Herramientas inform
Herramientas inform á á ticas para ticas para acceder a la Informaci
acceder a la Informaci ó ó n n Biom Biom é é dica dica
Dr. Alejandro Mauro Dr. Alejandro Mauro Residente de Inform
Residente de Informá á tica Mé tica M édica dica Hospital Italiano de Buenos Aires Hospital Italiano de Buenos Aires
[email protected] [email protected]
Hospital Carlos G.
Hospital Carlos G. Durand Durand 14/11/07
14/11/07
Objetivos Objetivos
z Conocer algunos de los problemas para acceder a la información biomédica
z Entender como se almacena la información en una base de datos bibliográfica
z Aprender porqué y para qué se utiliza un vocabulario controlado
z Adquirir conocimientos necesarios para
utilizar la base de referencias bibliográficas
MEDLINE
Necesidades de Necesidades de
informaci
informaci ó ó n n
Covell DG. Information needs in office practice Ann Intern Med 1985;103:596-9.
Gorman PN. Can primary care physicians’ questions be answered using the medical journal literature? Bull Med Libr Assoc 1994;82:140-6
•En la práctica clínica surgen entre 1-2 preguntas por pacientes
•Más del 70% de las preguntas quedan sin responder
La humanidad a generado más información en los últimos
30 años que en los pasados 5000
z
Una edición del “The New York Times” contiene más información que la que oyó una persona que vivió en el siglo XVII
z
El conocimiento impreso se duplica cada 3.5 años
z
Se publican internacionalmente más de 3000 libros por día
z
El conocimiento ha crecido más allá de la capacidad retentiva de la memoria
Sobrecarga de informaci
Sobrecarga de informaci ó ó n n
Wurman, RS, Information anxiety: What to do when information doesn't tell you what you need to know. 1st ed. 1989, New York: Doubleday. 356.
La era de la informaci
La era de la informaci ó ó n n
z Cada 2 años se duplica la cantidad de información digital
z Se estima que este año se generen 1.5
exabytes (1.5 x 10 18 ) de información nueva en el mundo
z Quiere decir que un alumno que cursa su 4to año universitario, la mitad de lo que aprendió en el primer año quedará
desactualizado cuando llegue al tercero.
z Se calcula que la información digital se
duplicará cada 72hs en el año 2010
Como si fuera poco
Como si fuera poco … …
z La literatura está repartida en varias fuentes y formatos
z Las herramientas que permiten acceder a la información son cada vez más complejas
z El lenguaje natural tiene muchos sinónimos
z El idioma predominante es el inglés
z Se necesitan herramientas para evaluar si la
información es pertinente y válida
Las Las “ “ 5 s 5 s ” ”
eStudios Síntesis Sinopsis Sístemas
Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13
Sistemas Informáticos de Soporte
Revisiones sistemáticas/ GPC Estudios originales
Libros de MBE
Las fuentes de información:
INTERNET
Sumarios
Resúmenes de Artículos de MBE
¿ ¿ Internet es la soluci Internet es la soluci ó ó n? n?
z Salud es uno de los temas más buscados en Internet
z Existe 1 millón de sitios relacionados con salud
z El término “health”
recupera 1960 millones de páginas
z El término “salud”
recupera más de 40
millones y medio de
páginas
Herramientas
Herramientas de de b b ú ú squeda squeda
z Directorios de recursos (Yahoo)
z Motores de búsqueda (Google)
z Motores de búsqueda específicos (PubMed)
z Meta-buscadores (TripDatabase)
Directorios de Recursos Motores de Búsqueda
Si Internet fuera un libro
Si Internet fuera un libro … … . .
Google Google
z Googol = 10 100
z +3 billones de búsquedas en google por mes
z Googlear= acción de buscar en motor de búsqueda de google información de
internet (Diccionario Oxford, 2006)
z Google Trends: MBE en 2007
• Indiza +8000 millones de páginas
• 200 millones de búsquedas diarias
• Ranking según links (PageRank)
• Maneja múltiples idiomas
• Directorio de Recursos
• Páginas en caché
• Busca archivos tipo .pdf, doc, ppt, xls
• Busca imágenes.
• “Voy a tener suerte”
Caracter
Caracter í í sticas de Google sticas de Google
• No diferencia mayúsculas de minúsculas
• Cálculos Matemáticos
• Corrector ortográfico
• Diccionario On-Line
• Traductor
Google Scholar Google Scholar
z Subset de Google.
z Orientación académica.
z Rankea por relevancia de la cita.
z Contiene
– Libros
– Artículos
– Tesis
– Citas bibliográficas
El modelo PICO El modelo PICO
Richardson WS, Wilson MC, Nishikawa J, et al.
ACP J Club 1995 Nov/Dec;123:A12-3.
Paciente
enfermedad y/o característica
Resultado (Outcome) mortalidad, diagnóstico,
calidad de vida
Intervención
tratamiento, examen, factor de riesgo, tiempo
Control
tratamiento, examen,
factor de riesgo, tiempo
Conceptos generales de Conceptos generales de b b ú ú squeda squeda
z
z FrasesFrases
– Uso de comillas
– “tratamiento del cólico del lactante”
zz TruncacióTruncaciónn
– Uso del asterisco *
– bacter*: bacteria, bacteriano, bacteriologico, etc.
zz “Stopwords“Stopwords””
– Preposiciones, conectores
( )
Operadores ló Operadores l ó gicos gicos
AND
OR
NOT
“Nidaci “ Nidació ó n” n ”
Uso del ( )
fiebre AND ibuprofeno OR paracetamol
Las Las “ “ 4 s 4 s ” ”
eStudios Síntesis Sinopsis Sístemas
Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13
Información para la toma de decisiones
Revisiones sistemáticas/ GPC
Estudios originales Resúmenes
Las fuentes de información:
Las Las “ “ 4 s 4 s ” ”
eStudios Síntesis Sinopsis Sístemas
Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13
Fuentes de informaci
Fuentes de informaci ó ó n n
z Bases de datos bibliografícas para recuperar estudios
z Herramientas para recuperar síntesis de la literatura
z Herramientas de resumen
z Sistemas para la toma de decisiones
¿ ¿ Qu Qu é é es Medline? es Medline?
z Es la base de datos de referencias bibliográficas más conocida y consultada del mundo
z Resultado de la automatización del repertorio bibliográfico del antiguo Index Medicus
z Desarrollada y mantenida por la National Library of Medicine (NLM)
z 1997 acceso libre y gratuito a Medline a través de la interfaz PubMed
z Cubre los campos de:
–
Medicina
–
Odontología
–
Enfermería
–
Veterinaria
–
Salud pública
¿ ¿ Qu Qu é é es una Base de datos? es una Base de datos?
¿ ¿ Qu Qu é é contiene Medline? contiene Medline?
z
Contiene 15 millones de referencias a artículos de publicaciones periódicas del ámbito de la biomedicina.
z
Indiza citas desde 1966 a la fecha. (Old Medline 1965- 1950)
z
Citas de más de 4800 publicaciones periódicas en 30 idiomas
z
Cerca del 52% de las citas son originalmente publicadas en E.E.U.U.
z
El 89% tiene como idioma de origen el inglés
z
El 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores.
z
Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas semanalmente a la base (400,000 al año
aproximadamente).
¿ ¿ Como organiza el Como organiza el contenido?
contenido?
Título:
Effects of computerized physician order entry on prescribing practices
Autores:
Autor 1: Teich J. M.
Autor 2: Merchia P. R.
Autor 3: Schmiz J. L.
Autor 4: Kuperman G. J.
Autor 5: Spurr C. D.
Resúmen:
BACKGROUND: Computerized order entry systems have the potential to prevent errors, to improve quality of care, and to reduce costs by providing feedback and suggestions to the physician as each order is entered. This study assesses the impact of an inpatient computerized physician order entry system on prescribing practices…
Revista: Archives of Internal Medicine Año: 2000
Volumen: 160 Páginas: 2741-7
Tipo de publicación: Journal article
Dirección del autor: Department of Emergency Medicine, Brigham and Women's Hospital, 75 Francis St, Boston, MA 02115. [email protected]
Interfaz PubMed Interfaz PubMed
Barra de menú
My NCBI
Novedades Servicios
Casillero de búsqueda Acceso a
todas las BD
Acceso directo a #BD
http://www.pubmed.gov
Ingl Ingl é é s, por qu s, por qu é é todo en ingl todo en ingl é é s!! s!!
z HONSelect
– http://www.hon.ch/HONselect z Babel Mesh
– http://babelmesh.nlm.nih.gov/
Problem
Problem á á tica del lenguaje tica del lenguaje
z Contracepción
z Inhibición de la fertilización
z Control de la fertilidad
z Control de la natalidad
z Métodos
contraceptivos
z Planificación Fliar
Anticoncepción
SI NO NI MO S
Vocabulario controlado: MeSH Vocabulario controlado: MeSH
z Acrónimo:
Medical Me Subject S Headings H
z Vocabulario médico y científico de terminología controlada de la NLM para sus diferentes
bases de datos.
z Lista autorizada tanto para la indización como para la recuperación de las citas en las bases de la NLM.
z Los descriptores (22.000 términos) tratan de representar los conceptos principales tratados en las citas.
z Permite que todos los términos estén representados por un solo descriptor.
z Se actualiza y revisa anualmente.
Ventajas de utilizar un vocabulario Ventajas de utilizar un vocabulario
controlado
controlado
Ventajas de utilizar un Ventajas de utilizar un
vocabulario controlado
vocabulario controlado
Que informaci
Que informaci ó ó n ofrece el n ofrece el MeSH
MeSH database database ? ?
Men Men ú ú de opciones de opciones
z Limits
– Acotar los resultados z Preview/Index
– Combinar diferentes opciones z History
– “Bitácora”
z Clipboard
– Selección de citas z Details
– Visualización de estrategia
z My NCBI
OJO!!! Todas las b
OJO!!! Todas las b ú ú squedas se har squedas se har á á n con n con los limites establecidos
los limites establecidos
PubMed PubMed
Obtuve muchos resultados Obtuve muchos resultados
¿ ¿ puedo limitar mi b puedo limitar mi b ú ú squeda? squeda?
Esta cita me interesa,
Esta cita me interesa, ¿ ¿ puedo puedo guardarla?
guardarla?
Esta cita me interesa,
Esta cita me interesa, ¿ ¿ puedo puedo guardarla?
guardarla?
Esta cita me interesa
Esta cita me interesa … … ¿ ¿ Puedo Puedo guardarla?
guardarla?
Imprimir
Esta cita me interesa
Esta cita me interesa … … ¿ ¿ Puedo Puedo guardarla?
guardarla?
Files
Esta cita me
Esta cita me interesa interesa … … ¿ ¿ Puedo Puedo imprimirla?
imprimirla?
Solo una cita vale la pena, Solo una cita vale la pena,
...tiene que haber m
...tiene que haber m á á s!!! s!!!
• PubMed compara las palabras del título, abstract y MeSH de cada cita, las coincidencias son
guardadas en un set precalculado
• Se muestran por un ranking de relevancia, con la cita de origen al principio
• Orienta en la búsqueda si no se encuentra lo términos adecuados
• Usarla siempre al encontrar la cita que mejor
representa lo que se busca
No tiene resumen No tiene resumen
Tiene resumen Tiene resumen
Texto completo Texto completo
Texto completo en Texto completo en PubMed Central PubMed Central
¿ ¿ La cita tiene La cita tiene resumen/
resumen/abstract abstract ? ?
Servicios PubMed Servicios PubMed
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Se accede a ellos desde la barra de menú de la izquierda de la página de inicio del PubMed
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MeSH Database (palabras claves)
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Journal Database (publicaciones)
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Clinical Queries Queries
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– Revisiones sistemáticas
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completo, pero … … .. ..
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