Análisis de ADN

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La aplicación de los análisis de ADN en el proceso penal

La aplicación de los análisis de ADN en el proceso penal

Por este motivo, limitar la admisibilidad de la creación de ficheros de ADN a los delitos verdaderamente graves y que responden a determinadas modalidades en su ejecución adquiere pleno sentido dentro del contexto más amplio de las intervenciones corporales y de los análisis de ADN practicables sobre las muestras así obtenidas. SCHNEIDER/RITTNER enmarcan esta restricción dentro de una tendencia más amplia que se va generalizando en diversos países de nuestro entorno cultural. En opinión de los citados autores, resulta imprescindible aclarar que la mera existencia de bancos o ficheros de ADN no constituye a priori ninguna garantía de que se pueda evitar la comisión de nuevos delitos por el mismo autor. En todo caso, sí posibilita una más rápida identificación del infractor reincidente y, en la medida en que la localización y aprehensión de éste sean practicables, obstaculizar terceras y sucesivas conductas ilícitas. Sin son, los autores más arriba citados, partidarios de introducir mayores restricciones que las señaladas en la práctica británica de la Nacional DNS Database. Las opciones que manejan son variadas: una relación o catalogo cerrado de delitos; el establecimiento de una pena que actúa como umbral; pero el criterio que verdaderamente adquiere sentido es el que hace depender la admisibilidad del registro de los análisis genéticos con la naturaleza o modalidad delictiva, es decir, aquellas infracciones delictivas que dejan huellas o vestigios biológicos como los delitos sexuales o los cometidos mediante violencia.

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Desarrollo y evaluación de rendimiento de una aplicación para el análisis de ADN utilizando Hadoop

Desarrollo y evaluación de rendimiento de una aplicación para el análisis de ADN utilizando Hadoop

El primer capítulo contiene todo lo relacionado con establecer un marco de refe- rencia básico acerca de la motivación para la realización del presente proyecto de tesis, así como las contribuciones resultado de la realización del proyecto de tesis. En el segundo capítulo se detalla cómo se consiguen y cuáles son los requerimien- tos necesarios en la aplicación a desarrollar, y se explica cuál es la parte exacta en el análisis de ADN, en que se enfocará la aplicación. De esta manera, se podrá comparar con las diferentes soluciones ya desarrolladas que existen para el pro- blema dentro del análisis de ADN, de manera que se pueda usar las aplicaciones ya desarrolladas como una referencia de la cual podremos extraer puntos fuertes y débiles. Finalmente, en este capítulo se justifica las herramientas que se eligieron para realizar los requerimientos de la aplicación como son Hadoop y Haskell, dando un análisis técnico de las mismas.

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Comprensión de protocolos en análisis de ADN y estrategias audiovisuales en estudiantes de la especialidad de Odontología Forense de la Universidad Científica del Sur – 2017

Comprensión de protocolos en análisis de ADN y estrategias audiovisuales en estudiantes de la especialidad de Odontología Forense de la Universidad Científica del Sur – 2017

Científicos descubrieron que la proteína HLA estaba presente en todas partes del cuerpo a aceptar los glóbulos rojos. También determinaron que HLA fue mayor en la concentración en las células blancas de la sangre, y que hay diferentes tipos de HLA, que variaban de persona a persona. HLA pruebas fue capaz de determinar la paternidad con una precisión del 80%. Las pruebas de ADN siguieron avanzando a través de los años 1980 y 1990. En el científico 80s descubierto una técnica de análisis de ADN denominada polimorfismo de longitud de fragmento de restricción. Esta técnica fue la primera prueba genética para usar ADN real. El estándar para las pruebas de ADN cambió en 1990 cuando el científico comenzó a utilizar una nueva técnica llamada reacción en cadena de la polimerasa o PCR. Este método produce resultados más rápidos y eficientes.

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Caracterización fenotípica y análisis de ADN mitocondrial de llamas de Marcapomacocha, Perú.

Caracterización fenotípica y análisis de ADN mitocondrial de llamas de Marcapomacocha, Perú.

Para el análisis del ADN mitocondrial se evaluó el gen citocromo B (cyt B) me- diante PCR. La prueba utilizó 2.0 μl de ADN con concentraciones que van desde 25 a 50 ng/μl en un microtubo conteniendo la prepa- ración Mix 1X: Buffer de 10X (150 μl), 1.5 mM MgCl 2 (90 μl), 0.25 mM dNTPs (187.5 μl) y H 2 O PCR (1042.5 μl). Posteriormente, se adicionó 0.25 μl del cebador H (40 pmol/ μl), 0.25 μl del cebador L (40 pmol 7 μl), 0.1 μl de Taq DNA pol (5 U/μl) obteniéndose un volumen final de 15.0 μl. Los productos de PCR fueron obtenidos utilizando un termociclador modelo 4200 GeneAmp® (Perkin Elmer). Los productos de PCR (10 μl) del gen cyt B fueron posteriormente so- metidos a la digestión enzimática utilizando la enzima de restricción Mbo I (0.2 μl), siguien-

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Anlisis de DNA en restos seos antiguos

Anlisis de DNA en restos seos antiguos

La identificación humana a través del análisis de ADN de muestras óseas es un método científico de laboratorio al servicio de la investigación forense en nuestro entorno que cada día evoluciona gracias a importantes avances en el campo de la biología molecular y específicamente en su aplicación en el campo de la genética forense que permite nosotros hoy para abordar y resolver casos cada vez más complejos, relacionados con la identificación genética de restos humanos, cuyo proceso tiene pasos como la recolección y el procesamiento de las mejores muestras para obtener perfiles genéticos.

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El ADN de Zamorano

El ADN de Zamorano

En celebración de los primeros 75 años de Zamorano, les quiero contar la historia de 3 personas que desarrollaron el ADN de esta noble institución. La historia inicia en 1891, hace 126 años, cuando Samuel Zemurray emigró de Rusia a los estados unidos, flaco, alto, y pobre. Nos quejamos hoy en día cuando nos avisan de un atraso de vuelo; el viaje del joven Zemurray le tomó meses, por ratos caminando, o en carreta, en tren, y barcos en alta mar, sin dinero, con hambre, un chico de apenas 14 años, con un destino desconocido. El colmo fue que cuando llegó a Nueva York los oficiales de migración no le entendían, hablaba mal el inglés, y le cambiaron el nombre.

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La prueba de ADN

La prueba de ADN

En la mayoría de los núcleos de nuestras células corporales portamos una espiral de 2 m de longitud que contiene información codificada sobre quiénes somos o cómo debe ser el funcionamiento combinado de nuestro cuerpo. Todos somos portadores de unos 30.000 genes, divididos a su vez en 23 pares de estructuras (uno procedente de la madre y otro del padre) que se llaman cromosomas y que se alojan en el interior de los núcleos de las células. Ese cromosoma en forma de aspa se puede descomponer en una doble hélice que a su vez está formada por las que podríamos llamar “frases” del libro de instrucciones de nuestro “mecanismo personal”. Una cadena de ADN está formada por distintos genes, es decir, una secuencia única de moléculas enlazadas llamadas bases químicas (Adenina, Timina, Citosina y Guanina). Estas bases se combinan entre sí para formar códigos de funcionamiento e identidad que podríamos decir que son únicos para cada persona aunque mantiene similitudes con sus familiares. Llevando esta somera y gráfica explicación sobre el ADN al objeto del presente trabajo, podemos decir que el análisis del ADN nos puede facilitar dos tipos de datos. Por un lado tendríamos los datos de tipo codificante, que nos daría información genética de la propia persona y de su predisposición a padecer determinados tipos de enfermedades; y por el otro tendríamos el ADN no codificante, es decir, material genético no sensible llamado “perfil genético” que permite ser convertido a un lenguaje o clave numérica que facilitará, no sólo el almacenamiento, sino también la comparación con otros perfiles y por supuesto la individualización entre todos ellos.

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OPTIMIZACIÓN DE LOS PROTOCOLOS DE EXTRACCIÓN DE ADN Y DEL MARCADOR MOLECULAR TIPO RAPD EN ANONÁCEAS

OPTIMIZACIÓN DE LOS PROTOCOLOS DE EXTRACCIÓN DE ADN Y DEL MARCADOR MOLECULAR TIPO RAPD EN ANONÁCEAS

RESUMEN. Las técnicas moleculares requieren de protocolos que permitan determinar los niveles de variación genética, dentro de las poblaciones en diferentes condiciones ambientales. Tanto la optimización del aislamiento del ADN, como el de las condiciones de trabajo de las amplificaciones, son fundamentales para alcanzar el éxito de los análisis moleculares, por lo que la presente investigación tiene como objetivo: optimizar los protocolos de extracción de ADN y del marcador molecular tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) en Anonáceas. Para la extracción de ADN se utilizaron los Kit Nucleon PHYTOpure y DNeasy ®

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La Activacion de nuestro ADN

La Activacion de nuestro ADN

En la doble hélice hay dos cadenas o filamentos de ADN envueltas dentro de una espiral. Lo que entiendo es que se nos desarrolla(ra) n doce hélices. Durante este tiempo, esto parece haber comenzado hace de 5 a 10 años. Nosotros estamos mutando. Esta es la explicación

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Clulas tumorales circulantes en cncer de mama: un posible riesgo biolgico

Clulas tumorales circulantes en cncer de mama: un posible riesgo biolgico

de tumor o ADN metilado aberrante, pueden emplearse como marcadores de ADN derivado del tumor primario; la detección de ADN aso- ciado con el tumor en el plasma puede deberse simplemente a la presencia de ADN circulante, sin indicar necesariamente la presencia de CTC ya que el ADN libre tiene una vida media prolongada en el plasma y puede ser detectable mucho tiem- po después de que fue liberado por un derrame en el tumor primario, haciendo que la detección de ADN en sangre pueda reflejar meramente la presencia de ADN libre y no de células tumorales circulantes. Otro inconveniente es que, debido a que los cambios como la metilación del ADN ocurren en los estadios tempranos del proceso de tumorogénesis, tales anormalidades pueden ser detectadas en ADN liberado de lesiones displásicas de pacientes que no tienen lesiones neoplásicas. Así pues, aunque la posible detec- ción de CTC basada en ADN es prometedora, aún tiene muchos retos que superar antes de poder ser usada en la práctica clínica.

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Estandarización de una PCR RFLP para la determinación genética de tres poliformismos de la enzima paraoxonasa 1(PON1) en niños costarricenses con leucemia linfocítica aguda

Estandarización de una PCR RFLP para la determinación genética de tres poliformismos de la enzima paraoxonasa 1(PON1) en niños costarricenses con leucemia linfocítica aguda

Si dos moléculas de ADN relacionadas son cortadas con la misma enzima de restricción y ambas difieren en un nucleótido reconocido o no por esta enzima, la molécula resulta en fragmentos de diferente tamaño para cada individuo, esta diferencia en la longitud de los fragmentos de restricción es lo que se conoce como RFLP (Griffiths 2002, Clark 2005). Para visualizar estas diferencias entre individuos, se utilizada la electroforesis en geles de poliacrilamida o agarosa. En contraste con la agarosa, la poliacrilamida permite una mayor resolución, sin embargo los costos y el tiempo invertido son mayores, además es cancerígena. Es utilizado para discriminar secuencias de hasta 1bp de diferencia. Los geles de agarosa son los más utilizados para el análisis de polimorfismos y otros cambios en los genes (Brito 2003).

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Del ADN a las proteinas

Del ADN a las proteinas

En la década de los 40 se desarrollaron técnicas de tinción y análisis que permitieron estudiar en qué lugares de las células aparecían los ácidos nucleicos. Se observó que el ADN solía aparecer casi exclusivamente en el núcleo y en pequeñas cantidades en algún orgánulo celular como las mitocondrias y los cloroplastos, mientras que el ARN aparecía repartido por el citoplasma, sobre todo en los ribosomas, y en ciertas cantidades también en el núcleo. Se comprobó también que existía ADN en los cromosomas, unido a proteínas, viéndose cómo la cantidad de ADN era siempre constante y propia de cada especie, lo que llevó a sospechar que tal vez existía relación entre el ADN de los cromosomas y los genes o factores

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Análisis de las bases nitrogenadas del ADN. Erwin Chargaff

Análisis de las bases nitrogenadas del ADN. Erwin Chargaff

tica molecular tal y como la cono- cíamos. Una de las aplicaciones fue su ayuda a Watson y Crick a descu- brir la estructura del ADN, que se observó que poseía una estructu- ra de doble hélice. A partir de ahí, estos descubrimientos permitieron las primeras técnicas de ingeniería genética ya que se podía localizar y acceder a zonas del genoma que se creían imposibles:

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Comparación de metodologías de extracción de ADN de bacterias Epífitas de Ulva lactuca y tamizaje preliminar de su actividad funcional

Comparación de metodologías de extracción de ADN de bacterias Epífitas de Ulva lactuca y tamizaje preliminar de su actividad funcional

Por otra parte, en el caso de Liu et al. (2011), puede que la extracción no haya funcionado por el método físico de lisis el cual emplea perlas de vidrio. La agitación continua de estas perlas y su golpe contra el alga en un recipiente de volumen considerable (erlenmeyer de 1L), actúan con el mismo principio del bead beating. Sin embargo, el material de las perlas parece influir sobre la eficiencia del método de extracción, además del tamaño y el peso (Bowien y Dürre, 2003; Fujimoto et al., 2004). Evidentemente, las perlas incluidas en los tubos de columna Fast Spin que emplean los kits rápidos de extracción (Longford et al. 2007 y kit ZR) son más pequeñas que las perlas de vidrio, atribuyéndoles una mayor relación superficie/unidad de masa, y por consiguiente una mayor frecuencia de choque contra las bacterias epífitas (Fujimoto et al., 2004), ya sea promoviendo la lisis por centrifugación (tal y como se instruye en el kit empleado por Longford et al. 2007) o por bead beating (kit ZR). De modo que, así hayan empleado reactivos (Buffer STE – Anexo E) que usualmente funcionan para purificar, extraer y precipitar el ADN, si las bacterias epífitas permanecen adheridas a la biopelícula, y si su pared celular mantiene su integridad, entonces no habría acceso para extraer el material genético.

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Obtención y caracterización de híbridos interespecíficos en Pisum y Lathyrus

Obtención y caracterización de híbridos interespecíficos en Pisum y Lathyrus

El análisis del gráfico de la dispersión de las medias de IADN (IAD=IRF de la muestra/ IRF del patrón) permitió separar las plantas monosómicas para el cromosoma 5 de las planas hermanas euploides. Tomando el valor de 4,2 como el valor límite de I ADN para la selección de plantas que contengan el cromosoma 5 de L. cicera se reduce el número de plantas a analizar por FISH al 47 % de la muestra inicial. Aunque la selección por este método pueda ocasionar la pérdida de un pequeño porcentaje de plantas con el genotipo deseado, sin embargo la reducción considerable de tiempo que supone la aplicación de esta técnica permite acelerar el programa de selección y por tanto la eficiencia del programa de mejora. Este resultado es especialmente importante teniendo en cuenta que en cada ciclo de autofecundación se espera un alto porcentaje de plantas sin la constitución cromosómica deseada y cuyo análisis mediante GISH ralentiza el proceso de selección. Es decir, el análisis de citometría permitiría seleccionar plantas potencialmente portadoras de los genotipos deseados reduciendo considerablemente el número de plantas a evaluar por GISH y por tanto la eficiencia del programa.

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Regulación de la replicación del ADN por la modificación colectiva del replisoma

Regulación de la replicación del ADN por la modificación colectiva del replisoma

Nuestros resultados han demostrado que la SUMOilación grupal del replisoma tiene un papel en la replicación del ADN, ya que la depleción de las proteínas SUMOiladas resulta en una reducción en la incorporación de EdU que lleva a un retraso en la progresión durante la fase S. Este efecto se observa en distintos grados en múltiples líneas celulares, tanto no transformadas (RPE), como transformadas (HCT116, U2OS y HeLa His-SUMO2/3). A pesar de los impedimentos causados por la ausencia de SUMO, no hemos detectado la activación de la RSR y no hemos observado cambios en los niveles de γH2AX, salvo en la línea HCT116, con un ligero incremento de esta marca del daño al ADN a las 4 horas de iniciar la replicación. Esta línea celular es la más sensible a los efectos de la depleción de SUMO, siendo necesario emplear una concentración del inhibidor más baja y retrasar el tratamiento durante el segundo bloqueo de timidina. Existen múltiples mecanismos que pueden explicar las funciones de SUMO en el replisoma. Por un lado, la presencia de un ambiente rico en SUMO puede favorecer el correcto funcionamiento de las diferentes proteínas implicadas en la replicación. Se ha descrito que SUMO puede actuar como un factor de solubilidad (64) de forma que la presencia de esta modificación puede ser

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Análisis de metilación del ADN de VPH 16  integrado al genoma celular

Análisis de metilación del ADN de VPH 16 integrado al genoma celular

Material y métodos. Se analizaron cinco muestras de pacientes con CaCU y cuatro muestras con citología normal con ADN de VPH 16 integrado al genoma celular. La detección del VPH se realizó utilizando iniciadores para MY09/11 o GP5+/6+ y la tipificación se hizo mediante RFLPs o secuenciación. El estado físico viral se determinó por presencia o ausencia de un fragmento de 1027 pb para el gen E2, el cual se elimina durante la integración viral. Los sitios CpG metilados se detectaron por modificación del ADN con bisulfito de sodio, amplificación de las regiones virales: L1-5’LCR (distal), central (enhancer) y 3’LCR (promotor), clonación en TOPO TA y secuenciación.

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El entramado filiatorio y el ADN: Análisis de las competencias profesionales del psicólogo

El entramado filiatorio y el ADN: Análisis de las competencias profesionales del psicólogo

La ciencia fuerza nuestra subjetividad en casi todos los órdenes de lo humano; tal vez, por eso la apelación a la ética sea hoy más necesaria que nunca. La ciencia sobre la cual estamos desprendiendo estas conjeturas es la del paradigma de la racionalidad tecno-científica, es decir, el corazón de la ciencia moderna. Paradigma que establece las pautas definiendo medios, fines y valores para alcanzar objetivos calculados en los términos que dicta el mercado (Lima y Ormart, 2015) El caso de los niños nacidos por TRHA ha generado un amplio debate en torno a muchas y distintas cuestiones. Uno de los puntos más controvertidos de los debates actuales es el de la donación anónima o no-anónima de gametos (óvulo, espermatozoide), procedimiento conocido como fecundación heteróloga y su incidencia en la constitución subjetiva del niño por venir, las fantasías respecto al tercero - aportante del material genético- y la dialéctica derecho a la identidad vs derecho a la privacidad. Es entonces aquí donde nuestras primeras disquisiciones en torno al origen adquieren plena vigencia. Decíamos que la ciencia pretende legislar sobre el origen anclando la verdad a la biología, si la verdad está contenida en la célula germinal el origen puede ser probado. Sin ir más lejos la prueba de ADN sanciona una compatibilidad genética, pero ¿qué dice eso del padre?

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EXPERIMENTO DE MESELSON Y STAHL: HORQUILLA DE REPLICACIÓN

EXPERIMENTO DE MESELSON Y STAHL: HORQUILLA DE REPLICACIÓN

La cadena hija que se formó en dirección 5' 3’ se construye en forma continua y la otra cadena hija es sintetizada de manera discontinua, en pequeños tramos, llamados fragmentos de Okazaki, los cuales se unen entre sí a medida que se sintetizan, por acción de la enzima ADN-ligasa. Entonces la síntesis del ADN es bidireccional, no sólo porque se produce en dos direcciones divergentes a partir de una misma burbuja de replicación, sino también porque las cadenas de la doble hélice son sintetizadas en direcciones opuestas.

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Diseño y evaluacion de la expresion de una potencial vacuna de adn contra el virus de la Tilapia del lago(TiLV)

Diseño y evaluacion de la expresion de una potencial vacuna de adn contra el virus de la Tilapia del lago(TiLV)

El Virus de la Tilapia del Lago (TiLV), es un patógeno causante de mortalidades masivas tanto en poblaciones de tilapias cultivadas y silvestres alrededor del mundo. El desarrollo de una vacuna efectiva contra este patógeno emergente es imperativo para prevenir pérdidas económicas. En este trabajo se diseñó y evaluó un vector de expresión como una potencial vacuna de ADN contra este virus. Inicialmente, se realizó un análisis de enhebramiento para predecir las estructuras tridimensionales y las funciones de las proteínas del TiLV. Se encontraron homologías estructurales entre las proteínas correspondientes al segmento genómico 1 y al segmento genómico 4 del TiLV, con las proteínas de ARN polimerasa dependiente de ARN del virus de la influenza B (56%) y la proteína neuraminidasa que pertenece a la cápside del virus de la influenza A (12%), respectivamente. Se insertó el amplicón del gen neuraminidasa viral en el vector plasmídico de expresión pCMV. Finalmente, se inyectó el constructo plasmídico en juveniles de la tilapia del Nilo Oreochromis niloticus y se midió su expresión mediante RT-PCR en tiempo real a las 8h, 16h, 24h, 72h después de la segunda inyección inmunizante. Se logró detectar expresión en los cuatro tiempos evaluados logrando una mayor expresión a las 16 horas post inyección. Estos resultados constituyen el primer paso para el desarrollo de una vacuna efectiva para la protección de los stocks de tilapias alrededor del mundo.

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