Clasificación funcional de genes inducidos (panel A, B) o reprimidos (panel C, D) en SP2 y SP3 en comparación con SP1, respectivamente. El conjunto de genes de cada comparación fue agrupado en categorías funcionales de acuerdo a la nomenclatura MIPS (http://mips.helmholtz- muenchen.de). Cluster: número de genes de cada comparación clasificados dentro de una categoría específica. Genoma: número de genes total de un categoría específica. El p-valor representa la probabilidad de que la intersección de una lista de genes de interés con una categoría funcional determinada ocurra por azar; éste se ha obtenido mediante análisis hipergeométrico.
A
CATEGORÍA FUNCIONAL MIPS p-valor GENES CLUSTER GENOMA
16.17 Unión de metales 1.08E-04 YDR492W YKR087C YOL002C YOL101C 4 27
01.06 Metabolismo de lípidos, ácidos
grasos e isoprenoides 2.97E-04 YBR183W YDR284C YDR492W YHR072W YLL012W
YNL231C YNR041C YOL002C YOL101C YPL170W 10 286 01.06.10 Regulación del metabolismo
de lípidos, ácidos grasos e isoprenoides 1.79E-03 YDR284C YNL231C YOL002C 3 26 34.01.01.01 Homeostasis de iones
metálicos (Ca, Na, K, etc.) 2.21E-03 YDR270W YDR492W YMR058W YOL002C YOL101C 5 98
16.13 Unión de compuestos carbonados 3.04E-03 YKR102W YNR041C 2 9
99 PROTEÍNAS INCLASIFICADAS 6.27E-03
YAL068C YBL108C-A YBR242W YCL049C YFL051C YFR032C YGL101W YGL262W YGR035C YGR149W YHL026C YHL044W YIL176C YLR037C YLR050C YLR326W YLR413W YML083C YOL015W YOR214C
YPL005W YPL247C
22 1393
42.27 Secrección extracelular de
proteínas 9.46E-03 YBR301W 1 1
42.27.03 Anclaje a la membrana
plasmática y/o pared celular 9.46E-03 YBR301W 1 1
34.01.01 Homeostasis de cationes 1.80E-02 YDR270W YDR492W YMR058W YOL002C YOL101C 5 162
34.01 Homeostasis 2.81E-02 YDR270W YDR492W YMR058W YOL002C YOL101C 5 182 34 INTERACCIÓN CON EL AMBIENTE 2.85E-02 YDR270W YDR309C YDR492W YJL078C YKR102W
YMR058W YNR044W YOL002C YOL101C 9 463 32.05.01.03 Resistencia a agentes
quimicos 3.03E-02 YMR058W YNL231C 2 29
32.05.01 Resistencia proteica 3.85E-02 YMR058W YNL231C 2 33
32.05 Virulencia y defensa 4.29E-02 YMR058W YNL231C 2 35
B
CATEGORÍA FUNCIONAL MIPS p-valor GENES CLUSTER GENOMA
20.01.01.01.01 Transporte iónico de
metales pesados (Cu+, Fe3+, etc.) 2.39E-04 YER145C YMR058W YNR060W YOL158C YOR316C 5 53 34.01 Homeostasis 6.82E-04 YDR492W YER145C YMR058W YNR060W YOL002C
YOL101C YOR316C YPL188W 8 182
01.06 01.06 Metabolismo de lípidos,
ácidos grasos e isoprenoides 8.64E-04 YDR492W YIR033W YKL008C YMR006C YMR101C
YMR246W YOL002C YOL101C YOR100C YPL170W 10 286 34.01.01 Homeostasis de cationes 1.66E-03 YDR492W YER145C YMR058W YNR060W YOL002C
YOL101C YOR316C 7 162
16.17 Unión de metales 2.90E-03 YDR492W YOL002C YOL101C 3 27
01.03.07 Metabolismo del DNA 7.03E-03 YDL010W YIL066C 2 12
10.03.02.01 Meiosis I 8.25E-03 YGR225W YHL022C 2 13
34 INTERACCIÓN CON EL AMBIENTE 9.76E-03 YDR492W YER145C YHR005C YIR033W YMR058W YMR127C YNR060W YOL002C YOL101C YOR316C
YPL188W 11 463
20.01.01.01 Transporte de cationes (H+,
Na+, K+, Ca2+ , NH4+, etc.) 9.77E-03 YER145C YMR058W YNR060W YOL158C YOR316C 5 122 11.02.03.04.01 Activación de la
transcripción 1.01E-02 YDR492W YIR033W YOL101C 3 42
20.01.01 Transporte de iones 2.16E-02 YER145C YMR058W YNR060W YOL158C YOR316C 5 149
01 METABOLISM0 2.25E-02
YCR005C YDL010W YDR492W YEL071W YER096W YGL184C YHL022C YIL066C YIL099W YIR033W YKL008C YLR343W YMR006C YMR058W YMR101C YMR246W YNL112W YOL001W YOL002C YOL101C
YOR100C YPL170W YPL188W YPR121W
24 1514
01.06.10 Regulación del metabolismo de
lípidos, ácidos grasos e isoprenoides 3.14E-02 YMR246W YOL002C 2 26
32.01.06 Respuesta cold shock 3.20E-02 YIR033W 1 3
01.05.03 Metabolismo de polisacáridos 3.24E-02 YER096W YIL099W YLR343W 3 65
02.16.03 Fermentación láctica 4.24E-02 YEL071W 1 4
C
CATEGORÍA FUNCIONAL MIPS p-valor GENES CLUSTER GENOMA
18.02.01.01 Activador enzimático 4.51E-03 YER180C-A YJR053W YKL210W 3 67
10.03.02 Meiosis 8.30E-03 YGL090W YGR230W YLR234W YNL250W 4 161
18.02.01.01.01 Activador de GTPasa 1.12E-02 YER180C-A YJR053W 2 32
10.03 Cico celular 1.36E-02 YBL097W YDR363W-A YGL090W YGR230W
YJR053W YLR234W YMR094W YNL250W 8 653
11.02.02 Síntesis de tRNA 1.55E-02 YBR089C-A YPR186C 2 38
10.01.05.03.01 Recombinación meiótica 1.63E-02 YLR234W YNL250W 2 39
10.03.01 Control del ciclo celular mitótico 2.24E-02 YBL097W YDR363W-A YGR230W YJR053W
YLR234W YMR094W 6 447
30.05.02 Receptor no enzimático de la
señalización 3.49E-02 YDL035C 1 7
30.05.02.24 Proteina G acoplada al receptor
no enzimático de la señalización 3.49E-02 YDL035C 1 7
10.01.11 Regulación del procesamiento del
DNA 3.98E-02 YLR234W 1 8
12.04.03 Terminación de la traducción 4.46E-02 YDR252W 1 9
30.01.05.05 Señal de transducción mediada
por la proteína G 4.71E-02 YDL035C YER180C-A 2 69
D
CATEGORÍA FUNCIONAL MIPS p-valor GENES CLUSTER GENOMA
20.03.01.01 Canales iónicos 5.95E-04 YLL052C YLL053C 2 10
20.03.01 channel / pore class transport 1.37E-03 YLL052C YLL053C 2 15
14.13 Degradación peptídica/proteica 1.41E-02 YCL057W YKL103C YKL210W YNR069C 4 256 01.05.09 Metabolismo de
aminosacáridos 2.23E-02 YKL127W 1 6
01.05.09.04 Anabolismo de
aminosacáridos 2.23E-02 YKL127W 1 6
01.05.09.07 Catabolismo de
aminosacáridos 2.23E-02 YKL127W 1 6
10.01.11 Regulación del procesamiento
del DNA 2.96E-02 YLR234W 1 8
14.13.01 Degradación de proteínas
nucleares y citoplásmicas 3.20E-02 YCL057W YKL103C YKL210W 3 188
14.13.04.02 Degradación de proteínas
vacuolares 4.05E-02 YKL103C 1 11
12.04 Traducción 4.24E-02 YJL102W YMR012W 2 88
