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Lo que debo saber de Biología Molecular

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(1)

BIOLOGÍA MOLECULAR

(2)

Niveles de organización biológica

Átomos

Moléculas

Complejos

supramacromoleculares

Organelos

Célula

Tejidos

Órganos

Aparatos y Sistemas

(3)
(4)

Charles Darwin

•  12 de febrero de 1809 – 19 de abril de 1882

•  Estudio medicina en la Universidad de

Edimburgo

•  El Origen de las especies 1859

•  Selección Natural - Evolución

•  Cuestiona el origen Divino de la vida y del

hombre

•  Represento un “ataque” por parte de la ciencia

a ideas fuertemente arraigadas

•  ¿Consecuencias de su teoría en ese tiempo y

(5)

Gregor Mendel

•  20 de julio de 1822 – 6 de enero de 1884

•  Doctor en matemáticas y ciencias -

Viena

•  Formuló las 3 leyes de la herencia

biológica

•  Principio de la genética moderna (padre

de la genética)

•  Trabajo con guisantes en un monasterio

(6)

Friedrich Miescher

•  13 de agosto de 1844 – 16 de agosto

de 1895

•  Trabajo en el laboratorio de

Hoppe-Seyler

•  Descubrió en la pus una sustancia

con un componente de nitrógenos y fósforos que estaba asociada a los núcleos

(7)

Frederick Griffith

•  1879 – 1941

•  Hizo sus trabajos durante la segunda guerra mundial

•  Principio transformante

(8)
(9)
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Edwin Chargaff

•  11 de agosto de 1905 – 20 de junio de 2002

•  Emigro a Estados Unidos durante la 2da Guerra Mundial

Erwin Chargaff

ADN diferentes organismos: –  Pirimidinas (T+C)

= Purinas (A+G) –  Cantidad (A) = (T)

–  Cantidad (C) = (G)

–  Cantidad (A+T) ≠ (G

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(13)

Matthew Messelson y Franklin Stahl

(14)

Nathans y Arber

•  Desarrollan trabajos en los 70´s en los que descubren las

(15)

Howard Temin y David Baltimore

•  Descubrimiento de la Transcriptasa reversa a comienzos

(16)

Frederick Sanger

•  13 agosto de 1918 – 19 de noviembre de 2013

•  Primer premio Nobel en Química en 1958 – Estructura de

la insulina

•  Segundo premio Nobel en Química en 1980 –

(17)

Martin Cline

•  Primer persona que transfirió un gen de humano a un

ratón, creando el primer organismo transgénico

•  Trato a dos personas que padecían un desorden

hereditario en la sangre con terapia génica, sin tener autorización de ninguna institución

•  Tuvo que renunciar a su puesto como profesor en la

(18)

Kary Mullis

•  PCR – Reacción en Cadena de la Polimerasa

•  Tuvo la idea de la PCR en 1983 y para 1985 ya la había

desarrollado

(19)

Ian Wilmut

•  Dirige el proyecto para la clonación del primer mamífero a

(20)

Chalfie – Shimomura - Tsien

•  Descubrimiento de la Proteína Verde Fluorescente (GFP)

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UNIDADES BÁSICAS DEL ADN

Polímeros lineales de nucleótidos

Nucleótido:

- un grupo fosfato - azúcar= ribosa -  base nitrogenada

4 nucleótidos

4 bases nitrogenadas:

PURINAS:

- Adenina - Guanina

PIRIMIDINAS: - Citosina

- Timina (ADN) - Uracilo (ARN)

(29)

NUMERACIÓN: - Bases

nitrogenadas: 1, 2, 3, ….

- Ribosa:

1´, 2´, 3´, 4´, 5´

NUCLEOSIDO = BN+AZUCAR

(30)

Solo RNA

(31)
(32)

Evidencias previas al descubrimiento de Watson y Crick

Erwin Chargaff

ADN diferentes organismos: –  Pirimidinas (T+C)

= Purinas (A+G) –  Cantidad (A) = (T)

–  Cantidad (C) = (G)

–  Cantidad (A+T) ≠ (G

+C)

Franklin y Wilkins

Difracción de rayos X: -  ADN largo y fino

-  Dos partes similares

paralelas

(33)

34 Å

(34)

Estructura simplificada de HÉLICE DOBLE

-Cada Hélice es un liston de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiester.

-Las hebras son antiparalelas (5’ à 3’ y 3’ à 5’).

-Las hebras son unidas por puentes de hidrógeno.

LA ESTRUCTURA CUMPLE: - Espesor de rayos X

(PURINA + PIRIMIDINA)

- Regularidad

(A+G) = (T+C)

(35)
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(38)

Tipos de ARN

•  ARNm – Secuencia de ARN que contiene la información

necesaria para la codificación de una proteína

•  ARNt – Secuencia de ARN que se encarga de transportar

los aminoácidos para la cadena peptídica

•  ARNr – Componente de los ribosomas, esencial para la

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REPLICACIÓN DEL ADN

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Replicación Semiconservativa

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Sitios de Inicio de la Replicación

•  Múltiples sitios de inicio

(52)
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(54)

Topoisomerasas

•  Grupo de enzimas capaces de actuar sobre la estructura del

ADN (enredándolo y desenredándolo)

•  Primera topoisomerasa descrita en E. Coli, por James C. Wang •  Quimioterapeuticos contra topoisomerasas

•  Anticuerpos anti Topoisomerasa I (Anti-Scl-70) en

(55)

Topoisomerasas

Topoisomerasas I

(56)

Helicasas

•  Enzimas que genera el rompimiento de los puentes de

hidrogeno entre las bases nitrogenadas

•  Se desplaza a lo largo de la hebra de ADN

•  El genoma humano codifica para 95 helicasas (64 para ARN y

(57)

SSBs

•  Proteínas que se encargan de la estabilización del ADN

(58)

Primasa y Cebadores

•  Polimerasa que sintetiza cebadores de ARN ( aprox. 10

nucleótidos) en la hebra molde durante el proceso de replicación

(59)

DNA ligasa

•  Enzima que cataliza la formación de enlaces entre el

(60)

RNAsa H

•  Enzima encargada de la degradación del los primers de

ARN durante la replicación del ADN

(61)

Polimerasas

•  Complejos proteicos con capacidad enzimática que

polimerizan cadenas de ácidos nucleicos

•  DNApo III

(62)

DNApol I

•  Enzima que participa en el proceso de replicación de ADN

•  Rellena el espacio que queda después de la eliminación

del primer de ARN

•  Trabaja en una dirección 5’ – 3’

(63)

DNApol III

•  Holoenzima

•  2 subunidades alfa α – Polimerasas

•  2 subunidades epsilon ε – Exonucleasa (proofreading)

•  2 subunidades teta θ – Proofreading junto con ε

•  2 sununidades beta β – Abrazaderas (clamps)

•  2 subunidades tau τ – Dimerizacion de α, ε y θ

•  1 subunidad gama γ – Participa en la union de β al ADN

•  1 subunidad ji χ – se asocia con γ para estabilizar

(64)
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ARN polimerasa

TIPO DE POLIMERASA ARN SINTETIZADO

ARNpol I ARN ribosomal

ARNpol II ARN mensajero y miRNAs

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ARNpol II

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(85)

Exones

•  Región del ARNm (inmaduro) que se conserva durante su

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Intrones

•  Región del ARNm (inmaduro) que se no conserva durante

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Espliceosoma

1.  Complejo de Ribonucleproteinas pequeñas nucleares

(snRNPs)

2.  El ARN de las snRNPs es el encargado del

reconocimiento de los intrones

Espliceosoma mayor: U1, U2, U4, U5 y U6

•  Reconoce la secuencia consenso de GU en 5’ y AG en 3’

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(95)

5’ Cap

•  Modificación del extremo 5’ de un ARNm inmaduro por la

adición de un nucleotido (GTP) en en un sentido diferente.

•  Enlace 5’-5’ trifosfato

•  ARN mitocondrial y ARN de cloroplastos no tiene 5’-cap

•  Exportación desde nucleo – Prevenir degradación por

(96)

5’ Cap

•  La guanina es metilada por una metiltransferasa en la

posición 7

(97)

Proceso 5’ Cap

1.  La ARN-trifosfatasa elimina uno de los fosfatos del

nucleótido en 5’

2.  La ARN-guanililtransferasa añade un GTP (que pierde 2

fosfatos) a los dos fosfatos del nucleótido en 5’

3.  La guanina-N7-metiltransferasa metila el nitrógeno 7 de

la guanina

4.  Se pueden producir otras modificaciones en los

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(101)

mRNA

IRE – Iron Responsive Element

IRES – Internal Ribosome Entry Site uORF – Upstream Open Reading Frame ARE – AU Rich Element

PAS – Poly(A) Signal

UTR – UnTranslated Region CDS – Coding Sequence

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TRADUCCIÓN

(105)

Definición

•  Segundo proceso de la expresión génica que consiste en

la síntesis de una proteína a partir de la secuencia de un ARNm

•  Aparato decodificador

•  Ribosomas (rRNA + proteínas): lugar de síntesis •  tRNA: Portador de aminoácidos

•  mRNA: Portador del mensaje cifrado

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• Aminoacil tRNA

(109)
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(111)

Definición

•  El código genético es el conjunto de reglas que define la

traducción de una secuencia de nucleótidos en el ARN a una secuencia de aminoácidos en una proteína, en todos los seres vivos. El código define la relación entre

secuencias de tres nucleótidos, llamadas codones, y

(112)

Definición

•  Debido a esto, el número de codones posibles es 64, de

los cuales 61 codifican aminoácidos (siendo además uno de ellos el codón de inicio, AUG) y los tres restantes son sitios de parada (UAA-UAG-UGA). La secuencia de

(113)
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(116)

Núcleo

•  Organelo de 6 µm en el que se encuentra el material

genético de las células eucariotas

•  Síntesis de ADN y ARN

•  Membrana de doble capa que separa el citoplasma del

(117)

Nucléolo

•  Región sin membrana del núcleo de 1 – 2 µm

•  Síntesis de ARNr y ensamblaje de proteínas del ribosoma

con los ARNr (ARNpol I

(118)

• Aminoacil tRNA

sintetasa específica para cada aa (20)

Brazo D – Unión a la Aminocil ARNt sintetasa

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Modificaciones químicas en ARNt

•  Adición de metilaciones y grupos isopentinilo

•  Modificación de Uridina en hidroxiuridina, pseudouridina o

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Características

•  Fuente de energia GTP

•  Primer aminoacido (ARNt) se une en el sitio P

•  Secuencia de inicio Shine-Dalgarno (GGAGG) –

Procariontes

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Características

•  La Peptidil-transferasa genere el enlace peptídico entre el

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Características

•  La síntesis de la cadena polipetidica termina cuando el

ribosoma encuentra un codón de paro, que no es reconocido por ningún ARNt.

•  Estos codones interactúan con un factor liberador

•  RF-1 (UAA, UAG)

•  RF-2 (UAA, UGA)

•  RF-3 Cataliza la liberación producida por RF-1 y RF-2

•  Polisomas: un ARNm que se le de manera simultanea por

(133)
(134)

•  Estreptomicina: se enlaza a la unidad 30s (no inicio de la

traducción)

•  Tetraciclina: bloquean el sitio A del ribosoma

•  Puromicina: estructura similar al ARNt-Tyr (terminación

temprana de la traducción)

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Glicosilaciones

Diferenciación de células y tejidos

Regulación metabólica

Regulación en la expresión de genes

Actividad de las proteínas

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Fosforilaciones

Diferenciación de células y tejidos

Vías de señalización

Regulación en la expresión de genes

Activación de las proteínas

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MUTACIONES

(157)

Definición

•  Cambio en la información genética (genotipo) de un ser

(158)

Clasificación

Tipo de célula (Físico , químico, etc.) Tipo de agente

Tamaño del daño Tipo de cambio

(sustitución, deleción, etc.)

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Tipo de célula

•  Germinal: Precursora de gametos – contiene la

información de la siguiente generación.

•  Somática : Forman parte de tejidos y órganos

Enfermedades Genéticas

Evolución Biológica

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Tipo de agente

Químico:

•  Agentes que reaccionan con al ADN: Hidroxilamina, Etil

metano sulfonato, metil metano sulfonato, etc

•  Agentes intercalantes: naranja de acridina, Bromuro de

etidio, ioduro de propidio, etc.

(162)

Tipo de agente

Físico

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(165)

Tipo de agente

(166)

Tamaño del daño

(167)
(168)
(169)
(170)

Teratógenos

•  Producto que administrado a una mujer embarazada

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