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Proteínas

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PÉPTIDOS

• Los péptidos son el resultado de la unión de varios aminoácidos mediante enlaces denominados peptídicos. En el ejemplo:

Alanina (Ala) – Glicina (Gly) – Serina (Ser)

• Hasta 10 aminoácidos se denominan OLIGOPÉPTIDOS (dipéptidos, tripéptidos,…) Entre 10 y 80 aminoácidos, POLIPÉPTIDOS y, por encima de 80 aminoácidos, se denominan PROTEÍNAS.

• Se escriben siempre desde el extremo amino-terminal

hacia el extremo carboxilo terminal

• Se nombran como derivados del aminoácido que ocupa la posición carboxilo terminal. En el ejemplo:

ALANIL-GLICIL- SERINA

(3)

El ENLACE PEPTÍDICO

(4)

El ENLACE PEPTÍDICO

 Es un enlace covalente

no ionizable

Más corto y rígido que

un enlace C-N normal, debido a la

deslocalización de los electrones dándole carácter “casi” de doble enlace.

No tiene giro libre

Los 4 átomos del enlace

están en el mismo plano

El H y el O están en

posición “trans”

Las cadenas laterales

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(6)

Direccionalidad en la secuencia de aminoácidos

Extremo amino-terminal

Extremo

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PÉPTIDOS DE INTERÉS BIOLÓGICO:

EL GLUTATIÓN

Es el -L- glutamil- L-cisteinil – L-glicocola.

Es un potente reductor biológico que, entre otras funciones, mantiene el átomo de hierro de

(8)

PÉPTIDOS DE INTERÉS BIOLÓGICO:

VITAMINAS HIDROSOLUBLES

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PROTEÍNAS

Las proteínas son biomoléculas

formadas por cadenas lineales

de aminoácidos

Las proteínas desempeñan un

papel fundamental para la vida.

Son biomoléculas versátiles

(10)

“Las proteínas son polímeros lineales

de 80 o más aminoácidos”

Ion dipolar

(11)

Clasificación de las proteínas

por el tamaño

Según el número de aminoácidos:

n<10: oligopéptido

10< n <100: polipéptido (PM < 5000)

n > 100: proteína

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Funciones

de las proteínas

Estructurales (fibrilares: queratina, colágeno…)

QUERATINA (pelos, cuernos,…)

COLÁGENO (tejido

(13)

Funciones de las

proteínas

Estructurales (fibrilares: queratina, colágeno…)

(14)

Funciones de las

proteínas

Estructurales (fibrilares: queratina, colágeno…)

Energéticas: Albúmina (lacto, ovo o seroalbúmina), caseína

Reguladoras:

(15)

Funciones de las

proteínas

Estructurales (fibrilares: queratina, colágeno…)

Energéticas: Albúmina (lacto, ovo o seroalbúmina), caseína

Reguladoras:

Inmunológicas (anticuerpos)Contráctiles (actina, miosina)

Regulación génica (factores de transcripción)Homeostática: fibrina (coagulación)

Catalítica y de regulación del metabolismo (enzimas)

Transportadoras (lipoproteínas, proteínas de membrana, hemoglobina…)

Comunicaciónintercelular: hormonas (insulina, prolactina, oxitocina, hormona del crecimiento,

…), neurotransmisores e interleucinas

(16)

Funciones de las

proteínas

Estructurales (fibrilares: queratina, colágeno…)

Energéticas: Albúmina (lacto, ovo o seroalbúmina), caseína

Reguladoras:

Inmunológicas (anticuerpos)Contráctiles (actina, miosina)Regulación génica (factores de

transcripción)

Homeostática: fibrina (coagulación)

Catalítica y de regulación del metabolismo

(enzimas)

Transportadoras (lipoproteínas, proteínas de

membrana, hemoglobina…)

Comunicaciónintercelular: hormonas

(insulina, prolactina, oxitocina, hormona del crecimiento,…), neurotransmisores e

interleucinas

Toxinas (tétanos, venenos de serpientes,…)Infectivas (priones)

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NIVELES ESTRUCTURALES

Son los diferentes grados de complejidad en que puede analizarse la estructura espacial de las proteínas

Secuencia de

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ESTRUCTURA PRIMARIA

EVOLUCIÓN MOLECULAR POR DUPLICACIÓN

• La homología secuencial

entre las dos cadenas de la hemoglobina (Hb) y entre estas y la mioglobina, de una sóla cadena, junto con la existencia en la lamprea de una Hb con una sola cadena peptídica, hace pensar en un gen original que se duplicó y experimentó mutaciones que originaron tres productos génicos distintos: la proteína

 y la proteína , en el caso de la Hb, y la Mioglobina. • La ferredoxina bacteriana es

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ESTRUCTURA PRIMARIA

(25)

ESTRUCTURA

SECUNDARIA:

(26)

ESTRUCTURA SECUNDARIA:

(27)

ESTRUCTURA 2ª:

CADENA

de

(28)

ESTRUCTURA SECUNDARIA:

(29)

ESTRUCTURA SECUNDARIA:

(30)

ESTRUCTURA TERCIARIA

(31)

ESTRUCTURA TERCIARIA

(32)

IRREVERSIBLE:

• La energía del estado nativo es mayor (menos estable) que la del estado desplegado.

• La renaturalización no es

posible ya que hay que superar una gran barrera de activación • (ej. Clara de huevo)

ESTRUCTURA TERCIARIA

DESNATURALIZACIÓN

(33)

ESTRUCTURA TERCIARIA

DESNATURALIZACIÓN

Es la pérdida de la estructura terciaria (conformación nativa). Se manifiesta por: pérdida de funcionalidad (inactivación) y/o pérdida de solubilidad (precipitación)

REVERSIBLE:

• La energía del estado nativo es menor (más estable) que la del estado desplegado.

• La renaturalización es

espontánea –sin gasto

energético- al retirar el agente desnaturalizante y rápida,

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TEMPERATURA

Hasta los 40-50ºC, el

aumento de T, favorece la solubilidad. Por encima de ese valor, se

desnaturalizan.

La Taq polimerasa usada en la RCP (reacción en cadena de la polimerasa) resiste los 95 ºC.

ESTRUCTURA TERCIARIA

(35)

pH

Cuando el pH alcanza el punto isoeléctrico de la proteína, las moléculas proteicas adquieren cargas de diferente signo y se

agregan, formando

conglomerados de gran tamaño que precipitan.

ESTRUCTURA TERCIARIA

(36)

FUERZA IÓNICA () La fuerza iónica es una

medida de la concentración de iones.

A bajas concentraciones, los iones favorecen la

solubilidad, pero, a medida que aumenta la fuerza

iónica, los iones compiten con la proteína por el agua y la “secuestran”, con lo que la proteína precipita.

ESTRUCTURA TERCIARIA

(37)

ESTRUCTURA 3ª

CHAPERONAS Y

CHAPERONINAS

En la célula, el plegamiento de las proteínas es

facilitado por unas proteínas: las

chaperonas. Los defectos se reparan en unos complejos proteicos: las

(38)

PLEGAMIENTO DE LAS PROTEÍNAS

El plegamiento de proteínas es el proceso por el que una

proteína alcanza su

estructura tridimensional

. La función

biológica de una proteína depende de su correcto plegamiento.

.

(39)
(40)
(41)

Defectos en las rutas de plegamiento y tráfico de las

proteínas son la causa molecular de varias

enfermedades:

Fibrosis quística.

Alzheimer

Enfisema

(42)

DEGRADACIÓN DE LAS PROTEÍNAS

El proceso de degradación ocurre constantemente en

la célula

Recambio proteico, necesario para mantener un nivel

adecuado de proteínas, impedir la acumulación de

proteínas anormales y el reciclado de aminoácidos

Las proteínas defectuosas se degradan muy

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Degradación Lisosómica:

Catepsinas, proteína con actividad proteolítica (enzima),

se encuentra en tejidos animales, cataliza la hidrólisis

de proteínas a polipéptidos. La mayoría se activan al

pH ácido que hay en el interior de los lisosomas, por

lo que su actividad suele darse en el interior de

dichos orgánulos.

(44)

Degradación Citosólica:

Reacciones de ubiquitinación. Este proceso se relaciona

no solo con la degradación de proteínas anómales, sino

tambien de proteínas normales de vida corta.

(45)
(46)
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(48)
(49)

El Proteasoma:

una máquina de degradar proteínas

(19S)

(50)

ESTRUCTURA TERCIARIA

DEDOS DE ZINC

Son el motivo estructural más frecuente en los factores de transcripción, que han de encontrar un gen concreto entre los

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ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES

En 1957, en tribus Fore de Nueva Guinea que practicaban el canibalismo ritual de los muertos y la endogamia, se descubre una enfermedad infantil del sistema nervioso a la que se denominó “kuru” (escalofrío).

Se trataba de una enfermedad transmisible, tras una larga incubación de varios años. Los cerebros de estos individuos presentaban un aspecto espongiforme: neuronas hinchadas, con grandes vacuolas.

Carleton Gajdusek Carleton Gajdusek obtuvo el Nobel en 1976 por su descubrimiento.

(52)

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Otras encefalopatías

espongiformes

Ya se conocía desde el

siglo XVIII una

enfermedad

espongiforme similar que

afectaba a los rebaños de

carneros, denominada

“tembladera” (scrapie),

por los temblores y

(53)

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Otras encefalopatías

espongiformes

A principios del siglo XX se

describió la

enfermedad de

Creutzfeld-Jacob (ECJ)

, un

tipo raro de demencia senil

transmisible.

Entre 1985 y 1986

aparecieron numerosos casos

en Francia, debido al

tratamiento con hormona de

crecimiento extraídas de

(54)

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Otras encefalopatías

espongiformes

Entre 1988 y 1996 se desarrolló

una epidemia de

encefalopatía

espongiforme bovina (EBB)

en el

Reino Unido, causada por incluirse

en los piensos, harina de huesos y

carnes procedentes de animales

infectados.

Se produjeron casos de

(55)

?

?

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Las causas

Tenía carácter transmisible.

No se ajustaban a infecciones

típicas al no existir procesos de

inflamación o de respuesta inmune.

El agente “infeccioso” era sensible

(56)

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Las causas

En 1982 Stanley Prusiner

propuso la hipótesis del

PRIÓN:

Pr

oteinaceus

I

nfectious

On

ly. La causa de la

enfermedad era una proteína

normal, que se alteraba en los

pacientes afectados y se

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La proteína normal tiene más hélices alfa que hojas beta y la

anormal al revés, lo que hace que esté más replegada.

Esto hace que la proteína patológica no se degrade y que se

acumule, generando un efecto tóxico, induciendo la apoptosis en

los tejidos nerviosos.

ESTRUCTURA TERCIARIA

(58)

ESTRUCTURA TERCIARIA

PRIONES:

Las causas

El plegamiento anormal de la proteína era transmisible a las

proteínas normales. Esto contradecía el dogma central de la

(59)

ESTRUCTURA CUATERNARIA

(60)

ESTRUCTURA CUATERNARIA

(61)

ESTRUCTURA CUATERNARIA

Ventajas de la Estructura cuaternaria:

Se

minimizan los errores

que se

producirían si sólo existiera una cadena.

Si se produce un error al incorporar un aminoácido cada 100.000 y se quiere sintetizar una proteína de 100.000 aminoácidos, todas las proteínas monoméricas tendrían el

(62)

ESTRUCTURA CUATERNARIA

Ventajas de la Estructura cuaternaria:

Se produce un

ahorro de ADN

: evolución

por duplicación

Las proteínas oligoméricas son más

versátiles al ser más regulable su acción que

las que carecen de estructura cuaternaria

Referencias

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