Genética de la Producción
Genética de la Producción
2012
Lic. Jimena Gutierrez Brower
Universidad Nacional de Misiones Universidad Nacional de Misiones
Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales
Mgter. Eric Stolar
Clase TP
Clase TP 6:
6: Heredabilidad
Heredabilidad y
y
Repetibilidad
Repetibilidad
Heredabilidad
Heredabilidad
Expresa la confianza que se puede tener
en el fenotipo del animal como una guia
para predecir su valor de cria.
Es propia de una carácter.
Determina estrategia a utilizar en el
mejoramiento de ese carácter.
Se define también como la regresión del
valor de cría sobre el valor fenotípico.
Si se grafica la regresion del valor de cria de un
individuo (juzgado a traves de la progenie)
sobre su valor fenotipico, el coeficiente b1 de
regresion (pendiente de la recta) es igual a la
heredabilidad.
Se puede predecir el valor de cría de un
animal :
=valor de cria esperado Se expresa en desviaciones de la media de la población, al igual que P.
Ejemplo: Si un toro es superior en 100g en ganancia de peso diaria con respecto a la media de la población a la cual pertenece, y si su heredabilidad es 0,4 para esa característica, la estimación de su valor de cría es 40 g, Esta es su superioridad genética.
Métodos de determinación de
Métodos de determinación de heredabilidad
heredabilidad
Todos los metodos se basan en determinar cuanto mas se parecen entre si animales emparentados que los no emparentados. El grupo de datos analizados debe necesariamente poseer una estructura familiar (no menos de 25% de coeficiente de parentesco entre individuos)
Entre los metodos mas usados encontramos:
Regresion de los hijos sobre el promedio de los padres Regresion de los hijos sobre uno de los padres
Regresion de hijas dentro de madres
Correlacion intraclase entre hermanos enteros Correlacion intraclase entre medio hermanos
Lineas isogénicas
Regresión de los hijos sobre
Regresión de los hijos sobre
un progenitor
un progenitor
Regresión de los hijos sobre
Regresión de los hijos sobre
un progenitor
un progenitor
Ejemplo:
Estimación de heredabilidad del peso (en libras) al año de edad en bovinos
Peso al año del padre (X) Peso al año del hijo (Y)
1006 956 1095 916 1018 944 1029 1036 1011 1054 1004 923 1005 938 1124 1003 961 899 1048 941 y x y x n s n i i i xy − =
∑
=1 1 2 1 2 2 1 x x n s n i i x − =∑
= Recordar: 2 X XY OP 2S
S
2
2b
h
=
=
Se utiliza cuando se tienen pocos datos. Se hace una
aproximación de la regresión hijos-padres.
1- Ordenar padres por fenotipo (de mayor a menor). Si N es impar se elimina la observación mediana.
2- Se ordenan los hijos por el orden de sus padres 3- Se calcula:
Regresión de los hijos sobre
Regresión de los hijos sobre
un progenitor
un progenitor
Regresión de los hijos sobre
Regresión de los hijos sobre
un progenitor
un progenitor
Método simplificado
=
=
=
=
inf sup inf supY
Y
X
X
Media mitad superior de los padres Media mitad inferior de los padres Media mitad superior de los hijosMedia mitad inferior de los hijos
−
−
=
inf sup inf sup 2X
X
Y
Y
2
h
Población de estudio:
Correlación
Correlación intraclase
intraclase entre
entre
medios hermanos
medios hermanos
Correlación
Correlación intraclase
intraclase entre
entre
medios hermanos
medios hermanos
♀
♂
♀ ♀ ♀
♂
♂
♀ ♀
♀
♀ ♀ ♀ ♀
♀
Se lo analiza mediante un ANOVA, considerando
a cada padre como un tratamiento.
Fuente de variación GL CM Entre padres (entre grupos de
medios hnos)
s-1 CMs
Entre progenies (dentro de grupos de medios hnos)
s (k -1) CMw Total sk - 1 2 s 2 w
k
.
σ
σ
+
2 wσ
s= N°de padresk = N°de hijos por padre (puede ser balanceado o no)
Los cuadrados medios pueden teóricamente explicar la variación en términos de componentes de varianza:
= componente de varianza entre padres
= componente de varianza dentro de progenies de un mismo padre (medio hnos)
2 s
σ
2 wσ
k
CM
CM
s w 2 s−
=
σ
w 2 w=
CM
σ
COV
HS Tipo de pariente COV VA VD Hijos-Padre OP ½ Hnos enteros FS ½ ¼ Medio hnos HS ¼Coeficiente de componentes de varianza incluidos en las covarianzas entre diferentes tipos de parientes.
COV
HS= ¼ V
At
4
4
h
2 w 2 s 2 s 2=
+
=
σ
σ
σ
t= correlación intraclasePoblación de estudio:
Correlación
Correlación intraclase
intraclase entre
entre
hermanos enteros
hermanos enteros
Correlación
Correlación intraclase
intraclase entre
entre
hermanos enteros
hermanos enteros
♀
♂
♀ ♀ ♀
♂
♂
♀ ♀
♀
♀ ♀ ♀ ♀
♀
Se lo analiza mediante un ANOVA.
Fuente de variación GL CM Entre padres s-1 CMs Entre madres dentro de
padres (grupos de medio hnos paternos)
s (d -1) CMd
Entre progenies dentro de madres (grupos de hnos enteros) sd (k-1) CMw 2 s 3 2 d 2 2 w
+
k
.
σ
+
k
σ
σ
s= N°de padresd= N°de madres por padres
k = N°de hijos por madre (puede ser balanceado o no)
2 d 1 2 w
k
.
σ
σ
+
2 wσ
=
=
=
2 s 2 d 2 wσ
σ
σ
Componente de varianza entre progenies Componente de varianza entre madres3 2 d 2 w s 2 s
k
)
σ
ˆ
k
(CM
CM
σ
ˆ
=
−
−
Podemos estimar componentes de varianza:
w 2 w
CM
ˆ
=
σ
1 w d 2 dk
CM
CM
σ
ˆ
=
−
En este análisis existen varios estimadores
de heredabilidad:
Estimación usando el componente padres
Estimación usando el componente madres
Estimación de la heredabilidad en sentido amplio
2 w 2 d 2 s 2 s 2 (s)
4
h
σ
σ
σ
σ
+
+
=
2 w 2 d 2 s 2 d 2 (d)4
h
σ
σ
σ
σ
+
+
=
2 w 2 d 2 s 2 d 2 s 2 d) (s)
(
2
h
σ
σ
σ
σ
σ
+
+
+
=
+No contiene efectos maternos ni de dominancia, representa mejor la h2en sentido estricto
Contempla efectos maternos y varianza debido a la dominancia.
La diferencia entre h2 (d) y
h2
(s) nos da una idea de
importancia de varianza debido a dominancia y efectos maternos
Los efectos maternos pueden ser debidos a: Nutrición pre y post-natal
Infecciones a traves de la madre Anticuerpos maternos
Herencia citoplasmática
Método sencillo para estimar la heredabilidad en sentido amplio.
Todos los individuos tienen el mismo genotipo. (Se considera isogénica una población con mas de 90% de consanguinidad).
En estas líneas toda la variación observada entre individuos puede atribuirse al ambiente, ya que todos los individuos tienen el mismo genotipo. La variancia genotípica de un determinado carácter se puede estimar entonces, como la diferencia entre la variancia fenotípica de la población de cría libre y la variancia fenotípica de la línea isogénica.
Líneas
Líneas isogénicas
isogénicas
G isogenica P P E isogenica P E G P
V
V
V
V
V
V
V
V
=
−
=
+
=
P G 2V
V
H
=
La obtención de estimaciones lo mas
reales posibles de heredabilidad es
un paso esencial para decidir que
método de selección utilizaremos
para el mejoramiento genético de
los caracteres cuantitativos.
Repetibilidad
Repetibilidad (R)
(R)
Existen caracteres que se manifiestan varias veces
en la vida de un animal.
Ejemplos
Produccion de leche
Peso del vellon
Peso del destete (de todos los hijos de una misma vaca)
Produccion huevos
R expresa la correlación entre medidas repetidas sobre un
R expresa la correlación entre medidas repetidas sobre un
mismo individuo, o sea entre medidas realizadas en dos o
mismo individuo, o sea entre medidas realizadas en dos o
mas momentos diferentes de su vida
mas momentos diferentes de su vida
Fenotipo= VG
+ VE
VEpermanente VEtemporal Clima Nutrición Manejo etcRepetibilidad
Repetibilidad
R es la fracción total del carácter que es debida
al genotipo y al ambiente permanente.
R marca el límite máximo que puede alcanzar la
heredabilidad.
Factor que se introduce que no esta en la fórmula de heredabilidadUn valor de R alto (mas de 0,4) nos indica que con una medida del carácter en cuestión del animal obtenemos información suficiente.
Ejemplos de su aplicación
Ejemplos de su aplicación
Si una vaca tiene un hijo con un peso al destete de 50 kg por arriba del promedio de los hijos del mismo rodeo, y sabiendo que R=0,4, entonces en la próxima camada, esta vaca producirá terneros que estarán 50 x 0,4 = 20 kg por encima del promedio de los terneros del mismo grupo de vacas.
El peso del vellón de dos borregos es de 3,6 y 4 kg respectivamente, o sea que la diferencia entre ambos es de 0,4 kg. Sabiendo que la repetibilidad del carácter es de 0,5, se espera que en la segunda esquila haya una diferencia entre ambos de 0,4 x 0,5 = 0,2 kg.
Cuando poseemos una medida de producción del
individuo y se conoce la R de la característica, se
puede calcular PRODUCCION MAS PROBABLE
(PMP) del individuo.
Medido en desviaciones de la media
Si tenemos varias medidas n del animal
P= Producción del individuo; Xp = Promedio de la población; Xn = promedio de los n desvios del animal; n= n°de re gistros
Ejemplo
Ejemplo
Se desean comparar vacas de un rodeo por su habilidad materna, según los pesos al destete producidos.(considerar R=0,4) Vaca N° registros Pesos al destete (desvios) Desvio promedi o PMP A 3 +27 +12 +13 +17,3 B 2 +19 +15,6 +17,3 C 3 -10 +5 -3 -2,7 D 1 -20 -20 E 1 +20 +20
Para estimar producción de un animal calculo PMP; para estimar la producción de su cría utilizo Valor de Cria.
Cuando el numero de registros por animal (k)
es solamente dos:
Cálculo de Repetibilidad
Se puede obtener el valor de R para la
característica estudiada a traves del cálculo del
coeficiente de correlación entre las dos medidas.
y x xy xy
S
S
S
r
=
=
R
Podemos encarar el calculo de R a traves de un ANOVA, si
consideramos a cada animal como un tratamiento y las
diferentes medidas como diferentes repeticiones.
Fuente variación SC GL CM
Entre individuos CME (CMI)
Dentro individuo CMD (CMW)
Varianza entre individuos:
Varianza dentro individuo:
Cálculo de Repetibilidad
R en esta caso tambien se llama coeficiente de correlación intraclase (t) k= n° de medidas por animal. Puede ser desbalanceado
Error estandar de la estimación de la
repetibilidad
k= N°de medidas por individuo N = N°de individuos estudiados
R marca el límite máximo que puede alcanzar H2. Tiene
exactamente el mismo denominador y en el numerador aparece el componenteσ2Ep que no existe en la heredabilidad. Esta relación
entre repetibilidad y heredabilidad, resulta de suma importancia práctica ya que es más fácil obtener estimaciones de repetibilidad que de heredabilidad, ya que en el primer caso no se requiere una estructura familiar.
Repetibilidad
Heredabilidad
Es una indicación del grado en
que la superioridad de un
animal en una medida será
observada en medidas
subsiguientes del mismo animal a lo largo de su vida
Indica el grado en que la
superioridad de los padres será observada en su descendencia.