Seminario
Facultad de Biología
Metodología de la
investigación científica
Profesor:
José Francisco Calvo Sendín Área de Ecología
José Francisco Calvo Sendín | [email protected] | http://webs.um.es/jfcalvo
1. El método científico
2. Fundamentos de probabilidad
3. Contraste estadístico de hipótesis
4. Fundamentos del diseño experimental
5. Análisis estadístico: enfoques metodológicos 6. Análisis estadístico: los datos
7. Análisis estadístico: métodos y modelos
Seminario “Metodología de la investigación científica”
Documento actualizado el 22/08/2022
• Este seminario intenta proporcionar una visión amplia y generalista sobre diversas cuestiones aplicadas relacionadas con la (bio)estadística y los aspectos metodológicos de la investigación científica.
• José F. Calvo es profesor de ecología, no es profesor de estadística.
• Se proporciona como complemento el acceso a un seminario de ejercicios prácticos de análisis estadísticos utilizando el software R
Metodología de la investigación científica
0. Antes de empezar
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
Ciencia e hipótesis científicas
• La ciencia trata de explicar racionalmente la naturaleza obteniendo
explicaciones sobre el funcionamiento de un sistema, o siendo capaz de predecir los resultados del sistema (Kéry & Schaub 2012).
• Science is a process for learning about nature in which competing ideas about how the world works are measured against observations (Richard Feynman, citado en Hilborn & Mangel 1997).
• Las hipótesis son las ideas o descripciones sobre cómo funciona el mundo.
• Dado que nuestras descripciones del mundo son casi siempre incompletas y nuestras medidas incorporan incertidumbre e imprecisión, necesitamos
métodos que nos permitan evaluar el grado de concordancia entre las ideas confrontadas y las observaciones: la estadística (Hilborn & Mangel 1997).
Ciencia e hipótesis científicas
• Hipótesis y teorías
Una hipótesis científica se refiera a un mecanismo o relación causa-efecto particular. Una teoría científica es mucho más general y sintética (Gotelli &
Ellison 2004) e implica un nivel de evidencia y soporte considerablemente mayor (Hilborn & Mangel 1997).
• Método científico
Es la técnica que se utiliza para decidir entre las hipótesis en base a las observaciones (Gotelli & Ellison 2004).
• Azar, variación, impredecibilidad, incertidumbre
Cualquier sistema que encontramos en la naturaleza (y cualquier faceta de la vida) es estocástico; es decir, sistemas que no son completamente predecibles porque incluyen procesos aleatorios que añaden un mayor o menor grado de variabilidad y, en consecuencia, de incertidumbre en sus resultados.
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
Modelos
Para interpretar formalmente cualquier observación necesitamos un modelo.
Los modelos son herramientas para evaluar las hipótesis (Hilborn & Mangel 1997). Un modelo es una definición abstracta de cómo creemos que nuestras observaciones son el resultado de cantidades observables (datos) e
inobservables (parámetros).
Los resultados de un sistema estocástico (la respuesta) pueden expresarse en forma de modelo estadístico:
respuesta = parte sistemática + parte estocástica
Pero… un modelo es una abstracción y, por tanto, siempre es incorrecto (Kéry 2010).
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
“señal”, información estructural “ruido”, entropía
El papel de los modelos en ciencia: Dichos sobre los modelos científicos
Fuente: Kéry & Schaub (2012)
Modelling is as much art as it is science (McCullagh & Nelder) All models are wrong, but some are useful (Box)
There has never been a straight line nor a Normal distribution in history, and yet, using assumptions of linearity and normality allows, to a good approximation, to understand and predict a huge number of observations (Youden)
Everything should be made as simple as possible, but not simpler (Einstein)
Nothing is gained if you replace a world that you don’t understand with a model that you don’t understand (Maynard Smith)
It is difficult to imagine another method that so effectively fosters clear thinking about a system than the use of a model written in the language of algebra (Kéry)
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
Contraste de hipótesis
Fuente: Wiens (1989)
Karl Popper (1902-1994) Fuente: LSE library - https://commons.wikimedia.org/w/
index.php?curid=9694262
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
Método hipotético-deductivo
Cuatro visiones filosóficas de la ciencia
Filósofo Palabras clave Tipo de confrontación
Popper Falsación de hipótesis Una única hipótesis es refutada por confrontación con los datos.
Kuhn Paradigmas, ciencia normal, revolución científica
Una única hipótesis es utilizada hasta que exista mucha información de que ha sido “derrocada” por una hipótesis
“mejor”.
Polanyi República de la ciencia
Se permiten múltiples visiones del mundo de acuerdo a diferentes opiniones de los científicos. La confrontación de estas visiones y los datos son juzgadas en función de su (i) verosimilitud, (ii) valor, (iii) interés.
Lakatos Programa de
investigación científica Confrontación de múltiples hipótesis con los datos como juez.
Fuente: Hilborn & Mangel (1997)
Metodología de la investigación científica
1. El método científico
Probabilidad y estadística
• Son ciencias que tratan sobre la incertidumbre.
• Estudian las características de:
− Sistemas estocásticos (descritos por los parámetros de un modelo).
− Los efectos o resultados de dichos sistemas (los datos observados).
• La teoría probabilística especifica los parámetros y el modelo.
• La estadística intenta inferir (deducir) las propiedades del sistema, dado el modelo.
La inferencia estadística tiene como
objetivo la estimación de las propiedades o características de una población a
partir del análisis de una muestra de dicha población.
“You can, for example, never foretell what any one man will do, but you can say with precision what an average number will be up to. Individuals vary, but the percentages remain constant. So says the statistician.”
Sherlock Holmes. The Sign of Four.
Metodología de la investigación científica
2. Fundamentos de probabilidad
Probabilidad
Es la frecuencia esperada con la que ocurre un evento.
Midiendo la probabilidad:
Si no hubiese incertidumbre en el resultado no haría falta
ni la probabilidad ni la estadística
𝑃 = número de resultados número de ensayos
𝑃 = número de hembras nacidas número de individuos nacidos
0,0 ≤ 𝑃 ≤ 1,0
Metodología de la investigación científica
2. Fundamentos de probabilidad
Densidad
z
Variables aleatorias y distribuciones de probabilidad
La distribución de probabilidad de una variable aleatoria es una función que asigna a cada suceso la probabilidad de que ocurra.
95%
𝑁(0,1)
Distribución normal (media = 0, desviación
estándar = 1)
-1,96 1,96
Metodología de la investigación científica
2. Fundamentos de probabilidad
Variables aleatorias y distribuciones de probabilidad Ejemplos:
Distribución Media Varianza Comentarios
Bernoulli 𝑝 𝑝(1 − 𝑝) Un único experimento con dos posibles resultados
Binomial 𝑛𝑝 𝑛𝑝(1 − 𝑝) Secuencia de n ensayos de Bernoulli
Poisson 𝜆 𝜆 Eventos raros independientes
Uniforme (𝑏 − 𝑎) 2
(𝑏 − 𝑎)2 12
Resultados equiprobables sobre el intervalo [a, b]
Normal 𝜇 𝜎2 Genera curvas simétricas para datos continuos Log-normal 𝑒𝜇+𝜎
2
2 𝑒𝜇+𝜎
2
2 × 𝑒𝜎2 Para datos con asimetría positiva (right-skewed) Exponencial 1 𝛽Τ 1 𝛽Τ 2 Distribución continua análoga a la de Poisson
DiscretasContinuas
Fuente: Gotelli y Ellison (2004)
Metodología de la investigación científica
2. Fundamentos de probabilidad
Significación estadística y valores de P
El contraste de hipótesis se realiza mediante pruebas o test estadísticos. Un test produce un resultado numérico (un estadístico) y un valor de probabilidad
asociado (P).
La hipótesis nula estadística (H0)
Establece un modelo simple que considera que las variaciones observadas en los datos son debidas al azar y no al efecto del factor o factores estudiados.
La hipótesis alternativa (H1)
En general, como hipótesis alternativas (una o varias), se definen las que sí consideran la existencia de efectos debidos al factor o factores estudiados.
Habitualmente se utiliza el criterio P < 0,05 para rechazar H0.
Pero el rechazo de H0 no implica aceptar H1 (solo sugiere que H1 puede ser cierta).
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
El valor de probabilidad (P, p, P-value, p-value)
Expresa la probabilidad de obtener los datos observados (y otros más extremos pero no observados) dado un modelo específico (definido por un parámetro o conjunto de parámetros θ):
Habitualmente el modelo considerado es la hipótesis nula (H0), y por tanto, el valor de P es la probabilidad de obtener unos datos (generalmente expresados como el resultado de un test estadístico) al menos tan extremos como los
observados:
También es frecuente utilizar otras notaciones:
Pr (datos|H0) Pr {datos|H0}
P (datos| H
0) P ( y ≥ y
obs| θ )
P no es la
probabilidad de que H
0“sea cierta”
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
Errores en el contraste de hipótesis
Decisión:
Realidad: No rechazar H0 Rechazar H0
H0 cierta Decisión correcta (probabilidad = 1 – α)
Error Tipo I
(probabilidad = α) falso positivo H0 falsa Error Tipo II
(probabilidad = β ) falso negativo
Decisión correcta (probabilidad = 1 – β )
Nivel de significación;
habitualmente α = 0,05
Poder o potencia estadística: 1 – β
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
Verosimilitud (likelihood)
De manera similar a un valor de P, la verosimilitud (ℒ) cuantifica la probabilidad de los datos dado un modelo. Pero ℒ solo usa los datos observados, no los más extremos e inobservados:
La interpretación de ℒ es opuesta (como una versión inversa) a la de P: aquél valor 𝜃 que proporcione el máximo de la función de verosimilitud para los datos observados es considerado la mejor estima de θ (estimación de máxima
verosimilitud, maximum likelihood estimate, MLE).
La verosimilitud de los datos es directamente proporcional a la probabilidad de obtener los datos observados dado el parámetro o parámetros estimados.
ℒ( θ | y
obs) ∝ P ( y
obs| θ )
θ puede ser un escalar o un vector Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
“es proporcional a”
Verosimilitud (likelihood)
Las verosimilitudes son números muy pequeños, menores que 1, por lo que suele utilizarse más frecuentemente el logaritmo (natural) de la verosimilitud:
Un buen modelo es el que tiene una alta verosimilitud. Por tanto, cuanto mayor es logℒ, mejor es el ajuste del modelo a los datos.
Un valor de ℒ es, en sí mismo, irrelevante. Pero tiene utilidad comparativa. La razón de verosimilitudes (likelihood ratio) permite comparar cuánto más
verosímil es un parámetro frente a otro:
También denotado como logLik, LL, L
ℒ( θ
2| y
obs) / ℒ( θ
1| y
obs) logℒ
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
Verosimilitud, desvianza y criterio de información de Akaike (AIC) La desvianza (deviance) se calcula como:
siendo ℒs la verosimilitud del modelo saturado: aquél que tiene tantos parámetros como datos y, por tanto, tiene un “ajuste” perfecto.
El criterio de información de Akaike (Akaike’s information criterion) se calcula como:
siendo K el número de parámetros del modelo.
Al igual que la verosimilitud y la desvianza, el AIC (o su versión corregida para tamaños de muestra pequeños, AICc) proporciona una medida de la calidad relativa de un modelo, para un conjunto dado de datos. Cuanto menor sea el valor de AIC de un modelo, mejor es el ajuste.
−2 (logℒ − logℒ
s)
−2 (logℒ − logℒ
s) + 2 K
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
El debate sobre la utilidad de P
La cultura científica basada en el uso de P ha dominado durante la mayor parte del siglo XX (y aún domina en el siglo XXI). No obstante, se tiende a abandonar su utilización y cada vez con mayor frecuencia se emplean como alternativa
procedimientos de selección de modelos e inferencia multimodelo, nuevo paradigma para el análisis estadístico (Burnham & Anderson 2002).
En síntesis, un procedimiento de selección de modelos evalúa un conjunto de modelos “candidatos” (generalmente
mediante el AIC) y realiza la estimación de parámetros en función de las estimaciones ponderadas de dicho parámetro en los diferentes modelos.
Se busca la “mejor” explicación posible para los datos observados (best approximating model) y, bajo esta
perspectiva, el uso de P no tiene sentido. Portada del libro de Burnham & Anderson (2002)
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
Metodología de la investigación científica
3. Contraste de hipótesis estadísticas
Selección de modelos e inferencia multimodelo (model averaging)
Ejemplo: modelos de supervivencia del búho real (Bubo bubo) en función del sexo (hembras/machos), la población (Murcia/Sevilla) y el año (2007-2010).
Model averaging: Los parámetros se estiman como medias ponderadas en función de los pesos de Akaike (wi).
Modelo AICc AICc wi K -2log(L)
S sexo 178.575 0.00 0.62111 2 174.544
S sexo + población 180.462 1.89 0.24174 3 174.400
S nulo 182.457 3.88 0.08913 1 180.447
S población 183.848 5.27 0.04448 2 179.817
S sexo + año 189.488 10.91 0.00265 9 171.015
S año 192.334 13.76 0.00265 8 175.957
S población + año 194.099 15.52 0.00026 9 175.627
Fuente: León-Ortega M et al. (2016). European Journal of Wildlife Research 62: 343-351.
Búho real © Carlos González Revelles
Diseño experimental
Término que describe la estructura lógica de un experimento.
Experimento
Es una operación o procedimiento para testar una hipótesis.
Unidad experimental
División más pequeña de material experimental que recibe un tratamiento.
Tratamientos y controles
Tratamiento es un término general para cualquier conjunto de comparaciones.
Entre los tipos tratamientos de un experimento debe figurar uno de control, que sirva de comparación para el análisis de los efectos (generalmente un no-
tratamiento). En determinadas ocasiones (por ejemplo cuando se pretende determinar entre dos o mas tratamientos cuál es el mejor), cada tratamiento actuaría como control del resto.
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Krebs (1999)
Experimentos “manipulativos” y “experimentos” mensurativos
En sentido estricto, un experimento es un procedimiento de investigación en el que todos los factores ambientales están bajo control. Como consecuencia es imprescindible manipular las condiciones en las que se realiza el estudio:
hablamos de experimentos “manipulativos” o estudios experimentales.
No obstante, muchas investigaciones utilizan procedimientos de obtención de la información “no manipulativos” que reciben la denominación de muestreos. El muestreo es un procedimiento de observación y medida exclusivamente:
hablamos de estudios observacionales, “experimentos” mensurativos, o
“experimentos naturales”.
Generalmente el tratamiento estadístico en ambos casos es idéntico, pero la diferencia radica en la confianza y generalidad que podemos atribuir a las
conclusiones derivadas del estudio. En cualquier caso, los principios generales del diseño experimental deben ser igualmente aplicados.
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Experimentos “manipulativos” y “experimentos” mensurativos
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Experimentos
• Estudios experimentales
• Experimentos “manipulativos”
Muestreos
• Estudios observacionales
• “Experimentos” mensurativos
• Experimentos naturales
Experimentación en el laboratorio para investigar germinación de plantas halófilas
© Juan A. Pujol Fructuoso
Muestreo para investigar la presencia de especies de anfibios en charcas ganaderas
© José F. Calvo
Elementos clave en el diseño experimental
1. Replicación y pseudorreplicación. Replicar consiste en disponer al menos de dos unidades experimentales por cada tipo de tratamiento. La incorrecta
consideración de lo que constituye una unidad experimental se conoce como pseudorreplicación.
2. Aleatorización y espaciamiento. Otro aspecto fundamental es la distribución de las réplicas en el espacio: un esquema de disposición espacial aceptable debe considerar la adecuada separación o espaciamiento (interspersion) de aquellas unidades experimentales con el mismo tratamiento. Lo ideal es una distribución aleatoria.
3. Control del diseño. Por control del diseño nos referimos a la consideración de otros elementos que tiene por objeto reducir el error experimental: unidades experimentales homogéneas, variables adicionales, más replicas, diseños
equilibrados, uso de bloques.
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Elementos clave en el diseño experimental 1. Replicación y pseudorreplicación
Adaptado de Hulbert (1984)
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Elementos clave en el diseño experimental 2. Aleatorización y espaciamiento
Diseños aceptables Diseños incorrectos
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Adaptado de Hulbert (1984)
Elementos clave en el diseño experimental 3. Control del diseño
Para reducir el error experimental (es decir, para que las conclusiones de las comparaciones estadísticas sean más precisas), hay que considerar:
a) usar unidades experimentales más homogéneas;
b) usar información de variables adicionales medidas en cada unidad experimental (análisis de la covarianza);
c) usar más réplicas;
d) usar un diseño experimental más eficiente: diseños equilibrados o
“balanceados” (balancing) y uso de bloques (blocking).
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Factores (efectos) fijos y factores (efectos) aleatorios
Una variable la consideramos factor fijo cuando sus niveles o valores son considerados de interés específico en la investigación y son seleccionados o
“deliberadamente”.
Una variable la consideramos como factor aleatorio cuando sus niveles o valores se seleccionan aleatoriamente entre todos los posibles. [No confundir con el
concepto de variable aleatoria.]
Los efectos fijos son los que analizamos normalmente sobre observaciones
estadísticamente independientes. Los efectos aleatorios surgen cuando tenemos más de una observación en cada unidad experimental (Venables & Ripley 2002).
Según los factores considerados, tenemos diseños (y modelos estadísticos) fijos, aleatorios o mixtos (si incluyen ambos tipos de efectos).
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
Tipos (en función de la naturaleza de las variables) (Gotelli & Ellison 2004) Tipos de diseño experimental (Krebs 1999)
1. Modelos lineales aditivos 2. Diseños factoriales
3. Diseños de bloques aleatorios 4. Diseños split-plot
5. Diseños anidados
6. Diseños de cuadrado latino 7. Diseños de medidas repetidas 8. Estudios de impacto ambiental
Variable independiente
Variable dependiente Continua Categórica
Continua Regresión ANOVA
Categórica Regresión logística Tabular
Metodología de la investigación científica
4. Fundamentos del diseño experimental
• Análisis paramétrico
• Análisis Bayesiano
• Análisis de Monte Carlo
• Análisis no paramétrico
• Selección de modelos e inferencia multimodelo
• Análisis paramétrico (clásico, convencional o frecuentista)
Asume que los datos se ajustan a un determinado tipo de distribución conocida.
Estima los parámetros de dicha distribución a partir de los datos.
Ronald Fisher (1890-1962) Fuente: Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w
/index.php?curid=42415558
Metodología de la investigación científica
5. Análisis estadístico: enfoques metodológicos
Thomas Bayes (1702-1761) Fuente: Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w
/index.php?curid=14532025
• Análisis Bayesiano
El análisis Bayesiano es mucho más antiguo (s. XVIII) que el frecuentista, pero es más complejo y su uso no se ha generalizado hasta el desarrollo de
software accesible para la mayoría de usuarios (WinBUGS).
La estadística Bayesiana también asume que los datos se ajustan a una distribución, pero los parámetros se estiman no solo a partir de los datos.
Por tanto, la probabilidad se usa para expresar la incertidumbre sobre un parámetro (en estadística clásica es sobre los datos).
La receta para un análisis Bayesiano es (Lindley 1983):
− ¿Qué es lo que no sabes y te interesa? Llámalo θ.
− ¿Qué sabes? Llámalo D.
− Ahora calcula P (θ |D).
− ¿Cómo? Usando las reglas de probabilidad.
Metodología de la investigación científica
5. Análisis estadístico: enfoques metodológicos
Probabilidad condicional y Teorema de Bayes
Es la probabilidad de que ocurra un evento A, sabiendo que también sucede otro evento B (probabilidad de A dado B):
Teorema de Bayes:
𝐴 𝐵
𝐴 ∩ 𝐵 𝑆
𝑃 𝐴 𝐵 = 𝑃 𝐵 𝐴 𝑃(𝐴) 𝑃(𝐵)
𝑃 𝐴 𝐵 = 𝑃(𝐴 ∩ 𝐵) 𝑃(𝐵)
Metodología de la investigación científica
5. Análisis estadístico: enfoques metodológicos
Conjunto de todos los resultados
posibles prior (distribución
o probabilidad previa)
verosimilitud
posterior (distribución o
probabilidad
posterior) 𝑃𝑜𝑠𝑡𝑒𝑟𝑖𝑜𝑟 = 𝑉𝑒𝑟𝑜𝑠𝑖𝑚𝑖𝑙𝑖𝑡𝑢𝑑 × 𝑃𝑟𝑖𝑜𝑟 𝐸𝑣𝑖𝑑𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎
área de B / área de S
Probabilidad conjunta de A y B
• Análisis de Monte Carlo (tests de aleatorización)
No asume ningún tipo de distribución paramétrica de los datos (por ejemplo, normalidad). Utiliza la aleatorización de los datos observados (permutaciones aleatorias).
• Análisis no paramétrico
Se fundamentan en el análisis de los datos transformados en sus rangos (número de orden), pero son un caso especial de análisis de Monte Carlo.
Actualmente su uso no se recomienda (Gotelli & Ellison 2004) porque:
a) con la transformación se pierde mucha información,
b) las técnicas paramétricas son a menudo “robustas” frente las violaciones de las asunciones, y
c) solo hay métodos disponibles para análisis simples.
• Selección de modelos e inferencia multimodelo
Metodología de la investigación científica
5. Análisis estadístico: enfoques metodológicos
Exactitud y precisión
Son dos aspectos fundamentales en el proceso de obtención de datos. La ausencia de exactitud se denomina sesgo (bias). La precisión se refiere a la dispersión de los datos y se relaciona con la repetibilidad y la reproducibilidad.
Fuente: Dnu72, CC BY-SA 3.0,
https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24584728
Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Estructura de las tablas de datos
Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Variable de respuesta (dependiente)
Tratamiento (variable categórica
independiente) Covariable
Tamaño de la muestra
(8 + 8)
Representa tus datos
> hist(coliform)
> plot(day, coliform, col=factor(method)) Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Box plot (box-and-whisker plot, diagrama de caja)
> boxplot(coliform ~ method)
Fuente: Jhguch at en.wikipedia, CC BY-SA 2.5, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=14524285
Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Barras de error
Barra de error Tipo Descripción Fórmula
Rango Descriptivo Amplitud entre los extremos de los datos El mayor valor menos el menor
Desviación
estándar (SD) Descriptivo Diferencia media entre los datos y su media SD = σ (𝑥𝑖− ҧ𝑥 2 𝑛 − 1 Error estándar Inferencial Medida de la variabilidad de la
media, si el estudio se repite
muchas veces SE = SDΤ 𝑛
Intervalo de
confianza (CI) Inferencial
Intervalo de valores entre los cuales se estima que estará la media
verdadera con una determinada probabilidad de acierto
ҧ𝑥 ± 𝑡𝜐,1− Τ𝛼 2 × SE
Fuente: Cumming et al. (2007)
Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Requisitos de normalidad y homocedasticidad. Transformaciones
− La aplicación de los test paramétricos presenta una serie de requisitos que deben cumplir los datos: independencia, normalidad (ajuste a una distribución normal) y homogeneidad de varianzas (homocedasticidad).
− La independencia se consigue con un diseño experimental (o de muestreo) adecuado. Si tenemos datos no independientes hay que utilizar las técnicas adecuadas para analizarlos (modelos mixtos).
− La normalidad y la homocedasticidad (en el caso de variables continuas) se pueden conseguir a través de transformaciones (por ejemplo
aplicando logaritmos).
− No obstante, los tests paramétricos suelen ser “robustos” frente a las violaciones de estos requisitos.
Metodología de la investigación científica
6. Análisis estadístico: los datos
Seminario de ejercicios prácticos en R
− ANOVA, regresión lineal y ANCOVA
− ANOVA de dos factores
− Modelos lineales generalizados
− Diagnósticos
− Sobredispersión
− Modelos GAM
− Regresión no lineal
− Modelos mixtos
− Modelos anidados
− Análisis split-plot
− Análisis de datos pareados
− Tablas de contingencia: chi-cuadrado, regresión logística y análisis loglineal
− Tablas de contingencia con más de un factor
− Selección de modelos e inferencia multimodelo Metodología de la investigación científica
7. Análisis estadístico: métodos y modelos
Seminario:
Análisis estadístico de datos biológicos en R
http://fobos.inf.um.es/jfcalvo/?p=822
Bibliografía recomendada
• Gotelli NJ, Ellison AM (2004) A Primer of Ecological Statistics. Sinauer, Sunderland, MA.
• Krebs CJ (1999) Ecological Methodology. 2ª ed. Benjamin/Cummings, Menlo Park, CA.
• Venables WN, Ripley BD (2002) Modern Applied Statistics with S. 4ª ed.
Springer, New York.
Otras referencias citadas
• Burnham KP, Anderson DR (2002) Model Selection and Multimodel Inference. 2ª ed. Springer, New York.
• Cumming G, Fidler F, Vaux DL (2007) Error bars in experimental biology. The Journal of Cell Biology, 177: 7-11.
• Hilborn R, Mangel M (1997) The Ecological Detective. Confronting Models with Data. Princeton University Press, Princeton, NJ
• Hurlbert SH (1984) Pseudoreplication and the design of ecological field experiments. Ecological Monographs 54: 187-211.
• Kéry M (2010) Introduction to WinBUGS for Ecologists. Elsevier, Amsterdam.
• Kéry M, Schaub M (2012) Bayesian Population Analysis Using WinBUGS. Elsevier, Amsterdam.
• Lindley DV (1983) Theory and practice of Bayesian statistics. Statistician 32: 1-11.
• Wiens JA (1989) The Ecology of Bird Communities. Cambridge University Press, Cambridge.
Seminario “Metodología de la investigación científica”