Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal
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(2) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal. BACTERIAS PROMOTORAS DEL CRECIMIENTO VEGETAL PLANT GROWTH PROMOTING RHIZOBACTERIA Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales mecanismos de Promoción de crecimiento vegetal.. Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs.. Capítulo 3. Estudio combinado de las relaciones entre mecanismos promotores del crecimiento vegetal, diversidad de PGPRs y cultivos. Bibliografía..
(3) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales Mecanismos de Promoción de Crecimiento Vegetal. Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales mecanismos de Promoción de crecimiento vegetal. Taghavi S, van der Lelie D, Hoffman A, Zhang Y-B, Walla MD, Vangronsveld J, et al. (2010) Genome Sequence of the Plant Growth Promoting Endophytic Bacterium Enterobacter sp. 638. PLoS Genet 6(5): e1000943. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000943.
(4) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales Mecanismos de Promoción de Crecimiento Vegetal. Nitrogenasa - nifHDK. Nitrogenasa Mo-Fe de Azotobacter vinelandii, estado oxidado. Compuesta por Fe-prot (A y C) y Fe-Mo prot (B y D). 1: Ácido Homocítrico, 2: Grupo Fe-Mo-S, 3: Ca2+ y 4: Grupo Fe-S..
(5) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales Mecanismos de Promoción de Crecimiento Vegetal. Indolpiruvato Descarboxilasa – ipdC/ppdC. 1. 2 Indol Piruvato. Triptófano. 3. Indol-3-acetaldehído. Ácido Indolacético. Nitrito Reductasa - nirK. ACC Desaminasa - acdS. H2O. NO2-. +. ACC. α-cetobutirato. Amonio. NO.
(6) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 1. Las Bacterias PGPR. Principales Mecanismos de Promoción de Crecimiento Vegetal. Respuesta Sistémica Adquirida. Ruta 2-3-butanodiol Piruvato. Acetolactato Sintasa - budB 2-acetolactato Acetolactato Descarboxilasa - budA acetoína Diacetil Reductasa - budC. 2,3-butanodiol.
(7) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal. Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs.
(8) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Materiales y métodos Firmicutes. α Proteobacteria. β Proteobacteria. γ Proteobacteria. Gram + Alto [G+C]. 15. 34. 4. 36. 11. Cepa. nifH. nifD. nifK. ipdC/ppdC. acdS. +. + + +. Acinetobacter baumannii ABNIH24 Acinetobacter gyllenbergii MTCC 11365 Acinetobacter pittii. nirK. budA. Acinetobacter sp. P8-1 Acinetobacter sp. P8-9. Agrobacterium sp. P7-7. Brasiliense,D.M.. + + +. Arshad,M. Arshad,M.. +. Arshad,M.. + +. +. +. Jones,K.J.. +. +. PoretPeterson,A.T.. +. Jung,J.-H.. + +. Arthrobacter crystallopoietes BAB-32. Luo,W.. +. +. +. Azoarcus sp. PA01]. + +. +. +. +. +. +. Azospirillum lipoferum 4B. +. +. +. Azospirillum sp. B510. + + +. + + +. + + +. Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 Azotobacter vinelandii DJ Bacillus cereus Bacillus mycoides. + +. Varghese,N. Nishizawa,T. Junghare,M. NP* Varghese,N.. +. Azospirillum lipoferum. Kumar,R.. + +. + + + +. Azospirillum brasilense Azospirillum brasilense Sp245. Joshi,M.N.. +. Arthrobacter subterraneus. Azoarcus tolulyticus. See-Too,W.S.. +. Arthrobacter sp. ERGS1:01. Azoarcus toluclasticus. Xiang,T. Jha,B.. Arthrobacter alpinus. Azoarcus sp. KH32C. +. + +. Arthobacter sp. PAMC 25486. Arthrobacter sp. CCBAU 10948. Zhan,Y. Arshad,M.. Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium tumefaciens. Autor Singh,N.K.. +. Agrobacterium rhizogenes Agrobacterium sp.. budC. Snitkin,E.S.. Acinetobacter pittii PHEA-2 Acinetobacter sp. P7-29. budB. +. + + +. +. Pothier,J.F. NP*. +. +. + + + + +. NP*. +. WisniewskiDye,F. Kaneko,T. Robson,R.L. Setubal,J.C.. + +. +. Hall,Neil. Bleich,R.M..
(9) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. ape bioconductor decipher msa seqinr rentrez.
(10) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. CLUSTALW. 𝑉𝑛,2 =. 𝑛! 2∗ 𝑛−2 !. Feng y Doolitle. 𝑆𝑖𝑑𝑒𝑛(𝑖𝑗ሻ 𝑆𝑒𝑓𝑓(𝑖𝑗ሻ. 𝑆𝑟𝑒𝑎𝑙(𝑖𝑖ሻ + 𝑆𝑟𝑒𝑎𝑙(𝑗𝑗ሻ = 2 𝑆𝑟𝑒𝑎𝑙(𝑖𝑗ሻ + 𝑆𝑟𝑎𝑛𝑑(𝑖𝑗ሻ = ∗ 100 𝑆𝑖𝑑𝑒𝑛(𝑖𝑗ሻ + 𝑆𝑟𝑎𝑛𝑑(𝑖𝑗ሻ. 𝐷𝑖𝑗 = −𝑙𝑛𝑆𝑒𝑓𝑓(𝑖𝑗ሻ. Jukes-Cantor 𝑝′ =. Neighbour Joining 𝑑=−. 𝑝 𝑁. 𝑠−1 𝑠 𝑙𝑛 ቆ1 − 𝑝′ቇ 𝑠 𝑠−1.
(11) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Resultados Presencia por gen de estudio Grupo. nifH. nifD. nifK. Alfaproteobacteria. 41% 7% 32% 11% 9%. 47% 6% 22% 16% 9%. 45% 6% 24% 15% 9%. Betaproteobacteria Gammaproteobacteria Firmicutes Gram+alto [G+C]. ipdC / ppdC 36% 10% 36% 13% 5%. acdS. nirK. budA. budB. budC. 45% 0% 34% 6% 15%. 70% 4% 11% 11% 4%. 11% 0% 56% 33% 0%. 25% 0% 75% 0% 0%. 25% 0% 50% 25% 0%. Coocurrencia de genes. nifH. nifH 44. nifD 33. nifK 34. ipdC / ppdC 12. acdS 21. nirK 11. budA 2. budB 2. budC 1. nifD. 33. 32. 32. 9. 18. 9. 2. 2. 1. nifK. 34. 32. 33. 9. 18. 9. 2. 2. 1. ipdC/ppdC. 12. 9. 9. 39. 26. 21. 4. 4. 1. acdS. 21. 18. 18. 26. 47. 23. 3. 2. 3. nirK. 11. 9. 9. 21. 23. 27. 0. 1. 2. budA. 2. 2. 2. 4. 3. 0. 9. 3. 1. budB. 2. 2. 2. 4. 2. 1. 3. 8. 0. budC. 1. 1. 1. 1. 3. 2. 1. 0. 8. Gen.
(12) Fe Prot-nifH. Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Proteína Fe. Nitrogenasa. Mo-Fe alpha-nifD. Proteína Fe-Mo (alfa). Mo-Fe beta-nifK. Proteína Fe-Mo (beta) Rhizobium gallicum Rhizobium leguminosarum Rhizobium etli Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium rhizogenes Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti 1021 Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium medicae WSM419 Sinorhizobium medicae Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Bradyrhizobium sp. STM 3809 Azoarcus sp. KH32C Azospirillum brasilense Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum 4B Azospirillum lipoferum Pseudomonas stutzeri RCH2 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Arthrobacter subterraneus Bacillus solani Paenibacillus barengoltzii G22 Paenibacillus amylolyticus Pseudomonas fluorescens Pseudomonas putida. Gluconacetobacter diazotrophicus PA1 5 Methylobacterium nodulans ORS 2060 Methylobacterium sp. 4-46 Methylobacterium sp. WSM2598 Rhizobium etli Rhizobium leguminosarum Sinorhizobium saheli Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium meliloti AK83 Azoarcus sp. KH32C Azoarcus tolulyticus Bradyrhizobium canariense Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 Bradyrhizobium ottaw aense Pseudomonas stutzeri KOS6 Azotobacter vinelandii DJ Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya chrysanthemi Pectobacterium carotovorum Klebsiella sp. 1 1 55 Pantoea sp. At-9b Frankia sp. EUN1f Frankia alni ACN14a Frankia sp. QA3 Bacillus Paenibacillus odorifer Paenibacillus graminis Paenibacillus durus Paenibacillus durus ATCC 35681 Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum 4B. Gluconacetobacter diazotrophicus PA1 5 Pectobacterium polaris Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya chrysanthemi Klebsiella sp. 1 1 55 Pantoea sp. At-9b Acinetobacter sp. P7-29 Acinetobacter sp. P8-1 Acinetobacter sp. P8-9 Pseudomonas stutzeri KOS6 Azotobacter vinelandii DJ Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 Agrobacterium sp. P7-7 Erw inia amylovora MR1 Erw inia amylovora CFBP 1232 Frankia sp. EUN1f Frankia alni ACN14a Frankia sp. QA3 Paenibacillus durus ATCC 35681 Paenibacillus durus Bacillus Paenibacillus graminis Paenibacillus odorifer Pseudomonas sp. B4(2012c) Azoarcus toluclasticus Azoarcus sp. KH32C Azoarcus tolulyticus Bradyrhizobium canariense Arthrobacter sp. CCBAU 10948 Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 Bradyrhizobium ottaw aense Rhizobium leguminosarum Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium meliloti AK83 Sinorhizobium saheli Agrobacterium tumefaciens Rhizobium etli Rhizobium etli Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum 4B Agrobacterium sp. Azospirillum brasilense Sp245 Methylobacterium nodulans ORS 2060 Methylobacterium sp. 4-46 Methylobacterium sp. WSM2598.
(13) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Pyruvate Decarboxylase-ipdC/ppdC Indolpiruvato Descarboxilasa Bacillus sporothermodurans Dickeya zeae Frankia inefficax Klebsiella michiganensis KCTC 1686 Serratia liquefaciens FK01 Pectobacterium carotovorum Dickeya chrysanthemi Dickeya solani Erw inia amylovora MR1 Erw inia amylovora Pantoea ananatis LMG 20103 Pantoea sp. CFSAN033090 Acinetobacter pittii Paenibacillus mucilaginosus KNP414 Bacillus cereus Bacillus thuringiensis Gluconacetobacter diazotrophicus PA1 5 Gluconacetobacter sp. SXCC-1 Agrobacterium sp. SUL3 Pseudomonas putida Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium medicae Sinorhizobium meliloti Rhizobium etli Rhizobium gallicum Rhizobium leguminosarum Arthrobacter sp. PAMC 25486 Paenibacillus polymyxa Pseudomonas sp. 37 R 15 Pseudomonas sp. 34 E 7 Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Bradyrhizobium sp. STM 3809 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum lipoferum Azospirillum brasilense Azoarcus sp. PA01 Azoarcus sp. KH32C Azoarcus toluclasticus Azoarcus tolulyticus. ACC deaminase-acdS ACC Desaminasa Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium canariense Agrobacterium rhizogenes Methylobacterium sp. 4-46 Methylobacterium nodulans ORS 2060 Rhizobium leguminosarum Rhizobium gallicum Sinorhizobium medicae Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Pseudomonas putida Serratia sp. M24T3 Pantoea sp. At-9b Pantoea sp. At-9b Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya zeae Dickeya chrysanthemi Dickeya solani Erw inia amylovora CFBP1430 Bacillus thuringiensis Bacillus cereus Bacillus mycoides Sinorhizobium saheli Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium tumefaciens Azospirillum brasilense Bradyrhizobium sp. STM 3809 Methylobacterium sp. WSM2598 Pseudomonas sp. 34 E 7 Pseudomonas sp. 37 R 15 Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 Azotobacter vinelandii Acinetobacter gyllenbergii MTCC 11365 Acinetobacter baumannii ABNIH24 Acinetobacter pittii Frankia sp. QA3 Frankia alni Frankia inefficax Frankia sp. EUN1f Arthrobacter crystallopoietes BAB-32 Arthrobacter sp. ERGS1:01 Arthrobacter alpinus Rhizobium etli Rhizobium etli Pseudomonas fluorescens.
(14) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Copper Nitrite Reductase-nirK. Nitrito Reductasa. NO2Rhizobium gallicum Rhizobium leguminosarum Rhizobium etli Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium rhizogenes Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti 1021 Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium medicae WSM419 Sinorhizobium medicae Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Bradyrhizobium sp. STM 3809 Azoarcus sp. KH32C Azospirillum brasilense Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum brasilense Sp245 Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum 4B Azospirillum lipoferum Pseudomonas stutzeri RCH2 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Arthrobacter subterraneus Bacillus solani Paenibacillus barengoltzii G22 Paenibacillus amylolyticus Pseudomonas fluorescens Pseudomonas putida. NO.
(15) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal. Acetolactate synthase - budB Ruta de 2-3-butanodiol. Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. Diacetyl Reductase-budC. Acetolactato Sintasa. Diacetil Reductasa. Pectobacterium carotovorum. Paenibacillus sp. P1XP2. Pseudomonas putida Bacillus cereus. Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 Acinetobacter pittii PHEA-2. Methylobacterium radiotolerans Pantoea ananatis LMG 20103. Pseudomonas fluorescens. Erw inia amylovora ATCC 49946 Pantoea ananatis. Serratia sp. ATCC 39006. Diacetyl Reductase - budA. Erw inia gerundensis. Dickeya dadantii 3937. Acetolactato Descarboxilasa. Azospirillum brasilense Sp245. Klebsiella sp. 1 1 55 Azospirillum lipoferum 4B. Bradyrhizobium sp. PARBB1 Bacillus mycoides Bacillus cereus. Ruta 2-3-butanodiol Piruvato. Acetolactato Sintasa. Bacillus thuringiensis Dickeya dadantii 3937 Pectobacterium carotovorum Erw inia amylovora ATCC 49946 Pantoea ananatis LMG 20103. 2-acetolactato Acetolactato Descarboxilasa acetoína. Diacetil Reductasa 2,3-butanodiol.
(16) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal Capítulo 2. Relación filogenética de PGPRs. gyrB Marcadores filogenéticos. Erwinia amylovora Erwinia amylovora Enterobacterales Klebsiella sp. 1 1 55 Klebsiella sp. G2-16S-Nf13 Pseudomonas putida Pseudomonas sp. 37 R 15 Pseudomonas sp. 34 E 7 Azotobacter vinelandii Azotobacter chroococcum Pseudomonas stutzeri Pseudomonas stutzeri Acinetobacter Acinetobacter pittii PHEA-2 Acinetobacter baumannii Erwinia amylovora MR1 Methylobacterium radiotolerans Bacillus sporothermodurans Sinorhizobium saheli Erwinia gerundensis Pantoea ananatis Bacillus mycoides Acinetobacter baumanii Agrobacterium tumefaciens Bacillus Bacillus thuringiensis Paenibacillus mucilaginosus Paenibacillus barengoltzii Paenibacillus Paenibacillus amylolyticus Paenibacillus sp. P1XP2 Paenibacillus durus Paenibacillus durus ATCC 35681 Paenibacillus graminis Paenibacillus Bacillus clausii KSM-K16 Arthrobacter alpinus Arthrobacter sp. ERGS1:01 Arthrobacter crystallopoietes Arthrobacter subterraneus Frankia inefficax Frankia sp. EUN1f Frankia sp. QA3 Frankia alni Azoarcus sp. PA01 Azoarcus sp. KH32C Azoarcus toluclasticus Azoarcus tolulyticus Acetobacteraceae Gluconacetobacter diazotrophicus Azospirillum brasilense Azospirillum brasilense Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum Bradyrhizobium oligotrophicum Bradyrhizobium sp. STM 3809 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Bradyrhizobium sp. PARBB1 Bradyrhizobium Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium ottawaense Methylobacterium sp. IER25-16 Methylobacterium Methylobacterium nodulans Agrobacterium sp. DSM 25559 Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium rhizogenes Rhizobium gallicum Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti Serratia sp. M24T3 Serratia liquefaciens Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya solani Dickeya chrysanthemi Ech1591 Dickeya dadantii Pantoea Pantoea Pantoea sp. At-9b. rpoB.
(17) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal. Capítulo 3. Estudio combinado de las relaciones entre mecanismos promotores del crecimiento vegetal, diversidad de PGPRs y cultivos Materiales y métodos Arroz. Maíz. Alfaproteobacteria. 5. 13. Judía Garbanzo 27. Betaproteobacteria. 4. 0. 0. Gammaproteobacteria. 7. 10. Firmicutes. 15. Gram+alto [G+C]. 0. Alcachofa. Brassica. Algodón. Trigo. Cebada. Tomate Cacahuete. 0. 0. 3. 0. 4. 4. 0. 8. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 9. 0. 7. 2. 9. 0. 0. 7. 12. 0. 0. 0. 6. 0. 0. 6. 6. 0. 15. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% Poaceae. Fabaceae. Brassicaceae. Alfaproteobacteria. Betaproteobacteria. Firmicutes. Gram+alto [G+C]. Malvaceae. Solanaceae. Gammaproteobacteria. De Souza;Vessey 2003; Ahemad 2014; Pérez-Montaño 2014 y Nadeem 2014. Soja.
(18) Alfaproteobacteria. Betaproteobacteria. Firmicutes. Gram+alto [G+C]. Poaceae. Fabaceae. Brassicaceae. Gammaproteobacteria Malvaceae. Solanaceae. 0% 20% 40% 60% 80% 100%. ACC deaminase-acdS α Proteobacteria. β Proteobacteria. γ Proteobacteria. Gram + Alto [G+C]. Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium canariense Agrobacterium rhizogenes Methylobacterium sp. 4-46 Methylobacterium nodulans ORS 2060 Rhizobium leguminosarum Rhizobium gallicum Sinorhizobium medicae Sinorhizobium meliloti BL225C Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti Azospirillum sp. B510 Azospirillum lipoferum Bradyrhizobium oligotrophicum S58 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Pseudomonas putida Serratia sp. M24T3 Pantoea sp. At-9b Pantoea sp. At-9b Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya zeae Dickeya chrysanthemi Dickeya solani Erw inia amylovora CFBP1430 Bacillus thuringiensis Bacillus cereus Bacillus mycoides Sinorhizobium saheli Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium tumefaciens Azospirillum brasilense Bradyrhizobium sp. STM 3809 Methylobacterium sp. WSM2598 Pseudomonas sp. 34 E 7 Pseudomonas sp. 37 R 15 Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 Azotobacter vinelandii Acinetobacter gyllenbergii MTCC 11365 Acinetobacter baumannii ABNIH24 Acinetobacter pittii Frankia sp. QA3 Frankia alni Frankia inefficax Frankia sp. EUN1f Arthrobacter crystallopoietes BAB-32 Arthrobacter sp. ERGS1:01 Arthrobacter alpinus Rhizobium etli Rhizobium etli Pseudomonas fluorescens. Firmicutes. Erwinia amylovora Erwinia amylovora Enterobacterales Klebsiella sp. 1 1 55 Klebsiella sp. G2-16S-Nf13 Pseudomonas putida Pseudomonas sp. 37 R 15 Pseudomonas sp. 34 E 7 Azotobacter vinelandii Azotobacter chroococcum Pseudomonas stutzeri Pseudomonas stutzeri Acinetobacter Acinetobacter pittii PHEA-2 Acinetobacter baumannii Erwinia amylovora MR1 Methylobacterium radiotolerans Bacillus sporothermodurans Sinorhizobium saheli Erwinia gerundensis Pantoea ananatis Bacillus mycoides Acinetobacter baumanii Agrobacterium tumefaciens Bacillus Bacillus thuringiensis Paenibacillus mucilaginosus Paenibacillus barengoltzii Paenibacillus Paenibacillus amylolyticus Paenibacillus sp. P1XP2 Paenibacillus durus Paenibacillus durus ATCC 35681 Paenibacillus graminis Paenibacillus Bacillus clausii KSM-K16 Arthrobacter alpinus Arthrobacter sp. ERGS1:01 Arthrobacter crystallopoietes Arthrobacter subterraneus Frankia inefficax Frankia sp. EUN1f Frankia sp. QA3 Frankia alni Azoarcus sp. PA01 Azoarcus sp. KH32C Azoarcus toluclasticus Azoarcus tolulyticus Acetobacteraceae Gluconacetobacter diazotrophicus Azospirillum brasilense Azospirillum brasilense Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum Azospirillum lipoferum Bradyrhizobium oligotrophicum Bradyrhizobium sp. STM 3809 Bradyrhizobium sp. ORS 375 Bradyrhizobium sp. PARBB1 Bradyrhizobium Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium ottawaense Methylobacterium sp. IER25-16 Methylobacterium Methylobacterium nodulans Agrobacterium sp. DSM 25559 Agrobacterium sp. SUL3 Agrobacterium rhizogenes Rhizobium gallicum Sinorhizobium meliloti Sinorhizobium meliloti Serratia sp. M24T3 Serratia liquefaciens Serratia sp. ATCC 39006 Dickeya solani Dickeya chrysanthemi Ech1591 Dickeya dadantii Pantoea Pantoea Pantoea sp. At-9b. Resultados. Capítulo 3. Estudio combinado de las relaciones entre mecanismos promotores del crecimiento vegetal, diversidad de PGPRs y cultivos. Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal.
(19) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal. Bibliografía. •. Bruto, M., Prigent-Combaret, C., Muller, D. & Monne-Loccoz, Y. Analysis of genes contributing to plant-beneficial functions in plant growth-promoting rhizobacteria and related Proteobacteria. Sci. Rep. 4, 1–10 (2014).. •. Doolittle, R. F., Feng, D. F., Tsang, S., Cho, G. & Little, E. Determining divergence times of the major kingdoms of living organisms with a protein clock. Science 271, 470–7 (1996).. •. Kim, W.-I. Genetic Diversity of Cultivable Plant Growth-Promoting Rhizobacteria in Korea. J. Microbiol. Biotechnol. 21, 777–790 (2011).. •. Larkin, M. A. et al. Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 23, 2947–2948 (2007).. •. NCBI Resource Coordinators. Database Resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 45, D12–D17 (2017).. •. R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing. (2017).. •. Shailendra Singh, G. G. Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR): Current and Future Prospects for Development of Sustainable Agriculture. J. Microb. Biochem. Technol. 7, 96– 102 (2015)..
(20) Diversidad de genes bacterianos relacionados con promoción del crecimiento vegetal TRABAJO FIN DE MÁSTER Enero 2018 Miguel García Hidalgo.
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