllac
321.9. Referéncies 36
Capítol2:
Apliació
de les mesures de formaenquímica organometál-líca
2.1.
Alquil
i arilcompostos
homoléptics
392.2.
Olefina,
alquí
i al·lilcomplexos
42 2.3. Dienscom alligands
bidentats 462.4. Tamborets de
piano
[MCpL3]:
Coordinació tetraédrica ooctaédrica? 51
2.5. La família de
compostos
[MCp2L2]
552.6. Conclusions 57
2.7.
Apéndix
583.1. Poliedres de referencia i camins de distorsió per
compostos
pentacoordinats
3.2. La
pseudorotació
deBerry
3.3. Distribució de les estructures
experimentals
pentacoordinades
3.4. Análisi de les estructures
experimentals
segons la sevaconfiguració
electrónica3.5. Efecte dels
lligands
sobre l'esfera de coordinació 3.6. Conclusions3.7.
Apéndix
Annex 3.1. TaulesAnnex 3.2.
Diagrames
de Walsh 3.8. ReferénciesCapítol
4:Esteroquímica
decompostos
tetracoordinats de metalls detransició4.1.
Mapes
de forma peracompostos
tetracoordinats4.2. Poliedres ideals i camins de distorsió 4.3. El cavallet com a forma de referencia
4.4. Distribució
experimental
de les estructurestetracoordinades
4.5. Análisi de les estructures
experimentals
perconfiguració
electrónica del metall
4.6. Influencia dels
lligands
sobre l'esfera de coordinació 4.7. Conclusions 4.8.Apéndix
4.9. Referéncies 64 67 70 71 91 98 99 100 104 106 114 115 118 122 126 148 154 156 157Capítol5:
Estructura electrónica decompostos
tetracoordinats 5.1. Isomeria iestatdespin
5.2. Orbita1s moleculars en
compostos ML4
5.3.
Diagrames
de Walsh igeometria
encompostos
tetracoordinats
5.4.
Estereoquímica
encompostos
ML45.5. Efecte del
tipus
delligand
5.6. Efecte de l'estat d'oxidació 5.7. Efecte de la serie de transició5.8. Predicció d'estereosp inómers en
compostos
tetracoordinats
homoléptics
5.9. Distribució asimétrica delligands
5.10. Conclusions5.11.
Apéndix: Metodologia computacional
5.12. Referéncies 168 170 173 176 191 196 198 200 205 209 211 214Capítol
6: Estudi de la correlació estructuraanisotropia
encompostso
de coordinació6.1. El desdoblamentacamp zero
6.2. Correlació entre el desdoblament a camp zero i l'entom
de coordinació
6.3. Cálcul teóric del desdoblamenta camp zero
6.4. Sistemes mononuclears
6.5. Correlacions estructurals amb el desdoblament a camp
222
226 230 232
zero
6.6. Efecte de la
configuració
electrónica 6.7. Sistemespolinuclears
6.8. Conc1usions
Annex 6.1. Cálculdel
parámetre
de desdoblament a campzeroper
primers principis.
Efecte del funcional i deltipus
de base 6.9. Referéncies 235 240 242 244 245 251Introducció
1. Introducció
La classificació ha estat sempre un dels
objectius
del coneixement científicoTotes les
disciplines
de ciéncies pures han intentat classificar i sistematizar de la forma més acurada igeneral possible
tots els coneixements acumulats dels quedisposen.
Enaquest
sentit,
laquímica
ha estatespecialment
exitosa,
ja
que haaconseguit
construir un mapaconceptual
que agrupauna granpart
del coneixementquímic
que esté avuídia,
la Taula Periódica. Tot i queaquesta
eina és moltútil,
nopot
copsar tots elsaspectes
del coneixementquímic
delsquals disposem.
L'ús cada cop més extens detécniques
espectroscópiques
i de caracteritzacióavancades
aporta
cada cop més
informació,
tantdepropietats químiques
com de l'estructuramolecular. Prova d' aixó és l' incesantaugment
d'estructures que s' estaproduint
a les bases dedades
cristal-Iográfiques
durant els últims anys. Per intentar entendre i sistematizartota la informació estructural que s'ha
generat
enquímica,
una de les idealitzacionsmés
emprades
consisteix en associar lesposicions
d'unconjunt
d'átoms als vértexsd'un
poliedre.
La
representació
de les estructures moleculars ambpoliedres
de referenciavacomencar amb els treballs de Van't Hoff i Le
Bel,
que establien l'entorn de coordinació tetraédric per I'átom decarboni,
i va continuar amb els treballs d' AlfredWernerPl
que dividia elscomplexos
aminometál-Iics en dos grups segons el númerode coordinació. Els últims avencos en caracterització estructural han
permés
que cadacop es
disposi
de mésinformació,
i mésacurada,
sobre l'estructura molecular.Aquests
avencos,juntament
amb les novestécniques
de síntesi i els progressos ques'estan fent en el
disseny
de novesmolécules,
fan que cada coptinguem
moléculesmés
complexes,
onl'assignació
delpoliedre
que millor les descriu es fa difícil. Laidealització de les estructures moleculars amb
poliedres
haportat
a quealgunes
famílies de
compostos
agafin
elnom delpoliedre
de referencia que millorles descriu.conjunt
de formes de referencia que hemd'emprar
per descriure els entoms de coordinacióencompostos
de metalls de transició.Figura 1. Estructura molecular del compost
tetrakis((!l3-t-butoxy)-carbonil-coure(I),
[2] quepertany a la família deis cubans, on el nucli de la molécula [CU404J te geometria de cubo A
I'esquerra, molécula de
tetraedra_l3]
La
descripció
dels entoms de coordinació i de les estructuressupramoleculars
amb
poliedres
és molt útil per la sevasimplicitat
iprecissió,
pero
sovint enspodem
trobar amb
alguns problemes
de difícil solució. Elprincipal d'aquests problemes
és l'ús delspoliedres
i de les formes de referenciacom unapropietat
binaria que esté,
o no es té. Enaquest
sentit,
quan una estructura no coincideix exactament amb unaforma de
referencia,
ladescripció
que es dóna delcompost
esforca ambigua,
i esdonen
descripcions
deltipus
"moltdistorsionat",
"lleugerament
distorsionat",
"bastantdistorsionat",
etc. Per altrabanda,
sovintno és trivial escollirquin
és elpoliedre
que millor descriu una estructura. Perexemple,
lageometria
dels vuit átomsd'oxigen
coordinats al calcienelgranat
s'ha descrit amb tresformesdiferent,
un"cubtort",
un"antiprisma quadrat
distorsionat" o un "dodecaedre distorsionat"(figura
2).[4]
Donatque existeixuna correlació íntimaentre la reactivitat
química,
lespropietats físiques
i l'estructuramolecular,
ésconvenient donarunadescripció
acurada,
i al'horasenzilla,
Introducció
Figura 2. Model per I'entorn de coordinació amb vuit oxigens pel
Ca2+
en elgranat.[5]
Aquestentorn de coordinació ha estat descrit com un "cub tort", com un "antiprisma quadrat
distorsionat"o com un "dodecaedre distorsionat".
2.
Objectius
Els
objectius d'aquest
treball són donar unaperspectiva general
de lametodologia
de les mesures contínues deforma,l6,
7] quepermeten
unadescripció
senzilla,
pero
acurada,
de l'entom de coordinació encompostos
de metalls detransició. S "introduiráuna nova eina associada a la
metodologia
de les mesures de formapel seguiment
d'estructures que es troben en camins d'interconversió entrepoliedres.
Les mesures de forma seranemprades
per analítzarl'esteroquímica
decompostos
organometál
-Iics,
comparant aquests compostos
i els seuslligands típics
amb els
análegs
dequímica
de coordinació. S' estudiara l'estereoquímica
decompostos
tetracoordinats ipentacoordinats
en funció de laconfiguració
electrónicadel metall i de les restriccions
estereoquímiques imposades
perlligands
amb diferent denticitat. Pelscompostos tetracoordinats,
esfaráun estudi de les corbesd'energia
pertotes les
configuracions electroniques
ipels
diferents estats despin,
per correlacionarla distribució de les estructures
experimentals
amb lesgeometries
i estats despin
predits
anivell teóric. Es mostraracom espoden
obtenirunconjunt
deregles
senzillesper la
predicció
de l'entom de coordinació encompostos
tetracoordinats enfunció del'estructura electrónica del
metall,
iquins
són els factors quepoden
modificar l'estatde
spin
del metall.Finalment,
i donada la relació íntima que hi ha entre estructura i3. Forma isimetria
Malgrat
que la forma i la simetría estanÍntimamentassociades,
ija
queaquest
treball es fonamentará en les mesures de
forma,
ésimportant
destacar les diferenciesentre
aquestes
duespropietats,
que sovint es confonen. Per il·lustraraquestes
diferencies emprarem dos
exemples.
Ala
figura
3 trobemtrespoliedres
arquimedians
quetenensimetriaoctaédrica,
aixóés,
quepertanyen
al gruppuntual
de simetriaOh,
pero
que difereixen en elnombre de vertexs i
tipus
de cares.És
clardones,
que tot i que tenen la mateixasimetria,
les formes són ben diferents.Figura 3. Poliedresarquimediansamb simetria Ohperoformes clarament diferents
Considerem ara el
conjunt
deprismes trigonals
de lafigura
4. Tots tenen el mateix nombre de vertexs i la mateixa simetria(grup puntual D3h).
No obstantaixó,
la relació entre lalongitud
dels costats delstríangles
i la de les arestes que els uneixenno és
igual
entots els casos.Aquesta
relació és més gran que la unitat a4a,
i méspetita
a4d,
metre que els dostipus
d'arestes tenenla mateixalongitud
a4b i 4c. Totique 4b i 4c
poden
semblar diferents aprimer
copd'ull,
són exactamentiguals,
i només difereixen en l' orientació relativa i en eltamany.
Podem dones afirmar queaquests quatre
prismes
tenen la mateixasimetria,
pero
tres formes diferents. Fins i totpodem
veurequepodem
definirtantsprismes
comvolguem
varíant la relació entrelesIntroducció
e
4a
4b
,
4c
4d
Figura
4. Diferentsprismes trigonals amb la mateixa simetriaperodiferent forma.En resum, direm que dos
objectes (molécules
en el nostrecas)
tenen la mateixa forma si difereixen només entamany,
posició
o orientació enl'espai.
Altemativament,
podem
dir que dosobjectes
tenen la mateixa forma si elspodem
superposar per combinació d'unatranslació,
una rotació i un escalatisotrópic.
Ambaquests
exemples podem
veureque la formaés,
engeneral,
un criteri de classificació4. Referencíes
[1]
A.Wemer,
Z.Anorg.
Chem.1893,3,267.
[2]
R. L.Geerts,
J. C.Huffman,
K.Folting,
T. H.Lemmen,
K. G.Caulton,
J Am. Chem. Soco1983,105,3503.
[3]
H.Imgartinger,
A.Goldmann,
R.Jahn,
M.Nixdorf,
H.Rodewald,
G.Maier,
K.-D.Malsch,
R.Ernrich, Angew. Chem.,
Int. Ed.1984,23,
993.[4]
M.O'Keeffe,
B. G.Hyde, Crystal
Structures. 1. Patterns andSymmetry,
Mineralogical Society
ofAmerica,
Washington,
D.C.,
1996.[5]
T.Armbruster,
C. A.Geiger,
Eur. J Miner.1993,5,59.
[6]
H.Zabrodsky,
S.Peleg,
D. J.Avnir,
J Am. Chem. Soco1992,114,
7843.[7]
D. J.Avnir,
O.Katzenelson,
S.Keinan,
M.Pinsky,
Y.Pinto,
Y.Salomon,
H.Zabrodsky
Hel-Or,
Concepts
inChemistry:
AContemporary
Challenge,
Research Studies PressLtd., Tauton,
England,
1997.Capítol
1:
Capítol
1:Metodologia
de les Mesures Contínues de FormaLa
química
de coordinació va néixer com adisciplina
científica quan AlfredWemerva dividir els
complexos
aminometál-lics endos grups, els que tenien númerode coordinació sis i els que tenien número de coordinació
quatre, proposant
l' octaedre i elquadrat
com arespectius
entoms de coordinació per a cadascunad'aquestes
famílies,
i mostrant com la sevaproposta
estereoquímica podia explicar
l'isomeriaque
presentaven
elscompostos
de cobalt iplatí.
[1,2]Aquest
descobriment,
juntament
amb els estudis anteriors de Van 't Hoff i Le Bel que establien l'entom tetraédric de l' átom de
carboni,
van constituir un dels fonaments de l'estereoquímica
molecular.Des
d'aquell
moment, elspoliedres
van demostrar ser una eina molt útil per a ladescripció
dels entoms decoordinació,
tant encompostos
amb metalls de transició com encompostos
orgánics
o en estructures de sólids.Aquesta
idealització ha arribat alpunt
enque algunes
famílies decompostos
prenen el nom delpoliedre
que millorles
representa,
comés el casdels cubanso del tetraedrá,Tot i que
aquesta
idealització és molt útil ipresenta
nombrosesaplicacions,
l'assignació
a un determinatpoliedre
de referenciano sempre ésfácil,
ja
queaquests
presenten
unelevat grau de simetria que sovintno és capac derepresentar
adientmentla
plasticitat
de l'esfera decoordinació,
especialment
encompostos
de metalls detransició. Per
aquest
motiu,
és necessária unadescripció
mésacurada,
pero
senzilladeIs
poliedre
de coordinació.En
aquest
capítol
espresenten
els diferentspoliedres
de referenciaemprats
enquímica
de coordinació per descriure l'entom del metall de transició encomplexos.
Després,
espresentará
lametodologia
de les mesures contínues de forma com a einaper la
descripció quantitativa
de la forma.Seguidament,
es mostraranles eines que esi
antiprismes,
o elspoliedres
de Johnson.Seguidament
es faráunapetita
descripció
decadascuna
d'aquestes
famílies,
ordenades de més amenysregularitat.
i)
Solids PlatonicsLa familia de sólids
platónics
esta formada per cincpoliedres
que esdefineixen com
aquells
que tenen per carespolígons regulars
i tenen tots elsvertexs,
cares i arestes
equivalents.
Aquest
cincpoliedres
són eltetraedre, l'octaedre,
elcub,
el dodecaedre i l'icosaedre. A lafigura
1.1 estrobaunesquemad'aquests poliedres.
Figura 1.1. Els sólidsplatónics:tetraedre, octaedre, cub, dodecaedre i icosaedre.
Donat l' elevat grau de simetria i
regularitat
quepresenten aquests
poliedres,
així com el seu reduitnombre,
moltesvegades
no són suficients per descriure demanera adient els entorns de
coordinació,
si be sovint la sevasimplicitat
ha fet quehagin
estatels mésemprats
enquímica
ambaquest
propósit,
ii)
SolidsArquimedians
Aquesta
família de catorzepoliedres
es caracteritzapel
fet que tenen tots els vértexsequivalents, pero
no necessariament les caresni les arestes.Aquests
poliedres
es defineixencom a
aquells
que tenenper carespolígons regulars
de dos oméstipus,
iguals
entre si perclasses idisposats
de la mateixamanera acada vertex, EIspoliedres
arquimedians poden
serobtinguts
apartir
delsplatónics, ja sigui
perexpansió
o perCapítol
1:Metodologia
de lesMesuresContínues de FormaFigura
1.2. Els catorze sólids arquimedians. D'esquerra a dreta i de a dalta baix, tetraedretruncat, octaedre truncat, icosaedre
truncát,
cub truncat, dodecaedre truncat, cuboctaedre, icosidodecaedre, rombicuboctaedre, rombicosidodecaedre, cuboctaedre rombitruncat,icosidodecaedre rombitruncat, cub rom, cubrom
(enantiórner)
i dodecaedre romoiii)
Prismes iantiprismes
Aquests
poliedres
sónels únics convexos. Tot i que estrictamentpertanyen
alssólids
arquimedians,
sempre s'estudiencom unconjunt
separat.
Elconjunt
deprismes
i
antiprismes
ésinfinit,
elque
obliga
a introduir restriccions en el criteri al'hora deseleccionar-los com a estructures de referencia. En el nostre cas,
imposem
que totesles arestes han de ser de la mateixa
longitud
i,
enconseqüéncia,
totes les cares sónpolígons regulars.
Tots elsprismes
es construeixen amb dues caresparalleles,
anomenades
directrius,
i unconjunt
dequadrats,
tants com costatstinguin
les caresFigura 1.3. Prisma trigonal (cares directrius triangulars i costats
quadrats)
i antiprismaquadrat(caresdirectriusquadradesi costatstriangulars)
iv)
Poliedres de JohnsonFins ara, totes les famílies de
poliedres presentades
tenenunpunt
encomú: elspoliedres
que les formen són tots esferics. Aixó vol dir que totes les distancies dels vertexs al centregeométric
de lafigura
sóniguals
o, des d'un altrepunt
devista,
quetots els vertexs estan col-locats sobre la
superfície
d'una esfera.Malgrat
tot,alguns
cops aixóno és suficient per descriurealgunes
formes moleculars oalguns
entoms decoordinació,
i ens cal recórreraalgun
dels 92poliedres
deJohnson-",
que sónaquells
que tenenper cares només
polígons regulars
amb arestes de la mateixalongitud pero
que no són ni sólids
platónics,
ni sólidsarquimedians
niprismes
oantiprismes.
A lafigura
1.4 es mostrenalguns
dels 92poliedres
de Johnson útils en ladescripció
d'entoms de coordinació.
En
general,
aquests
poliedres
no sónesferics. No obstantaixó,
enalguns
casospodem
definirpoliedres
com els de J ohnson en la seva versióesférica,
imposant
lacondició
d'esfericitat,
ipermetent
que les caresincompleixin
la condició depolígon
regular
amb totes les arestes de la mateixalongitud.
Enaquests
casos, l'elecció de l'estructura idealpot
no serunívoca,
i ens calimposar
una altra condició: maximitzarla distancia entre tots els
parells
devertexs,
condició quepodem aplicar
emprant
el model d'esferesrígides.
Capítol
1:Metodologia
de les Mesures Contínues de FormaFigura 1.4. Poliedres de Johnson J1
(pirámide
quadrada) i J12 (bipirámidetrigonal),
moltemprats en química de coordinació per descriure entorns de coordinació en compostos
pentacoordinats.
1.2. Mesures contínues de forma
Com s'ha mostrat en les seccions
anteriors,
existeix unaamplia
varietat deformes de referencia per descriure els entoms de coordinació en
complexos.
Noobstant,
l'assignació
d'una determinada forma a unobjecte
és un criteri sovintambiguo
Aquesta
assignació
moltesvegades
resultadifícil,
i ens condueix adescripcions
com ara"lleugerament
deformat",
"moltdeformat",
etc... Enaquest
sentit,
calunasistematizació i avaluació numéricad'aquest
concepte.
A
partir
delconcepte
de mesures contínues de simetria definit per Avnir icol-Iaboradors.T'Í'
Álvarez
icol-Iaboradorsl'
vandesenvolupar
elconcepte
demesures contínues de forma. Les mesures de forma es defineixen com la mínima
distancia entre una forma
problema
i una determinada forma de referencia.Així,
la mesura contínua de forma de l'estructuraQ
formada per unconjunt
de Npunts
caracteritzats
pels
vectors deposició
relativa a unobjecte
donatP,
amb una formadeterminada que esprencom a
referencia,
esdefineixcom:I.lqk
-Pkl2
S(Q,P)
=Q. Aquesta
mesura és el valor mínim pertotes lespossibles
orientacions relatives enl'espai, independentment
derotacions itranslacions,
idesprés
de normalitzar la mida de les duesfigures
(problema
ireferencia)
per tal que elproblema esdevingui
independent
de lamida. El valord'aquesta
mesura es troba normalitzat en una escalade O a 100. El valor de
S(P,Q)
= Os'assoleix quan les coordenades
Qi
de l'estructuraproblema
coincideixen amb les coordenadesPi
de lafigura
dereferencia,
és adir,
quan les dues
figures
sónidéntiques. Progressius
increments del valor de lamesura deforma
indiquen
diferencies creixents entre ambdues formes. A lafigura
1.5 trobemunail·lustració numérica
d'aquest
concepte.
Estructurade referenciaP Estructura
problema Ql
Estructuraproblema Q2
S(P,Ql)
= 3.17S(P,Q2)
= 9.47Figura 1.5 Aplicació de les mesures de forma a estructures de quatre vértexs 01 O2
respecteP
(tetraedre).
El valor deS(P,Q1)
és 3.17 i el valor deS(P,Q2)
és 9.47.Tot i que la necessitat de tractar la forma i la simetria com a
propietats
nodiscretes
ja
ha estatexplorada
desde diferentspunts
de vista i existeix un nombrósconjunt
deparámetres
quebusquen quantificar
aquestes
magnituds,
així com unaamplia bibliografía
alrespecte,[8]
les mesures de formaaporten
una senzillesaconceptual
i unapotencia descriptiva
que, sota el nostrepunt
devista,
les fan tremendament útils per als estudis de gransconjunts
d'estructures.1.3. Cálcul deles mesurescontínues deforma
L'objectiu
de les mesures de forma és obtenir les coordenades{pk}
dels k vértexs delpoliedre
ideal P que es troben més properes a una certa estructuraCapítol
1:Metodología
deles Mesures Contínues de Formaaquesta
mesurasigui independent
de l'orientacióespacial,
de la rotació i deltamany.
L'algorisme
per calcular lesmesures de forma esdivideixenelssegüents
pasos:1.-
Col·loquem
el centregeométric
tantde l'estructura de referencia com delpoliedre
problema
al'origen
decoordenades.l/'
Espot
demostrar queunavegada
hemcol·locatles estructures a
l'origen
decoordenades,
no és necessária cap altre translació en laminimització dela distanciaentre els vértexs de les estructures.
2.- Normalitzem el
tamany
de les dues estructures.Q
és l'estructuraproblema, r"
l'estructurade referencia inicial iNés el nombre de vértexs:(1.2)
3.-
Apliquem
una rotació RsobrepO
que minimitzi les distancies entre els vértexs de les dues estructuresp�
=Rp�
,on R ésunatransformació unitaria(matriu 3x3)
que minimitza la distanciaentre els vértexs.4.- Definimla funció distancia:
(l.3)
5.-
Apliquem
un factor d'escalaisotrópic AQP
ales coordenades{p�}
delpoliedre
dereferencia,
per tal d'obtenir eltamany
delpoliedre
de referencia que ensminimitza ladistancia entre
vértexs,
que definim com acr.D'aquesta
manera, les novescoordenades són:
Pk
=AQPP�
3N(j2
=L
(
qk
-P
k)
2 k=!(l.4)
de
(52,
considerant la normalització fetaal'eq.
1.2,
que és elque
defineix el valor de la mesurade forma deQ
respecte
aPal' eq 1.5.S(Q, P)
=eJ(';;
P)
x100(1.5)
1.4.
Mapes
de formaL'introducció de les mesures de forma
permet
dones unaquantificació
delcontingut
d'una determinada forma que té una certa estructura. Amés,
enspermet
calibrar en la mateixa escala la distancia d'una estructura a diferents
figures
dereferencia.
Aquest
procediment
enspermet
comparar, perexemple,
per a unaestructura de sis
vértexs,
la distanciarespecte
l'octaedre,
elprisma
trigonal,
lapirámide pentagonal
i 1'hexágon.
Tot i que
aquesta
metodologia
és proupotent
per simateixa,
ja
que resumeixtota la informació estructural d'un
compost
en un sólparámetre,
si volem fer estudisde grans famílies
d'estructures,
I'análisi de les dadesnumériques
resultantspot
resultarfeixuga.
Una forma alternativa d'analitzar totaaquesta
informació és la construcció de mapes deforma.
[7] Un mapa de forma ésungráfic
en elqual
dibuixemsimultániament les mesures de forma
respecte
dospoliedres
de referencia alternatiusamb el mateix nombre de vértexs perunamateixa estructura. En
aquests
mapes, cadapoliedre
ocupaunaregió específica
i les distorsionsd'aquests poliedres
de referenciaestan ben caracteritzades per diferents línies. A
conseqüéncia
daixó,
la ubicaciód'una estructuraenel mapa de forma ensdónauna
descripció qualitativa
dequin
és elpoliedre
que millor ladescriu,
així com eltipus
i grau de distorsió quepresenta
respecte
d'aquest poliedre.
Ala
figura
1.6 es mostrala ubicació de dues estructures en unmapa de forma.El
compost
problema
éstetracoordinat,
i s'han calculat les mesures de formarespecte
el tetraedre i el
quadrat.
A l'eix d'abcisses hi ha els valors de mesures de formarespecte
el tetraedre i a l'eix d'ordenades els valorsrespecte
elquadrat.
Col-locant la al mapa d'acord amb lesCapítol
1:Metodología
de les Mesures Contínues de Formavisualitzar que l'estructura de l' esquerra es troba més propera al tetraedre que al
quadrat,
mentre que la de la dreta es troba més propera alquadrat,
comja
indicavenels valors numérics de les
corresponents
mesures de forma.Obviament,
la gran utilitatd'aquests
mapes esdesplega
al realitzar estudis sistemátics amb grans famílies decompostos.
Aquest
potencial
ha estat mostrat en diferents treballsdisponibles
a labibliografiay,10-13]
40Gu
S(
T4)
= 12.45'.
30S(SP4)
= 6.35�1\
f�
� � 20-Ví10-[MnTezPz]
S(T4) = 3.48 o,", I -o 10 20 30 40S(SP4)
= 29.87 S(T4)[IrP4]
Figura 1.6. Exemple de mapa de forma per a compostos tetracoordinats, mostrant les
mesuresde forma de dues estructures problemarespecte el tetraedre
(T4)
i elquadrat(SP4).
En groc, el
comoost'l"
[Mn{TeSi(SiMe3)}2(dpme)], i enverd, elcompost'T''
[lr(PPh2Me)4f.
Tot i que
podem
tenir diversos mapes de formadepenent
dequina
parella
depoliedres
de referenciaseleccionem,
tots ellscomparteixen
uns trets comuns que escomentena continuació:
i)
Lesmesures de forma de dospoli
edres P i Tunrespecte
de l'altre sóniguals,
es adir,
S(T,P)
=S(P,1). Aquest
valorespot
associar a una constantkPT,
quedefinimcomii)
Elpunt
(0,0)
no te sentit físic inoésmaiassolible,
ja
queequivaldria
adir que unaestructura és exactament P i T
alhora,
o el que és elmateix,
que una estructura tésimultániament dues formes diferents.
iii)
Només hi ha unpunt
permés
sobre cadascun deIseixos,
ja
que la distancia d'unafigura
de referencia al' altra és única.iv) Sempre
éspossible
definirun camí d'interconversió entre les dues estructures de referencia que estableix el límit inferior del mapa, i nopot
haver-hi estructures persota
d'aquest
camí.1.5. Camins de mínima distorsió
Una de les
característiques
que es troba alrepresentar
gransconjunts
d'estructures en els mapes de
forma,
és que sempre es trobaunlímit inferior per sotadel
qual
no hi ha estructuresexperimentals. Aquest
fet va serprovat
construint elmapa de forma
hipotétic
per cinc milions d'estructuresML4
generades
al'atzar senserestriccions
estériques.
Totesaquestes
estructures es van dibuixar en elcorresponent
mapa de forma i com es
pot
observaralafigura
1.7a delimitenperfectament
un camíque uneix les duesestructures de referencia.
Aquest
límit,
queapareix
per definició de les mesures de forma i de larepresentació
que enfem d'elles en el mapa deforma,
ens indicaquin
és el camí méscurtper anard'una
figura
de referencia al'altra,
o en altresparaules,
ens indica com ens hemd'allunyar
delpoliedre
P per apropar-nos alpoliedre
T amb els mínimsdesplacaments
atómicspossible (figura 1.7b).
Aixó s'anomena camí de mínima distorsioentreP iT,
i el definimcomaquell
que conté les estructuresQ
que prenen elvalor mínim de
S(Q, 1)
perun determinat valor deS(Q,P)
en l'interval O:sS(Q, 1)
:sCapítol
1:Metodología
de les Mesures Contínues de Forma 80 � 60 <:t" a... V) V)SxCT)
40 20 o 20 40 60 S(T4) 80 100SxCP)
1.7a
1.7b
Figura
1.7.(a)
Mapa de forma amb 5 milions d'estructures MLt generades aleatóriament, ones mostra la regió permesa
obtinguda.
(b)
Camí de mínima distorsió per a la interconversióentreels poliedresPi Ten elcorresponentmapa deforma
L'expressió
analíticacorresponent
aaquests
camins de mínimadistorsióp6]
espot
deduir en termes de les mesures contínues de forma. Peraixó,
cal notar quel'equació
1.2 espot
interpretar
coml'equació
d'unahiperesfera
de radiJN
centradaal'
origen
de coordenades en unespai
de 3Ndimensions,
de la mateixa maneraque en unespai
tridimensional 1'
equació
d'una esfera ésX2
+l
+Z2
=r', Segons
aquesta
perspectiva,
lesdiferentsrepresentacions
centrades i normalitzadestantde l'estructuraproblema
Q
comde l'estructura idealP,
espoden
considerarcom apunts
situats sobrela
superfície
d 'unahiperesfera
de 3N-1 dimensions i radi
JN.
Qualsevol
de lesrepresentacions
de P(segons
lespossibles
orientacions enl'espai)
resultants del'aplicació
d'unaoperació
unitaria i també tenint encompte
lespossibles
permutacions
depunts,
continuaran estant sobreaquesta
hipersuperfície, igual
quequalsevol
estructura centrada al'origen
de coordenades i normalitzada segonsl'equació
1.2.la secció circular de 1
'hiperespai
3N dimensional quecompren
els dospunts
corresponents
ales duesestructuresmésl'origen
decoordenades(figura 1.8).
o
Figura
1.8. Secció circular de I'hiperesfera delimitada perp',
T'
i I'origende coordenades O.L'aplicació del factor d'escala A redueix la distancia amb
T'. L'angle ST,P
que formen els dosvectorsés la mesura
angular
de forma.Ala
figura
1.8podem
veure quel'aplicació
del factor d'escala que passa deP'
(estructura
normalitzada i amb la millorsuperposició
ambT)
a Prepresenta
unadisminució enla distancia amb
T'.
Amés,
espot
deduir queAPT
ha de sermenor quela unitat per la minimització de
(J2.
També espot
definirST,P
coml'angle
de la seccióentre els vectors
corresponents
aT'
i a P,
(o P).
D'aquesta
manera, éspossible
redefinir les dues funcions distancia apartir
de l'angle
de lasecció,
comsegueix:
• CI _
a(T,P)
(1.7)
smoT
P -r:: , vNd'
(T, P)
=2N(
1-�I-O"(�T)
)
=2N(1-
cosI1T,p)
(1.8)
Per tant, es
pot
entrendre lamesura contínua de forma entre dues estructures(P
i Tenaquest
cas),
comlamesura del'angle
que formen els seusvectors enl'espai
3N dimensional.
Així,
apartir
del'equació
1.5,
expresem el valor de la mesura de formacom:Capítol
1:Metodología
de les Mesures Contínues de FormaS(T,P)
=100sin2
eT,p
(1.9)
Elvalor máxim de lamesurade
forma,
S(T,P)
=100,
escorrespondrá
al'angle
máxim en
l'hiperespai,
eT,p
=n/2,
mentre que quan les dues estructurestinguin
lamateixa
forma, S(T,P)
valdrázero,ieT,p
=O.A
partir d'aquesta reinterpretació
de les mesures deforma,
irecuperant
ladefinició de camí de mínima
distorsió,
elconjunt
d'estructuresQ
querecorren el camíde mínima distorsió entre les estructures
P'
iT'
seranaquelles
que es trobin en lasecció circular de la
hiperesfera
entreP'
iT'.
la que hem definit el camí de mínimadistorsió com
aquell
en que pera cada valor deS(Q,P)
el valor deS(Q,1)
pren el seuvalor
mínim,
seraaquell
en que per a cada valor de l'angle
entre P iQ
prengui
el valor minim del'angle
entreTiQ,
iprecisament
aquesta
és una manerapossible
dedefmir l'arc de la secció circularentre
P'
iT' (figura 1.9).
T
o
Figura
1.9. Estructura Q al lIarg del camí de mínima distorsióentrep'
iT'.
La suma de lesmesures de forma S(Q,
T) (angle a)
iS(Q,P)
(angle�)
ha de ser igual a la mesura de formaS(T,P)
(angle8T,p).
D'
aquesta
manera, si es recuperen les relacionstrigonometriques
entre elsangles
i les mesures deforma,
s'obté unaexpressió
analíticapel
camí de mínimadistorsió entrePi T: .
�S(Q,P)
.�S(Q,T)
arcsm +arcsm =8T
P . 10 10'(1.11)
També es
pot
establir la relaciótrigonométrica
entre la constant de formakPT
(equació
1.6)
il'angle
demínima distorsió8T,p:
kPT
=�S(P,T)
=)S(T,P)
=lOsin8T,p
(1.12)
A
partir d'aquesta expressió
éspossible
obtenir el valor de la constant de forma il'angle
de mínima distorsió perqualsevol parella
depoliedres.
A les taules de l'annex 1.1 es mostrenels valorscorresponents
a les constantskPT
i alsangles 8r,p
pera
poliedres
entrequatre
i vuit vértexs amb unátomcentral.Les
expressions analítiques pels
camins de mínima distorsió entermes de lesmesures de forma són útils per a I'análisi
estereoquímic.
Amés,
és molt convenientpoder disposar
de les estructures moleculars(coordenades atómiques)
alllarg
d'aquests
camins. En el cálcul de les mesures deforma,
un cop s'haobtingut
elpoli
edre P més proper aQ,
on cada átom de P es compara amb un átom deQ,
éspossible
obtenir les distancies qk-Pk
(equació 1.3).
El camí de mínima distorsió escorrespondrá
amb elconjunt
d'estructuresalllarg d'aquests
vectorsdesplacament
i espoden
obtenir les coordenades de les formes queestrobenalllarg
del camí escalant elvector
desplacament
amb unfactorentrezeroi la unitat(figura 1.10).
a
b
Figura 1.10. Estructures alllarg del camí de mínima distorsió entre
a)
el cub i la bipirarnideCapítol
1:Metodologia
deles Mesures Contínues de FormaS'ha demostrat que els camins d'interconversió més comuns en
química
decoordinació
(la planarització
percompostos
ML4,
lapseudorotació
deBerry
percompostos MLs
i elgir
de Bailar percompostos
ML6)
corresponen a camins demínima distorsió per la interconversió dels
poliedres
inicial i [mal delcamí.[16]
Tot i queja
s'havien intentat establir models matemátics per aaquest
tipus
decamins'p7]
creiem que
aquest
és elprimer
cop que espoden
generalitzar
enbase a unaequació
i unaconstantassociada alprincipi
i al final del camí.1.6. Avaluació dela desviació
respecte
del camídemínima distorsióLes mesures de forma ens
indiquen
numéricamentquina
és la distancia entreuna estructura
problema
i una estructurade referencia. Tot i que aixó enmolts casos enspermet
fer unaassignació
de la forma que millor descriu la nostra estructuraproblema,
enalguns
casosaquesta
es trobaforca lluny
dels dospunts
dereferencia,
ipot
ser més acurat descriure les estructures com apunts
que es troben en el camíd'interconversió. Per avaluar siuna estructuraXes troba o no en el camí de mínima
distorsió,
definimlafunció
de desviació com:1
[
.�S(X,P)
.�S(X,T)]
f1(P,T)
== -arcsm +arcsm -1(1.13)
(}T,P
10 10D'acord amb
aquesta
definició,
el valor de la funció de desviació sera zero peraquelles
estructures que es troben sobre el camíd'interconversió,
i com méslluny
estiguem d'aquest
camí,
més gran(i
positiu)
sera el valor deI1(P,I).
Aquesta
funciópot
prendre
qualsevol
valorpositiu, pero
els estudis fets durantaquest
treball hanmostrat que desviacions
superiors
a 0.15permeten
afirmar que l'estructuraproblema
del 0.70. La desviació del camí de mínima
distorsió,
peranalogia
amb les mesures deforma,
es normalitza en una escala de O a 100.Aquesta expressió
és molt útil peranalitzar convenientment la distribució d'estructures
experimentals
alllarg
deIscorresponents
camins de mínima distorsió.40�---��---�
11\
...•..
�
...�
. 10 .: ... ..-.' ,,' .... i· 04---�---�--��--�:--� O 10 20 S(T4)300
40Figura 1.11. Exemple d'aplicació de I'equació de desviació deis camins de mínima distorsió
(eq 1.13).
1.7. Coordenada
generalitzada
d'interconversió entrepoliedres
La
possibilitat
de descriure la interconversió entre dos entorns de coordinacióens obre
l'opció
depoder
estudiar diversos processosquímics d'Interes,
com sónels processos fluxionals o les reaccions d'associació/dissociació delligands,
amb laconseqüent
necessitat d'introduiralgun parámetre
que ensindiqui
enquin
punt
de lainterconversió ens trobem. Amb
aquest
objectiu,
s'ha introduít un nouparámetre,
aportació
novad'aquest
treball,
ales eines d'análisidesenvolupades
dins el marc delesmesures contínues de forma.
En
principi,
si reprenem la idea del mapa de forma i del camíd'interconversió,
Capítol
1:Metodologia
de les Mesures Contínues de Formaquin
punt
del camí ens trobem. Aixópresenta
uninconvenient,
que és la no linealitatde les mesures de forma
(veure eq.1.2). Aquests
valors responen a unaexpressió
quadrática,
es adir,
que
si duesfigures
estanseparades
pern unitats de mesures deforma,
elpunt
mig
del caminoés n12. 1 encaramés,
els valors canviaran segons si ensho mirem des d'unoaltre
punt
de referencia.Persolventar
aquest
problema,
cal recuperar la idea que les mesures de formaes
poden interpretar
com aangles.
Donat que la suma dels dosangles
per aqualsevol
punt
alllarg
del camí d'interconversió és constantperunaparella
donada depoliedres
(eq.1.9), podem
descriure laposició
relativaen el camí de TaP per la fraccióangular
queesdefineix enla
següent
expressió:
(/JQ(T
�P)
=100a(Q,T)
=100
arcsin(�S(Q,T)J
(}T,P
(}T,P
10(1.12)
D'acord amb
aquesta
expresssió,
(/JQ(T
�P)és
zeroquan l'estructuraQ
éscoincident amb
T,
iprén
el valor de 100 quanestema l'altreextrem del camí(poliedre
P),
i totes les estructures intermedies alllarg
del camí d'interconversió prenen diferents valors de(/JQ (T
�P)
querepresenten
laporció
de camí(en percentatge)
recorregut.
Obviament,
el camí de tomada espot
trobarreemplacant S(Q,1)
perS(Q,P)
al'equació
1.12.Aquesta
coordenada de reacciófraccional,
descrita al'equació
1.12,
presenta
diferentspropietats:
i) És completa
enel sentitconceptual
de lesmesures de forma.ii)
Tot i que estrictament ésaplicable
només a estructures que es trobenenel camí deiv)
Dóna una mesurapercentual
delpunt
en elqual
ens trobem sobre el camíd'interconversió
(50% equival
alpunt
mig
delcamí).
v)
El camí directe i el camí de tomadaestroben relacionats per la inversió.L'utilitat
d'aquest parámetre queda
clara si repreneml'exemple
del camí d'interconversió entre el tetraedre i elquadrat.
Aquestes
duesfigures
estanseparades
per 33.33 unitats de mesures de forma.
Així,
si una estructuraproblema
te unavalorde
S(T4)
de16.66,
podriem
pensar que es troba amig
camí entre les duesfigures
de referencia. La coordenadageneralitzada
ens indica clarament que aixó ésincorrecte,
ja
que unaS(T4)
de 16.66 teun valor de coordenadageneralitzada
de68.33%,
mésproper al
quadrat
que al tetraedre.Per tot
aixó,
definimaquest
parámetre
com a coordenadageneralitzada
d'interconversió entre
poliedres.[18]
A lafigura
1.12 sil-lustral'aplicació d'aquesta
equació.
En el mapa trobemquatre punts
alllarg
del camí d'interconversió entretetraedre i
quadrat.
Si mirem el camí de T4 cap aSP4,
elprimer
punt
es trobaal'inicidel
camí,
amb laqual
cosa el valor de la coordenadageneralitzada
es de0.0,
i a mesura que ens apropem alquadrat,
la coordenadageneralitzada
ens indica si enstrobem a un
quart
del camí(25%),
amig
camí(50%)
o al final(100%).
Complementáriament,
si mirem el camí dequadrat
cap atetraedre,
elprimer
punt
és el final delcamí,
i téunvalor de la coordenadageneralitzada
de 100. Com s'observaalataula de la