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Certificación de Viveros de Palma Aceitera

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Certificación de Viveros de

Palma Aceitera

Consuelo Estévez de Jensen, Ph.D.

Departamento de Cultivos y Ciencias

Agroambientales

Universidad de Puerto Rico, Recinto Mayagüez

Junio 20, 2013

(2)

Antecedentes

Primer reporte de la pudrición del cogollo causada por

Phytophthora palmivora

en Colombia.

Gómez et al, 2010.

En el 2011 en plantaciones de palma aceitera en las

Provincias de San Lorenzo y Sto. Domingo de los

Tscháchilas no se logró aislar en medio selectivo ni detectar

por medio de serología a

Phytophthora

spp. desde tejido

afectado.

Se detectó a

Phytophthora

spp en raíces utilizando tiras

inmunológicas.

(3)
(4)

Triángulo de la enfermedad

Hospedero Susceptible

Pat

ó

geno (s)

El Medioambiente

(5)
(6)

Objectivos de un Programa de

Certificación

Garantizar plantas sanas y de alto potencial

genético.

Asegurar plantas libres de patógenos

transmitidos por material vegetativo

Desarrollar protocolos para un programa de

saneamiento de viveros.

(7)

Componentes de un Programa de

Certificación

Programa de Cuarentena

asegura la

introducción segura de germoplasma.

Programa de Saneamiento

pruebas que detectan

la presencia de patógenos y tratamientos que

conducen a la producción de germoplasma libre de

patógenos.

Programa de Certificación

garantiza que las

fuentes de germoplasma esten libres de

(8)

Enfermedades de importancia

Patógenos transmisibles por material vegetativo

que comprenden virus, viroides, procarióticos

sistémicos, fitoplasmas y espiroplasmas.

Las plantas en un vivero deben estar libres de

plagas y enfermedades.

El substrato debe ser libre de patógenos de

suelo.

(9)
(10)

Viveros en áreas de cuarentena

Inspección anual de viveros por síntomas de

Phytophthora

spp

.

Un mínimo de 40 plantas por vivero.

Todas las plantas sintomáticas deben ser analizadas para

Phytophthora

spp. en un laboratorio aprobado.

Los métodos de detección pueden ser por serología

(DAS-ELISA) Double antibody sandwich-Enzyme linked

inmunosorbant assay DAS-ELISA.

En caso de resultados positivos realizar aislados en medio

selectivo e identificación por morfología.

Análisis molecular con PCR para la identificación de la

especie.

(11)

An

á

lisis de Nuevas Introducciones de Palma

Aceitera

Patógeno Método Tejido

Phytophthora DAS ELISA PCR

Cogollo y raíces

Erwinia spp. DAS-ELISA Cogollo

Fitoplasmas PCR Tallo

Virus RT-PCR y PCR Foliar

Fusarium solani Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis

Aislados y pruebas de patogenicidad

cogollo y raíces

(12)

Phytophthora

spp.

• Patógeno destructivo en plantas herbáceas y leñosas.

• Causa muerte repentina, pudrición de raíces y tallo.

• El inóculo de Phytophthora puede ser transportado en el aire, en el agua o en el follaje susceptible.

• Diseminación por agua y suelo contaminado

• Deficiente aereación del suelo

• Suelos saturados (>70%)

• Temperaturas 59 a 74 F.

• Sobrevive en el suelo, agua y en plantas susceptibles

(13)

Síntomas de Phytophthora palmivora

• Decoloración de la hoja más joven.

• Lesiones humedas en el follaje.

• Amarillamiento y necrosis de la hoja bandera.

• Lesiones alargadas en el interior de la hoja bandera de color miel a café.

• Pudrición de la base de la hoja.

• Caída de las hojas

• Pudrición en la base del tallo y del cogollo.

(14)

Detección de P. palmivora del agua

Aislado desde el agua

• Medio selectivo PARPH y PARP, mas benomyl (10 ppm) para suprimir crecimiento de Zygomicetes.

• Medio V8 clarificado para produccion de sporangias.

• Cultivos incubados en temperatura ambiente y luz continua ( 40 watts) por 4 -5 dias. Cultivos en la

obscuridad para observar estructuras sexuales (homotalicas).

(15)

Métodos de Identificación

DAS-ELISA

• Los anticuerpos monoclonales están adheridos a la microplaca.

• Colocar las muestras maceradas con un amortiguador.

• Durante el período de incubación si Phytophthora esta presente es capturado por el anticuerpo y capturado en el microplato.

• Luego de un enjuague se unen y los anticuerpos detectado con un substrato por un cambio de color en presencia del conjugado

enzimático

Tira inmunológica

• Macerar el tejido con un amortiguador

• Insertar la tira inmunológica

• Dejar por 3 minutos y observar la presencia de una doble

banda (+).

Aislamiento

Aislado en medio específico (PARPH).

Identificación de características culturales y morfológicas.

(16)
(17)

Reacción en Cadena de la Polimerasa

(PCR)

Extracción del ADN

Kit de Qiagen

Reacción en cadena de la

Polimerasa.

Cebadores universales

ITS 1 y ITS4

Secuenciación

Cebadores especificos

A2 y I2 (Drenth et al,

2006).

Stock inicial Stock final Volumen 1Rx Buffer (10x) 1x 2.50 MgCl2 1.50 mM 0.75 DNTPs (2.5 mM) 0.20 mM 2.00 Primer A2 (50u/µL) 0.25 µM 0.125 Primer I2 (50u/µL) 0.25 µM 0.125 Mango Taq (5u/µL) 0.50 u 0.160 ADN 50 ng 1 Agua - 18.340 Total - 25

(18)

• Para la detección preliminar en las raíces utilizar tiras inmunológicas o la técnica de Double antibody

sandwich-Enzyme linked

inmunosorbant assay DAS-ELISA.

• Para confirmación aislar en medio selectivo.

• Para suelo o substrato realizar

diluciones de suelo y utilizar medio especifico (PARPH).

Métodos de Identificación desde raíces

y suelo

(19)

Analisis de patógenos en plantas de

vivero de Palma Africana

Patógeno Método Prueba Re-Indexación

Phytophthora DAS ELISA Tira Inmunológica Polymerase Chain Reaction (PCR) palma sintomática Raíces Substrato Anual Fusarium solani Fusarium oxysporum Aislado Planta sintomática Substrato y raíces Anual

(20)

Fusarium

Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis

• Patógeno habitante del suelo

• Sobrevive en forma de

clamidósporas en el suelo y en los residuos.

• Bloqueo de las vasos del xylema y producción de tilosas y goma.

• Reducción del crecimiento

• Marchitez y muerte de la palma

Fusarium solani

• Patógeno habitante del suelo

• Sobrevive en forma de

clamidósporas en el suelo y en los residuos.

• Causa la pudrición de las raices.

(21)

Fusarium solani

Fusarium solani (Mart.) Sacc. (teleomorph = Nectria haematococca (Berk. & Br.).

• Para aislar el patogeno del suelo, mezclar la muestra del suelo con agua destilada y mezclar vigorosamente.

• Realizar diluciones seriadas y colocar 1 alicuota de cada dilucion en el medio de cultivo Nash & Snyder’s modificad (Cho, J.H., et al, 2001).

• Incubar los platos a temperatura ambiente y luz y luego de 7 dias trasnferir las

(22)

Fusarium solani

• En papa dextrosa agar F. solani produce micelio de color blanco a crema, escaso y tambien abundante

• Las macroconidias tienen 3-4 septas y son ligeramente curvadas, tienen una pared gruesa y su parte apical es atachada.

• La microconidias son abundante, oval a arinonada y se forman en falsas cabezas en monofialidos largos

(23)

Pudrición Basal del Tronco

Ganoderma

sp.

Material de propagación contaminado.

Ganoderma boninense, G. zonatum

y

G. miniatocinctum

reportadas en Malasia como patogénicas en Palma

Africana.

Pudrición interna de la palma y el crecimiento externo

del hongo en el tronco.

Marchitez de las hojas inferiores o de toda la palma

Immunoassay Protein-based – ELISA (anticuerpos

policlonales).

(24)

Detección de

Ganoderma

spp.

Multiplex PCR-DNA para la detección e

identificación de las diferentes especies de Ganoderma boninense, G. zonatum y G. miniatocintum.

Primers de la region ITS del ADN ribosomal.

• 5’-TTG ACT GGG TTG TAG CTG-3’ (Forward primer)

• 5’-GCG TTA CAT CGC AAT ACA-3’ (Reverse primer).

• ADN de Ganoderma boninense

(25)

Phytoplasmas

Parasitos obligados

Amarillamiento letal del

cocotero '

Ca.

Phytoplasma

palmae'

Extracción de ADN

DNeasy Plant Mini Kit Qiagen

modificado

PCR con cebadores

universales para

phytoplasmas.

(26)

Phytoplasmas

Componentes AccuPrime HF1 La Taq2

Agua Molecular 41.75μl 37.5μl

10X AccuPrime Buffer II (blue

cap)/10X Buffer 5μl 5μl

dNTP ---- 4μl

Primer 1 (20pmol/μl) 1μl 1μl

Primer 2 (20pmol/μl) 1μl 1μl

Enzyme 0.25μl 0.50μl

Template DNA (10-50nm/ul) 1-3μl 1-3μl

Master Mix para la amplificacion PCR para una reaccion

de 50μl

(27)

Programa para PCR y Nested PCR

LA-Taq DNA Polymerase P-55-38 (AccuPrime-HF)

94

o

C 1 min.

94

o

C 2 min.

94

o

C 30 seg,

94

o

C 1 min.

50

o

C 1 min.

55

o

C 2 min.

68

o

C 5 min.

72

o

C 3 min.

35 ciclos (paso 2 - 4)

38 ciclos (pasos 2-4)

72

o

C 10 min.

72

o

C 7 min.

(28)

Virus en palma africana

African oil palm Ringspot Virus (Foevovirus)

Chlorotic mottle

RT-PCR

Cebadores specificos AOPRV (Morales et al,

2009).

Forw165

5’-CCTTTGACTCTAGCCAAGA-3’

Rev936

(29)

Erwinia spp.

Erwinia carotovora

Erwinia amylovora

(30)

Prioridades

Prioridad 1 Prioridades de Investigación

Resumen 1. Determinar la presencia de Phytophthora en las zonas productoras de Palma en Ecuador.

2. Utilizar métodos moleculares para la detección de

Phytophthora palmivora desde tejido sintomático.

3. Investigar las alternativas exitosas disponibles en otros países (fertilización, prácticas culturales,

fungicidas, etc.) para el manejo de la enfermedad que se puedan validar y diseminar en Ecuador.

4. Implementar un plan de investigación a mediano plazo para la detección de otras enfermedades transmitidas por material vegetativo en Palma Africana.

(31)

Determinar la presencia de

Phytophthora

en

palma africana en Ecuador

Muestreo en San Lorenzo.

Utilizar varios metodos de aislamiento de

P. palmivora

utilizando trampas.

Muestreo de otros hospederos de

P. palmivora.

Estudiar posibles reservorios de

P. palmivora.

Determinar la sucesion de los patógenos asociados a la

pudrición del cogollo.

Estudiar la importancia de

Erwinia

en la pudrición del

cogollo.

(32)

Utilizar métodos moleculares para la detección

de

Phytophthora palmivora

desde tejido

sintomático

Determinar la presencia de

P. palmivora

desde el tejido

afectado utilizando PCR

Utilizar qPCR (PCR en tiempo real).

Utilizar controles (+) de

P. palmivora

para las pruebas

moleculares.

Mejoramiento del vigor del sistema radicular.

Estudiar el efecto de las prácticas de manejo de la palma

y su influencia en la enfermedad.

(33)

Prioridades

Prioridad 2

Prioridades Regulatorias

Resumen 1. Establecer un sistema de producción de material de propagación certificado de palma africana.

2. Implementar regulaciones obligatorias para la producción de material de propagación de palma africana.

3. Establecimiento de un control fitosanitario para producción de palma africana.

4. Iniciar un programa colaborativo de cuarentena y

certificación con responsabilidades compartidas entre las diferentes entidades y organizaciones públicas y privadas y los Productores de Palma.

5. Integrar las iniciativas y programas existentes o

(34)

Referencias

Broschat, T., Elliot M. 2005. SP 360 Disorders and Diseases of Ornamental Palms. University of Florida.

Drenth A., Wagels G., Smith B., Sendall B., Dwyer C., Irving G., Irwin J. 2006. Development of a DNA-based method for detection and identification of Phytophthora species. Australasian Plant Pathology Society.

Cho, J. H., Rupe, J. C., Cummings, M. S., and Gbur, E. E., Jr. 2001. Isolation and identification of Fusarium solani f. sp. glycines from soil on modified Nash and Snyder’s medium. Plant Dis. 85:256-260.

Referencias

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