Análisis del software ImageJ para el análisis científico de imágenes

ESCUELA TÉCNICA SUPERIOR DE INGENIERÍA Y

SISTEMAS DE TELECOMUNICACIÓN

PROYECTO FIN DE GRADO

TÍTULO: Análisis del software ImageJ para el análisis científico de imágenes

AUTOR: Daniel Sánchez Valenciano

TITULACIÓN: Grado en Ingeniería de Sonido e Imagen

TUTOR: Alfonso Luís Martín Marcos.

DEPARTAMENTO: Ingeniería Audiovisual y Comunicaciones

VºBº

Miembros del Tribunal Calificador:

PRESIDENTE: Carlos Carrillo Sánchez

VOCAL: Alfonso Luís Martín Marcos

SECRETARIO: José Manuel Díaz López

Fecha de lectura:

Calificación:

Análisis del

software

ImageJ para el análisis científico de imágenes

Daniel Sánchez Valenciano

Estudiante de Grado en Ingeniería de Sonido e Imagen

Resumen

2.

M

ENÚ

I

MAGE

2.1. Submenú Type





2.1.1. 8-bit



( )







2.1.2. 16-bit



( )

( )( )



2.1.3. 32-bit





2.1.4. 8-bit Color





( )



 [ ]   ( )  ( )  ( ( ) )      

2.1.7. HSB Stack

2.2. Submenú Adjust

2.2.1. Brightness/Contrast







( ) ( )





-

2.2.2. Window/Level





2.2.5. Color Threshold















( )

( )( )

( )

( )_{( )}( )

( )

( )( ) ( )_{( )}( )

-2.2.7. Canvas size

     

2.5.2. Merge Channels

2.5.3. Arrange Channels







2.5.6. Make Composite

2.5.8. Display LUT









2.5.10. Color Picker

2.6.1. Add/Delete/Next/Previous/Set Slice     

2.6.2. Images to Stack



-    

2.6.3. Stack to Images











2.6.6. Orthogonal Views









2.6.9. Plot Z-axis Profile

       

2.7.1. New Hyperstack.    -     

2.7.3. Hyperstack to Stack.

2.7.4. Reduce Dimensions.

2.8. Crop

2.10. Rename 2.11. Scale       

2.12.1. Flip Horizontally

2.12.2. Flip Vertically

2.12.3. Flip Z

2.12.5. Rotate











2.12.6. Translate

2.12.8. Image to Results

2.12.9. Results to Image

     

2.14. Submenú Overlay



3.

M

ENÚ

P

ROCESS

3.4. Find Maxima





3.6. Submenú Noise







3.8. Submenú Binary



















-3.9. Submenú Math





γ γ=1. Verde: γ=2











⁄







3.10. Submenú FFT





3.11. Submenú Filters















3.12. Submenú Batch





















4.

M

ENÚ

A

NALYZE

4.1. Measure

̅









4.2. Analyze Particles









4.5. Label

4.6. Clear Results

4.7. Set Measurements

















4.14. Submenú Tools

4.14.2. Fractal Box Count

( )

4.14.3. Analyze Line Graph





4.14.4. Curve Fitting





4.14.5. ROI Manager

-► ► ►  

4.14.6. Scale Bar









4.14.7. Calibration Bar















5.

P

LUGINS

5.1. Submenú Macros

5.1.2. Run

5.1.4. Startup Macros

5.2. Submenú Shortcuts

5.2.1. List Shortcuts

5.2.2. Create Shortcuts

     5.2.4. Remove

5.3. Submenú Utilities

5.3.3. Search     

5.3.5. Monitor Memory

5.3.6. Capture Screen

5.3.8. ImageJ Properties 5.3.9. Threads 5.3.10. Benchmark 5.3.11. Reset   

5.4. Submenú New

5.4.9. Table

5.5. Compile and Run