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PREDICCIÓN DE TIEMPO DE FRACASO DE UN TRATAMIENTO ANTIRRETROVIRAL MEDIANTE ALGORITMOS DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO DE SUPERVIVENCIA

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PREDICCIÓN DE TIEMPO DE FRACASO DE UN TRATAMIENTO ANTIRRETROVIRAL MEDIANTE

ALGORITMOS DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO DE SUPERVIVENCIA

Autor: Javier Amado Bouza

10/01/2021 Profesora: Núria

Pérez Álvarez Responsable: Marc

Maceira Duch

Máster

Universitario de

Bioinformática y

Bioestadística

(2)

ÍNDICE:

o El VIH

o El ensayo Lake o Gestión de datos o La imputación

o Aprendizaje automático

o Desempeño de los algoritmos o Comparación de tratamientos o De cara al futuro

o Conclusiones

2

(3)

EL VIH

0,7%

De los adultos

38 millones

De seropositivos

1,7 millones

De nuevos casos

690.000

Muertes anuales

(4)

EL ENSAYO LAKE

Tratamiento A Tratamiento B Vs

• 2 cápsulas Vs 7 cápsulas

116 pacientes

• Hospitales de España e Italia

219 variables

• 48 semanas de seguimiento

41% datos faltantes

• Problema

4

(5)

GESTIÓN DE DATOS

Datos Crudos Datos procesados

(6)

LA IMPUTACIÓN

6

(7)

APRENDIZAJE AUTOMÁTICO

o Bosque aleatorio de supervivencia

o Máquina de soporte vectorial de supervivencia

o Boosting

(8)

DESEMPEÑO DE LOS ALGORITMOS

Obtención del índice C de Harrell

8

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COMPARACIÓN DE TRATAMIENTOS

Carga viral final tratamiento Linfocitos CD4 final tratamiento

(10)

DE CARA AL FUTURO

o Ensayos clínicos con menor cantidad de pacientes o Predicción mediante aprendizaje automático

o Mayor calidad de vida en pacientes VIH+

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CONCLUSIONES

• La imputación permite sacar más provecho a las BBDD.

• Tratamiento A es el mejor tratamiento

• Boosting es el mejor algoritmo

• Con pocos pacientes se obtiene buena predicción

(12)

BIBLIOGRAFÍA

o 1. Vinzamuri B, Li Y, Reddy CK. Active learning based survival regression for censored data. CIKM2014 - Proceedings of the 2014 ACM International Conference on Information and Knowledge Management. 2014;241–50.

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http://openaccess.uoc.edu/webapps/o2/bitstream/10609/64085/6/romancalafatiTFG0617memoria.pdf

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o 10. Medicine AB of I. ABIM Laboratory Test Reference Ranges - January 2020 [Internet]. 2020. pp. 1–12.Available from:

https://www.abim.org/%7B~%7D/media/ABIM%20Public/Files/pdf/exam/laboratoryreference-ranges.pdf

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IMÁGENES UTILIZADAS

o Imagen de la diapositiva 7 utilizada bajo licencia CC BY 2.0. Siendo el autor Mike Mackenzie

Referencias

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