Análisis de la supervivencia

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Identificación de neoantígenos a partir de datos de ultrasecuenciación y aplicación posterior en análisis de supervivencia en pacientes con cáncer colorrectal

Identificación de neoantígenos a partir de datos de ultrasecuenciación y aplicación posterior en análisis de supervivencia en pacientes con cáncer colorrectal

En la siguiente imagen (Ilustración 3), se puede observar el flujo de trabajo seguido para poder alcanzar con éxito el proyecto. Partiendo de datos proporcionados por la plataforma del TCGA y mediante los servidores Broad Institute y cBioPortal se procedió a su descarga. Una vez obtenidos, se procedió a la Selección del tipo de mutación de estudio. A continuación, se procedió a la obtención de las Variantes génicas a partir del servidor web wAnnovar y con la librería proporcionada por Bioconductor a la obtención de las secuencias proteicas. Una vez obtenidas dichas secuencias, se procedió a la generación de una función en forma de bucle con el fin de obtener los péptidos candidatos a neoantígenos. A continuación, mediante el servidor web NetMHCcons se procedió a la obtención de la lista de neoantígenos con unión al complejo MHC- I y su posterior análisis bioinformático y de supervivencia.
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Análisis de supervivencia y tolerabilidad del trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos en LMA

Análisis de supervivencia y tolerabilidad del trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos en LMA

El resto de las complicaciones suelen tener una escasa incidencia. Los dos casos de toxicidad neurológica se debieron principalmente al acondicionamiento con busulfán y se manifestaron como epilepsia, mioclonias y alteraciones neurológicas. Esta complicación ocurre en un 12% de los pacientes y suele ser más frecuente en trasplantes alogénicos. Como complicación vesical, uno de los pacientes presentó cistitis hemorrágica postrasplante, que aparece en la literatura como complicación derivada del uso de ciclofosfamida o procesos víricos asociados a la inmunosupresión. Únicamente un paciente presentó alteración de las transaminasas como complicación hepática y en ningún caso encontramos datos de síndrome de obtrucción sinusoidal, bastante resaltada en la literatura. Por último, decir que tampoco hubo toxicidad cardiaca relevante en la muestra estudiada. 2,10,24 Respecto al análisis de supervivencia realizado, se observó una supervivencia libre de progresión del 52,5% a los 3 años y una supervivencia global del 59,5% a los 3 años, estableciéndose así una buena correlación de los datos obtenidos con la literatura actual (Tabla 1). 10,18,23
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Análisis del nacimiento de lechones y los distintos factores que afectan su supervivencia

Análisis del nacimiento de lechones y los distintos factores que afectan su supervivencia

La población mundial tendrá un marcado y continuado ascenso, de acuerdo a las proyecciones demográficas de la ONU. He aquí la importancia sobre investigar acerca de la carne porcina, como herramienta de alimentación de este futuro mundo superpoblado. El enfoque va a ser en la supervivencia de los lechones, realizado a través del análisis de la madre y del nacimiento y peso de sus crías. En cuanto a la madre, se consideró relevante saber si su edad al servicio influía en el peso al nacimiento de los lechones; su resultado fue que no había significación entre el peso promedio de la camada nacida y el peso de la madre, ya que este factor por sí solo no afecta al peso de la camada. El otro aspecto a considerar de la madre fue su alimentación durante la preñez, y el análisis se basó en los diferentes días de gestación a partir del cual se aumentaba la cantidad de la dieta para ver si había relación con el peso al nacimiento promedio de la camada. La conclusión que se desprende del estudio estadístico es que, si bien hay un aumento progresivo del peso promedio de la camada cuanto antes se produce el aumento de la dieta, el mismo no es significativo al no encontrar dichas diferencias entre ninguno de los grupos observados.
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Análisis de supervivencia y tolerabilidad del trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos en linfoma de Hodking  Experiencia HURH hasta 201m

Análisis de supervivencia y tolerabilidad del trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos en linfoma de Hodking Experiencia HURH hasta 201m

En este análisis de SG, para el grupo que va en RC tras tratamiento de rescate previo TASPE se estima una media de 273,364 meses (límite inferior de 234,799 y límite superior de 311,929), mientras que para el grupo que no llega a trasplante en RC la media toma un valor de 144,787 meses (límite inferior de 106,449 y límite superior de 183,125 meses). No se alcanza a estimar el valor de la mediana de supervivencia para el grupo que alcanza RC. Para el grupo de pacientes en RP se objetiva un valor de 183,125 meses (límite inferior de 109,139 meses y superior de 160,861 meses) como mediana de supervivencia. Al realizar el análisis de SLP se obtiene, para el grupo que alcanza condición de RC, una media de supervivencia de 252,455 meses (límite inferior de 217,797 meses y límite superior de 287,112 meses), en contraste con la media de 135,971 meses (límite inferior de 88,83 meses y límite superior 183,112 meses) obtenida para el grupo de pacientes que no alcanzan dicha condición. Nuevamente, la mediana de supervivencia es sólo estimable para el grupo de pacientes que acceden a trasplante sin obtener RC tras inmunoquimioterapia, tomando un valor de 124 meses.
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Análisis de supervivencia de pacientes intervenidos quirúrgicamente por hepatocarcinoma

Análisis de supervivencia de pacientes intervenidos quirúrgicamente por hepatocarcinoma

Las estadísticas globales indican el consumo de alcohol como un factor de riesgo muy relevante que aumenta el riesgo de padecer cáncer (Instituto Nacional del Cáncer, 2018, https://www.cancer.gov/espanol/cancer/causas-prevencion/riesgo/alcohol), pero una vez desarrollado el análisis no existen diferencias entre las probabilidades de supervivencia de aquellos que lo desarrollaron por haber o no consumido alcohol. En el caso de la infección vírica, las funciones de supervivencia entre las personas que las padecían (una o más) y las que no (expuestas en la Figura 14), tampoco son significativamente distintas. Los pacientes que padecían el virus de la hepatitis (ya sea B o C) no tienen probabilidad de supervivencia estadísticamente distinta que los que no la padecían.
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Análisis de supervivencia de proyectos de ley 2000 2016

Análisis de supervivencia de proyectos de ley 2000 2016

Fan y Jiang (2012) mencionan que uno de los problemas fundamentales en el análisis de supervivencia consiste en cómo modelar los riesgos condicionales de falla dadas ciertas covariables, ya que surge la interrogante de si ciertas variables están o no correlacionadas con los tiempos de falla. Consecuentemente Klein y Moeschberger (2003) indican que al ajustar el modelo por las variables explicatorias, la comparación de los tiempos de supervivencia entre los grupos debe ser menos sesgada y más precisa que una simple comparación. También se presenta la dificultad adicional de predecir la distribución de los tiempos hasta la ocurrencia del evento a partir de las variables explicatorias y el interés se centra en predecir el riesgo de ciertos factores sobre el evento analizado. Uno de los modelos más utilizados para tratar el problema expuesto anteriormente es el Modelo de Riesgos proporcionales o Regresión de Cox, el cual es detallado a continuación.
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Introducción al Análisis de Supervivencia con R Commander  

Introducción al Análisis de Supervivencia con R Commander  

A la hora de exponer este tipo de análisis se suele considerar por simplificar la explicación que el evento de interés es “la muerte” y por tanto el tiempo hasta la ocurrencia del evento se le suele llamar tiempo de supervivencia (aunque como hemos comentado este tipo de análisis se aplica también para medir tiempo hasta curación, tiempo hasta el rechazo de un órgano,…..). El tiempo

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Análisis comparativo de biología tumoral y de supervivencia en pacientes con adenocarcinoma pulmonar, con y sin historial de tabaquismo

Análisis comparativo de biología tumoral y de supervivencia en pacientes con adenocarcinoma pulmonar, con y sin historial de tabaquismo

En este capítulo realizamos un análisis de supervivencia para medir el tiempo transcurrido hasta el evento muerte, nuestra variable de interés. El objetivo era determinar si el intervalo hasta el evento era igual o diferente entre ambos grupos (historial tabaquismo / sin historial), es decir, nuestro objetivo era comprobar si nuestra hipótesis alternativa “existen diferencias de supervivencia entre ambos grupos” era cierta. En términos estadísticos, debíamos averiguar si el tiempo de supervivencia se encontraba íntimamente ligado con la covariante “historial de tabaquismo”, concretamente si la pertenencia a alguno era significativa. En el caso de ser cierto, habría indicios para afirmar que las características del adenocarcinoma en ambos grupos es diferente y esto podría abrir una línea de investigación nueva para detectar el origen de estas diferencias y la necesidad de biomarcadores y tratamientos diferentes.
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Análisis estadístico de eventos asociados a variables de tiempo en R:modelo de supervivencia en pacientes con carcinoma de células renales

Análisis estadístico de eventos asociados a variables de tiempo en R:modelo de supervivencia en pacientes con carcinoma de células renales

Es cierto que muchos campos de estudio se esmeran por intentar predecir el momento de ocurrencia de algún evento de su interés, es por eso que incorporan el concepto dinámico del tiempo como variable principal mediante la cual se intenta describir el momento en el que sucede el evento ≪time-to-event≫ (Le, Chap T 1997). El presente trabajo toma como punto de partida, el tiempo, que es una de las unidades dimensionales más importante en las disciplinas académicas y de investigación. Este tiempo lo asociamos con eventos o sucesos, en nuestro caso es la muerte o recaída del paciente, que junto a los datos recopilados en las variables de seguimiento y apoyados en análisis estadísticos, permitirá la estimación de las diferentes funciones de supervivencia y evaluación de modelos ajustados sobre la base de datos. Estos métodos nos ayudarán a comprender, analizar y predecir los tiempos de duración de una determinada situación que culmina con la ocurrencia de un evento y su relación con otros factores clínicos demográficos de seguimiento, los cuales pueden catalizar la ocurrencia del mismo.
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Diseño óptimo de experimentos para el análisis de supervivencia

Diseño óptimo de experimentos para el análisis de supervivencia

Antes de hacer inferencia basada en una hip´ otesis sobre la forma de la distribuci´ on, es necesario contrastar si esa hip´ otesis es adecuada a los datos observados. Para ello proponemos un procedimiento basado en la compara- ci´ on de una estimaci´ on no param´ etrica de S(t) y la funci´ on de supervivencia del modelo elegido. Esta comparaci´ on puede hacerse gr´ aficamente dibujando en un diagrama bidimensional g[ ˆ S(t)] frente a h(t). Las funciones g y h se eligen de acuerdo con el modelo que se quiere analizar, de forma que, si ´ este es adecuado, la nube de puntos se dispone aproximadamente seg´ un una l´ınea recta. Supongamos que tenemos una muestra de tiempos de supervivencia y que se quiere analizar la hip´ otesis de que siguen una distribuci´ on Expo- nencial. Si efectivamente los datos satisfacen esta hip´ otesis, su funci´ on de supervivencia es,
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Análisis de la supervivencia de pacientes con hepatoblastoma 2005 - 2011

Análisis de la supervivencia de pacientes con hepatoblastoma 2005 - 2011

En general, la histología del HB y el pronóstico tiene estrecha correlación. El componente epitelial del HB es el hecho histológico más importante para el pronóstico. En un estudio realizado por el Children's Cancer Study Group (CCSG) y el Pediatric Oncology Group (POG), se evaluó el valor pronóstico del tipo histológico. Se demostró que los pacientes en quienes el tumor se resecó por completo en la intervención quirúrgica primaria, los que tenían histología fetal pura, tuvieron mejor supervivencia comparados con otros tipos histológicos. Para estadios más avanzados, el valor del tipo histológico es menos claro y se requieren más estudios. (22)
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Análisis de supervivencia del injerto post-trasplante renal

Análisis de supervivencia del injerto post-trasplante renal

Ninguno de los pacientes de la cohorte presentó como antecedente al trasplante HIV, VDRL, HB- sAG, HBcAG IgM, VHC ni CMV IgM positivos. La incidencia de rechazo durante el primer año re- portada en esta cohorte fue inferior a lo reportado por otros estudios (18,9%), pudiendo explicar la alta tasa de supervivencia del injerto en nuestros pacien- tes a 5 años (88,4%) 6–8 .

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Análisis de supervivencia del tratamiento en LAL infantiles

Análisis de supervivencia del tratamiento en LAL infantiles

Sin embargo, la supervivencia en grupos de riesgo bajo nos da unos resultados algo más bajos de lo que cabría esperar; mientras que en los pacientes de riesgo alto obtenemos una supervivencia más alta de lo que cabría esperar. Según otros estudios, los pacientes en los grupos de alto riesgo, sobre todo los de muy alto riesgo (particularmente el grupo de adolescentes), aún permanecen con tasas de supervivencia bajas (alrededor de 40-60%), razón por la cual los estudios actuales se enfocan en mejorar los tratamientos para este grupo de pacientes (10) .
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Esclerosis lateral amiotrófica: Características clínicas y análisis de supervivencia

Esclerosis lateral amiotrófica: Características clínicas y análisis de supervivencia

La mediana del retraso diagnóstico fue de 12 meses. Además, la supervivencia en aquellos pacientes en los que el diagnóstico se estableció en menos de 12 meses, fue 19 meses inferior. Sin embargo, estas diferencias no fueron significativas. En el estudio de Mandrioli et al. 18 la mediana fue de 13 meses, similar a los resultados obtenidos por Rodriguez de Rivera et al. 19 en cuyo estudio el retraso diagnóstico fue de 11 meses. Por otro lado, la revisión de Chio et al. 9 observó que en la mayoría de estudios los pacientes con un retraso diagnóstico inferior tenían un supervivencia menor. Esto puede deberse a que los pacientes que se diagnostican en menor tiempo tengan formas más agresivas que les lleve a consultar con el médico antes.
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Aprendizaje computacional y análisis de supervivencia en pacientes de cáncer de mama.

Aprendizaje computacional y análisis de supervivencia en pacientes de cáncer de mama.

La principal tarea a mejorar es el funcionamiento de la interfaz realizada a la que no se le ha podido dedicar demasiado tiempo. En la versi´ on actual se ejecuta una predici´ on completa con el consiguiente tiempo de ejecuci´ on y espera cada vez que se cambia un par´ ametro. Para poder disfrutar de un uso pr´ actico y efectivo, es conveniente mejorar el c´ odigo y que solamente se realice una predicci´ on cuando la combinaci´ on de par´ ametros final est´ e seleccionada. Otras mejoras a realizar en la interfaz ser´ıan poder almacenar las curvas previas para poder comparar como afectan a la supervivencia los distintos par´ ametros, y a˜ nadir la visualizaci´ on de una barra de progreso que indique el estado de la predicci´ on al usuario.
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Implicación de las mutaciones del gen K RAS en el cáncer de pulmón

Implicación de las mutaciones del gen K RAS en el cáncer de pulmón

Para calcular la variable time para el análisis de Supervivencia Libre de Progresión (SLP), se ha tenido en cuenta como fecha de inicio del estudio, la fecha de inicio del tratamiento que se administró a los pacientes en primera línea. El tiempo se ha calculado en meses. De todos los pacientes con datos clínicos disponibles, se identificaron 3 pacientes de los cuales no se disponía de la fecha de inicio del tratamiento, ni la fecha de diagnóstico de la primera metástasis, por lo que se tomó la fecha del diagnóstico de cáncer como fecha de inicio (según se adoptó en el estudio original). Como fecha de producción del evento, se tomó la fecha de éxitus del paciente o la fecha en que se determina que después de finalizar la línea del tratamiento correspondiente, se constata que la progresión del cáncer continúa. Si se revisan los datos iniciales de la muestra, al inicio de cada línea de tratamiento (X2nd.line... X5th.line) se codifica la progresión del cáncer. Todos los códigos diferentes de A22 indican una progresión en la enfermedad. En caso de progresión se toma la fecha de inicio del tratamiento de la siguiente línea, como fecha de ocurrencia del evento. Hay tres casos en que se desconoce la fecha de progresión o éxitus, por lo que se toma la última fecha de seguimiento disponible, como fin de periodo y marcando estos pacientes como censurados (en la tabla 4.2, la variable ObjSLP de los pacientes censurados tiene un símbolo +).
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Supervivencia de la parada cardiorrespiratoria extrahospitalaria en Gipuzkoa: cuatro años de seguimiento

Supervivencia de la parada cardiorrespiratoria extrahospitalaria en Gipuzkoa: cuatro años de seguimiento

Actualmente en Gipuzkoa, además de las tres unidades de SVA, existen 21 ambulancias de Soporte Vital Básico (SVB) que disponen de desfibriladores semiautomáticos, donde trabajan 126 técnicos en emergencias que han recibi- do la formación necesaria para utilizarlos según los proto- colos establecidos, con lo cual confiamos en aumentar la supervivencia de la PCR extrahospitalaria. Por otro lado, en estos momentos, para evitar perder datos para posteriores análisis de la situación de la PCR extrahospitalaria, realiza- mos un registro siguiendo el estilo Utstein con objeto de poder aportar en el futuro datos fiables y confiamos que con mejores resultados.
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Carcinomas de cabeza y cuello, experiencia  de un Centro Oncolgico del Estado de Durango, Mxico

Carcinomas de cabeza y cuello, experiencia de un Centro Oncolgico del Estado de Durango, Mxico

Se realizaron análisis univariados para evaluar los factores pronóstico de acuerdo con la supervivencia y a la evaluación de vida usando el método de Log-Rank. Para evaluar factores pronóstico asociados a consumo de alcohol y/o tabaco se utilizó el método de Kruskal-Wallis. Para el análisis multivariado de la distribución de supervi- vencia estimada fue utilizado el método Kaplan-Meier. Los resultados se consideraron significantes cuando presenta- ban una p menor o igual a 0.05 y fueron analizados con el paquete estadístico SPSS 20.0 (Profesional Estadistics, SPSS Inc.; Chicago, Il USA).
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Comparativa entre la reseccin anatmica y la no anatmica en el tratamiento del hepatocarcinoma: mtodo de emparejamiento por anlisis de propensin

Comparativa entre la reseccin anatmica y la no anatmica en el tratamiento del hepatocarcinoma: mtodo de emparejamiento por anlisis de propensin

Objetivo: Evaluar el pronóstico de la resección anatómica (RA) y la resección no anatómica (RNA) de los pacientes sometidos a cirugía de carcinoma hepatocelular. Método: Estudio retrospectivo sobre una base de datos prospectiva entre mayo de 2002 y diciembre de 2016. Para evitar posibles sesgos de confusión, se realizó un estudio de emparejamiento por análisis de propensión (EAP). Resultados: Se incluyeron 86 pacientes, divididos en dos grupos: 39 RA y 47 RNA. Tras el EAP, quedaron 17 en cada grupo. No hubo diferencias en las variables demográficas ni del tumor. La supervivencia global (SG) tras el EAP fue del 93.9 y el 55.9% al año y los 5 años, y la supervivencia libre de enfermedad (SLE) global fue del 91 y el 45.7%, respectivamente. No se observaron diferencias entre los grupos (p = 0.47 y p = 0.31). El análisis de regresión no halló relación de los grupos con la SG (p = 0.47) ni con la SLE (p = 0.31). Respecto a la recidiva, no hubo diferencias. La RNA presenta mayor tendencia a la recidiva. Tampoco se encontraron diferencias en cuanto al tiempo de aparición de la recidiva. Conclusiones: El tipo de resección hepáti- ca en el tratamiento del hepatocarcinoma no influye en los resultados a largo plazo ni en la aparición de recidiva.
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Mecanismos organizativos de adaptación y supervivencia de los servicios de urgencia

Mecanismos organizativos de adaptación y supervivencia de los servicios de urgencia

En la presente revisión, se ha efectuado una descripción de la mayoría de los esfuerzos adapta- tivos y de supervivencia que los SUH han “inven- tado” o “improvisado” para poder seguir llevando a término su misión, que no es otra que la de atender a los pacientes que demandan asistencia urgente. Por ello, un análisis frío de esta situación lleva a darnos cuenta de que gran parte de lo hasta aquí expuesto representa una huída hacia delante que poco o nada tiene que ver con esta misión. En efecto, la ineficiencia hospitalaria, en porcentaje la causa más importante del estado que en la actualidad viven los SUH en España, si- gue campando a sus anchas. Así, como las altas no se ofrecen ni en cantidad ni en adecuación ho- raria de forma sincrónica a las necesidades reales de los SUH, éstos acaban por asumir funciones que van más allá de su auténtica misión 12 . Se in-
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