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QUIMICA MEDICINAL. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales UBA

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(1)

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 1

(2)

2

toxicidad

quimioterapia combinada

Posibles

interacciones entre drogas

desarrollo de mecanismos de resistencia

(3)

3

Estructura del ADN

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(4)

4

Estructura del ADN

(5)

5

Estructura del ADN

Doble hélice 3.4 nm

surco menor

surco mayor

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(6)

6

Estructura del ADN

Tautomerización de las bases

*

*

(7)

7

Estructura del ADN

Tautomerización de las bases

*

*

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(8)

8

Estructura del ADN

Tamaño y forma

µm a cm

empacado con la ayuda de histonas cromatina

Linear – circular – supercoiled

topoisomerasas

(9)

9

Estructura del ADN

Tamaño y forma

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(10)

10

Estructura del ADN

Tamaño y forma

mecanismo de clivaje del ADN por las topoisomerasas

(11)

11

Estructura del ADN

conformaciones

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

Hélice derecha azúcar C3'-endo

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(12)

12

Estructura del ADN

conformaciones

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

(13)

13

Estructura del ADN

conformaciones

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

Hélice derecha azúcar C3'-endo

nº de nucleótidos por vuelta (p: pitch) 11

dist. entre bases consecutivas ( h:

helical rise) 2.56 Å

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(14)

14

Estructura del ADN

conformaciones

Hélice derecha azúcar C2'-endo

nº de nucleótidos por vuelta (p: pitch) 10

dist. entre bases consecutivas ( h:

helical rise) 3.38 Å

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

(15)

15

Estructura del ADN

conformaciones

Hélice izquierda

G: conformación syn azúcar: C3'-endo

C: conformación anti azúcar: C2' endo

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(16)

16

Estructura del ADN

conformaciones

conformaciones syn y anti

anti syn

G

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

(17)

17

Estructura del ADN

conformaciones

Hélice izquierda

G: conformación syn azúcar: C3'-endo

C: conformación anti azúcar: C2' endo

nº de nucleotidos por vuelta: 12 h: 7.4 Å

(para Z-DNA la unidad repetitiva es G-C).

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(18)

18

Estructura del ADN

conformaciones

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

(19)

19

Estructura del ADN

conformaciones

Ancho del surco Profundidad del surco

mayor menor mayor menor

A-DNA 11.0 Å 2.7 Å 13.5 Å 2.8 Å

B-DNA 11.7 Å 5.7 Å 8.5 Å 7.5 Å

ADN-A, ADN-B, ADN-Z

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(20)

20

Clases de drogas que interactúan con el ADN

intercalantes alquilantes

cortantes de cadenas de ADN

(21)

21

intercalantes

Destruyen la estructura regular de la hélice Interfieren con las ADN topoisomerasas y/o

ADN polimerasas

N

N

O O HO

O

N N

O

CO

2

H

camfotecina (topoisomerasa I) ác. nalidíxico

(topoisomerasa II) -reversibles-

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(22)

22

intercalantes

Intercalación de bromuro de etidio con B-DNA

nucleótido molécula

intercalada

(23)

23

intercalantes

La intercalación es necesaria pero no suficiente

No hay una correlación entre poder intercalante y actividad antitumoral

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

UBA

(24)

24

intercalantes

acridinas

R, R´= H amsacrina (leucemia)

N

R

HN

H

3

CO NHSO

2

CH

3

Se aloja en el surco menor

puede interactuar

con una proteína

(25)

25

intercalantes

actinomicinas

Dactinomicina Streptomyces

O N

O

O NH

2

Thr-L

O

L-MeVal Pro-L Sar

Val-D O L -Thr

O

L-MeVal Pro-L Sar

Val-D

Inhibe la síntesis de ADN y ARN (bloquea la elongación de cadena) Específica en fases S y G1

quedan en el surco menor

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(26)

26

intercalantes

antraciclinas

OCH

3

O

O

OH

OH

O

X OH

H O O

OH NH

3

9

D A

X = OH doxorubicina (adriamicina)

-amplio espectro- X= H daunorubicina

-leucemia- Streptomyces

Inhiben la replicación y transcripción del ADN, y además inducen la ruptura del ADN inducida por radicales

Sobresale hacia el surco menor sobresale hacia

el surco mayor

(27)

27

intercalantes

Distamicina: agentes que se unen al surco menor

Se une en secuencias ricas en A-T (ADN-B)

surco menor más estrecho

N2 de G produce impedimento estérico

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(28)

28

intercalantes

Drogas bisintercalantes: WP631

daunorubicina

espaciador: 7 A º

unión más firme,

más selectiva

no sufre MDR

(29)

29

alquilantes -irreversibles-

mostazas nitrogenadas etileniminas

ésteres de ác. metansulfónico nitrosoureas

triazenos

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(30)

30

mostazas nitrogenadas

Cl

S

Cl Cl N

Cl

R

(31)

31

mostazas nitrogenadas

SH > NH 2 > PO 4 3- > CO 2 -

N

N N H N

NH

2

N N N

H N

NH

2

NH

N N H N

O

NH

2

N

N H NH

2

O 7

3

1

1

G A A C

> > >

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(32)

32

mostazas nitrogenadas

N

N N H N

NH

2

N N N

H N

NH

2

NH

N N H N

O

NH

2

N

N H NH

2

O 7

3

1

1

G A A C

> > >

La reactividad está fuertemente controlada por efectos estéricos, electrónicos y uniones hidrógeno

El tipo de reacción depende de la estructura química del

agente alquilante

(33)

33

mostazas nitrogenadas

ion aziridinio

ion aziridinio

asistencia anquimérica en mostazas nitrogenadas

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(34)

34

mostazas nitrogenadas

alquilación de ADN por mecloretamina

+ +

+

Consecuencias:

G más ácida

- G-T en vez de G-C

(35)

35

mostazas nitrogenadas

G-T en vez de G-C

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(36)

36

mostazas nitrogenadas

alquilación de ADN por mecloretamina

+ +

+

Consecuencias:

G más ácida

- G-T en vez de G-C

codificación incorrecta

en la replicación

(37)

37

mostazas nitrogenadas

alquilación de ADN por mecloretamina

+ +

+

+

Consecuencias:

G más ácida

- G-T en vez de G-C codificación incorrecta en la replicación

- N-alq G susceptible de hidrólisis

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(38)

38

mostazas nitrogenadas

N-alq G susceptible de hidrólisis

Ruptura de cadena de ADN

(39)

39

mostazas nitrogenadas

alquilación de ADN por mecloretamina

+ +

+

+

Consecuencias:

G más ácida

- G-T en vez de G-C codificación incorrecta en la replicación

- N-alq G susceptible de hidrólisis

-Posible unión ADN-proteína

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(40)

40

mostazas nitrogenadas

Cl

N

Cl

CH

3

Cl

N

Cl

R Cl

N

Cl

CO

2

H

mecloretamina (mal de Hodgkin)

clorambucilo

Cl

N

Cl

NH

N H O

O

mostaza de uracilo (leucemia linfática

crónica)

(41)

41

mostazas nitrogenadas

mecanismos de resistencia:

- disminución de ingreso de droga a la célula - aumento de los procesos de reparación

- aumento del contenido de –SH (glutatión) - aumento en la producción de enzimas

metabólicas (ej. glutatión S-transferasa)

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(42)

42

Etileniminas (aziridinas)

N

N N N

N N

O

O

N N

O

O

O

NH

2

O

O

N EtO

2

CHN

N NHCO

2

Et

trietilenmelamina carboquona diaziquona

grupos atractores de e - unidos a la aziridina las hacen

menos reactivas

(43)

43

metansulfonatos

H 3 CO 2 SO OSO 2 CH 3 n

n = 1 a 8

n = 4 busulfan

entrecruzamiento intra-cadena

H

3

CO

2

SO

OSO

2

CH

3

Nu (N-7 G)

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(44)

44

drogas alquilantes de uso

clínico

(45)

45

KM-2210

O O

O

PhOCO

O

N

Cl

Cl 3

OH

O N

O Cl

Cl

estramuslina (estracyst)

cáncer prostático

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(46)

46

nitrosoureas

R

N N

H O

N O

R

Cl Cl carmustina - BCNU

Cl lomustina - CCNU

Cl semustina - MeCCNU

OCH

3

(47)

47

nitrosoureas

ác. isociánico

especie reactiva

R

N O

O

N O

nitrosouretanos

toxicidad

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(48)

48

nitrosoureas

(49)

49

nitrosoureas

produce entrecruzamiento inter-cadena C G

carmustina

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(50)

50

nitrosoureas

(51)

51

triazenos

N N H

CONH 2

N N N

dacarbazina

Requiere activación inicial: demetilación

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(52)

52

Complejos de platino

H 3 N Pt

Cl

H 3 N Cl O

O

O

O H 3 N

Pt H 3 N

cisplatina

carboplatina

entrecruzamiento intra-cadenas, mayormente a

través de N-7 G

(53)

53

Drogas que escinden cadenas de ADN

-irreversibles-

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas Bleomicina

Antibióticos antitumorales endiinos

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(54)

54

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

- reacción con topoisomerasa II - transferencia electrónica

OCH3 O

O

OH

OH

O

X OH

H O O OHNH3

9 D A

X = OH doxorubicina (adriamicina)

X= H daunorubicina

(55)

55

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

transferencia de un e

-

para producir el radical A, que a su vez genera O

2-

A .

A

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(56)

56

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

o A .

A

ruptura

(57)

57

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

- reacción con topoisomerasa II - transferencia electrónica

- formación de un complejo férrico

OCH3 O

O

OH

OH

O

X OH

H O O OHNH3

9 D A

X = OH doxorubicina (adriamicina)

X= H daunorubicina

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(58)

58

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

A A

A A

ruptura

el complejo férrico se une al ADN (por un mecanismo

no intercalante) mucho más fuertemente

(59)

59

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

- reacción con topoisomerasa II - transferencia electrónica

- formación de un complejo férrico

- generación (por reducción) de un aceptor de Michael

OCH3 O

O

OH

OH

O

X OH

H O O OHNH3

9 D A

X = OH doxorubicina (adriamicina)

X= H daunorubicina

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(60)

60

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

mecanismo de la generación (por reducción –2 e - -)

de un aceptor de Michael que reacciona con el ADN

(61)

61

Antibióticos antitumorales tipo antraciclinas

mecanismos de resistencia:

- aumento de expulsión de la droga de la célula - aumento de los procesos de reparación

- aumento del contenido de –SH (glutatión)

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(62)

62

Bleomicina BLM

Streptomyces verticillus

BLM-A 2

(63)

63

Bleomicina BLM

Complejo BLM -Fe (II) - O 2

mecanismo de acción

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(64)

64

Bleomicina BLM

produce rupturas de simple y doble cadena

mecanismo de acción

(65)

65

Bleomicina BLM

mecanismo de acción

ruptura de ADN por BLM activada

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(66)

66

Bleomicina BLM

mecanismo de acción

ruptura de ADN por BLM activada

C > T > A > G

(67)

67

Antibióticos antitumorales endiinos

neocarzinostatina

esperamicinas calicheamicinas

dinemicinas

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(68)

68

Antibióticos antitumorales endiinos

Mecanismo de acción:

1) parte de la molécula se intercala en el surco menor

2) un –SH o NADPH dispara una reacción que genera radicales

(69)

69

Antibióticos antitumorales endiinos

neocarzinostatina

esperamicinas calicheamicinas

dinemicinas

surco menor

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(70)

70

Antibióticos antitumorales endiinos

activación de las esperamicinas y calicheaminas

reordenamiento

de Bergman

(71)

71

Antibióticos antitumorales endiinos

neocarzinostatina

esperamicinas calicheamicinas

dinemicinas

intercalante

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(72)

72

Antibióticos antitumorales endiinos

activación de dinemicina A

–mecanismo reductivo-

(73)

73

Antibióticos antitumorales endiinos

activación de dinemicina A –mecanismo nucleofílico-

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(74)

74

Antibióticos antitumorales endiinos

neocarzinostatina

esperamicinas calicheamicinas

dinemicinas

intercalante

(75)

75

Antibióticos antitumorales endiinos

activación de neocarzinostatina (zinostatina)

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(76)

76

Antibióticos

antitumorales endiinos

corte en la cadena de ADN activada por neocarzinostatina

80 %

(77)

77

Antibióticos antitumorales endiinos

corte en la cadena de ADN activada por neocarzinostatina (NCS) y otros endiinos

H+ H+

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

(78)

78

Antibióticos antitumorales endiinos

neocarzinostatina

esperamicinas calicheamicinas

dinemicinas

T > C > A > G C >> T > A = G

T > A > C > G

G

(79)

79

-The Organic Chemistry of Drug Design and Drug Action. R. B. Silverman. Academic Press. 1992.

-Introduction to Medicinal Chemistry. How Drugs Act and Why. A. Gringauz. Wiley-VCH. 1997.

-An introduction to Medicinal Chemistry. Graham L. Patrick. Oxford University Press. 2º Ed. 2001.

-Foye´s principles of Medicinal Chemistry. D. A. Williams, T. L. Lemke, W. O. Foye. 5º Ed. 2002.

-Medicinal Chemistry. An introduction. G. Thomas. John Wiley & Sons.2000.

-Enzymes: A practical introduction to Structure, Mechanism and Data Analysis. R. A. Copeland.

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-Drug Targeting Organ-Specific Strategies. Ed. G. Molema, D. K. F. Meijer. Wiley. 2001.

-Enzyme Systems that metabolize drugs and other xenobiotics. Ed. C. Ioannides. Wiley. 2001.

-Pharmacokinetics and Metabolism in Drug Design. D. A. Smith, H. van der Waterbeemd, D. K.

Walker. Wiley-VCH Verlag GmbH. 2001.

-The Practice of Medicinal Chemistry. C. G. Wermuth, Academic Press. 1996.

-A Textbook of Drug Design and Development. P. Krogsgaard-Larsen, T. Liljefors y U. Madsen.

2da edición. Harwood Academic Publishers. 1996.

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

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