www.genego.com Este sitio ofrece una base de datos de vías metabólicas y reguladoras en la cual pueden efectuarse búsquedas.
www.nature.com/subject/cellsignaling Es una colección de artículos de investigación originales, revisiones y comentarios respecto a la emisión de señales celulares.
http://stke.sciencemag.org El sitio web de Signal Transduc- tion Knowledge Environment, mantenido por la revista Science. Es un excelente sitio, pero partes del mismo están cerradas a quienes carecen de una suscripción.
www.signaling-gateway.org Este portal es presentado por la University of California en San Diego, y es apoyado por Genentech y Nature. Un excelente recurso, completo, con artículos especiales.
www.qiagen.com/geneglobe/pathwayview.aspx Qia- gen. Un útil sitio web comercial.
www.biosignaling.com Parte de Springer Science+Business Media.
www.youtube.com Muchos videos y animaciones excelentes de sitios web de emisión de señales están disponibles en Youtube, demasiado numerosos como para mencionarlos aquí. Simplemente hay que escribir las vías en un navegador de web e ingresar. Sin em - bargo, es necesario conocer de dónde proviene el video. No todos los videos son exactos, de modo que es necesario verificar los he - chos con la literatura médica publicada.
www.hhmi.org/biointeractive/immunology/tcell. html Película del Howard Hughes Medical Institute (HHMI): Cloning an Army of T Cells for Immune Defense.
P r e g u n t A s d e e s t u d i o
1. La familia nfat es una familia omnipresente de factores de transcripción.
a. En condiciones de reposo, ¿dónde está ubicado el nfat en
una célula?
b. En condiciones activadas, ¿dónde está ubicado el nfat en
una célula?
c. ¿Cómo se libera desde su estado en reposo y se le permite que se reubique?
d. Los fármacos inmunosupresores, como la ciclosporina, ac - túan por medio de inhibición de la fosfatasa calcineu- rina. Si nfat es omnipresente, ¿cómo cree que estos fármacos pueden actuar con tan pocos efectos secunda- rios sobre otros procesos de señalización dentro del cuerpo?
2. Durante los primeros días de los experimentos diseñados para
detectar el receptor de célula T, varios grupos de investigación diferentes encontraron que los anticuerpos dirigidos contra proteínas de inmunoglobulina parecieron unirse al receptor de célula T. Dado lo que ahora se sabe acerca de la estruc- tura de las inmunoglobulinas y el receptor de célula T, ¿por qué esto no es por completo sorprendente?
3. ¿Cierto o falso? Explique sus respuestas.
Las interacciones entre receptores y ligandos en la superficie celular:
a. están mediadas por interacciones covalentes.
b. pueden dar lugar a la creación de nuevas interacciones co - valentes dentro de la célula.
4. Describa cómo las manipulaciones experimentales que siguen se usaron para determinar la estructura de anticuerpos.
a. Reducción y alquilación de la molécula de anticuerpo b. Digestión enzimática de la molécula de anticuerpo
c. Detección de fragmentos de inmunoglobulina por anti-
cuerpo
5. ¿Qué es un itam, y qué proteínas modifican el itam en Igα e
Igβ?
6. Defina una proteína adaptadora. Describa cómo una interac- ción entre proteínas que portan SH2 y grupos de tirosina fos- forilados (pY) ayuda a transducir una señal desde el receptor de célula T hacia la proteína cinasa ZAP-70.
7. La IgM tiene 10 sitios de unión a antígeno por cada molécula,
mientras que la IgM sólo tiene dos. ¿Esperaría que la IgM fuera capaz de unirse a cinco veces más sitios antigénicos en un antígeno multivalente que la IgG? ¿Por qué sí/por qué no?
8. Usted y otra compañera están estudiando un receptor de cito- cina sobre una célula B que tiene un Kd de 10–6 M. Usted sabe
que los sitios receptores de citocina sobre la superficie celular deben estar ocupados al menos 50% para que la célula B reciba una señal de citocina desde una célula T auxiliar. Su compa- ñera de laboratorio mide la concentración de citocina en la sangre del animal de experimentación y detecta una concen- tración de 10–7 M. Ella le dice a usted que el efecto que ustedes
han estado midiendo posiblemente no podría depender de las citocina que están estudiando. Usted está en desacuerdo. ¿Por qué?
9. La activación de cinasas de la familia Src es el primer paso en varios tipos diferentes de vías de señalización. Por ende tiene sentido biológico que la actividad de esta familia de tirosina cinasas esté regulada de manera en extremo estrecha. Describa cómo la fosforilación de cinasas de la familia Src puede suministrar señales tanto activadoras como inhibidoras a cinasas Src.
10. Usted ha generado una clona de células T en la cual la tirosina cinasa de la familia Src, Lck, es inactiva. Estimula esa clona con su péptido antigénico cognado, presentado sobre la plata- forma de mhc apropiada, y hace pruebas para secreción de interleucina-2, como una medida de activación de células T. ¿Espera ver secreción de IL-2 o no? Explique.
11. Nombre una proteína que se ha mostrado que es defectuosa en
muchos casos de agammaglobulinemia ligada a X, y describa cómo una reducción de la actividad de esta proteína podría llevar a inmunodeficiencia.
12. Las proteínas receptoras de células B y T tienen regiones in - tracitoplasmáticas notoriamente cortas, de sólo algunos aminoácidos. ¿Cómo puede usted conciliar esta característica estructural con la necesidad de emitir una señal al interior de la célula de la presencia de antígeno unido?
13. Describa una manera en la cual la estructura de los anticuer-
pos está muy bien adaptada a su función.
14. Como un estudiante graduado, su asesor ha dado a usted una clona de células T que parece estar constitutivamente (siem- pre) activada, aunque a un bajo nivel, incluso en ausencia de estimulación antigénica, y le ha pedido que averigüe por qué. Su compañero de pupitre le sugiere empezar por verificar la secuencia de su gen lck, o el estado de la actividad de Csk en la célula. Usted está de acuerdo en que son buenas ideas. ¿Cuál es su razonamiento?