1. Métodos moleculares
1.7. Electroinmunotransferencia de proteínas o “western blotting” 88
los sistemas de electrotransferencia (Biorad) y los pasos son los siguientes:
Electroforesis desnaturalizante de extractos proteicos en geles de
poliacrilamida al 10 % con SDS (Sodium Dodecil Sulfato). En el caso de extractos
provenientes de cultivos celulares se cargaron 10 µl del extracto, y para extractos
provenientes de embriones se cargaron 40 µg de proteína total. Previamente los
extractos fueron desnaturalizados en tampón de carga SDS 2X (50 mM Tris‐HCl
durante 7‐10 min a 100oC (agua en embullición). Las muestras se separaron
mediante electroforesis a un amperaje constante de 10‐12 mA en el tampón de
electroforesis (25 mM Tris base, 250 mM glicina pH 8.3, 0,1 %(p/v) SDS). En el
caso de EIT con pocos embriones, se cargaron en el gel ≈15‐20 embriones
tempranos recogidos según el protocolo de Su, (2000).
Inmovilización de las proteínas en membranas de PVDF (del inglés
Polyvinylidene Difluoride Western Blotting Membrana) mediante
electrotransferencia en tampón 8 mM Tris base, 39 mM glicina y 0,0375 % SDS.
Para la inmunodetección, la membrana se equilibró con PBST (PBS 1X y 0,05 %
Tween 20) y se bloqueó con 3 % BSA en PBST a TA durante 1 h o a 4oC TN. Luego
se llevaron a cabo los siguientes pasos:
o Incubar la membrana con el anticuerpo primario a TA durante 1‐2 h o a 4oC
TN y en agitación suave.
o Hacer 3 lavados con tampón PBST, de 4 min cada uno.
o Incubar la membrana con los anticuerpos secundarios conjugados con la
enzima peroxidasa. Incubar a TA durante 30‐45 min y en agitación suave.
o Hacer tres lavados con PBST de 4 min cada uno.
o Añadir a la membrana el sustrato quimioluminiscente, Pierce ECL Western
Blotting Substrate, o en el caso de la inmunotransferencia con pocos
embriones, añadir el reactivo Supersignal®West Pico, de mayor sensibilidad
que el anterior (Tabla MM5). En ambos casos se siguieron las instrucciones
del fabricante.
o Exponer en un cassette de revelado la membrana a una película.
En el caso de la EIT competida, se realizó todo exactamente igual a lo
comentado, exceptuando que el anticuerpo primario era previamente
preincubado con la proteína GST‐Cbt∆Zn (0,5 µg/µl) o la proteína Cbt traducida
in vitro (50 µl) durante 4 h a TA o TN a 4oC 1.8. EXPRESIÓN DE PROTEÍNAS
1.8.1 Expresión y purificación de la proteína GST‐Cbt∆Zn
Para la expresión de la proteína de fusión GST‐Cbt∆zn, y de la proteína GST
se utilizó la cepa BL21 de E. coli con baja actividad proteasa para reducir la
degradación de proteínas. La expresión y la purificación se realizaron siguiendo
las instrucciones descritas en el manual GST Gene fusion system (Pharmacia
Biotech), aunque modificando el tiempo de inducción con 0,1 mM de IPTG a 3 h
para reducir la degradación de la proteína GST‐Cbt∆Zn y añadiendo al medio
Posteriormente se llevó a cabo la extracción de las proteínas a partir de los
cultivos mediante el procesamiento mecánico, utilizando altas presiones en el
vacío generadas por una prensa francesa o “French Press”.
La purificación de las proteínas GST y GSTCbt∆zn se realizó mediante
cromatografía de afinidad utilizando Glutation sefarosa 4B (GE Helathcare), una
matriz de sefarosa capaz de reconocer y unir la GST. En esta matriz la molécula
de glutatión queda anclada a la sefarosa dejando libre un sitio de unión
complementario a la unión de la glutatión S‐transferasa. Para la purificación se
utilizó el procedimiento de “batch”.
Los niveles de expresión y de purificación de las proteínas se visualizaron
mediante electroforesis y tinción de Comassie. La cuantificación de las proteínas
se realizó mediante espectrofotometría. Además se realizó una EIT con
anticuerpo anti‐GST, para comprobar que las bandas observadas en los geles
correspondían a la proteína de fusión GST‐Cbt o/y subproductos de degradación
(Fig. MM3)
Figura MM3. Purificación de la proteína GST‐CBT∆Zn. (A) Elución de la columna de purificación por afinidad de la proteína GST‐Cbt∆Zn. Se puede observar una banda mayoritaria de ≈66 kDa que corresponde a la proteína GST‐Cbt∆Zn y otras bandas de menor tamaño debidas a la degradación/procesamiento de la proteína de fusión. (B) EIT con el anticuerpo anti‐GST‐POD que muestran que el extracto eluído corresponde a la proteína GST‐Cbt∆Zn y fragmentos de degradación de la misma.
1.8.2. Expresión in vitro de la proteína CbtFL.
Debido a que la proteína Cbt completa es tóxica en bacterias y con el
objeto de obtener esta proteína para los ensayos funcionales de retardo en gel,
la proteína Cbt fue expresada in vitro utilizando el kit comercial TnT®Quick
Coupled Transcription/Translation Systems (Tabla MM5), siguiendo las
recomendaciones de su manual y añadiendo ZnSO4. Para ello, clonamos la ORF
clonación múltiple y además la región 5`UTR de la β‐globina, incrementándose
así el rendimiento de la transcripción del gen clonado en el vector.
Para comprobar que la proteína se traducía correctamente llevó a cabo la
reacción en presencia de MetS35 tanto en la muestra con el vector pT7‐Flag‐Cbt
como en la muestra control con el vector pT7 vacío y el plásmido pLuc. 5 µl de
cada mezcla de reacción se analizaron en un gel desnaturalizante PAGE 10 %, que
posteriormente se transfirió a papel Whatman utilizando un desecador y se
sometió a autorradiografía durante 3 h en una pantalla de BaFBrEu que fue
revelada en un detector de imágenes fotoestimulable. En etapas posteriores, la
comprobación de que la proteína era traducida se realizó mediante EIT utilizando
el anticuerpo anti‐Cbt∆Zn (Fig. MM4).
Figura MM4. Detección de la transcripción/traducción in vitro de la proteína Flag‐Cbt. A la izquierda, autorradiografía obtenida tras la transcripción/traducción in vitro de la proteína Flag‐Cbt en presencia de MetS35. A la derecha, EIT de la transcripción/traducción in vitro, utilizando anticuerpo anti‐Cbt∆Zn. pLuc y el extracto TnT son controles.