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1. ASIGNATURA / COURSE

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Academic year: 2021

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(1)

1.

ASIGNATURA /

COURSE

1.1.

Nombre /

Course Title

Complementos de Química Física/ Physical Chemistry Complements

1.2.

Código /

Course Code

12657

1.3.

Tipo /

Type of course

Optativa/ Optional

1.4.

Nivel /

Level of course

Grado /

Grade

1.5.

Curso /

Year of course

2

1.6.

Semestre /

Semester

1

1.7.

Número de créditos /

Number of Credits Allocated

2

1.8.

Requisitos Previos /

Prerequisites

1.9.

¿ Es obligatoria la asistencia ? /

Is attendance to

class mandatory?

(2)

1.10.

Datos del profesor/a / profesores /

Faculty Data

Juan Salvador Jiménez Martínez (Coordinador)

Depto Química Física Aplicada

Universidad Autónoma de Madrid

Ctra. Colmenar Viejo, Km 15. 28049 Madrid. Spain

e-mail: [email protected]

Tlf 34 914974724 Fax 34 914974785

http:// www.uam.es/juans.jimenez

1.11.

OBJETIVOS DEL CURSO /

OBJETIVE OF THE COURSE

Esta asignatura se ha configurado para suministrar al alumno de bioquímica de

las principales herramientas fisicoquímicas necesarias para el estudio general

de la bioquímica y la biología molecular: termodinámica, cinética y

espectroscopia general, desde un punto de vista muy básico y con un marcado

carácter de aplicaciones bioquímicas.

This subject has been configured to provide the main physicochemical tools

that the biochemistry student needs to go through the general methods and

uses of biochemistry and molecular biology: thermodynamics, kinetics and

general spectroscopy from a very basic poin of view and and with a strong

biochemical application.

1.12

. Contenidos del Programa /

Course Contents

PRINCIPIOS DE EQUILIBRIO QUIMICO

1.- Las dos primeras leyes de la Termodinámica Contenido:

Propiedades y sistemas Termodinámicos. Calor y Trabajo. Energía Interna, Entalpía y Entropía.

2.- La constante de equilibrio Contenido:

Sistemas cerrados y energía libre. El equilibrio químico. 3.- Aplicaciones prácticas del equilibrio químico

Contenido:

Desarrollo de ejemplos prácticos sencillos relacionados con la constante de equilibrio, y la espontaneidad de reacciones, con especial interés en aquellas reacciones de interés bioquímico.

4.- Aplicaciones prácticas del equilibrio químico Contenido:

(3)

5.- Influencia de la Temperatura en la constante de equilibrio Contenido:

La ecuación de Van`t Hoff. Desarrollo con dos ejemplos prácticos. 6.- pH y constantes de disociación.

Contenido:

pK de un ácido débil. Disoluciones reguladoras. Ionización de aminoácidos y proteínas 7.- Influencia del pH en la constante de equilibrio.

Contenido:

Constante de equilibrio en función del pH.

8.- Influencia de la fuerza iónica en la constante de equilibrio. Contenido:

Coeficientes de actividad. Fuerza iónica. Potencial Electroquímico. Disoluciones de Macro - moléculas.

9.- Temperatura, pH y Fuerza Iónica Contenido:

Ejemplos prácticos extraidos de apartados de Materiales y Métodos de la Bibliografía 10.-Equilibrios múltiples y Alosterismo

Contenido:

Uso de la ecuación de Adair. Desarrollo de un caso práctico de cooperatividad positiva en interacción proteína-ligando.

CINETICA DE REACCIONES 1.- La ecuación cinética. Contenido:

Conceptos básicos de cinética formal de reacciones: velocidad de reacción, ecuación cinética, orden de reacción, mecanismo de reacción, productos intermedios, y catalizadores.

2.- Determinación práctica de la ecuación cinética. Contenido:

Ejemplos prácticos de la determinación del orden de reacción y constante de velocidad. 3.- Mecanismos de reacción

Contenido:

La ecuación cinética a partir del mecanismo. Aproximación de la etapa limitante. Ejemplos prácticos.

4.- Aproximación del estado estacionario. Contenido:

Desarrollo de dos ejemplos de obtención de la ecuación cinética mediante la aproximación del estado estacionario. La ecuación de Michaelis-Menten.

5.- Factores que afectan a la constante de velocidad. Contenido:

Influencia de la temperatura. Ecuación de Arrhenius. Fuerza Iónica. Reacciones controladas por la difusión.

ESPECTROSCOPIA BASICA

1.- Radiación electromagnética y niveles de energía Contenido

(4)

2.- Niveles de energía en moléculas poliatómicas. Contenido:

Una breve descripción de los niveles cuánticos de energía. Energía de Rotación. Energía de Vibración. Energía Electrónica. Valores relativos de la diferencia de energía entre niveles. Población de los niveles de energía.

3.- Elementos básicos de la espectrofotometría. Contenido:

El espectro electromagnético. Componentes básicos de un espectrofotómetro. La Ley de Lambert-Beer.

4.- Espectroscopía infrarroja. Contenido:

Características fundamentales del espectro de IR de moléculas poliatómicas. Grupos funcionales. Espectro de infrarrojo de proteínas.

5.- Espectroscopía ultravioleta-visible (UV-v). Contenido:

Características fundamentales de los espectros de UV-v de nucleótidos, aminoácidos, y proteínas. Tres ejemplos prácticos de utilización.

1.13

. Referencias de Consulta Básicas /

Recommended

Reading.

-Bioquímica Física. K.E. Van Holde, W.C. Johnson, P.S. Ho Prentice Hall.

. Alhambra

-Physical Chemistry with Applications to the life Sciences. D. Eisenberg and D.

Crothers. Benjamin

-Fisicoquímica para Biólogos. J.G. Morris. Reverté

-The Principles of Chemical Equilibrium. K. Denbigh. Cambridge University

Press.

Physical Chemistry. I.N. Levine. Mc Graw Hill.

-Biophysical Chemistry. C.R. Cantor and P.R. Schimmel. W.H. Freeman and

Company

2

Métodos Docentes /

Teaching methods

(5)

3

Métodos de Evaluación y Porcentaje en la

Calificación Final /

Assessment Methods

and Percentage in the Final marks

La calificación final se basará en un examen escrito en el que se habrán de

desarrollar aspectos numéricos, así como teóricos sobre la materia desarrollada

en clase. Igualmente se plantearán cuestiones de carácter práctico derivadas

de los problemas y aspectos generales de la bioquímica.

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