• No se han encontrado resultados

Análisis de estabilidad fenotípica mediante el sistema SAS

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2020

Share "Análisis de estabilidad fenotípica mediante el sistema SAS"

Copied!
13
0
0

Texto completo

(1)ARTICULOS TECNICOS ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA MEDIANTE EL SISTEMA SAS. Julio Ricardo Galindo P. I.A.. RESUMEN. Con elfin de proveer al fitomejorador de una herramienta para el análisis de estabilidad fenotipica, se escribiO un programa en el sistema de análisis estadistico SAS que realiza el cálculo automático de los parämetros de estabilidad par cuatro rnétodos diferentes: Eberhart y Russell, Shukla, Tai, y Wricke. Se incluyO el cálculo de Ia cota minima de Eskridge para la selecciOn del mejor genotipo. El programa puede ser transcrito y ejecutado en torma convencional o ser solicitado en el modo interactivo Window que genera una ventana denominada EBERHART donde el usuario entra los datos básicos del archivo SAS que contiene los resultados a analizar. Su facilidad de operacsOn, junto con Ia versatilidad del SAS, Ia hacen particularmente Util.. Palabras Claves Adicionales: InteracciOn genotipo ambiente, pruebas regionales, adaptabilidad, variedades superiores.. ABSTRACT Phenotypic stability analysis using the SAS system In order to provide a tool for the phenotypic stability analysis, it was written a SAS (Statistical Analysis System) program that automatically computes the stability parameters, proposed by: Eberhart and Russell, Shukla, Tai, and Wricke. The first safety rule of Takaoka was applied to the Shukla and Eberhart & Russell parameters according to the Eskridge methodology. The program can be executed directly or by using the interactive mode Window of SAS to require the user's basic information and execute automatically the related procedures to the analysis. It's easy operation with the SAS versatility makes this program specially useful.. Additional Key Words: Genotype-environment interaction, measures of phenotipic stability, regional trials. Division de Biometria. Centro Experimental Tlbaitatá. A.A. 151123, Bogota.. 49.

(2) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - Marzo 1992 Un objetivo importante en el fitoniejoramiento es Ia obtenciOn de variedades de alta estabilidad fenotipica, lo cual sign ifica que el comportamiento agronOmico de las mismas se mantiene, con un minimo de alteradOn, bajo diferentes ambientes agroecolOgicos. Para estimar Ia estabilidad, un grupo de genotipos se evakia a través de diferentes ambientes por sus caracteristicas de rendimiento, y/o calidad. El análisis de estabilidad fenotipica consiste en estimar parámetros estadisticos con los cuales se pueda caracterizar Ia estabilidad de las variedades, y compararlas buscando los genotipos mäs estables y de mejor rendimiento. Wricke, citado por Becker (2), propuso calcular Ia "ecovalencia" de cada genotipo, definida como su contribuciOn a Ia suma de cuadrados de Ia interacciOn genotipo-ambiente, para usarla como un parámetro de estabilidad. En tal caso, un genotipo estable se reconoce por su menor ecovalencia. Eberhart y Russell,(1) propusieron el uso del análisis de regresiOn para obtener de cada genotipo, Ia relaciOn de Ia respuesta fenotipica en funciOn de un 'Indice ambiental', el cual se calcula con el desempeno promedio de los genotipos en experimentaciOn para cada ambiente. El coeficiente de regresiOn que se obtiene constituye un parämetro de estabilidad. Un genotipo estable segUn esta metodologla se reconoce por un coeficiente de regresiOn igual a 1, alta producciOn y desviaciones de regresiOn cercanas a cero. Tai(1O), basândose en I a metodologia de Eberhart y Russell, propuso utilizar el modelo matemático convencional del análisis de varianza para estimar Ia respuesta lineal de los genotipos al efecto del ambiente. Shukla(9) argumentando que la relaciOn genotipo ambiente no siempre es lineal, propuso y obtuvo estimadores no sesgados de. 50. los componentes de varianza para explicar Ia interacciOn genotipo ambiente. Eskridge(4) propuso utilizar Ia primera regla de seguridad de Takaoka para determinar el mejor genotipo combinando los parámetros de estabilidad y el rendimiento promedio. La técnica consiste en estimar el rendimiento mInimo esperado para cada genotipo y seleccionar el valor máximo encontrado. Kang (6), escribiO un programa en ellenguaje MATRIX de SAS (7) para calcular los parámetros de estabilidad fenotipica propuesto por Wricke (2) y Shukla (9). En el presente artIculo se pretende poner a disposiciOn del investigador de fitomejoramiento los paràmetros de estabilidad fenotipica segUn diferentes autores: Wricke, Eberhart y Russell, Shukla, y Tai; incluyendo también Ia metodologla de Eskridge para Ia selecciOn del mejor genotipo. For Jo tanto se elaborO un programa SAS para realizar el análisis de estabilidad fenotipica, que se ejecuta en forma convencional o interactiva. A diferencia de Kang(6), no se utiliza el lenguaje MATRIX. De esta forma el investigador dispone de una metodologia estadistica ágil y confiable para el análisis de sus resultados.. MATERIALES V METODOS. El programa para realizar el análisis de estabilidad fenotipica Iué escrito en ellenguaje SAS (Statistical Analysis System) (7,8). El usuario tiene dos alternativas: si tiene el conocimierito necesario del paquete SAS, puede elaborar un programa SAS propio que incluya las sentencias que se presentan en el apendice de éste articulo, y ejecutarlo en forma convencional, o, en.

(3) GALINDO. Anälisis estadIstico SAS caso contrario, utilizar Ia facilidad interactiva propuesta en este trabajo, para lo cual debe disponer de los archivos necesarios que se señalan posteriormente. En cualquier caso, el usuario debe disponer del equipo adecuado y del paquete SAS.. Ejecución del programa SAS en forma convencional Para escribir el programa SAS propio, puede usar el EDITOR del paquete SAS, siguiendo las reglas de sintáxis del lenguaje. Para este caso se explicará Ia forma de crear el archivo de trabajo SAS y se anexa el programa con las sentencias necesarias para solicitar el anälisis de estabilidad fenotipica. Una vez transcrito y grabado, se ejecuta en Ia forma convencional de un programa SAS, es decir teniendo el programa en Ia ventana del editor, se oprime Ia tecla F-i 0.. Creación del archivo de datos El archivo de datos debe corresponder a los resultados de un ensayo de estabilidad fenotipica realizados en un disefto de bloques completos al azar en varios ambientes o localidades. Las variables de clase son el nümero de bloque, el ambiente (o localidad), y el genotipo. Las variables de Ia respuesta medida en los genotipos pueden ser de rendimiento o calidad de Ia producci6n, 10 cual se define de acuerdo a los objetivos de Ia investigaciOn. Los datos se deben ordenar en una matriz, donde cada linea es una observaciOn, y las columnas contienen informaciOn de las variables de clase, con las cuales se identifica cada observaciOn, y las variables de respuesta, que contienen los resultados. experimentales. Para ilustrar el procedimiento, se presentart un ejemplo modelo utilizando los resultados de un ensayo de estabilidad fenotIpica donde se midlO el rendimiento de fibra de algodOn de cinco genotipos, evaluados en un diseno de bloques completos al azar en siete ambientes, con dos bloques por localidad. Estos datos corresponden a un extracto de Ia tesis sobre 'EvaluaciOn de genotipos de algodOn', del Dr. Miguel Espitia, ICA, Cesar (3). La matriz de datos con los resultados está grabada en un archivo texto, que en el presente caso se denomina 'Datos.txt' y se encuentra en Ia unidad A.. Programa SAS de usuario Una vez se tenga grabado el archivo de datos, (Datos.txt) el primer paso para Ia realizaciOn del análisis de estabilidad fenotipica consiste en crear un archivo de trabajo SAS. Para el ejemplo modelo, este archivo se ordena mediante las siguientes sentencias: DATA UNO; INFILE 'A:DATOS.TXT'; INPUT REP LOCAL GENOTIPO RENDHA; La variable REP corresponde al nUmero de bloque en el diseno de bloques, LOCAL corresponde a un nUmero de localidad, GENOTIPO a un cOd igo que identifica cada genotipo, y RENDHA al rendimiento por hectárea de Ia variable medida. Para solicitar el análisis de estabilidad fenotipica, debe transcribir a continuaciOn el programa que figura en el apéndice bajo el nombre de EBERHART.TEM, y ejecutarlo en Ia forma convencional. Cuando el usuario posee Ia informaciOn a analizar de forma que se pueda ajustar al ejemplo modelo, sin cambiar los nombres. 51.

(4) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - f1arzo 1992 de variables, puede seguir los pasos descritos y obtener el análisis de estabilidad. EJECUCION DEL PROGRAMA EN FORMA I NTERACTIVA Para efectuar el análisis de estabilidad fenotipica en forma interactiva, objetivo principal de este trabajo, el usuario debe poseer un diskette en Ia unidad A con los programas básicos: EBE R HA RI. P RS E BE R HA RI. SSP Estos dos arch ivos constituyen el paquete de análisis de estabilidad fenotipica y pueden ser solicitados a la DivisiOn de Biometria, ICA, Tibaitatä. Para utilizar Ia forma interactiva, el usuario debe crear el archivo de trabajo SAS tal como se explicO en el numeral 1, pero sin transcribir el archivo EBERHART.TEM.. Para solicitar el análisis se debe escribir a continuaciOn Ia sentencia %INCLUDE nombrando el archivo "EBERHART.PRS". Para el ejemplo modelo, el programa SAS cornpleto queda asi: OPTIONS PS=60 LS=132 NODATE: DATA UNO; INFILE A:DATOS.TXT; INPUT REP LOCAL GENOTIPO RENDHA; %INCLUDE 'A:EBERHART.PRS';. Para ejecutarlo se utiliza el comando SUBMIT (0 se oprime la tecla Fl 0). Después de unos segundos, aparece la ventana denominada 'EBERHART' que se ilustra en Ia Figura 1. En esta ventana se solicita al usuario teclear la informaciOn requerida, referente al nombre del archivo y nombres de variables. Como los nombres por omisiOn consisten exactamente en los nombres de variables del ejemplo modelo, en este caso sOlo es necesario teclear ENTER hasta liegar a Ia ültima linea de Ia ventana EBERHART.. Command ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA METODOS UTILIZADOS: Wricke (1962) Eberhart & Russell (1966) Tal (1971) Shukla (1972) Cota minima de Eskridge (1990) COLOQUE LOS SIGUIENTES NOMBRES Y TECLEE RETORNO: ARCHIVO SAS? VARIABLE(S) DEPENDIENTE(S) A ANALIZAR? VARIABLES DE CLASE Localidades? Genotipos? Repeticiones?. (t:jltimo creado) (RENDHA) (LOCAL) (GENOTIPO) (REP). Si deja el espacio en blanco, se asigna por omisiOn el nombre entre parOntesis. FIGURA 1. Ventana Eberhart donde se soilcita la inlormac,On básica para realizar el análisis de estabilidad fenotipica.. 52.

(5) GAIINDO. Análisis estadIstko SAS Una vez se teclea ENTER para Ia Ultima Ilnea de Ia ventana EBERHART, se inicia automáticamente Ia ejecuciOn del programa SAS que realiza el anälisis de estabilidad fenotipica. Los resultados son idénticos a los obtenidos por el usuario que transcribe el programa EBERHART.TEM y Jo ejecuta en forma convencional. Las ventajas de utilizar el modo interactivo son Ia flexibilidad para aceptar cualquier nombre de archivo o nombres variables, y para analizar más de una variable de respuesta a Ia vez. Para tal efecto, Ia informaciOn requerida en Ia ventana EBERHART puede ser diiigenciada con las misrnas facilidades que contiene el paquete SAS para los procedimientos estadIsticos: El nombre del archivo SAS puede omitirse, en cuyo caso el programa utiliza el ültimo archivo SAS creado. TambiOn se puede nombrar un archivo SAS permanente, en cuyo caso debe darse el nombre de Ia librerla con el nombre SAS del archivo, separados por un punto (nombrede-librerla. nombre-de-archivo, que es Ia convenciOn corriente). Para tal efecto debe haberse definido previamente el nombre de Ia libreria con Ia sentencia LIBNAME de SAS. Se puede omitir el nombre de las variables de análisis y de clase, Si los nombres de las variables existentes en el archivo SAS corresponden a los nombres que se asumen por omisiOn en el programa (Senaladas entre parentesis). Si los nombres de las variables de respuesta a analizar constan de un prefijo cornün y un sufijo nurnérico en secuencia, coma por ejemplo REND1 REND2 REND3 (cada una corresponde al rendimiento de calidades diferentes), la espe-. cificaciOn puede abreviarse de Ia forma corriente, calocando Ia primera y Liltima variable de Ia serie separadas por un signo '-': REND1-REND3. También puede utilizarse el doble guiOn (--) para mencionar Ia primera y Ultima variables que encierran una serie de variables adicionales, de acuerdo al orden con que estén dispuestas en el archivo SAS. Para el caso, en que el archivo de datos sea un archivo SAS permanente, que se encuentra en el diskette de Ia unidad A, se ilustra un ejemplo, donde el archivo permanente SAS se Ilamará NUEVO (en el directorio del diskette aparecerá coma NUEVO.SSD) y contendrá las variables de clase: BLOQUE, AMBIENTE, GENOTIPO, y Ia variable de respuesta FINURA. Para tal caso, el programa SAS que solicita el anälisis es el siguiente:. LIBNAME DISK 'A:'; TITLE 'ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA EN ALGODON'; %INCLUDE 'A:EBERHART.PRS';. El usuario puede (opcionalmente) colocar el primer tItulo con el comando TITLE de SAS para mejarar Ia presentaciOn de los resultados. La linea 2 de los tItuIos (TITLE2) estA reservada para el programa EBERHART. Para este caso, el paquete de análisis de estabilidad esta en el diskette de Ia unidad A e igualmente el archivo SAS permanente. DespuOs de su ejecuciOn (con SUBMIT a Fl 0) aparecera Ia ventana EBERHART que se debe diligenciar de Ia manera como se ilustra en Ia Figura 2. La salida aparecerá en Ia ventana OUTPUT y su explicaciOn se encuentra bajo el numeral de Resultados y DiscusiOn del presente articuio.. 53.

(6) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - Marzo 1992 El paquete de análisia de estabilidad fenotIpica A continuaciOn se explica brevemente Ia funciOn de cada uno de los archivos del paquete de análisis de estabilidad fenotIpica que utiliza el usuario para solicitar el análisis interactivamente con Ia ventana EBERHART. Existen dos archivos básicos y uno generado por Ia ejecuciOn de los dos anterlores. Los básicos son EBERHART.PRS, y EBERHART.SSP. El archivo del programa se denornina EBERHART.TEM. A continuaciOn se explica el objeto de cada archivo: * EBERHART.PRS Es un archivo de control del programa donde se le especifican los nombres de librerias para los archivos permanentes SAS (sentencia LIBNAME), un nombre de archivo DOS donde se graba el programa SAS para su posterior ejecuciOn (sentencia FILENAME) Ia orden de ejecuciOn del archivo ejecutable SAS (sentencia RUN), y finalmente, Ia orden de ejecutar el programa EBERHART.TEM que contiene las Ilneas de programaciOn SAS para realizar el análisis de estabilidad fenotipica (sentencia %INCLUDE). Las Ilneas del archivo son: LIBNAME DISK 'A:'; FILENAME EBERHART 'A:EBERHARTTEM RUN DATA=PGM.EBERHART: %INCLUDE 'A:EBERHART.TEM'. El usuario puede modificar este archivo para ubicar el programa ejecutable en el disco duro u otra unidad cualquiera. * EBERHART.SSP Es el archivo ejecutable de SAS, que micia Ia creaciOn de una ventana de captura. 54. EBERHART donde el usuario escribe los datos bsicos del archivo a ser analizado, y genera un programa SAS bajo el nombre de EBERHART.TEM que realiza el anãlisis propiamente dicho. * EBERHART.TEM Es el archivo que contiene el programa SAS con los procedimientos necesarios para hacer el análisis de estabilidad fenotIpica. Este archivo puede ser visto y editado por el usuario con conocimientos de SAS. Es un archivo temporal, porque se reescribe con cada ejecuciOn del paquete. El archivo EBERHART.PRS lo ordena ejecutar inmediatamente el usuario termina de Ilenar los datos de la ventana EBER HART, con Ia sentencia % INC LUDE.. RESULTADOS Y DISCUSION. Si el usuario ha utilizado Ia forma convencional para realizar el análisis de estabilidad fenotIpica, transcribiendo el programa del ejemplo modelo de Ia forrna como se indicO anteriormente, o ha utilizado el modo interactivo para solicitar el anlisis, los resultados de los procedimientos incluirän: * Un anälisis varianza para un diseño de bloques completos al azar combinado en localidades. * Tabla de doble entrada local idad * genoti po para los promedios de rendimiento * Análisis de regresiOn lineal simple para Ia variable de respuesta (rendimiento) en furiciOn de los indices ambientales. * Cálculo de los parámetros de estabilidad por las diferentes metodologias..

(7) C ALINDO Análisis estadIst ico SAS. Command ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA METODOS UTILIZADOS: Wricke (1962) Eberhart & Russell (1966) Tai (1971) Shukla (1972) Cota minima de Eskridge (1990) COLOQUE LOS SIGUIENTES NOMBRES Y TECLEE RETORNO: ARCHIVO SAS?. DISK.NUEVO. VARIABLE(S) DEPENDIENTE(S) A ANALIZAR?. (RENDHA). (iltimo creado). FINURA VARIABLES DE CLASE Localidades?. AMBIENTE. (LOCAL). Genotipos?. TRAT. (GENOTIPO). Repeticiones?. BLOQUE. (REP). Si deja el espacio en blanco, se asigna por omisiOn el nombre entre paréntesis. FIGURA 2. Ventana Eberhart donde se Ilena Ia inlormación requerida para realizar el anállsis de estabilidad lenotipica. Para el ejemplo los resultados de Ia ejecuciOn del programa incluyen un anáflsis de varianza cornbinado con el procedimiento PROC ANOVA de SAS, que se presenta en Ia Tabla 1, una tabla de promedios cruzados GENOTIPO * AMBIENTE realizada por el procedimiento PROC TABULATE, que se presenta en Ia Tabla 2, los análisis de regresiOn para cada genotipo del rendimiento de fibra en funciOn del indice ambiental, realizados con el procedimiento PROC REG, que por su extensiOn no se presentan, y finalmente, un resumen (Tabla 3) con los parámetros de estabilidad para cada genotipo, resultado de '.in procedimiento PROC PRINT.. Adems, en Ia libreria de trabajo de SAS (SAS WORK) quedan grabados automäticamente dos archivos: * XDATA1 Contiene los promedios de genotipo por ambiente para cada variable analizada. Corresponden a los promedios que se presentan en salida del programa EBERHART con el procedimiento TABULATE. * XDATA2 Contierie Ia informaciOn de los parámetros de estabilidad, tal coma aparecen en Ia tabla resumen.. 55.

(8) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - Marzo 1992 Estos archivos son temporales, por cuanto son borrados cuando Ia sesiOn de SAS termina, a menos que el usuario los grabe en un directorlo propio. Si el usuario desea modificar o mirar algUn paso del programa SAS, puede hacerlo , en dando Ia orden INCLUDE EBERHART Ia linea de comandos del editor SAS.. El uso de ventanas para Ia programaciOn SAS ya es corriente en las versiones de SAS 6,03 en adelante. Por Ia versatilidad del SAS, el lenguaje interactivo y Ia precisiOn de los resultados, el programa EBERHART es una herramienta Util para el fitomejorador.. TABLA 1. Anâlisis Combiflado Resultado de Ia Ejecución del Programa de Estabilidad. ANALISIS COMBINADO POR LOCALIDADES. VARIABLE DEPENDIENTE= RENDF Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: Source Model Error Corrected Total. DF 41 28 69. Sum of Squares 7236871.44285716 961244.39999998 8198115.84285714. Mean Square 176509.05958188 34330.15714286. R-Square 0.882748. CV. 19.39885. Root MSE 185.28399052. DF 7 6 4 24. Anova SS 380971.10000002 3817253.14285714 1398253.34285714 1640393.85714286. Mean Square 54424.44285715 636208.85714286 349563.33571429 68349.74404762. Source REP(LOCAL) LOCAL GENOTIPO LOCALGENOTIPO. Pr F 0.0001. F Value 5.14. Mean 955.12857143 Pr F 0.1809 0.0001 0.0001 0.0407. F Value 1.59 18.53 10.18 1.99. TABLA 2. Promedios de Ia Variable RENDF para Ia Interacción Genotipo-Ambiente. VARIABLE DEPENDIENTE = RENDF AMBlE N T E S. 0 ENOTIPO 1 5 8 12 15 PROMEDIO. 56. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 5. PROMEDIO. 1607.000 1392.500 1453.500 1176.500 1015.500 1329.000. 1112.000 1019.000 1623.000 1021.500 427.000 1040.500. 1371.500 1181.000 1474.500 853.500 1113.000 1198.700. 1113.000 707.000 1019.000 936.000 929.000 940.800. 1046.000 701.000 689.000 712.000 750.000 779.600. 865.000 708.000 1070.500 706.000 543.000 778.500. 574.000 614.500 663.500 584.000 658.000 618.800. 1098.357 903.286 1141.857 855.643 776.500 955.129.

(9) TABLA 3. Parámetros de Estabilidad Segün Diversos Autores. ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA VARIABLE DEPENDIENTE = RENDF. GENOTIPO. 1 5 8 12 15. u-I. SHUKLA METODOS: EBERHART & RUSSELL F DESV.REG Sigma PROMEDIO b. 1098.36 903.29 1141.86 855.64 776.50. 1.26902 1.12742 1.29242 0.72160 0.58954. 10228.16 9125.11 51148.56 10994.28 50470.65. 10487.88 3003.70 68715.30 12096.86 76570.63. 0.61 0.17 4.00 0.70 4.46. COlA DE ESKRIDGE G. TAI PR F Eberhart Shukla Alfa Lambda. 0.692 0970 0.007 0.625 0.004. 902.508 738.700 753.234 652.694 374.709. 671.690 0.29418 501.052 0.13934 559.097 0.31978 423.904 -0.30445 175.779 -0.44885. 0.58933 0.54672 3.06690 0.63360 2.98981. ECOV W. 157532.43 103646.31 576769.83 169117.06 633328.23.

(10) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - Marzo 1992 CONCLUSIONES. BECKER, H.C. 1986. Measures of phenotypic stability. Crop Science 26:894-899. Se creO el programa EBERHART para computadores compatibles con el paquete SAS, para realizar el análisis de estabilidad fenotipica por varias metodoIogIas estadisticas. Su ejecuciOn se puede realizar en forma convenciorial o en forma interactiva. Con ésta Ultima se utiliza el modo interactivo WINDOW para solicitar al usuario en una ventana EBER HART los datos básicos para realizar el análisis.. ESPITIA, M. 1992. Análisis de estabilidad Fenotipica para variedades de algodOn. Tesis M.Sc. Universidad Nacional de Colombia, Fac. de Agronomia, Programa de Posgrado en Fitomejoramiento. ESKRIDGE,K. 1990. Selection of stable cultivars using a Safety-First rule. Crop Science 30:369-374. GERARDINO, A. 1989. Manual para el análisis estadistico computarizado agricola. Division de Biometria, ICA, Tibaitatá.. - La forma interactiva es de fácil operaciOn y el usuario requiere de conocimientos mlnimos del paquete SAS para Ia creaciOn de un archivo de trabajo SAS. Con una sola sentencia (%include) se solicita el análisis de estabilidad, para lo cual se genera Ia ventana EBERHART, donde el usuario digita la informaciOn requerida, en forma similar como 10 hace con los procedimientos corrientes del SAS.. KANG, M.S. 1985. A SAS program for calculation of stability-variance parameters. The Journal of Heredity 76:142-143. SAS INSTITUTE. 1989. SAS language and procedures: Usage, Version 6. SAS Institute Inc, Cary, NC. 638 p.. - Con un nivel alto de confiabilidad, el fitomejorador puede concluir acerca de sus ensayos, basado en una sola metodologla o Ia cornbinaciOn de las propuestas en éste trabajo.. SAS INSTITUTE. 1988. SAS/STAT User's Guide, Release 6.03. SAS Institute lnc.,Cary, NC. 1028 pp.. SHUKLA, G.K. 1972. Some statistical aspects for partitioning genotype-environ mental components of variability. In: Jines J.(ed), Heredity Birminghan, Great Britain. pp 237-245. REFERENCIAS BIRLIOGRAFICAS. EBERHART, S.A; RUSSELL, W.A. 1966. Stability parameters for comparing varieties. Crop Science 6:36-40. 58. 10.. TAt, C.C. 1971. Genotypic stability analysis and it's application to potato regional trials. Crop Science 11:181-190.

(11) GAUNDO. Análisis estadIstico SAS APENDICE Programa EBERHART.TEM. OPTIONS NODATE NONOTES NOSOURCE2 LS= 132 PS=60; PROC SORT DATA=UNO; BY LOCAL GENOTIPO REP; Ordena los datos del archivo UNO por local, genotipo y rep, Fija los tamaños de página para impresión (opcional) DATA XDATA1 (RENA ME(R END HA = _)); SET UNO; VARDEP="RENDHA'; LABEL VARDEP=VARlABLE DEPENDIENTE"; Asigna rátulos y nombres de variables; PROC ANOVA OUTSTAT=XSTAT1(DROP_TYPE_ F PROB); BY VARDEP; MODEL - = REP (LOCAL) LOCAL GENOTIPO TITLE2 'ANALISIS COMBINADO POR LOCALIDADES'; Realiza el análisis de varianza combinado para cada una de las variables dependientes; PROC MEANS NOPRINT DATA =XDATA1; BY VARDEP LOCAL GENOTIPO; VAR _; OUTPUT OUT =XDATA1(KEEP= VARDEP LOCAL GENOTIPO - NR) MEAN=_ N=NR; Obtierie los promedios par ambiente y genotipo; PROC TABULATE FORMCHAR =. '; BY VARDEP;. CLASS GENOTIPO LOCAL; VAR; LABEL = ------- LOCAL ="AMBIENTES'; TABLE GENOTIPO ALL(LOCAL ALL)*(_. (MEAN)) F = 10.3 /RTS = 10; KEYLABEL MEAN= ' ALL='PROMEDIO"; TITLE2; * Presenta los promedios de cada variable dependiente en una tabla de doble entrada (ambiente-genotipo); PROC SUMMARY; BY VARDEP; CLASS LOCAL VAR; OUTPUT OUT=XDATA2(DROP=_FREQ_) MEAN=MLOC N=NTR; Calcula el promedio global y los promedios par ambiente; DATA XDATA2(DROP=_TYPE_);MERGE XDATA1 XDATA2; BY VARDEP LOCAL; RETAIN GLOBAL; IF _TYPE_=0 THEN DO; GLOBAL=MLOC; DELETE; END; INDICE= MLOC-GLOBAL; UIJ = _-MLOC; INDUIJ = INDICE' UIJ; * Calcula los indices ambientales; PROC SORT; BY VARDEP GENOTIPO; PROC SORT DATA =XSTAT1; BY _NAME_; DATA XSTAT1(KEEP=VARDEP GLE CM); SET XSTAT1; RETAIN GLE;. 59.

(12) REVISTA ICA, Vol. 27, Enero - Mario 1992 IF _SOURCE_= ERROR' THEN GLE =DF; CM = SS/DF; Ordena los resultados de los análisis de variaaza para usarlos en el cálculo de parãmetros de estabilidad PROC TRANSPOSE OUT=XSTAT1(KEEP=VARDEP GLE CM1-CM3) PREFIX=CM; BY VARDEP GLE; VAR CM; Dispone Ia informaciOn para combinarla en un archivo final; TITLE2 'ANALISIS DE REGRESION PARA CADA GENOTIPO"; TITLE3; PROC REG DATA=XDATA2 OUTEST = XEST(KEEP = VARDEP GENOTIPO INDICE _RMSE_); BY VARDEP GENOTIPO; MODEL -= INDICE; Realiza los análisis de regresiOn de Ia variable(s) dependiente(s) en funciOn del indice ambiental; PROC MEANS NOPRINT DATA=XDATA2; BY VARDEP GENOTIPO VAR INDICE UIJ INDUIJ NR NTR; OUTPUT OUT=XDATA2(DROP=X1-X18) SUM = Xl X2 X3 SINDUIJ X4 X5 MEAN = PROM EDIO X6 X7 X8 NR NTR CSS = X9 XlO SCCUIJ Xli X12 X13 N = NLOC X14 X15 X16 X17 X18; Realiza pasos intermedios en el cálculo de parámetros de estabilidad; PROC MEANS NOPRINT; BY VARDEP; VAR 5CCLIIJ; OUTPUT OUT= XDATA3(KEEP =VARDEP SCCTUIJ) SUM = SCCTUIJ; Consolida las sumas de cuadrados de los indices U DATA XDATA2 (KEEP=VARDEP GENOTIPO PROMEDIO B DESV_REG ESKEBER SIGMA F PRF ESKSHUK ALFA LAMBDA W); MERGE XEST XDATA2 XDATA3 XSTAT1 ; BY VARDEP; 8= INDICE; DESVREG=RMSE 2; CME= CM1/NR; SIGMA = (NTR (NTR-1)SCCU IJ-SCCTUIJ)/((NLOC-l) (NTR-i ) (NTR-2)); IF SIGMA = 0 THEN DO; F = SIGMAICME; PRF = 1 -PROBF(F,(NLOC-2),GLE); ESKSHUK = PROMEDIO-1 .645 SQRT(SIGMA); END; ESKEBER = PROMEDIO-1.645* SQRT(DESVREG); ALFA = NTR * NR SINDUIJ/(NLOC-i )/(CM3-CM2); LAMBDA = NTR NR (SCCUIJ/(NLOC-1 )-ALFASINDUIJ/(NLOC-1))/CM1 /(NTR-l); W =SCCUIJNR; TITLE2 "ANALISIS DE ESTABILIDAD FENOTIPICA"; TITLE6 Une los archivos de los resultados de análisis de varianza y de análisis de regresiOn junto. 60.

(13) C AI,INDO. AnáIisiN eS(adIstic() SAS con los cálculos de indices ambientales para calcular los parámetros de estabilidad segün las diferentes metociologias PROC PRINT SPLIT = ""BY VARDEP;PAGEBY VARDEP; ID GENOTIPO; VAR PROM EDIO B DESV_REG SIGMA F PRF ESKEBER ESKSHUK ALFA LAMBDA W; LABEL PAOMEDIO= "MET000S: * * PROMEDIO B = '-EBERHART B" DESV_REG="& RUSSELL- DESV.REG" SIGMA = SIGMA" F =' SHUKLA PRF= PR F" ESKEBER = -COTADE EBERHART" ESKSHUK = ESKRIDGE- SHUKLA" ALFA ="----G. ALFA" LAMBDA = TAI---LAMBDA" W=" -ECOV- *W; FORMAT F .2 PAF .3; QUIT: TITLE2; TITLE3; Presenta los parámetros de estabilidad en una tabla de resultados OPTIONS NOTES SOURCE2; Reactiva las opciones para Ia coIocacin de notas y archivos fuentes del SAS. 61.

(14)

Figure

FIGURA 1. Ventana Eberhart donde se soilcita la inlormac,On básica para realizar el análisis de  estabilidad fenotipica
FIGURA 2. Ventana Eberhart donde se Ilena Ia inlormación requerida para realizar el anállsis  de estabilidad lenotipica
TABLA 1. Anâlisis Combiflado Resultado de Ia Ejecución del Programa de Estabilidad
TABLA 3. Parámetros de Estabilidad Segün Diversos Autores

Referencias

Documento similar

Cedulario se inicia a mediados del siglo XVIL, por sus propias cédulas puede advertirse que no estaba totalmente conquistada la Nueva Gali- cia, ya que a fines del siglo xvn y en

No había pasado un día desde mi solemne entrada cuando, para que el recuerdo me sirviera de advertencia, alguien se encargó de decirme que sobre aquellas losas habían rodado

[r]

SVP, EXECUTIVE CREATIVE DIRECTOR JACK MORTON

Social Media, Email Marketing, Workflows, Smart CTA’s, Video Marketing. Blog, Social Media, SEO, SEM, Mobile Marketing,

Missing estimates for total domestic participant spend were estimated using a similar approach of that used to calculate missing international estimates, with average shares applied

Por lo tanto, en base a su perfil de eficacia y seguridad, ofatumumab debe considerarse una alternativa de tratamiento para pacientes con EMRR o EMSP con enfermedad activa

The part I assessment is coordinated involving all MSCs and led by the RMS who prepares a draft assessment report, sends the request for information (RFI) with considerations,