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Programas de Vigilancia Microbiológica. Centro ... - GESDoc

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Academic year: 2023

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Los datos sobre la distribución geográfica y temporal de los grupos serológicos son básicos a la hora de decidir las intervenciones de vacunación. Determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) con Etest frente a 6 fármacos antimicrobianos (rifampicina, ciprofloxacino, penicilina, ampicilina, cefotaxima y ceftriaxona).

Figura 1. Evolución de los serogrupos de Neisseria meningitidis en España desde 1978 hasta 2019.
Figura 1. Evolución de los serogrupos de Neisseria meningitidis en España desde 1978 hasta 2019.

Programa de Listeriosis

Esta caracterización incluyó inicialmente el serotipado, método de tipificación fenotípica basado en la variabilidad de los antígenos somáticos (O) y flagelares (H) de L. Distribución de los aislados clínicos de Listeria monocytogenes recibidos en el CNM por grupo de serotipo y año, 2000 -2020.

Figura 1. Distribución de los aislados clínicos de Listeria monocytogenes recibidos en el CNM por serotipo-grupo y año, 2000-2020.
Figura 1. Distribución de los aislados clínicos de Listeria monocytogenes recibidos en el CNM por serotipo-grupo y año, 2000-2020.

Programa de Infección Gonocócica

Sensibilidad Antimicrobiana, 1991-2020

Determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) mediante el Etest frente a 8 sustancias antimicrobianas (Penicilina, Tetraciclina, Ciprofloxacina, Cefixima, Ceftriaxona, Espectinomicina, Gentamicina y Azitromicina). El CNM ha estado realizando vigilancia microbiológica del GI desde principios de los años 1990.

Tabla 1. Características de los aislados de Neisseria gonorrhoeae recibidos en el CNN, 1991-2020.
Tabla 1. Características de los aislados de Neisseria gonorrhoeae recibidos en el CNN, 1991-2020.

Programa de Streptococcus pneumoniae

PCV13 representa casos de ENI debido a serotipos incluidos en la vacuna conjugada trecevalente (línea de puntos rosa). En los últimos años se ha producido un aumento de casos de ENI debido a aislados clínicos no incluidos en la vacuna PCV13 que muestran resistencia a los antibióticos β-lactámicos.

Figura 1. Tendencias de ENI en España en población pediátrica y adulta durante el periodo 2009-2019
Figura 1. Tendencias de ENI en España en población pediátrica y adulta durante el periodo 2009-2019

Programa de enfermedad invasiva por Streptococcus pyogenes

El gráfico de barras muestra el número de aislamientos de los 18 tipos de emm más comunes (≥ 10 aislamientos). La administración de la vacuna 30-valente en España cubriría a la gran mayoría de aislados de GAS invasivos.

Figura 1. Distribución anual (1994-2020) de las cepas invasivas de S. pyogenes estudiadas por el programa de vigilancia del CNM.
Figura 1. Distribución anual (1994-2020) de las cepas invasivas de S. pyogenes estudiadas por el programa de vigilancia del CNM.

Programa de Haemophilus influenzae

Estudiar la estructura poblacional de cepas causantes de enfermedades invasivas, así como caracterizar brotes, mediante secuenciación genómica masiva [estudios SNP, Multilocus Sequence Typing (MLST) y MLST core genome (cgMLST)]. En el análisis de edad de los pacientes con patología invasiva por Hi en el periodo 2015-2019 observamos que las cepas no encapsuladas se detectaron principalmente en pacientes mayores de 65 años seguidos de niños menores de 4 años.

Figura 1. Distribución de casos de patología invasiva debida a Haemophilus influenzae no capsulado y capsulado según las edades de los pacientes (2015-2019).
Figura 1. Distribución de casos de patología invasiva debida a Haemophilus influenzae no capsulado y capsulado según las edades de los pacientes (2015-2019).

Programa de Resistencia a Antibióticos

Determinar la estructura poblacional, hacer circular clones de alto riesgo y estudiar brotes mediante secuenciación del genoma completo (MLST, cgMLST y filogenia mediante SNPs). Durante estos años, PVRA-CNM (EARS-Net) detectó diferencias significativas en la tendencia de prevalencia de resistencias, lo que llevó a cambios en el tratamiento empírico de las infecciones bacterianas.

Figura 1. Minimun spanning tree que representa la estructura poblacional 131 cepas de K
Figura 1. Minimun spanning tree que representa la estructura poblacional 131 cepas de K

Programa de infecciones producidas por los estafilococos

Existe una preocupación creciente con respecto a la caracterización de la ECN aislada en el hospital (Tabla 1). En el octavo estudio multicéntrico nacional de prevalencia de estafilococos, realizado en 2014, ya se observó esta tendencia, la resistencia al linezolid en S.

Tabla 1. Datos de prevalencia de RENAVE y cepas estudiadas en el CNM.
Tabla 1. Datos de prevalencia de RENAVE y cepas estudiadas en el CNM.

Programa de infecciones entéricas bacterianas transmitidas por agua y alimentos

ECEH, en el período analizado, el CNM recibió muestras/aislamientos clínicos del 73% de los casos declarados en RENAVE (Tabla 3). Si comparamos nuestros datos con los recogidos en el mismo período en TESSy, el CNM recibió el 27,39% de los casos confirmados (Tabla 5). Si comparamos nuestros datos con los recogidos en el mismo período en RENAVE, el CNM recibió el 24,94% de los casos confirmados.

En el caso de la vigilancia nacional y europea, sólo los casos de cólera causados ​​por cepas toxigénicas de V.

Tabla 1. Aislados enviados al CNM en el periodo 2013-2021.
Tabla 1. Aislados enviados al CNM en el periodo 2013-2021.

Programa de Legionelosis

El 39% de las muestras clínicas recibidas tuvieron resultado epidemiológico procesable, al igual que el 55% del total de muestras de origen humano. Muestras de origen humano recibidas por el Programa de Vigilancia de Legionelosis del CNM. Muestras de origen ecológico recibidas por el Programa de Vigilancia de Legionelosis del CNM.

Se determinó el tipo de secuencia (ST) según el esquema SBT en todos los aislados (467) de origen humano de L .

Tabla 1. Muestras de origen humano recibidas por el Programa de Vigilancia de Legionelosis en el CNM (2012-2020).
Tabla 1. Muestras de origen humano recibidas por el Programa de Vigilancia de Legionelosis en el CNM (2012-2020).

Programa de infecciones causadas por especies toxigénicas del género Corynebacterium

Entre 2014 y 2020 se recibieron en el Laboratorio de Difteria del CNM 305 muestras clínicas o aislados no duplicados para su identificación, confirmación, estudios de toxigenicidad y/o caracterización molecular. De estos 56, diez corresponden a portadores asintomáticos identificados en la investigación de contactos del caso de difteria respiratoria notificado en Cataluña en 2015. Por lo tanto, se excluyen del estudio descriptivo por ser la misma especie del caso. En la Tabla 1 se detallan las características de los casos notificados a RENAVE y confirmados en el Laboratorio de Difteria, excluyendo los casos aislados de contactos asintomáticos del caso de 2015.

Uno de estos dos aislamientos fue identificado en 2015 en un caso de difteria respiratoria en Cataluña, y el otro también procedía de Cataluña a partir de un caso de difteria cutánea.

Tabla 1. Características de los aislados toxigénicos notificados a la RENAVE.
Tabla 1. Características de los aislados toxigénicos notificados a la RENAVE.

Programa de resistencias en el complejo tuberculoso

La encuesta epidemiológica incluida en el protocolo RENAVE incluye los resultados de las pruebas de susceptibilidad (2). La OMS recomienda que los resultados de las pruebas de sensibilidad a la rifampicina se documenten en al menos el 75% de los nuevos casos de tuberculosis pulmonar (3). En este período de estudio no se observó ningún aumento en el número de casos importados.

El 56,70% de los aislados resistentes al etambutol mostraron alguna sustitución del codón 306 en el gen embB, de los cuales Met306Val fue el más común (30,93%).

Tabla 1. Aislados enviados al CNM en relación al número de casos notificados por cada Comunidad Autónoma a la RENAVE (datos cedidos por Rosa Cano del Centro Nacional de Epidemiología
Tabla 1. Aislados enviados al CNM en relación al número de casos notificados por cada Comunidad Autónoma a la RENAVE (datos cedidos por Rosa Cano del Centro Nacional de Epidemiología

Programa de micobacterias no tuberculosas

La descripción de nuevas especies pertenecientes al grupo NTM ha aumentado debido a las mejoras en las técnicas de identificación y cultivo. Número de hospitales de las diferentes comunidades autónomas que han enviado cepas de MNT al laboratorio de Micobacterias. Desarrollo a lo largo de los años de complejos y especies con mayor número de aislados expresado en porcentaje.

Se identificaron 153 cepas como Mycobacterium simiae, de las que se aislaron en Canarias y 29 (19%) en un hospital de una provincia de Castilla la Mancha.

Tabla 1. Evolución del número de hospitales, número de cepas y número de especies, subespecies y tipos en el periodo de tiempo de vigencia del Programa de Vigilancia de cepas MNT.
Tabla 1. Evolución del número de hospitales, número de cepas y número de especies, subespecies y tipos en el periodo de tiempo de vigencia del Programa de Vigilancia de cepas MNT.

Programa de GRIPE

Cumplimiento de las funciones como Centro Nacional de Gripe de la OMS y Laboratorio Nacional de Referencia de Gripe del Sistema de Vigilancia de Gripe en España (SVGE). Proporcionar información virológica a las autoridades sanitarias regionales, nacionales y supranacionales responsables de la vigilancia de la influenza. El CNM, junto con el CNE, elabora informes semanales sobre la circulación de los virus gripales en España.

Desde 1972 se han creado diversas fuentes de datos que se utilizan para la vigilancia de enfermedades y son esenciales en el programa de vigilancia.

Tabla 1 y Figura 1. Muestras recibidas en el Programa de Vigilancia de la gripe desde el 1 de septiembre de 2010 hasta 31 de agosto de 2021
Tabla 1 y Figura 1. Muestras recibidas en el Programa de Vigilancia de la gripe desde el 1 de septiembre de 2010 hasta 31 de agosto de 2021

Programa de SARS-CoV-2

Coordinador: Red Nacional de Laboratorios para la Integración de la Secuenciación Genómica en la Vigilancia COVID (RELECOV). Rendimiento de detección de distintos tipos de muestras tomadas y analizadas en el CNM desde el inicio de la pandemia. Distribución de CCAA que han enviado muestras al CNM desde el inicio de la pandemia.

Detección temprana de variantes circulantes e integración de información en la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica.

Figura 1. Muestras recibidas y analizadas en el CNM desde el principio de la pandemia
Figura 1. Muestras recibidas y analizadas en el CNM desde el principio de la pandemia

Programa de Enterovirus y Parálisis Flácida en menores de 15 años

El sistema de vigilancia de la polio se complementa con la vigilancia de VE en muestras clínicas de otras afecciones clínicas, principalmente neurológicas. En el caso de vigilancia de EV, cualquier paciente con diagnóstico previamente confirmado de infección por EV (cultivo viral o RT-PCR positiva). En España, la vigilancia de la PFA y otros enterovirus distintos de la polio se introdujo en 1998.

La tasa de notificación de vigilancia de PFA siempre ha sido inferior a lo esperado, ya que se considera que debería haber 1 caso de PFA por cada 100.000 niños menores de 15 años (tasa 1), y el promedio no supera 0,6, lo que oscila a lo largo del año. años (Tabla 1).

Tabla 1. Indicadores de calidad de la vigilancia de PFA en España (2002-2019).
Tabla 1. Indicadores de calidad de la vigilancia de PFA en España (2002-2019).

Programa de Parotiditis

Proporcionar datos que ayuden a esclarecer los motivos del alto índice de fracaso de las vacunas. Según nuestros estudios previos (3), se introdujo en España en 2005, desplazando al genotipo H y en menor medida al D, al inicio de la ola epidémica 2005-2009. Este programa de vigilancia se ha implementado para cumplir con las recomendaciones de la OMS y el RENAVE sobre vigilancia de la parotiditis.

La detección de IgM es complementaria, pero en el contexto epidemiológico actual tiene un bajo valor predictivo negativo y no es útil por sí sola para el diagnóstico de infección y clasificación de casos.

Figura 1. Incidencia de parotiditis. Coberturas de vacunación. España, 1982-2018.
Figura 1. Incidencia de parotiditis. Coberturas de vacunación. España, 1982-2018.

Programa de Sarampión y Rubeola

Sin embargo, en la situación actual, el genotipado del sarampión es insuficiente para describir con precisión los patrones de circulación de los virus y el origen de los casos. El diagnóstico de casos se realiza principalmente en las comunidades autónomas, especialmente en sarampión, donde el total de casos investigados en el CNM alcanza el 35,7%. La integración de datos epidemiológicos y de laboratorio en la vigilancia es esencial para la clasificación de casos y la verificación de la eliminación en esta fase posterior a la eliminación.

Se debe mantener la vigilancia para examinar su impacto en los patrones de circulación del virus en un futuro próximo.

Tabla 1. Muestras y determinaciones del programa
Tabla 1. Muestras y determinaciones del programa

Enfermedades víricas transmitidas por vectores

El diagnóstico de estos virus comenzó a realizarse en el CNM a principios del siglo XXI a través de proyectos de investigación. Muestras totales y positivas obtenidas en el CNM para diagnóstico de virus endémicos (TOSV y VWN) y virus importados (CHIKV, DENV y ZIKV). El diagnóstico de DENV ha sido más estable, aunque es un virus que está claramente aumentando tanto en número de solicitudes diagnósticas como de resultados positivos (Figura 1, paneles C y D).

La aparición de estos agentes en cualquier parte del mundo incide en el número de viajeros que llegan a nuestro país con sospecha de infección por estos virus.

Figura 1. Muestras totales y positivas recibidas en el CNM para diagnóstico de virus endémicos (VTOS y VWN) e importados (VCHIK, VDEN y VZIK)
Figura 1. Muestras totales y positivas recibidas en el CNM para diagnóstico de virus endémicos (VTOS y VWN) e importados (VCHIK, VDEN y VZIK)

Programa de Rabia

En España la vigilancia de la rabia humana se realiza en el marco del RENAVE. Garantizar la disponibilidad de laboratorios de diagnóstico de rabia en todo el estado para orientar las acciones adecuadas. La vigilancia de la rabia en murciélagos ha mejorado mucho tras la colaboración con los CREA catalanes, que se debe seguir promoviendo en el resto de comunidades autónomas.

Nuestro control de la rabia en murciélagos se encuentra entre los mejores de Europa, pero aún está lejos de los países líderes.

Tabla 1. Muestras y determinaciones.
Tabla 1. Muestras y determinaciones.

Programa de Variantes del Virus de la Hepatitis B de Impacto en Salud Pública y Estudio de Brotes de Hepatitis

Programa de variantes del virus de la hepatitis B con impacto en la salud pública e investigación de brotes de hepatitis. Programa de variantes del virus de la hepatitis B con impacto en la salud pública e investigación de brotes de hepatitis 152. Programa de variantes del virus de la hepatitis B con impacto en la salud pública e investigación de brotes de hepatitis 153.

Programa de variantes del virus de la hepatitis B con estudio de impacto en la salud pública y brote de hepatitis 154.

Tabla 2. Listado de mutaciones de escape en HBsAg encontradas Mutación/ combinación de mutaciones
Tabla 2. Listado de mutaciones de escape en HBsAg encontradas Mutación/ combinación de mutaciones

Programa de Leishmaniasis Humana en el Area-9 de la Comunidad Autónoma de Madrid

  • Vigilancia de casos humanos: El Laboratorio de Leishmaniasis y Enfermedad de Chagas (LLEC) dirige las actividades correspondientes a este
  • Vigilancia de los vectores: El Laboratorio de Entomología Médica (LEM) diseña e implementa desde 2012 un plan de vigilancia de flebotomos,
  • Vigilancia inicial del perro como principal reservorio conocido: El LLEC realizó en el bienio 2011-2012 pruebas serológicas de detección de anticuerpos de
  • Vigilancia de otros reservorios potenciales: Dado que los resultados iniciales del estudio de seroprevalencia de la leishmaniasis canina dejaban en un

El número de pacientes con CM de los que se enviaron muestras clínicas al laboratorio en el periodo 2012-2020 fue de 4.526. Distribución por hospital de CM del número de pacientes a los que se les tomaron muestras clínicas para diagnóstico general en el periodo 2012-2020. Distribución por hospital de CM del número de pacientes a quienes se les tomaron muestras clínicas dentro del programa de vigilancia en el periodo 2012-2020.

El perro no juega un papel relevante en la transmisión de la leishmaniasis en la zona.

Figura 1. Evoluciòn del nº de muestras clìnicas procedentes del la CM analizadas dentro del programa de vigilancia y como diagnòstico general del LLEC
Figura 1. Evoluciòn del nº de muestras clìnicas procedentes del la CM analizadas dentro del programa de vigilancia y como diagnòstico general del LLEC

Programa de la Enfermedad de Chagas

Al no existir en España un sistema de vigilancia de EC, las estimaciones de la población afectada se basan en el análisis de datos poblacionales de América Latina reportados por el Instituto Nacional de Estadística (INE), que en combinación con datos sobre el consumo de la principal droga de de elección (benzonidazol), permiten estimar la distribución de la población infectada en las diferentes regiones de España, así como la proporción de la población que ha recibido tratamiento (Figura 1). Cualquier laboratorio de microbiología de los hospitales de la red pública y de los laboratorios de salud pública de las CCAA. Cribado y confirmación en el diagnóstico de laboratorio de la enfermedad de Chagas. En este informe se describe un panorama de las actividades en el diagnóstico de la enfermedad celíaca en la Unidad de Leishmaniasis y Enfermedad de Chagas desde 1997 hasta mayo de 2021 que justifican la existencia de este programa.

Este programa contribuye al cumplimiento de los objetivos para el control de la EC propuestos en el plan estratégico de la OMS 2021-2030.

Figura 1. A) Población nacida en Latinoamérica que reside en España. Fuente: INE (1998-2001, consultado en 2009; 2002-2020, consultado en 2021)
Figura 1. A) Población nacida en Latinoamérica que reside en España. Fuente: INE (1998-2001, consultado en 2009; 2002-2020, consultado en 2021)

Programa de la Resistencia a los antifúngicos en España

Para las especies de Candida incluidas en el programa de vigilancia se analizó el número de aislamientos resistentes por año y la distribución por especie (Cuadro 3). Número y porcentaje (%) de cepas resistentes por año de las diferentes especies de Candida incluidas en el programa. Número y porcentaje (%) de cepas resistentes por año de las diferentes especies de Aspergillus incluidas en el programa.

Número y porcentaje (%) de cepas resistentes de diferentes especies de Candida incluidas en el programa por año.

Tabla 1. Número de cepas recibidas por año y especie.
Tabla 1. Número de cepas recibidas por año y especie.

AGRADECIMIENTOS

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Figura 1. Evolución de los serogrupos de Neisseria meningitidis en España desde 1978 hasta 2019.
Figura 1. Distribución de los aislados clínicos de Listeria monocytogenes recibidos en el CNM por serotipo-grupo y año, 2000-2020.
Tabla 1. Características de los aislados de Neisseria gonorrhoeae recibidos en el CNN, 1991-2020.
Tabla 2. Aislados de Neisseria gonorrhoeae recibidos vs casos de IG notificados por CCAA, 2016-2019.
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Referencias

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