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Taller. Macromoléculas

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(1)

Taller

Macromoléculas

(2)

EL EXPERIMENTO DE STANLEY MILLER (II)

En experimentos posteriores se han utilizado atmósferas que contienen CO

2

,

soluciones acuosas con ácido cianhídrico (HCN) y ácido fórmico (HCNO) y energía

de rayos X, rayos γ, ultrasonido y/o radiación α y β y se han podido obtener hasta

10 aminoácidos, 4 bases nitrogenadas, ácidos tricarboxílicos, ácidos grasos de

hasta 10 carbonos y polisacáridos lineales y ramificados que contienen pentosas

y hexosas

(3)

ACTIVIDAD CATALITICA DEL RNA

Hace algunos años se determinó que una molécula de RNA, la cual puede plegarse y adoptar estructuras secundarias (dominios tipo horquilla) y terciarias (dominios espaciales) es capaz de promover su propia síntesis y el corte de su secuencia de manera dirigida (actividad catalítica del RNA).

Además, existen RNAs como los tRNAs capaces de “cargar” aminoácidos por lo que también los RNAs pueden promover la síntesis de proteínas.

aa

tRNA cargado con aminoácido

aa

(4)

EL AGUA EN LAS CELULAS

El principal componente de todas las células es el agua (70% del peso total)

por lo que es el solvente universal con el que tienen que interactuar todas

las biomoléculas (proteínas, ácidos nucleicos, azúcares y lípidos)

(5)

EL AGUA Y LA UNION PUENTE HIDROGENO

(6)

FORMACION DE PUNTES DE HIDROGENO DEL

AGUA CON DISTINTOS GRUPOS ORGANICOS

(7)

MOLECULAS POLARES, APOLARES Y AMFIPATICAS

(8)
(9)

Síntesis de macromoléculas

(10)

Condensación e hidrólisis

condensacion H2O

(11)

CARBOHIDRATOS

CARBOHIDRATOS

(12)

Funciones generales:

Energía: La oxidación de los carbohidratos es la principal ruta de obtención de energía en la mayoría de las células.

Estructural: Polímeros insolubles de carbohidratos actúan como elementos estructurales y de protección en las paredes celulares de

Carbohidratos

elementos estructurales y de protección en las paredes celulares de bacterias y plantas, y en los tejidos conjuntivos y envolturas celulares animales.

Información: Polímeros de carbohidratos, unidos covalentemente a

proteínas o lípidos, actúan como señales que determinan la

localización intracelular o el destino metabólico de éstos.

(13)

CLASIFICACION POR NUMERO DE SUBUNIDADES

MONOSACARIDOS: azúcares simples de una sola subunidad. En la naturaleza los más comunes son la glucosa, la galactosa y la manosa OLIGOSACARIDOS: cadenas de 2 a 100 unidades de azúcares. En la OLIGOSACARIDOS: cadenas de 2 a 100 unidades de azúcares. En la naturaleza los más comunes son los disacáridos, como la sacarosa

POLISACARIDOS: cadenas de cientos hasta miles de unidades de

azúcares que pueden ser lineales o ramificadas. En la naturaleza los

más comunes son la celulosa y el almidón

(14)

LA UNIDAD MINIMA DE UN AZUCAR

Los azúcares son esencialmente polihidroxialdehidos y polihidroxicetonas

(15)

D-ALDOSAS Y D-CETOSAS

(16)

Carbohidratos

Fórmula general; (CH

2

O)n, glucosa; C

6

H

12

O

6

En solución adquieren conformación cíclica

(17)

Enlace glucosídico

• 2 monosacáridos unidos

• maltosa (glucosa a 1,4 glucosa),

• lactosa (galactosa b1,4 glucosa) y

• sacarosa (glucosa a 1, 2 fructosa, en el

dibujo)

(18)

Disacáridos Carbohidratos

Maltosa (glucosa-glucosa) Lactosa (galactosa-glucosa)

Glucosa-fructosa

(19)

ESTRUCTURA DE POLISACARIDOS

Los polisacáridos no tiene un peso molecular definido (a diferencia de las proteínas que son decodificadas desde de un RNAm) porque dependen de la actividad de las enzimas que los sintetizan, las cuales son reguladas post-trancripcionalmente (por fosforilación, en general). Cada tipo de unión O- glicosídica es realizada por una enzima específica.

(20)

Polisacáridos

(21)

LIPIDOS

LIPIDOS

(22)

Los lípidos poseen estructuras químicas diversas, y su característica común es su insolubilidad en agua.

Funciones generales:

Energía: En muchos organismos las grasas y aceites son las formas principales de almacenamiento energético.

Lípidos

almacenamiento energético.

Estructural: Componen las membranas biológicas.

Comunicación: Algunas hormonas y mensajeros intracelulares.

Catalítica: Algunos son co-factores enzimáticos de reacciones químicas en la

célula.

(23)

Ácidos grasos

Hidrofóbica

Lípidos

Ácido graso saturado

Ácido graso

insaturado

(24)

Saturado C 4:0

Lípidos

Insaturado

Los ácidos grasos insaturados aportan más fluidez a la membrana.

C 16:1 n-7

(25)

NOMENCLATURA

El carbono 1 de la cadena hidrocarbonada es el ácido carboxílico. La mayoría de los ácidos grasos naturales tienen entre 12 y 22 carbonos, presenta entre2 y 4 insaturaciones muchas veces en posición 9, 12 y 15 y estos dobles enlacesnunca están conjugados

Para nombrar un ácido graso se indica primero el número de carbonos de la cadena hidrocarbonada, seguido de dos puntos (:) y el número de dobles enlaces, luego entre paréntesis se agrega una delta (Δ) y en

1

dobles enlaces, luego entre paréntesis se agrega una delta (Δ) y en superíndice la posición de los carbonos que presentan los dobles enlaces ej. Los ácido linoleico y linolénico de membrana de células vegetales corresponden a C18:2 (Δ9,12) y C18:3 (Δ 9, 12, 15), respectivamente. Elácido araquidónico (AA) de la membrana de células animales corresponde a C20:4 (Δ 5, 8, 11, 14). Este ácido graso no es sintetizado por células animales sino que se obtiene de la dieta. El AA se acumulan en aceites de pescado pero son primariamente sintetizados pormicroalgas marinas

(26)

•saturados

• insaturados

“ Grasas saturadas: formadas mayoritariamente por ácidos grasos saturados. Aparecen por ejemplo en el tocino, en el sebo, en las mantecas de cacao o de cacahuete, etc. Este tipo de grasas es sólida a temperatura ambiente

Grasas insaturadas: formadas principalmente por ácidos grasos insaturados como el oleico o el palmitoleico. Son líquidas a temperatura ambiente y comúnmente se les conoce como aceites. Pueden ser por ejemplo el aceite de oliva, de girasol, de maíz.

Las grasas insaturadas pueden subdividirse en:

Grasas trans: Se obtienen a partir de la hidrogenación de los aceites vegetales, por lo cual pasan de ser insaturadas a saturadas, y a poseer la forma espacial de trans, son altamente aterogénicas y pueden contribuir a elevar los niveles de lipoproteínas LDL y los triglicéridos, haciendo descender peligrosamente los niveles de lipoproteínas HDL.

(27)

Triglicéridos

(28)

Fosfolípidos

(29)

LOS LIPIDOS DE MEMBRANA

(30)

LOS FOSFOLIPIDOS MAS ABUNDANTES EN LA MEMBRANA

En las membranas de células animales, los principales fosfolípidos (más del 50%) son la

fosfatidilcolina (PC), fosfatidiletanolamina (PE), fofatidilserina (PS) y la esfingomielina (SM). Sólo

la PS tiene carga negativa en la región polar y los otros son neutros a pH=7.0. El fosfatidilinositol

es un fosfolípido de membrana más escaso pero tiene gran importancia en la transducción de

señales del medio externo hacia el interno de la célula.

(31)

Formación de bicapas lipídicas

Lípidos

(32)

Estructuras de fosfolípidos Lípidos

Micela Liposoma

Bicapa de fosfolípidos

(33)

LOS ANTIGENOS SANGUINEOS

GLICO-ESFINGOLIPIDOS

GLICO-ESFINGOLIPIDOS

(34)

EL COLESTEROL Y LOS ESTEROLES

Los esteroles son todos derivados del colesterol el cual es sintetizado por condensación de unidades de isopreno. El

colesterol es una molécula planar que se intercala entre los fosfolípidos aumentando la rigidez de la membrana y

dismuyendo su fluidez

(35)

HORMONAS ESTEROIDALES

(36)

VITAMINA D

La vitamina D regula el metabolismo del calcio y fosfato en animales. El primer paso en la vía de síntesis de la vitamina D es la transformación del colesterol en colecalciferol a nivel de la piel y requiere la luz UV del sol. Luego, el y requiere la luz UV del sol. Luego, el colecalciferol debe sufrir dos hidroxilaciones, una en el hígado y otra en el riñón para originar el 1,25 dihidroxi-colcalciferol que es la vitamina D activa.

Vitamina D3 activa es 1,25 dihidroxicolecalciferol

(37)

ÁCIDOS NUCLEICOS

ÁCIDOS NUCLEICOS

(38)

Nucleótidos y ácidos nucleicos

Funciones generales:

- Energética: Es la moneda energética (ATPADPAMP) en las transacciones metabólicas (catabolismo, anabolismo).

- Catáliticos: Son componentes estructurales de una gran variedad de cofactores enzimáticos e intermediarios metabólicos (NADH, FADH

2

).

- Información: Constituyen un vínculo escencial en la respuesta de las células a hormonas

y a otros estímulos extracelulares. Por último, pero ciertamente no menos importante, son

los constituyentes de los ácidos nucleicos: ácido desoxirribonulceico (DNA) y ácido

ribonucleico (RNA), que son los depositos moleculares de la información genética.

(39)

O N

N N

N N H 2

C H 2 O

-O P O

-

Los ácidos nucleícos:

Secuencia de

Ácidos nucleicos

O N

O H O H

O -

H

H H

P e n t o s a B a s e

N u c l e ó s i d o F o s f a t o

N u c l e ó t i d o

Secuencia de Nucleótidos Almacenamiento y

Expresión de la

información genética

(40)
(41)

Pentosas Ácidos nucleicos

Acido ribonucleico (RNA)

Acido desoxirribonucleico (DNA)

Ribosa 2- Desoxiribosa

(42)

Los nucleótidos estan unidos covalentemente a través de enlaces fosfodiéster

Ácidos nucleicos

Grupo hidroxilo en 5´ está unido al hidroxilo 3´ del

nucleótido siguiente a través

del enlace fosfodiéster.

(43)

A G C T

Hombre, H.sapiens 0.29 0.18 0.18 0.31

Composición en bases del DNA en algunas especies

Ácidos nucleicos

Hombre, H.sapiens 0.29 0.18 0.18 0.31

Bovino, Bos taurus 0.26 0.24 0.23 0.27

Levadura, S.cerevisiae 0.30 0.18 0.15 0.29

Mycobacterium sp. 0.12 0.28 0.26 0.11

(44)

Puentes de hidrógeno

Figura 3: Estructura molecular básica del ADN.

(45)

Estructura helicoidal del DNA

- Estabilizada por puentes de hidrógeno.

- La distancia entre dos bases nitrogenadas es de 3.5 A°

nitrogenadas es de 3.5 A°

- Cada vuelta tiene 10 bases nitrogenadas

- El tamaño de cada vuelta es de 34 A°

(46)

Estructura del DNA

- Doble hebra antiparalela:

3

´ 5

´3´ 5´

- Ambas cadenas están unidas a través de puentes de hidrógeno que se forman entre las bases nitrogenadas.

- Adenina y Timina se unen por 2 puentes de hidrógeno

- Citosina y Guanina se unen por 3

puentes de hidrógeno.

(47)

Estructura del RNA mensajero

Ácidos nucleicos

(48)

Estructura y tipos de

Estructura y tipos de ARNs ARNs

Estructura ARN

(49)

Comparaci

Comparació ón entre ADN y ARN n entre ADN y ARN

Ácidos nucleicos

(50)

PROTEINAS

PROTEINAS

(51)

ESTRUCTURA GENERAL DE LOS AMINOACIDOS

Los 20 aminoácidos de las proteínas son α-aminoácidos ya que tienen el grupo amino y el carboxílico en el carbono α

El grupo R o cadena lateral es lo que los diferencia y les otorga las propiedades fisicoquímicas (tamaño, carga y solubilidad). Los carbonos de la cadena lateral son designados por las letras griegas ß, γ, δ y ε

la cadena lateral son designados por las letras griegas ß, γ, δ y ε

(52)

Aminoácidos

Proteínas

(53)

Enlace Peptídico

Proteínas

(54)

Proteínas

• Covalente simple

• De desprende una molécula de agua

• Los aá se unen a CH y forman glicoproteínas.

Estructura primaria

(55)

Estructura secundaria:

Proteínas

Alfa hélice Hoja beta plegada

(56)

c) Estructura Terciaria

• Permite a la proteína formar su estructura nativa =>

funcional.

• Estabilizada por puentes de H, interacción hidrofóbica y puentes disulfuro.

Proteínas

puentes disulfuro.

• Presentan dominios (polipéptido que se conserva)

(57)

Estructura cuaternaria: unión de dos o más polipéptidos

(58)

ESTRUCTURAS TERCIARIAS Y DOMINIOS FUNCIONALES

(59)

DENATURACION DE PROTEINAS

Denaturacion con agente caotrópico como la

urea permite renaturación Agentes desnaturantes que no permiten

renaturación

(60)
(61)

Macromoléculas

Polímero Monómero Ej. Monómero Ejj. polímero Enlace principal función

Carbohidratos

aminoácidos

ADN y ARN

(62)

Origen de la vida

(63)

LA TEORIA DE OPARIN

En

1922

, el bioquímico ruso Alexander Oparin publicó un libro que exponía su teoría sobre el origen de la vida en la sopa primordial prebiótica La teoría postulaba que la atmósfera primitiva de la tierra estaba compuesta por gases como metano (CH

4

), amoníaco (NH

3

), hidrógeno (H

2

) y vapor de agua, estaba en contacto con el agua de los agua, estaba en contacto con el agua de los océanos que aún estaban calientes, y expuesta a intensas lluvias, tormentas eléctricas y una fuerte radiación UV

En esta atmósfera primitiva se habrían originado

las primeras moléculas biológicas por condensación

de gases que aportaban el carbono, nitrógeno y

oxígeno y con la energía de la radiación UV y

eléctrica

(64)

Paisaje hipotético de era prebiótica

(65)

EL EXPERIMENTO DE STANLEY MILLER (I)

En 1953, los científicos americanos Harold Urey y Stanley Miller realizaron, en base a lo descrito por Oparín, un experimento de simulación de la atmósfera primitiva caliente (80ºC) y luego de varias semanas recolectaron y analizaron los compuestos sintetizados

Con sorpresa, detectaron algunos aminoácidos

simples (glicina, alanina, ác. aspártico), algunos

ácidos orgánicos (cianhídrico, fórmico, acético,

láctico), urea y otros compuestos orgánicos

simples (formaldehido y sarcosina)

(66)

Tiempo de aparición de organismos

Referencias

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