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Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec Section Salmonella spp. Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec Michael Mulvey Ph. Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec Section Streptococcus pyogenes.

Direction des risques biologiques et de la santé du travail, Institut national de santé publique du Québec Christian Lavallée, microbiologiste-infectiologue, membre. Direction des risques biologiques et de la santé au travail, Institut national de santé publique du Québec MISE EN PAGE. Alejandra Irace-Cima et Jasmin Villeneuve, Direction des risques biologiques et de la santé au travail, Institut national de santé publique du Québec.

Cindy Lalancette, Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec. Brigitte Lefebvre, présidente, Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec. Christophe Garenc et Jasmin Villeneuve, Département des risques biologiques et de santé au travail, Institut national de santé publique du Québec.

Brigitte Lefebvre, Laboratoire de santé publique du Québec, Institut national de santé publique du Québec.

Tableau 1  Description et portée des programmes de surveillance en antibiorésistance,  surveillances continues
Tableau 1 Description et portée des programmes de surveillance en antibiorésistance, surveillances continues

Entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC)

Il est cependant intéressant de noter que le nombre de souches porteuses des gènes OXA-48 et IMI/NMC a augmenté significativement depuis 2015.

Tableau 3  Présentation des mécanismes de résistance selon le nombre de souches  positives par gène testé chez les entérobactéries soumises au programme de  surveillance
Tableau 3 Présentation des mécanismes de résistance selon le nombre de souches positives par gène testé chez les entérobactéries soumises au programme de surveillance

Neisseria gonorrhoeae

Les souches dites à sensibilité réduite au C3G (céfixime 0,25 mg/L et ceftriaxone 0,12 et 0,25 mg/L) sont sensibles à ces antibiotiques, mais leurs concentrations minimales inhibitrices (CMI) se rapprochent du seuil de non-sensibilité (14).

Figure 2  Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques des souches de Neisseria  gonorrhoeae au Québec, 2010-2016 †  (n = 6207 souches)
Figure 2 Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques des souches de Neisseria gonorrhoeae au Québec, 2010-2016 † (n = 6207 souches)

Neisseria meningitidis invasif

Ce phénomène a également été observé dans une étude menée en Ontario, qui a montré qu'une sensibilité intermédiaire à la pénicilline était associée aux sérogroupes Y et W-135 (18).

Salmonella spp

Il s'agit d'un programme canadien de surveillance passive qui examine les tendances en matière de résistance aux antibiotiques chez les salmonelles isolées des environnements agricoles et isolées des humains dans le cadre du Programme intégré canadien sur la résistance aux antibiotiques (CIPARS). L'Agence de la santé publique du Canada effectue une surveillance passive de la résistance aux antibiotiques des salmonelles isolées chez les humains et le bétail au Canada. Toutes les souches collectées dans les deux premières semaines de chaque mois reçues au LSPQ sont envoyées au LNM pour antibiogramme.

L’utilisation vétérinaire de molécules apparentées, comme le ceftiofur, pourrait donc avoir un impact direct sur la sensibilité des souches humaines. L'analyse de la résistance d'un agent zoonotique est souvent complexe et dans le cas de Salmonella spp. les tendances en matière de résistance dépendent de la prévalence des sérotypes qui sont souvent associés à la résistance, de la contribution à la résistance associée aux voyages, de la nature et de la quantité d'antibiotiques utilisés en santé animale, de la principale source zoonotique du sérotype, de la nature des antibiotiques utilisés en santé humaine et donc des évolutions de pratiques et de recommandations en lien avec l’usage des antibiotiques en santé humaine et animale. Dans l'ensemble, les données pour 2003-2016 sont présentées dans la figure 4 et montrent que la sensibilité de l'ampicilline et de l'amoxicilline-clavulanique a augmenté et qu'en 2016 elle était de 83 % et 94 %, respectivement.

Il est intéressant de noter que la sensibilité au ceftiofur a augmenté entre 2006 et 2009 suite au retrait volontaire de cet antibiotique dans l'industrie avicole de 2005 à 2007(19). Les sérotypes Enteritidis, Heidelberg et Typhimurium sont respectivement les sérotypes les plus isolés au Québec, représentant plus de 60 % des Salmonella spp. Si le nombre de souches sensibles semble similaire entre Enteritidis et Heidelberg (55%), les souches de

La résistance au ceftiofur, qui génère une résistance à la ceftriaxone dans la santé humaine, est principalement associée au sérotype Heidelberg dont la principale source est la volaille(20). Ce sérotype est le deuxième sérotype le plus isolé au Québec avec environ 23 % des infections invasives dans le sang. Au Québec, un retrait volontaire mais temporaire de 2005 à 2007 de l'utilisation du ceftiofur dans les œufs et les poussins a rendu cela possible.

En mai 2014, l’industrie avicole a officiellement arrêté l’utilisation de substances antimicrobiennes considérées comme très importantes pour la médecine humaine, notamment les céphalosporines de troisième génération, chez les poulets de chair et les dindes, puis cette pratique a été étendue au secteur avicole. Cela s'est traduit par une diminution générale de la résistance des Salmonella du poulet(21), et la même diminution a été observée pour les isolats humains au Québec à partir de 2015. Des multirésistants du Kentucky, entre autres, à la ciprofloxacine sont apparus, et leur probable association avec des voyages font l'objet d'une enquête(22).

Figure 4  Pourcentage de sensibilité pour les isolats humains du Québec de Salmonella spp
Figure 4 Pourcentage de sensibilité pour les isolats humains du Québec de Salmonella spp

Staphylococcus aureus

De leur côté, les données d'une première surveillance des infections cutanées et des tissus mous de la communauté (SARM-IPTMC) proviennent de 25 laboratoires au cours de la période du 1er avril au 2 mai 2015. Les principaux antibiotiques utilisés pour traiter les infections à SARM peuvent être divisés en trois catégories, à savoir les molécules utilisées par voie intraveineuse (daptomycine, gentamicine, linézolide, tigrecycline, vancomycine), celles utilisées par voie orale (clindamycine, doxycycline, érythromycine, rifampicine, TMP-SMX) et celles utilisées topiquement (acide fusidique, mupirocine). La figure 5 présente l'antibiogramme cumulé des 868 souches de SARM isolées des hémocultures analysées pour les quatre campagnes de surveillance du LSPQ.

Ces campagnes ont permis de démontrer qu'à l'exception de la clindamycine (< 30 %) et de l'érythromycine (< 15 %), toutes les sensibilités aux antibiotiques restent supérieures à 90. Les sensibilités aux antibiotiques ont été évaluées à 100 % pour la vancomycine, la daptomycine et le TMP-SMX ; 99 % pour la doxycycline et le linézolide ; 93 % pour la mupirocine et 91 % pour l'acide fusidique(7).

Figure 5  Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques ‡  des souches de SARM isolées des hémocultures au Québec, 2009-2016 § (n = 868 souches)
Figure 5 Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques ‡ des souches de SARM isolées des hémocultures au Québec, 2009-2016 § (n = 868 souches)

Streptococcus pneumoniae

Dans l’ensemble, le nombre total de souches invasives de Streptococcus pneumoniae a diminué depuis l’introduction des premiers vaccins conjugués. L’introduction du vaccin 13-valent a entraîné une réduction du nombre de souches de sérotype 19A, souvent multirésistantes.

Figure 6  Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques des souches invasives de Streptococcus pneumoniae isolées chez les
Figure 6 Pourcentage de sensibilité aux antibiotiques des souches invasives de Streptococcus pneumoniae isolées chez les

Streptococcus pyogenes

Tuberculose

En revanche, en 2013, en plus de la souche multirésistante (MDR), nous avons enregistré la première souche de M. Cette souche a été isolée des crachats d'une personne d'Europe de l'Est. Cette souche était également résistante à tous les principaux antibiotiques testés (RMP, INH, EMB et PZA).

Les mutations les plus fréquemment retrouvées au Québec et associées à la résistance sont décrites par Spinato et al., 2016 (31). Les données de surveillance en laboratoire pour l'ensemble du Canada sont disponibles auprès de la Section de lutte contre la tuberculose de l'Agence de la santé publique du Canada en les téléchargeant à l'adresse suivante : http://www.phac-aspc .gc.ca/tbpc-latb /index-fra .php. Par sa mission de laboratoire de référence, de santé publique provinciale et de soutien aux laboratoires médicaux, le LSPQ est à l'avant-garde pour observer et documenter les nouveaux phénomènes de résistance aux antibiotiques au Québec.

Ces dernières années, l’arrivée des résistances suivantes a attiré l’attention de la communauté sanitaire.

Figure 8  Évolution du taux de la résistance aux antituberculeux au Québec, 2006-2016 (n = 2142)
Figure 8 Évolution du taux de la résistance aux antituberculeux au Québec, 2006-2016 (n = 2142)

Bacteroides fragilis

Salmonella Dublin

Shigella spp

L’augmentation de la résistance aux antibiotiques est un problème de santé majeur qu’il est essentiel de documenter au niveau local afin de faire une analyse précise de la situation et de recommander une pratique médicale éclairée. Ce premier résumé de la surveillance de la résistance aux antibiotiques au Québec présente une synthèse des connaissances actuelles sur le sujet et invite le lecteur à consulter les rapports complets pour plus de détails. Rapport sur la surveillance en laboratoire des souches d'entérobactéries résistantes aux carbapénèmes isolées au Québec en 2015.

Surveillance des souches de Neisseria gonorrhoeae résistantes aux antibiotiques au Québec : rapport annuel 2014 [En ligne]. Surveillance des souches de Staphylococcus aureus résistantes à la méthicilline isolées de bactériémies au Québec, rapport 2013-2014. Surveillance des souches de Staphylococcus aureus résistantes à la méthicilline isolées de bactériémies au Québec, rapport 2009-2010.

Surveillance en laboratoire du Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline isolé du pus superficiel et du pus profond de la peau et des tissus mous de patients communautaires : rapport 2015 [en ligne]. PROGRAMME CANADIEN INTÉGRÉ DE SURVEILLANCE DE LA RÉSISTANCE AUX ANTIMICROBAUX (CIPARS) RAPPORT ANNUEL 2013 - Chapitre 2. Réduire l'utilisation et la résistance aux antimicrobiens : premiers résultats suite au retrait des antimicrobiens médicalement importants par l'industrie avicole canadienne (CIPARS) ) [ Sur le Web].

Preliminary guidelines for the assignment of methicillin-resistant Staphylococcus aureus to a Canadian pulsed-field gel electrophoresis epidemic using spa typing. Molecular epidemiology and antimicrobial susceptibility profiles of methicillin-resistant Staphylococcus aureus blood culture isolates: results from the Quebec provincial surveillance program.

Figure

Tableau 1  Description et portée des programmes de surveillance en antibiorésistance,  surveillances continues
Tableau 2  Description et portée des programmes de surveillance en antibiorésistance,  surveillances ponctuelles
Tableau 3  Présentation des mécanismes de résistance selon le nombre de souches  positives par gène testé chez les entérobactéries soumises au programme de  surveillance
Figure 1  Évolution du nombre de souches d’entérobactéries productrices de carbapénèmases présentant les principaux gènes  associés à cette résistance, 2010-2016 (n = 891)
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