Laboratorio de Epidemiología Molecular Servicio de Microbiología

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Laboratorio de Epidemiología Molecular

Servicio de Microbiología

Análisis molecular de los aislados clínicos de Acinetobacter

baumannii multirresistente de las Islas Baleares

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ÍNDICE

1. ANTECEDENTES... 3

2. MATERIALES Y MÉTODOS... 3

2.1. Cepas analizadas... 3

2.2. Detección y caracterización molecular de las carbapenemasas implicadas ... 3

2.3. Tipado molecular de las cepas de A. baumannii ... 4

3. RESULTADOS... 4

4. CONCLUSIONES... 4

4.1. Acciones futuras... 5

5. PARTICIPANTES EN EL ANÁLISIS Y EN EL INFORME... 5

6. ANEXOS... 5

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1. ANTECEDENTES

Acinetobacter baumannii es considerado uno de los patógenos nosocomiales más importantes a

nivel mundial, principalmente por su gran capacidad de desarrollar resistencia a todos los grupos de antimicrobianos y por persistir durante largos períodos de tiempo en el ambiente hospitalario. Destaca por su incidencia en las Unidades de Cuidados Intensivos y Reanimación.

Desde el primer caso en el Hospital Universitario Son Espases (HUSE) en el año 2010 (Espinal P

et al. Antimicrob Agents Chemother. 2013; 57:589-91), han persistido los aislamientos de A. baumannii multirresistente en toda la Comunidad Autónoma. Como característica común, estos

aislamientos son resistentes a todos los antibióticos exceptuando la colistina y la tigeciclina. Dada la gran relevancia clínica y epidemiológica de este patógeno, el Laboratorio de Epidemiología Molecular del HUSE ha caracterizado todos los aislados de A. baumannii multirresistente disponibles hasta la fecha del presente informe.

2. MATERIALES Y MÉTODOS 2.1. Cepas analizadas

La colección de cepas analizadas comprende la práctica totalidad de aislados de A. baumannii multirresistente recuperados en HUSE o remitidos para su estudio desde otros hospitales de las Islas Baleares, desde su aparición en febrero de 2010 hasta octubre de 2015. Concretamente, se han estudiado un total de 78 cepas procedentes de diversos hospitales de la Comunidad Autónoma o de muestras remitidas desde Atención Primaria. De estas 78 cepas, 76 son aislados clínicos y los 2 restantes corresponden a aislados de muestras superficiales. Solamente se ha incluido un aislado por paciente.

2.2. Detección y caracterización molecular de las carbapenemasas implicadas

La detección y posterior caracterización de las carbapenemasas implicadas se llevó a cabo mediante amplificación por PCR con cebadores específicos y posterior secuenciación de los genes blaOXA-23, blaOXA-24 y blaOXA-58.

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2.3. Tipado molecular de las cepas de A. baumannii

Se ha utilizado la electroforesis de campo pulsado (ECP) siguiendo el Procedimiento Normalizado de Trabajo EM-TL-001 del Servicio de Microbiología, de acuerdo con las condiciones establecidas para A. baumannii, y utilizando SmaI como enzima de restricción.

3. RESULTADOS

Tal como se puede observar en el Anexo 1, 76 de las 78 cepas (97,4%) pertenecen a un mismo clon mayoritario. En todos los aislados pertenecientes a este clon, además, se ha detectado la betalactamasa OXA-23 mediante PCR específica.

Por otra parte, un aislado de 2015 del HUSE, procedente de un paciente natural de Bulgaria que había establecido recientemente su residencia en Mallorca, presentó un patrón de campo pulsado ligeramente distinto al del clon mayoritario, identificándose así como un subclon del mismo. Además este aislado fue el único en el que se detectó la presencia de la carbapenemasa OXA-24. Por último, una cepa aislada en una muestra procedente de Atención Primaria resultó pertenecer a un clon esporádico y no se detectó la presencia de OXA-23, OXA-24 o OXA-58.

4. CONCLUSIONES

Los resultados ponen de manifiesto la diseminación de un clon mayoritario de A. baumannii multirresistente productor de OXA-23 en las Islas Baleares, que hemos denominado ABAU1-OXA-23. Trabajos previos muestran como este clon pertenece al Clon Europeo II (EC-II) y el análisis de multilocus sequence typing (MLST) permitió atribuirle el secuenciotipo ST2 (Espinal P

et al, AAC 2013; 57: 589-591).

Dicho clon, no solamente se circunscribe al HUSE, sino que se encuentra ampliamente diseminado en las Islas Baleares. Desde hace años es especialmente prevalente en el Hospital Comarcal de Inca, pero también se ha detectado más recientemente en el Hospital Can Misses, en el Hospital General y en numerosos pacientes procedentes de centros de Atención Primaria de toda la geografía insular.

Por otro lado, se ha identificado un subclon de ABAU1 productor de carbapenemasa OXA-24. Dicho subclon se ha denominado ABAU1A-OXA-24 y procede de en un paciente ingresado en la UCI del HUSE, natural de Bulgaria, con residencia reciente en Mallorca. La presencia de A.

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probablemente se trate de un caso importado.

4.1. Acciones futuras

Debido a la elevada trascendencia clínica y de Salud Pública de estos hallazgos, se considera conveniente continuar con el seguimiento epidemiológico de los casos nuevos de A. baumannii multirresistente en todos los hospitales de la Comunidad Autónoma, además del envío periódico de los correspondientes aislados al Laboratorio de Epidemiología Molecular del Hospital Son Espases para proceder a su caracterización y tipado molecular por ECP.

5. PARTICIPANTES EN EL ANÁLISIS Y EN EL INFORME Coordinadores:

• Xavier Mulet Aguiló, Laboratorio de Epidemiología Molecular, Servicio de Microbiología.

• Antonio Oliver Palomo, Laboratorio de Epidemiología Molecular, Servicio de Microbiología.

Otros participantes:

• Laura Zamorano Páez, Laboratorio de Microbiología, Unidad de Investigación.

• Maria Gayá Ribas, Laboratorio de Epidemiología Molecular, Servicio de Microbiología.

Revisión:

• José L. Pérez Sáenz, Servicio de Microbiología, Hospital Son Espases.

6. ANEXOS

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Anexo 1. Resumen de las características y resultados del estudio

Nº muestra Paciente Tipo muestra Servicio Fecha PCR Clon

05060546 ALM Esputo NML 02/2010 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

07/0421 RCVS Herida H.C. Inca 01/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

07/0712 CWA Cepa H.C. Inca 01/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

07/9891 DAS Esputo H.C. Inca 03/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

08/7587 ODS BAS H.C. Inca 04/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

08/8685 PCM Orina H.C. Inca 05/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

09/5381 MCMA L. Peritoneal H.C. Inca 06/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

01238151 PAGS Orina UCI 07/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

09/8129 JCC Orina H.C. Inca 07/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

00/0712 JPV Herida H.C. Inca 08/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

01/7830 CVS Catéter H.C. Inca 09/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

02/1245 AFS Esputo H.C. Inca 10/2011 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05091752 FBC BAS UCI 02/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05091949 JAP Ex. Rectal UCI 02/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05093116 PBM BAS UCI 03/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05093118 ACG Exudado TRI 03/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05094860 MCAA Exudado MIR 04/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

05095776 PPM Úlcera pie DM END 04/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

01278117 AFR Orina Bonanova 05/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

544469 PAPS Úlcera CS Inca 06/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

547237 JGC Asp. traqueal NML 06/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

542957 MFV Ex. celulitis CS Pollença 06/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

564884 DMR Orina URG-UCE 08/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

548490 AFP Orina CS Inca 10/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

552838 CGL Ex Faringeo CS C’Picafort 11/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

558258 SJR Ex. rectal MPR 11/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

557195 RES BAS REA 12/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

567645 MADC C. bronquial NML 12/2012 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

569686 DRS Ex Inguinal MPR 01/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

827928 MCSG Ex Herida Qx CGD 01/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

829431 PSV BAL REA 01/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

574481 JEE BAS REA 01/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

579590 MPMDC F. Axilar MPR 02/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

544818 ARM Orina CS Sineu 02/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

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548860 - Superficie REA 03/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

549216.2 FJM BAS UCI 03/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

873471 JSC Ex Inguinal NRC 04/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10157980 JBC Orina MIR 09/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10211770 RBU Catéter NRL 12/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91236340 IRR Absceso UCE 12/2013 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16008046 JLS BAS NML 02/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10080275 MAAR Catéter UCI 03/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91339197 ARH Úlcera H. General 04/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16028533 IBJJ Orina CS Inca 05/2014 Negativo Clon esporádico

91365489.1 JAMR Herida CS Palma 06/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10140153.2 MMRP Ex Herida CPL 06/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16037247 RCRAC BAS UCI 08/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16038894.1 BMT Úlcera UCI 09/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10202755 JAMM Ex Herida Qx CPL 09/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10201100 DRM Orina URO 09/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91524632 ABD Úlcera CS Palma 10/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10230145.2 FEPI Ex. Rectal URO 10/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91419764 IBG Ex. Rectal H. General 11/2014 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16048329.3 DMGG Orina CS Palma 01/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91544938 GPC Orina HC Inca 02/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

10339636 MAR Ex. Rectal MIR 03/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

91608504 CPO Esputo H.C. Inca 03/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

41002323 BSC Cepa H. Can Misses 03/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

44102986 JCV Cepa H. Can Misses 04/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

16055002 RGSN Cepa H. Can Misses 04/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 91687093 CMP Orina H. General 05/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 91723941 PASS Ex. Herida CS Sa Pobla 06/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 91795873 JMPR Úlcera CS Inca 07/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 10452077 ARJ Ex. Rectal NRC 07/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 16062193 MMM Ex. Herida CPL 07/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 16058203 - Superficie H.C. Inca 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 50020843 TMG Cepa H.C. Inca 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 50017245 MCR Cepa H.C. Inca 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 50020642 MOS Cepa H.C. Inca 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23

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Anexo 1. Continuación (2)

50020783 JMCX Cepa H.C. Inca 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 10460306 RW Esputo MIR 08/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 16059213 MPM Cepa H.C. Inca 09/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 41014364 NRRC Cepa H. Can Misses 10/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 41014332 ACI Cepa H. Can Misses 10/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 41014354 JAFC Cepa H. Can Misses 10/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 41014336 FGP Cepa H. Can Misses 10/2015 OXA-23+ ABAU1-OXA-23 16066061 DMD Ex. Rectal UCI 10/2015 OXA-24+ ABAU1A-OXA-24