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1 clase Quimica organica I semestre Biologia

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(1)

QUÍMICA ORGÁNICA

(2)

Origen de la vida

- Se remontan a una tierra primitiva rodeada de una atmósfera de metano, agua, amoniaco e hidrógeno. - La energía – radiación del sol, descargas de

(3)

https://youtu.be/B-m1gx0s0Ro

(4)

Química orgánica básica

La química orgánica es el estudio de los compuestos de carbono.

- Los átomos de carbono son únicos en su habilidad:

- De formar cadenas muy estables y anillos

- De combinarse con otros elementos tales como hidrógeno, oxígeno, nitrógeno, azufre y fósforo.

(5)

HISTORIA

El término “química orgánica" fue introducido en 1807 por Jöns Jacob Berzelius, para estudiar los compuestos derivados de recursos naturales. Se creía que los compuestos relacionados con la vida poseían una “fuerza vital” que les hacía distintos a los compuestos inorgánicos, además se consideraba imposible la preparación en el laboratorio de un compuesto orgánico, lo cual se había logrado con compuestos inorgánicos.

(6)

En 1928, Wöhler observó al evaporar una disolución de cianato

de amonio, la formación de unos cristales incoloros de gran tamaño, que no pertenecían al cianato de amonio. El análisis de los mismos determinó que se trataba de urea.

La transformación observada por Wöhler convierte un

compuesto inorgánico, cianato de amonio, en un compuesto orgánico, la urea, aislada en la orina de los animales.

(7)

En el siglo XVII los químicos obtuvieron nuevos compuestos, es así que Rovelle en 1773 mediante extracciones sucesivas con agua y luego con etanol, aisló la úrea de la orina. Cari Scheele, un farmaceuta sueco implemento las técnicas para manipular compuestos orgánicos sensibles, aislando (1775-1785) los ácidos naturales: tartárico de las uvas, cítrico de los limones y úrico de la orina, a través de su conversión en sales insolubles de calcio y magnesio.

(8)

Importancia de la Química

Orgánica en la Biología

(9)

Importancia de la Química

Orgánica en la Biología

La química orgánica estudia los compuestos que contienen carbono y algunos de ellos constituyen los productos químicos centrales de los seres vivos.

Ejemplo:

(10)

Importancia de la Química

Orgánica en la Biología

(11)

QUíMICA ORGÁNICA

• El estudio de la química orgánica parte del estudio del elemento Carbono.

• El CARBONO es parte fundamental y soporte de los organismos vivos, porque proteínas, ácidos nucleicos, carbohidratos, lípidos y otras moléculas esenciales para la vida contienen carbono

• El movimiento global del carbono entre el ambiente abiótico y los organismos se

(12)

CICLO DEL CARBONO

• 1.El dióxido de carbono de la atmósfera es absorbido por las plantas y convertido en azúcar, por el proceso de fotosíntesis.

• 2. Los animales comen plantas y al descomponer los azúcares dejan salir carbono a la atmósfera, los océanos o el suelo.

• 3.Bacterias y hongos descomponen las plantas muertas y la materia animal, devolviendo carbono al medio ambiente.

• 4. El carbono también se intercambia entre los océanos y la atmósfera. Esto sucede en ambos sentidos en la interacción entre el aire y el agua

(13)

EL CARBONO EN EL AMBIENTE

• Los compuestos del C que implican perjuicio en el ambiente

Concentración CO CH4

Pre-industrial

Tasa actual de incremento

280 ppm 353 ppm

0.8 ppm 1.72 ppm Tasa actual de incremento 0.5% 0.9% Tiempo de vida 50 a 200 años 10 años Potencial de Calentamiento

Global

1 11

Contribución relativa al calentamiento global

(14)

EL CARBONO EN LA NATURALEZA

 Es un elemento no metálico que se presenta en formas muy variadas.

 Puede aparecer combinado, formando una gran cantidad de compuestos, o

libre (sin enlazarse con otros elementos).

CombinadoCombinado

En la atmósferaatmósfera: en forma de dióxido de carbono CO2

En la corteza terrestrecorteza terrestre: formando carbonatos, como la caliza CaCO3

 En el interior de la corteza terrestreinterior de la corteza terrestre: en el petróleo, carbón y gas natural

 En la materia viva materia viva animal y vegetal: es el componente esencial y forma parte de compuestos muy diversos: glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucléicos.

 En el cuerpo humano, por ejemplo, llega a representar el 18% de su masa.

(15)

Formas aleotrópicas del

carbono

OCHO ALEÓTROPOS DEL CARBONO

 DIAMANTE

 GRAFITO

 LONSDALEITA (diamante hexagonal)

Carbono vítreo

Carbono acetilénico lineal (LAC)  Carbono amorfo

 C60 (Buckminsterfulereno o buckybola)

 C70

(16)

Diamante

Cada átomo está unido a otros cuatro por fuertes enlaces químicos formando un tetraedro.

(17)

GRAFITO

• Constituyen una red hexagonal plana

• La forma más estable del carbono en condiciones estándares.

• A diferencia del diamante es buen conductor de la corriente eléctrica

• Es usado en termoquímica como el estado estándar para definir el calor de formación de los compuestos de carbono

(18)
(19)

¿Por qué razón, a diferencia del

diamante, el grafito es tan blando?

La explicación la da su propia estructura.

Romper la red de hexágonos es difícil,

pero separar las láminas resulta mucho

más fácil, dado que las fuerzas que las

unen son mucho más débiles que las

existentes entre los carbonos de una

(20)

• Esta diferencia entre ambas estructuras cristalinas marca también sus otras propiedades además de la dureza.

• El diamante es transparente y, cuando está libre de impurezas, también incoloro. El grafito, por el contrario, es negro

• El diamante es un aislante eléctrico perfecto, mientras el grafito es conductor gracias a que su red hexagonal permite el movimiento libre de los electrones por ella, algo que no es posible en los rígidos enlaces tetraédricos del diamante.

• El diamante es una joya, mientras el grafito se usa hasta en los lápices; esto último indica tanto la escasez de aquél como la abundancia de éste

(21)

Carbono Amorfo

• A escala macroscópica, el carbono amorfo no tiene una estructura definida, puesto que consiste en pequeños cristales irregulares, pero a escala nanomicroscópica, puede verse que está hecho de átomos de carbono colocados regularmente

• El carbono no tiene estructura cristalina, como con todos los materiales vítreos.

(22)

LONSDALEITA

Lonsdaleíta es un alótropo hexagonal del alótropo de carbono diamante, que se cree se forma a partir del grafito presente en los meteoritos al impactar sobre la Tierra. El gran calor y tensión del impacto transforman el grafito en diamante, pero reteniendo la estructura cristalina hexagonal del grafito.

(23)
(24)

Carbono acetilénico lineal (LAC)

• Carbino. Estructura química -(C≡C)n- como una cadena repetitiva.

• Los átomos de carbono en esta forma están dispuestos cada uno de ellos en una geometría lineal con hibridación sp

(25)

C60 (Buckminsterfulereno o buckybola)- 1985

El más importante de los fullerenos es

el C60, denominado así por contar con un total de sesenta átomos de carbono, los cuales forman una estructura constituida por 20 hexágonos y 20 pentágonos alternados, formando el balón de fútbol.

Por esta razón se ha denominado con

los informales nombres de futboleno o buckybola, aunque su nombre oficial, aparte del C60, es el de

buckminsterfulereno

(26)
(27)

Todos ellos tienen en común ser estructuras geométricas cerradas y tridimensionales, aunque a diferencia del diamante todos los átomos de carbono se sitúan sobre la superficie, dejando vacío el volumen interior.

(28)

Posible uso en medicina

Reacciones químicas exóticas,

aprovechando su capacidad para

enjaular en su interior átomos,

moléculas o iones de otros

elementos

o

compuestos

químicos.

(29)

NANOTUBOS DE CARBONO

Suomo Lijima en 1991.

La estructura de ambos es similar, pero a diferencia de los fullerenos los nanotubos no forman poliedros sino, como su nombre indica, tubos de tamaño nanométrico, un millón de veces menores que un milímetro.

(30)

NANOTUBOS DE CARBONO

Dependiendo de la manera en la que se enrollan, o del número de capas que los forman, existen diversos tipos de nanotubos:

Nanotubos monocapa: formados por una única capa, y a su vez se subdividen en varias categorías según sea la distribución geométrica de los hexágonos que la componen.

Los haces de nanotubos monocapa: serían algo así como un haz de macarrones -crudos

(31)
(32)

Los nanotubos, tienen ambos extremos abiertos.

(33)

Nanoespumas

• Descubiertas en 1997 por el equipo

encabezado por Andrei V. Rode.

• Tienen una estructura porosa o, por

decirlo con mayor propiedad, nanoporosa.

• Su densidad es muy baja, y su

(34)

Nanocilindros - 2005

Se sometió a los fullerenos a altas presiones (200 000 atmósferas) y altas temperaturas (2 200 oC), (equipo de

físicos alemanes encabezado por Natalia Dubrovinskaia) y se logró convertirlos en nanocilindros, pequeños hilos de unos pocos nanómetros de espesor.

(35)

Aparecieron en el 2007

Descritas por vez primera por un equipo de investigadores finlandeses formado por Esko Kauppinen, David Brown, Nasibulin Albert y Jiang Hua

Se pueden definir a las nanoyemas como estructuras híbridas entre los nanotubos y los fullerenos, con las estructuras poliédricas de los

segundos ancladas en las paredes de los primeros.

Sus propiedades físicas son asimismo una combinación de las de ambos, lo cual les proporciona interesantes expectativas de uso.

(36)

Elementos más importantes en los compuestos orgánicos:

El número de compuestos orgánicos naturales y sintéticos

conocidos en la actualidad sobrepasa los diez millones!!!.

Carbono Hidrógeno Oxígeno Nitrógeno

Azufre Fósforo Cloro Flúor Yodo Magnesio Molibdeno Hierro

 El hidrógeno, carbono, nitrógeno y oxígeno constituyen el

99.33 % de todos los átomos que forman los compuestos orgánicos.

Elementos en los compuestos orgánicos

Principales

(37)

Algunas características estructurales

de los compuestos orgánicos

• Las moléculas orgánicas:

– Pueden tener cadenas lineales o ramificadas

– Ser cadenas abiertas o cíclicas – Saturadas o insaturadas

(38)

• Enlaces sencillos,

saturados

• Enlaces

dobles

o

triples,

insaturados

(39)

¿Qué aspecto tienen?

• Pueden ser sólidos cristalinos,

aceites,

ceras,

plásticos,

elásticos, móviles o los líquidos

(40)
(41)

Moléculas orgánicas – Polímeros naturales

Caucho (latex)

Polisacáridos.

•Almidón.

•Celulosa.

Seda

(42)
(43)
(44)

Almidón

Es

el

segundo

polisacárido

más

abundante. Al ser triturado y tratado con

agua caliente se divide en 2 fracciones

principales según su solubilidad.

La enzima que hidroliza el almidón es la

La enzima que hidroliza el almidón es la

amilasa

(45)
(46)

Solanina

La solanina: es un triterpenoide presente en las papas que protege al tubérculo y en el hombre es inhibidor de colinesterasas, por lo que presenta gran toxicidad. Esta se presenta en la corteza verde de las papas.

(47)

Plásticos

• Polietileno

• PVC

• Baquelita

• Poliuretano

• Poliésteres….

Fibras textiles sintéticas

• Nylon, tergal…

Elastómeros (neopreno)

(48)

Aromas y Fragancias

• Empresas como la Internacional de Sabores y Fragancias (EE.UU.) o Givaudan-Roure (Suiza) en rangos muy grande de productos de química fina para el perfume, cosméticos, y las industrias alimentarias.

• Muchas de ellas provienen de petróleo, pero otros provienen de fuentes vegetales.

• Un perfume típico contiene una mezcla 5-10% en un fragancias de etanol / agua (alrededor de 90:10).

• Por lo tanto, la industria de perfumería necesita una gran cantidad de etanol y no mucho de perfume.

(49)

• Algunos compuestos aromatizantes son también los perfumes, y también pueden ser utilizado como un intermediario de otros compuestos.

(50)

Semejanzas y Diferencias?

(51)

EL CARBONO

Un átomo de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes con cuatro átomos diferentes como máximo.

Sus átomos pueden formar enlaces entre sí y así, formar cadenas largas.

(52)

Tetrahedro

La forma molecular es esencial

para comprender los fenómenos

que se presentan al nivel

molecular de la vida

(53)
(54)

¿Qué tienen de especial los

compuestos del carbono que

justifique su separación de los

otros elementos de la tabla

periódica?

Hay muchísimos compuestos del

carbono, y sus moléculas pueden

(55)

Características del Carbono

• Electronegatividad intermedia

– Enlace covalente con metales como con no metales

• Tetravalencia:

s2p2 s p

x py pz 400 kJ/mol

• (se desprenden 830 kJ/mol al formar 2 enlaces C–H)

• Tamaño pequeño, por lo que es posible que los átomos se aproximen lo suficiente para

formar enlaces “”, formando enlaces dobles y

triples (esto no es posible en el Si).

(56)

¿QUÉ TIENE DE ESPECIAL EL ÁTOMO

DE CARBONO?

KEKULÉ

Los átomos de carbono pueden unirse entre sí hasta grados imposibles para los átomos de cualquier otro elemento.

Pueden formar cadenas de miles de átomos o anillos de todos los tamaños; estas cadenas y anillos pueden tener ramificaciones y uniones cruzadas.

(57)

¿QUÉ TIENE DE ESPECIAL EL ÁTOMO

DE CARBONO?

Cada ordenamiento atómico diferente

corresponde a un compuesto distinto

Cada compuesto tiene su conjunto de

características químicas y físicas.

Hoy se conocen millones de compuestos

del carbono

(58)

TEORÍA ESTRUCTURAL

o

BASE sobre la cual se han acumulado

millones de hechos acerca de cientos de

miles

de

compuestos

individuales,

ordenándolos en forma sistemática.

(59)

TEORÍA ESTRUCTURAL

Es el marco de ideas acerca de cómo se

unen los átomos para formar moléculas.

Tiene que ver con el orden en que se

juntan los átomos y con los electrones que

los mantienen unidos.

(60)

TEORÍA ESTRUCTURAL

Nos revelan bastante acerca del compuesto cuyas moléculas representan; cómo proceder para hacerlo, qué propiedades físicas se pueden esperar de él ( punto de fusión, punto de ebullición, densidad, tipo de disolventes en que se disolverá el compuesto, si será coloreado o no, qué tipo de comportamiento químico esperar)

La clase de reactivos con los que reaccionará y el tipo de productos que formará, y si reaccionará rápida y lentamente.

(61)

Enlace Químico

(62)

ENLACE QUÍMICO

FUERZA QUE MANTIENE UNIDO LOS

ÁTOMOS DE UNA MOLÉCULA

– MECÁNICA CUÁNTICA 1926

• CAMBIOS EN LAS IDEAS SOBRE LA FORMACIÓN DE LAS MÓLÉCULAS

(63)

Tanto Kossel como Lewis basaron sus

ideas en el siguiente concepto del átomo

• Un núcleo cargado positivamente está rodeado de electrones ordenados en capas o niveles energéticos concéntricos.

• Hay un máximo de electrones que se pueden acomodar en cada capa:

– Dos en la primera, ocho en la segunda, dieciocho en la tercera, y así sucesivamente.

• La estabilidad máxima se alcanza cuando se completa la capa externa, como en los gases nobles.

(64)

ENLACE IÓNICO

Resulta de la transferencia de electrones

Ejemplo: la formación del fluoruro de litio.

Un átomo de litio tiene dos electrones en su capa interna y uno en su capa externa o de valencia; la pérdida de un electrón dejaría al litio con una capa externa completa de dos electrones.

Un átomo de flúor tiene dos electrones en su capa interna y siete en su capa de valencia; la ganancia de un electrón daría el flúor una capa externa completa con ocho electrones.

El fluoruro de litio se forma por la transferencia de un electrón del litio al flúor; el litio tiene ahora una carga positiva, y el flúor, una negativa.

(65)

Enlace iónico entre Cl y Na: formación del

(66)

ENLACE IÓNICO

Estructura cristalina del NaCl expandida para mayor claridad. Cada Cl- se

(67)

Redes iónicas

(68)

T de fusión alta

Conductividad eléctrica ( sólo en

estado líquido o en disolución

Solubilidad (sólo en disoluciones

polares)

Gran dureza

(69)

Es la unión de átomos por

compartición de electrones.

(70)

Diferentes tipos de enlace

covalente

• Enlace covalente normal:

–Simple

(71)

Tipos de enlace

Enlace simple: Los cuatro pares de electrones se

comparten con cuatro átomos distintos. Ejemplo:

CH4, CH3–CH3

Enlace doble: Hay dos pares electrónicos compartidos con el mismo átomo.

Ejemplo: H2C=CH2, H2C=O

Enlace triple: Hay tres pares electrónicos compartidos con el mismo átomo.

(72)

Al enlace ubicado en la región

intermolecular se le designa enlace

(73)

Enlace covalente dativo o coordinado

• Cuando el par de electrones compartidos

pertenece sólo a

uno

de los átomos se

presenta

un

enlace

covalente

coordinado o dativo

.

(74)

Enlace de átomos de azufre (S) y oxígeno (O)

Molécula de SO: enlace covalente doble

Molécula de SO2: enlace covalente doble y un enlace covalente

coordinado o dativo

:O ←

˙ ˙

˙ ˙

S ═ O:

˙ ˙

˙ ˙

Molécula de SO3: enlace covalente doble y dos enlaces covalentes coordinado o dativo

(75)

Polaridad del enlace covalente

• Enlace covalente apolar: entre átomos de idéntica electronegatividad (H2, Cl2, N2…). Los electrones compartidos pertenencen por igual a los dos átomos.

(76)

Moléculas covalentes

Moléculas polares

(HCl, H

2

O...) (dipolos

permanentes)

Moléculas apolares

(77)

Moléculas covalentes polares:

(78)

Moléculas covalentes apolares:

el centro geométrico de δ- coincide con el

centro geométrico de δ+

En el CO

En el CO22 existen enlaces covalentes polares y, sin existen enlaces covalentes polares y, sin embargo, la

embargo, la molécula covalente no es polarmolécula covalente no es polar. Esto . Esto es debido a que la molécula presenta una

es debido a que la molécula presenta una

estructura lineal y se anulan los efectos de los

estructura lineal y se anulan los efectos de los

dipolos de los enlaces C-O.

dipolos de los enlaces C-O.

O

O

C

C

O

O

δ+

(79)
(80)

Enlace metálico

• Las sustancias metálicas están formadas por átomos de un mismo elemento metálico (baja electronegatividad).

• Los átomos del elemento metálico pierden algunos electrones, formándose un catión o “resto metálico”.

• Se forma al mismo tiempo una nube o mar de electrones:

conjunto de electrones libres, deslocalizados, que no pertenecen a ningún átomo en particular.

• Los cationes se repelen entre sí, pero son atraídos por el mar de electrones que hay entre ellos. Se forma así una red metálica: las sustancias metálicas tampoco están formadas por moléculas.

(81)

El modelo del mar de electrones representa al metal como un conjunto de cationes ocupando las posiciones fijas de la red, y los electrones libres moviéndose con facilidad, sin estar confinados a ningún catión específico

(82)

Propiedades sustancias metálicas

• Elevados puntos de fusión y ebullición

• Insolubles en agua

• Conducen la electricidad incluso en estado

sólido (sólo se calientan: cambio físico).

– La conductividad es mayor a bajas temperaturas.

• Pueden deformarse sin romperse

(83)

electronegatividad

determina

puede darse entre Átomos diferentes

En los cuales

La diferencia de E.N.

iónico Diferente de cero

covalente polar

y el enlace puede ser

mayor que 1,7 Diferencia de E.N.

Entre 0 y 1,7

El tipo de enlace

que

Diferencia de E.N.

Átomos iguales

En los cuales

La diferencia de E.N.

Covalente puro o no polar

Cero

y el enlace es

(84)

ENLACE INTERMOLECULAR

• Enlace más débil que mantiene unidas las

moléculas entre sí.

• Estos enlaces son las

Fuerzas de Van

Der Waals.

• Estas son fuerzas entre moléculas debido

a la atracción eléctrica entre dipolos.

(85)

Uniones Intermoleculares de Van der Waals

Uniones Intermoleculares de Van der Waals

 Los inducidos dipolos se forman igualmente en Los inducidos dipolos se forman igualmente en

respuesta a los dipolos permanentes y a los

respuesta a los dipolos permanentes y a los

dipolos transitorios.

dipolos transitorios.

 Los movimientos moleculares reorientan los Los movimientos moleculares reorientan los

dipolos en ambas moléculas.

dipolos en ambas moléculas.

 Las uniones intermoleculares de Van der Waals Las uniones intermoleculares de Van der Waals

explican la condensación del H

explican la condensación del H2 2 y del Ar y el estado y del Ar y el estado líquido del benceno a temperatura ambiente.

líquido del benceno a temperatura ambiente. +

-+ - +

(86)

-• Fuerzas de van der Waals también conocidas como fuerzas de London.

• Son interacciones débiles causadas por cambios momentáneos en la densidad electrónica de una molécula.

• Son solamente fuerzas atractivas presentes en un compuesto no polar.

(87)

• Todos los compuestos presentan fuerzas de van der Waals. • El área de superficie de un molécula, determina la fuerza

de las interacciones de van der Waals entre dos moléculas Intermolecular Forces—van der Waals Forces

(88)

. Interacciones Dipolo-dipolo son las fuerzas atractivas entre los dipolos permanentes de dos moléculas.

(89)

SÓLIDOS MOLECULARES FUERZAS INTERMOLECULARES

+

+

+

+

-

-ENLACES DE VAN DER WAALS

•Entre moléculas Entre moléculas discretas (dipolos

discretas (dipolos

inducidos)

inducidos)

•Actúan a larga Actúan a larga distancia

distancia

•No son dirigidasNo son dirigidas •DébilesDébiles

•Entre moléculas Entre moléculas discretas (dipolos

discretas (dipolos

inducidos)

inducidos)

•Actúan a larga Actúan a larga distancia

distancia

•No son dirigidasNo son dirigidas

(90)

VdW (débil)

VdW (débil)

10-100 Kj.mol

10-100 Kj.mol-1-1

Covalente (fuerte)

Covalente (fuerte)

50-1000 Kj.mol

50-1000 Kj.mol-1-1

(91)

Enlace de hidrógeno

:Cuando el átomo de hidrógeno está unido a átomos muy

electronegativos (F, O, N), queda prácticamente convertido en un protón. Al ser muy pequeño, ese

átomo de hidrógeno “desnudo” atrae fuertemente (corta distancia) a la zona de carga negativa de

otras moléculas

HF

H

2

O

(92)
(93)

PUENTES DE HIDRÓGENO

Se requieren tres átomos para este enlace:

Átomo de hidrógeno

Átomo más electronegativo, que está unido por enlace covalente con el átomo de hidrógeno. Se le llama átomo

donador de hidrógeno

Átomo que posee al menos un orbital con

un par de electrones no

(94)
(95)
(96)
(97)
(98)

Enlace de hidrógeno

Este tipo de enlace es el responsable de

Este tipo de enlace es el responsable de

la existencia del agua en estado líquido y

la existencia del agua en estado líquido y

sólido.

sólido.

Estructura del hielo y del agua líquida

(99)
(100)

Enlaces de hidrógeno en el ADN

Apilamiento de las bases.

Enlaces de hidrógeno Interior hidrófobo Esqueleto desoxiribosa-fosfato Enlaces de hidrógeno Exterior hidrófilo

A: adenina

G: guanina

C: citosina

T: timina

Bases nitrogenadas

(101)
(102)

GRUPO FUNCIONAL

(103)

Referencias

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