Cepas bacterianas y plásmidos.

Las características más relevantes de las cepas bacterianas utilizadas en este trabajo se describen en la Tabla II.1. Los plásmidos y transposones utilizados se detallan en la Tabla II.2.

Tabla II.1. Cepas bacterianas utilizadas en el presente trabajo. 

Cepas Propiedades Referencias

Agrobacterium tumefaciens

UBAPF2 A. tumefaciens libre de plásmidos. Rifar. Hynes, et al., 1985 UBAPF2G Derivado de UBAPF2. Gmr por la presencia del

transposón Tn5-M8S.

Este trabajo

Ensifermeliloti

2011 Smr, Nod+ Fix+ en alfalfa J. Dénarié, France 2011-Sp Spr Smr, Nod+ Fix+ en alfalfa. Pistorio, et al., 2003 20MP6 Derivado de E. meliloti 2011, Smr, Tcr, GFP. Pistorio, et al., 2002 SmA818 E. meliloti 2011 curada del plásmido pSymA. Oresnik, et al., 2000

SmA818R Derivado de SmA818, Rifar. Este trabajo SmA818B SmaA818R con el plásmido pLPU83b-5. Este trabajo

SmA818AB SmaA818R con el plásmido pLPU83b-5 y pLPU83a- 13.

Este trabajo

Rhizobiumetli

CFNX89 CFN42 curada del plásmido simbiótico. Brom, et al., 1992

CFNX89R Derivado de CFNX89, Rifar. Este trabajo

Rhizobium sp.

LPU83 Smr, Nod+ Fix+/- en alfalfa. Del Papa, et al., 1999 LPU83-5 Tn5-B10 insertado en pLPU83b. Este trabajo LPU83-12 Tn5-B10 insertado en pLPU83c. Este trabajo LPU83-13 Tn5-B10 insertado en pLPU83a. Este trabajo LPU83-21 Tn5-B10 insertado en pLPU83c. Este trabajo LPU83-35 Tn5-B10 insertado en pLPU83a. Este trabajo LPU83-38 Tn5-B10 insertado en pLPU83b. Este trabajo LPU83-H R. sp. LPU83 nodH::pGnod83, Smr Gmr. Del Papa, et al., 2007

Tabla II.1. Continuación 

Cepas Propiedades Referencias

LPU83-dobleH Derivado de LPU83. Posee el gen de Tcr del plásmido pHP45Ω-Tc interrumpiendo el gen nodH.

Este trabajo

LPU83 (pMP604) R. sp. LPU83 con el plásmido pMP604. Smr Tcr. Este trabajo LPU83-H (pMP604) R. sp. LPU83-H con el plásmido pMP604. Smr Gmr

Tcr.

Este trabajo LPU83-nodC::lacZ

sense

Derivado de LPU83, Smr, Gmr, Fusión transcripcional en el gen nodC con el plásmido pGATT9.

Este trabajo LPU83-nodC::lacZ

antisense

Derivado de LPU83, Smr, Gmr, Fusión transcripcional en el gen nodC con el plásmido pGATT10.

Este trabajo LPU83-traR- R. sp. LPU83 (pLPU83a-traR::(pK18mob::traR)). Smr

Nmr.

Este trabajo LPU83-traR-

(pBBR1MCS5)

R. sp. LPU83-traR- con el plásmido (pBBR1MCS5). Smr, Nmr, Gmr.

Este trabajo LPU83-traR-

(pBBR1MCS5::traR)

R. sp. LPU83-traR- con el plásmido (pBBR1MCS5::traR). Smr, Nmr, Gmr.

Este trabajo LPU83-GFP Derivado de R. sp. LPU83 conteniendo el plásmido

pFAJ-1708::GFP. Smr Tcr.

Este trabajo

Escherichia coli

E. coli DH5α recA, ΔlacU169, F80dlac ZDM15. Bathesda Res. Lab.

E. coli S17–1 E. coli 294 RP4-2-Tc::Mu-Km::Tn7 integrado en el cromosoma.

Simon, et al., 1983

Rifar, Nmr, Smr, Tcr, Gmr, Kmr, Apr, Cmr =  Resistencias  a rifampicina, neomicina, estreptomicina, 

tetraciclina, gentamicina, kanamicina, ampicilina, y cloranfenicol, respectivamente.   Tabla II.2. Plásmidos y transposones utilizados en el presente trabajo. 

Plásmidos y

transposones Propiedades Referencias

Plásmidos

pLOW1 Cmr, Vector de clonado de bajo número de copias. Hansen, et al., 1997 pUC19 Ampr, Vector de clonado de alto número de copias. Yanisch-Perron, et al.,

1985 pK18mob Kmr.Vector de clonado de alto número de copias. Schäfer, et al., 1994 pK18mob-LK Derivado de pK18mob con un sitio de clonado

modificado.

Tesis Doctoral M. Lozano pG18mob2 Gmr.Vector de clonado de alto número de copias. Kirchner & Tauch, 2003

Tabla II.2. Continuación 

Plásmidos y

transposones Propiedades Referencias

pFAJ1708 Ampr, Tcr.Vector replicativo y estable en rizobios. Posee el sitio de clonado múltiple río abajo del promotor fuerte de nptII para permitir la expresión de genes.

Dombrecht, et al., 2001

pK18mobsacB Kmr. Confiere sensibilidad a sacarosa. Vector de clonado de alto número de copias.

Schäfer, et al., 1994 pBBR1MCS5 Gmr.Vector de clonado de bajo número de copias,

replicativo en rizobios con el promotor Lac.

Kovach, et al., 1995 pK18mob::traR Gmr.Derivado de pK18mob con 257 pb internas al

gen traR de pLPU83a.

Este trabajo pBBR1MCS5::traR Gmr.Derivado de pBBR1MCS5 con el gen traR de

pLPU83a en la misma orientación que el promotor Lac.

Este trabajo pGreenTIR Vector con la posibilidad de liberar un cassette con la

proteína verde fluorescente (GFP).

Miller & Lindow, 1997 pFAJ1708::GFP Derivado de pFAJ1708 conteniendo el fragmento

EcoRI del pGreenTIR que codifica para la GFP en el mismo sentido que el promotor fuerte de nptII.

Este trabajo pAB2002 Apr, Gmr, con el cassette lacZ-aacC1 sin promotor

para fusiones transcripcionales del gen lacZ.

Becker, et al., 1995 pGATT8 Kmr.pK18mob-LK, con un fragmento EcoRI de 1,25

kb del gen nodC de R. sp. LPU83.

Este trabajo pGATT9 CassettelacZ-aacCI del pAB2002 en el sitio HindIII

del pGATT8, orientado en igual sentido que el gen

nodC.

Este trabajo pGATT10 Cassette lacZ-aacCI del pAB2002 en el sitio HindIII

del pGATT8, orientado en antisentido del gen nodC.

Este trabajo pKnodHTc Derivado de pK18mobsacB que posee el gen de Tcr

del plásmido pHP45Ω-Tc interrumpiendo el gen

nodH de R. sp. LPU83.

Este trabajo

pHP45Ω-Tc Apr, Tcr.Posee un cassette con la resistencia a Tcr flanqueado por terminadores transcripcionales y traduccionales.

Prentki & Krisch, 1984

pMP604 Tcr. Plásmido FITA. Contiene un activador transcripcional independiente de flavonoides.

Spaink, et al., 1989 pRDV3 Cósmido conteniendo la región nod de R. sp. LPU83. Del Papa, et al., 2007 pRDV7 Cósmido conteniendo la región nod de R. sp. LPU83. Del Papa, et al., 2007 pLPU83b-5 Tn5-B10 insertado en pLPU83b. Este trabajo

Tabla II.2. Continuación 

Plásmidos y

transposones Propiedades Referencias

pLPU83a-13 Tn5-B10 insertado en pLPU83a. Este trabajo pRK2013 Kmr, replicón ColE1, tra+ de RK2. Figurski & Helinski, 1979 RK600 Cmr, replicón ColE1, tra+ de RK2. Kessler, et al., 1992 Transposones

Tn5-B10 Kmr RP4-mob. Simon, et al., 1989 Tn5-M8S Gmr RP4-mob. Quandt, et al., 2004

Rifar, Nmr, Smr, Tcr, Gmr, Kmr, Apr, Cmr =  Resistencias  a rifampicina, neomicina, estreptomicina, 

tetraciclina, gentamicina, kanamicina, ampicilina, y cloranfenicol, respectivamente.