Simposio Subregional de Nuevas Vacunas: Neumococo, Rotavirus y HPV. Epidemiologia Molecular de los Rotavírus

(1)

Simposio

Subregional

de Nuevas Vacunas:

Neumococo,

Rotavirus

y HPV

Epidemiologia

Molecular de los

Rotav

í

rus

Jos

é

Paulo

Gagliardi

Leite

Laboratorio de Virolog

í

a Comparada

Laboratorio de Referencia Regional para

Rotav

í

rus

IOC

–

FIOCRUZ

-

MS

“A scientist who is also a human being

cannot rest while knowledge which might

reduce suffering rests on the shelf.”

(2)

Parashar et al., 2006

Distribución mundial estimada de las 600.000 muertes anuales

provocadas por la infección de Rotavirus

Distribución mundial estimada de las 600.000 muertes anuales

provocadas por la infección de Rotavirus

1 punto = 1000 muertes

(3)

• La incidencia de la enfermedad provocada por Rotavirus es similar en países

en desarrollo como en países desarrollados

• La mejora de las condiciones sanitarias no reduce la incidencia de la

enfermedad.

• Diversidad de cepas circulantes:

PAISES EN DESARROLLO

>

PAISES DESARROLLADOS

• Es necesario vacunas para prevenir casos graves de gastroenteritis

asociados a Rotavirus

• POR LO CUAL, ES IMPRECINDIBLE ESTUDIAR LOS ASPECTOS

EPIDEMIOLOGICOS Y MOLECULARES DE LOS ROTAVIRUS CIRCULANTES

Otros

virus

Otros virus

Bacterias

_Bacterias

Rotavirus

Países

Desarrollados

Desconocido

_Desconocido

_Rotavirus

A. Kapikian, Fields Virology 2003

Países en

Desarrollo

(4)

Familia:

Reoviridae

Genero:

Rotavirus

Grupos:

A- G

Partícula viral:

70 -80 nm, sin envoltura

lipidia, simetría

icosaédrica, con triple

envoltura proteica.

Genoma:

ARN doble hebra

11 segmentos

Proteínas:

6 estructurales (VP)

6 no-estructurales (NS)

NSP4: enterotoxina viral (segmento 10)

Barth, 2006

Modificado de Estes, 2001

(5)

CLASIFICACIÓN BINARIA PARA

ROTAVIRUS DEL GRUPO A

:

GENOTIPOS

P

y

G

/ SEROTIPOS

VP4

VP7

SEROTIPOS

P1A[8],

P1B[4],

P2A[6],

P1A[8],

G1

G2

G3

G4

GENOTIPOS

Modificado de Estes, 2001

9

4

(6)

GENOTIPOS DE RV-A

Genotipos P: 28

Genotipos G: 16

Cepas comunes:

P[8]G1, P[8]G3, P[8]G4, P[4]G2, P[8, 4 ou 6]G9

(recientemente)

Cepas “raras”:

G5, G8, G10, G12

P6, P9, P10

Humanos

Martella et al., 2006; Gulati et al., 2007; Khamrin et al., 2007; Steyer et al., 2007

(7)

Santos &

Hoshino

, 2005

(8)

(9)

(10)

Transmisión

Interespecie

Humanos

(11)

TRANSMISIÓN INTERESPECIE Y

REORDENAMIENTOS

• Infecciones Heterólogas

• “Reordenamientos” de cepas RV-A humanas

- Combinación de antígenos P y G

• Rol de RV animales en la diversidad

- Ejemplos de transmisión interespecie

- RV reordenados Humanos-Animales

AU-1, Ro-5829 (P3[9]G3) Japan, Israel (11 FE)

116E (P8[11]G9) India (10 HU/1 BO)

Eg2295 (P[14]G8) Egypt (BO/LA/HU?)

Br1054 (P[8]G5) Brazil (8 HU/3 PO ?)

(12)

Que esta ocurriendo?

(13)

Serotipo Emergente :

regionalmente [G5]

en Brasil

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA

DE CEPAS CIRCULANTES Y ESTUDIOS MOLECULARES (2)

Leite et al., 1996; Gentsch et al., 2005

(14)

• Amplia diversidad de genotipos e infecciones mixtas

(países desarrollados

y en desarrollo)

• Serotipos emergentes :

globalmente: [G9]

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA

DE CEPAS CIRCULANTES Y ESTUDIOS MOLECULARES

Gentsch et al, 2005

(15)

Molecular and Serological Characterization of Group A Rotavirus

Isolates Obtained from Hospitalized Children in Goiânia, Brazil, 1998–

2000.

M. B. L. D. Souza, M. L. Rácz, J. P. G. Leite, C. M. A. Soares, R. M. B.

Martins, V. Munford and D. D. P. Cardoso.

Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2003, 22(7):441-3.

EMERGENCIA DE ROTAVIRUS GRUPO A GENOTIPO

G9 EN BRASIL

(16)

Modificado de Santos & Hoshino, 2005

DISTRIBUCI

Ó

N TEMPORAL DE RV

-

A GENOTIPO

G5 EN RIO DE JANEIRO, BRASIL

(17)

Seasonal distribution of G-Types of

Paraguayan rotaviruses isolated between

1998 and 2005.

Parra et al., J Med Virol, 2005

Parra et al., J Clin Virol, 2007

0

10

20

30

40

50

60 1998

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

Years

N

o

. d

e

sa

m

p

le

s

G1

G2

G4

G9

(18)

(19)

(20)

VP8*

CAD:

Community-Acquired Diarrhea

(21)

(22)

Phylogenetic analysis of VP7 nucleotide sequences of

genotype G4 strains isolated in Paraguay and worldwide

Parra et al., J Med Virol, 2005

Bok, et al., J Clin Microb, 2002

SA442/86 SA111/86 SA828/86 ItalyA ST3 JapHochi JapOdelia

Sublineage Ia

ArgRes1723 ArgBA1239 ArgMen1734 ArgTuc737 ArgMen1741 ArgRos987 ArgRes1724 ArgTuc1594 ArgTuc1620 ArgTuc1650

Sublineage Ib

Mvd9907 ArgBA958 Mvd9905 Py98102 ArgUsh2037 Py99355 Py99348 Py99449

Sublineage Ic

Sublineage Id

ArgSF928 Gottfried ItalyD ItalyC ItalyB

Lineage II

1 0 0 8 9 9 3 9 9 9 5 1 0 0 7 8 9 9 9 3 7 5 9 8 0 .0 2

Atypical strain, with characteristics from

sublineage Ic. Later on reported as the first

intragenic recombinant strain (Parra

et al

., 2004)

VR5(A) VR7(B) VR8(C) 87 100 141 150 208 224 Gottfried SEAPTQINDNEWKD LIRFASGEEL QTTNTATFETVADSEKL Py99348-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py99355-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py99449-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py02SR1-LIc ...S.T.... ..K.T.A... ...I... Py02SR7-LIc ...S.T.... ..K.T.A... ...I...

(23)

PREGUNTAS IMPORTANTES:

¾

DIFERENCIAS ENTRE “SALVAJES” Y VACUNADOS?

¾

IMUNIDAD DE REBAÑO?

¾

LIBERACIÓN DE PARTÍCULAS VIRALES : ≥7 DS ?

¾

El

NUMERO DE CASOS DE DIARREA ESTA

DISMINUYENDO

? Otros virus?

¾

COLECTAR MUESTRAS DESPUES DE LA VACUNACIÓN

¾

G2? VARIANTES DE G1?

Jin Qi et al, 1996: RRV-TV y RRV-S1 (G1):

Sorología – 49 y 64%, respectivamente.

Ya se identificaron por lo menos 4 linajes de G1

en USA

(24)

FIG. 2. Phylogenetic tree obtained from nucleotide sequences of group A

rotavirus G1 VP7 genes. Reference group A rotavirus strains were selected

from GenBank (accession numbers are indicated in the text). The scale

indicates nucleotide substitutions per position. The numbers in the branches

indicate the bootstrap values. *, sublineage containing rotavirus detected in

this study.

(25)

Phylogenetic analysis of VP7

nucleotide sequences of

genotype G1 strains isolated

in Paraguay

Py03IPN144

Py03SR6Ad

Py03IPN148

Py03IPN113

Py03SR286

Py03SR326

Py02SR43

Py02SR11

Py03SR139

ItalyPAF166-94

Rus1407-84

Lineage I I b

AU007

Py03SR124

ItalyPA2-04

ItalyPA5-03

ItalyPA9-03

Lineage I I c

Py99365

Italy90-PA389-00

ItalyPA378-00

ItalyPA164-99

ItalyPA33-99

Lineage I I d Lineage I I a Lineage I V

ItalyPA5-90

ItalyPA78-89

ItalyPA10-90

Lineage V

Ban59

Aus94A

Aus95C

Py99419

WD33

Mvd9901

Mvd9906

Aus94C

Aus94B

Mvd9816

Py9856

Mvd9705

Py9855

Lineage I Lineage I I I Lineage VI

JpnAu19

PorcineC60

PorcineC95

Lineage VI I 100 99 99 99 73 71 74 68 100 93 96 87 86 77 76 81 89 67 83 98 0.02

Atypical lineage detected during 2003

Parra et al., J Med Virol, 2005

Parra et al., J Clin Virol, 2007

(26)

(27)

(28)

(29)

(30)

(31)

G2P[4] was detected circulating in other

Latin America countries!

(32)

(33)

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA

EPIDEMIOLOGICA DE CEPAS

CIRCULANTES Y ESTUDIOS

MOLECULARES !

(34)

Lancet. 2007 Nov 10;370(9599):1592-3.

Effect of city-wide sanitation programme on reduction

in rate of childhood diarrhoea in northeast Brazil: assessment by two cohort

studies.

Barreto ML

,

Genser B

,

Strina A

,

Teixeira MG

,

Assis AM

,

Rego RF

,

Teles CA

,

Prado MS

,

Matos SM

,

Santos DN

,

dos Santos LA

,

Cairncross S

.

FINDINGS: we estimated an

overall diarrhoe prevalence

reduction of 22% (19-26%).

INTERPRETATION: Our results

show that urban sanitation is a

highly effective health measure

that can no longer be ignored,

and they provide a timely support

for the launch of 2008 as the

(35)

(36)

VPSRMA-Fiocruz/MS

Phone/Fax: 5521-2560 2921

jpgleite@ioc.fiocruz.br

Instituto Oswaldo Cruz

Laborat

(37)