7. DEFINICIÓN DE LA ARQUITECTURA UTILIZANDO LENGUAJE DE
7.4 DESCOMPOSICIÓN DE LOS COMPONENTES QUE
7.4.1 Descripción de los componentes básicos
Name
Klonierungsstrategie
Beschreibung
pRK5-
FKBP51FLAG
Vektor pRK5-SV40PUR geschnitten mit EcoRI und HindIII/blund
cDNA amplifiziert mit FKBP51START und FKBP51STOPFLAG
Expression von FKBP51 fusioniert mit C-terminalen FLAG
pRK5-
FKBP52FLAG
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
cDNA amplifiziert mit FKBP52XhoI START und FKBP52STOPFLAG
Expression von FKBP52 fusioniert mit C-terminalen FLAG
pRK5-FKBP51 Vektor pRK5-SV40PUR geschnitten mit EcoRI und HindIII/blund
cDNA amplifiziert mit FKBP51START und FKBP51END
Expression von FKBP51
pRK5-FKBP52 Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
cDNA amplifiziert mit FKBP52XhoI START und FKBP52END
pRK5-
FKBP51TPR- FLAG
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit EcoRI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP51START und FKBP51TPRMut352/358 rev
2. cDNA amplifiziert mit FKBP51TPRMut 352/358vor und FKBP51STOPFLAG 3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit
FKBP51START und FKBP51STOPFLAG
Expression von FKBP51 mit mutierter TPR-Domäne fusioniert mit C-terminalen FLAG
PRK5-FKBP51- PPIaseFLAG
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP51XhoI START und FKBP51PPIMUTvor
2. cDNA amplifiziert mit FKBP51PPIMUT rev und FKBP51 STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP51XhoI START und FKBP51 STOPFLAG
Expression von FKBP51 mit mutierter PPIase- Domäne fusioniert mit C- terminalen FLAG
PRK5-FKBP52- PPIaseFLAG
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP52XhoI START und FKBP52PPIMUTvor
2. cDNA amplifiziert mit FKBP52PPIMUT rev und FKBP52 STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP52XhoI START und FKBP52 STOPFLAG
Expression von FKBP52 mit mutierter PPIase- Domäne fusioniert mit C- terminalen FLAG
pRK5- FKBP51PPI- 52FLAG (Ch1)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP51XhoI START und 51 PPIrev
2. cDNA amplifiziert mit 51PPI-52 und FKBP52 STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP51XhoI START und FKBP52
Chimäres aus FKBP51 PPIase Domäne (AS 1- ) fusioniert mit C-terminalen Teil von FKBP52
STOPFLAG pRK5-
FKBP52PPI- 51FLAG (Ch2)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP52XhoI START und 52 PPIrev
2. cDNA amplifiziert mit 52PPI-51 und FKBP51 STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP52XhoI START und FKBP51 STOPFLAG
Chimäres aus FKBP52 PPIase Domäne (AS 1- 138) fusioniert mit C- terminalen Teil von FKBP51
pRK5-FKBP51- 52 Cal FLAG (Ch3)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. cDNA amplifiziert mit FKBP51XhoI START und 51vorCalrev
2. cDNA amplifiziert mit 51-52Cal und FKBP52STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP51XhoI START und FKBP52 STOPFLAG
Chimäres aus FKBP51 mit Calmodulin-Bindungs- Domäne von FKBP52 (AS 399-459) fusioniert FLAG- Epitop
pRK5-FKBP51- 52 TPR FLAG (Ch4)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. FKBP51 amplifiziert mit
FKBP51XhoISTART und FKBP51.5 2. Ch3 amplifiziert mit 52-51TPR und FKBP52STOPFLAG
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP51XhoI START und
FKBP52STOPFLAG
Chimäres aus FKBP51 mit TPR-Domäne von FKBP52 (AS 272-389) fusioniert mit FLAG-Epitop
pRK5-FKBP52- 51TPR/Cal- FLAG (ChA)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund 1. FKBP51 amplifiziert mit FKBP51STOPFLAG und 52-51TPR 2. FKBP52 amplifiziert mit FKBP52XhoISTART und FKBP52.5
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit
Chimäres aus FKBP52 mit TPR-Domäne und
Calmodulin-Domäne von FKBP51 fusioniert FLAG- Epitop
FKBP52XhoI START und FKBP52 STOPFLAG
pRK5-FKBP52- 51 TPR FLAG (Ch5)
Vektor pRK5-SV40MCS geschnitten mit XhoI und HindIII/blund
1. FKBP52 amplifiziert mit 51TPR-52 und FKBP52STOPFLAG
2. ChA amplifiziert mit FKBP52XhoISTART und 51TPRrev
3. PCR Produkte aus 1. und 2. mit FKBP52XhoI START und FKBP52 STOPFLAG
Chimäres aus FKBP52 mit TPR-Domäne von FKBP51 (AS 270-387) fusioniert FLAG-Epitop
psiRNAseq1 (seq1)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI
Oligo psiRNAseq1for mit Oligo psiRNAseq1rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Expression Doppelstrang-RNA mit einer Haarschleifen- struktur, wobei der Doppelstrangbereich homolog zu FKBP52 ist psiRNAseq1
mut (seq1mut)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI Oligo psiRNAseq1mut-for mit Oligo psiRNAseq1mut-rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Kontrolle der Spezifität von psiRNAseq4, da Sequenz nicht homolog zu FKBP52 d.h. sollte nicht zu RNAi führen
psiRNAseq3 (seq3)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI
Oligo psiRNAseq3for mit Oligo psiRNAseq3rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Expression Doppelstrang-RNA mit einer Haarschleifen- struktur, wobei der Doppelstrangbereich homolog zu FKBP52 ist psiRNAseq3
mut (seq3 mut)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI Oligo psiRNAseq3mut-for mit Oligo psiRNAseq3mut-rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Kontrolle der Spezifität von psiRNAseq4, da Sequenz nicht homolog zu FKBP52 d.h. sollte nicht zu RNAi führen
psiRNAseq2 (seq2)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI
Oligo psiRNAseq2for mit Oligo psiRNAseq2rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Expression Doppelstrang-RNA mit einer Haarschleifen-
struktur, wobei der Doppelstrangbereich homolog zu FKBP52 ist psiRNAseq2
mut (seq2 mut)
Vektor psiRNA geschnitten mit BbsI Oligo psiRNAseq2mut-for mit Oligo psiRNAseq2mut-rev annealen und in den Vektor ligieren
Plasmid zur Kontrolle der Spezifität von psiRNAseq4, da Sequenz nicht homolog zu FKBP52 d.h. sollte nicht zu RNAi führen
pPROEx- FKBP51FLAG
Vektor pPROEX H1 geschnitten mit NcoI und XbaI
cDNA amplifiziert mit FKBP51HIS-NcoI und FKBP51-FLAG-Xba-STOP
Plasmid zur Aufreinigung von FKBP51FLAG über His-Tag
pPROEx- FKBP52FLAG
Vektor pPROEX H1 geschnitten mit NcoI und XbaI
cDNA amplifiziert mit FKBP52HIS-NcoI und FKBP52-FLAG-Xba-STOP
Plasmid zur Aufreinigung von FKBP52FLAG über His-Tag