Epidemiología a Molecular de los Rotavírus

41 

Texto completo

(1)

Reuni

Reuni

ó

ó

n Internacional de Nuevas Vacunas:

n Internacional de Nuevas Vacunas:

Bogot

Bogot

á

á

, 27

, 27

-

-

29 de Febrero de 2008

29 de Febrero de 2008

Epidemiolog

Epidemiolog

í

í

a Molecular de los Rotav

a Molecular de los Rotav

í

í

rus

rus

Jos

Jos

é

é

Paulo Gagliardi Leite

Paulo Gagliardi Leite

Laboratorio de Virolog

Laboratorio de Virolog

í

í

a Comparada

a Comparada

Laboratorio de Referencia Regional para Rotav

Laboratorio de Referencia Regional para Rotav

í

í

rus

rus

IOC

(2)

Mortalidade Crianças Menores 5 Anos

3%

17%

4%

8%

19%

49%

HIV/AIDS

Diarréias

Sarampo

Malaria

Inf. Resp. Aguda

Outras

HIV/AIDS

321000

Diarréias

1762000

Sarampo

395000

Malaria

853000

Inf. Resp. Aguda

2027000

Outras

5237000

The World Health Report,

WHO, 2005

Fonte: Child and Adolescent Health and Development PROGRESS REPORT 2000-2001 - WHO

(3)

“O Globo” - 10/02/2008

(4)

Parashar et al., 2006

Distribución mundial estimada de las 600.000 muertes anuales

provocadas por la infección de Rotavírus

Distribución mundial estimada de las 600.000 muertes anuales

provocadas por la infección de Rotavírus

1 punto = 1000 muertes

(5)

• La incidencia de la enfermedad provocada por Rotavirus es similar en países

en desarrollo como en países desarrollados

La mejora de las condiciones sanitarias no reduce la incidencia de la

enfermedad.

• Diversidad de cepas circulantes:

PAISES EN DESARROLLO

>

PAISES DESARROLLADOS

• Es necesario vacunas para prevenir casos graves de gastroenteritis

asociados a Rotavirus

• POR LO CUAL, ES IMPRECINDIBLE ESTUDIAR LOS ASPECTOS

EPIDEMIOLOGICOS Y MOLECULARES DE LOS ROTAVIRUS CIRCULANTES

Otros

virus

Otros virus

Bacterias

Bacterias

Rotavirus

Países

Desarrollados

Desconocido

Desconocido

Rotavirus

A. Kapikian, Fields Virology 2003

Países en

Desarrollo

(6)

Familia:

Reoviridae

Genero:

Rotavirus

Grupos:

A- G

Partícula viral:

70 -80 nm, sin envoltura

lipidia, simetría

icosaédrica, con triple

envoltura proteica.

Genoma:

ARN doble hebra

11 segmentos

Proteínas:

6 estructurales (VP)

6 no-estructurales (NS)

NSP4: enterotoxina viral (segmento 10)

Barth, 2006

Modificado de Estes, 2001

(7)

ELETROFEROTIPOS DE ROTAVIRUS

Departamento de Virología - IOC - FIOCRUZ

EGPA – ELETROFORESIS EN GEL DE POLIACRILAMIDA

Laemmli, 1970; Pereira et al., 1983

Perfil:

largo, corto, súper corto

6

6

REARREGLO DE SEGMENTO dsRNA

(8)

CLASIFICACIÓN BINARIA PARA

ROTAVIRUS DEL GRUPO A

:

GENOTIPOS

P

y

G

/ SEROTIPOS

VP4

VP7

SEROTIPOS

P1A[8],

P1B[4],

P2A[6],

P1A[8],

P1A[8],

G1

G2

G2

G3

G4

GENOTIPOS

Modificado de Estes, 2001

9

4

(9)

GENOTIPOS DE RV-A

Genotipos P: 28

Genotipos G: 16

Cepas comunes:

P[8]G1, P[8]G3, P[8]G4, P[4]G2, P[8, 4 ou 6]G9

(recientemente)

Cepas “raras”:

G5, G8, G10, G12

P6, P9, P10

Humanos

Martella et al., 2006; Gulati et al., 2007; Khamrin et al., 2007; Steyer et al., 2007

(10)

Santos &

Santos &

Hoshino

Hoshino

, 2005

, 2005

(11)
(12)
(13)

Transmisión

Interespecie

Humanos

(14)

TRANSMISIÓN INTERESPECIE Y

REORDENAMIENTOS

Infecciones Heterólogas

“Reordenamientos” de cepas RV-A humanas

- Combinación de antígenos P y G

Rol de RV animales en la diversidad

- Ejemplos de transmisión interespecie

- RV reordenados Humanos-Animales

AU-1, Ro-5829 (P3[9]G3) Japan, Israel (11 FE)

116E (P8[11]G9) India (10 HU/1 BO)

Eg2295 (P[14]G8) Egypt (BO/LA/HU?) Br1054 (P[8]G5)

Brazil (8 HU/3 PO ?)

(15)

Serotipo Emergente :

regionalmente

[G5]

en Brasil

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA

DE CEPAS CIRCULANTES Y ESTUDIOS MOLECULARES

Leite et al., 1996; Gentsch et al., 2005

(16)

• Amplia diversidad de genotipos e infecciones mixtas

(países desarrollados

y en desarrollo)

• Serotipos emergentes :

globalmente: [G9]

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA

DE CEPAS CIRCULANTES Y ESTUDIOS MOLECULARES (2)

Gentsch et al, 2005

(17)

Molecular and Serological Characterization of Group A Rotavirus

Isolates Obtained from Hospitalized Children in Goiânia, Brazil, 1998–

2000.

M. B. L. D. Souza, M. L. Rácz, J. P. G. Leite, C. M. A. Soares, R. M. B.

Martins, V. Munford and D. D. P. Cardoso.

Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2003, 22(7):441-3.

EMERGENCIA DE ROTAVIRUS GRUPO A GENOTIPO

G9 EN BRASIL

(18)

Modificado de Santos & Hoshino, 2005

DISTRIBUCI

DISTRIBUCI

Ó

Ó

N TEMPORAL DE RV

N TEMPORAL DE RV

-

-

A GENOTIPO

A GENOTIPO

G5 EN RIO DE JANEIRO, BRASIL

G5 EN RIO DE JANEIRO, BRASIL

(19)

Distribución temporal de genotipos G de

cepas aisladas de individuos paraguayos

entre 1998 e 2005.

Parra et al., J Med Virol, 2005

Parra et al., J Clin Virol, 2007

0

10

20

30

40

50

60

1998

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

Years

N

o

.

d

e

s

a

m

p

le

s

G1

G2

G4

G9

(20)
(21)
(22)

VP8*

CAD:

Community-Acquired Diarrhea

(23)
(24)

Análisis filogenético de la secuencia nucleotídica de VP7 de

cepas genotipo G4 aisladas en Paraguay y prototipos del resto

del mundo

Parra et al., J Med Virol, 2005

Bok, et al., J Clin Microb, 2002

SA442/86 SA111/86 SA828/86 ItalyA ST3 JapHochi JapOdelia

Sublineage Ia

ArgRes1723 ArgBA1239 ArgMen1734 ArgTuc737 ArgMen1741 ArgRos987 ArgRes1724 ArgTuc1594 ArgTuc1620 ArgTuc1650

Sublineage Ib

Mvd9907 ArgBA958 Mvd9905 Py98102 ArgUsh2037 Py99355 Py99348 Py99449

Sublineage Ic

Sublineage Id

ArgSF928 Gottfried ItalyD ItalyC ItalyB

Lineage II

1 0 0 8 9 9 3 9 9 9 5 1 0 0 7 8 9 9 9 3 7 5 9 8 0 .0 2

Cepa atípica, con características del linaje Ic.

Luego reportada como la primera cepa con

recombinación intragenética (Parra et al., 2004)

VR5(A) VR7(B) VR8(C) 87 100 141 150 208 224 Gottfried SEAPTQINDNEWKD LIRFASGEEL QTTNTATFETVADSEKL Py99348-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py99355-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py99449-LIc ...S.T.... ..K.T... ... Py02SR1-LIc ...S.T.... ..K.T.A... ...I... Py02SR7-LIc ...S.T.... ..K.T.A... ...I...

(25)

PREGUNTAS IMPORTANTES:

Ø

DIFERENCIAS ENTRE “SALVAJES” Y VACUNADOS?

Ø

IMUNIDAD DE REBAÑO?

Ø

LIBERACIÓN DE PARTÍCULAS VIRALES : ≥7 DS ?

Ø

EL NUMERO DE CASOS DE DIARREA

ESTA

DISMINUYENDO

? OTROS VIRUS?

Ø

COLECTAR MUESTRAS DESPUES DE LA VACUNACIÓN

Ø

G2? VARIANTES DE G1?

Jin Qi et al, 1996: RRV-TV y RRV-S1 (G1):

Sorología – 49 y 64%, respectivamente.

Ya se identificaron por lo menos 4 linajes de G1

en USA

(26)

FIG. 2. Phylogenetic tree obtained from nucleotide sequences of group A

rotavirus G1 VP7 genes. Reference group A rotavirus strains were selected

from GenBank (accession numbers are indicated in the text). The scale

indicates nucleotide substitutions per position. The numbers in the branches

indicate the bootstrap values. *, sublineage containing rotavirus detected in

this study.

(27)

Análisis filogenético de

secuencias nucleotídicas de

VP7 pertenecientes al

genotipo G1, de cepas

aisladas en Paraguay

Py03IPN144 Py03SR6Ad Py03IPN148 Py03IPN113 Py03SR286 Py03SR326 Py02SR43 Py02SR11 Py03SR139 ItalyPAF166-94 Rus1407-84 Lineage I I b AU007 Py03SR124 ItalyPA2-04 ItalyPA5-03 ItalyPA9-03 Lineage I I c Py99365 Italy90-PA389-00 ItalyPA378-00 ItalyPA164-99 ItalyPA33-99 Lineage I I d Lineage I I a Lineage IV ItalyPA5-90 ItalyPA78-89 ItalyPA10-90 Lineage V Ban59 Aus94A Aus95C Py99419 WD33 Mvd9901 Mvd9906 Aus94C Aus94B Mvd9816 Py9856 Mvd9705 Py9855 Lineage I Lineage I I I Lineage VI JpnAu19 PorcineC60 PorcineC95 Lineage VI I 100 99 99 99 73 71 74 68 100 93 96 87 86 77 76 81 89 67 83 98 0.02

Linaje atípico detectado durante el

año 2003

Parra et al., J Med Virol, 2005

Parra et al., J Clin Virol, 2007

(28)
(29)
(30)
(31)
(32)

Distribuição mensal de 620 casos de diarréia aguda e 514 casos de

bronquiolite em dois hospitais públicos do Rio de Janeiro

0 5 10 15 20 25 30 35 40 CO UN Tempo 6 7 8 9 101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142 1-GE 3-Bronquiolite

Número

de casos

2001 2002 2003 2004

Diarréia

aguda

Bronquiolite

(33)

G1P[8]

G9P[8]

G3P[8]

G9P[8]

G2P[4]

G2P[4]

G3P[8]

G9P[8]

G9P[?]

Costa et al., 2008

(34)

G2P[4] fue detectado circulando en otros

países de América Latina!

(35)
(36)

INTENSIFICACIÓN DE LA VIGILANCIA

EPIDEMIOLOGICA DE CEPAS

CIRCULANTES Y ESTUDIOS

MOLECULARES !

(37)

Que esta pasando?

(38)

Lancet. 2007 Nov 10;370(9599):1592-3.

Effect of city-wide sanitation programme on reduction

in rate of childhood diarrhoea in northeast Brazil: assessment by two cohort

studies.

Barreto ML, Genser B, Strina A, Teixeira MG,

Assis AM, Rego RF, Teles CA, Prado MS,

Matos SM, Santos DN, dos Santos LA, Cairncross S.

FINDINGS: we estimated an

overall diarrhoea prevalence

reduction of 22% (19-26%).

INTERPRETATION: Our results

show that urban sanitation is a

highly effective health measure

that can no longer be ignored,

and they provide a timely support

for the launch of 2008 as the

(39)
(40)

VPSRMA-Fiocruz/MS

Phone/Fax: 5521-2560 2921

jpgleite@ioc.fiocruz.br

Instituto Oswaldo Cruz

Laborat

(41)

GRACIAS POR LA ATENCIÓN

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