UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS
(Universidad del Perú, DECANA DE AMERICA)
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA ACADEMICO PROFESIONAL DE GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA
DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE BIOLOGÍA CELULAR Y GENÉTICA
SYLLABUS
SEMESTRE ACADÉMICO
: 2015-I
I DATOS GENERALES
1.1 Nombre del curso (12) :SISTEMÁTICA GENERAL 1.2 Código del curso :B02015
1.3 Créditos :3
1.4 Duración del Curso :17 semanas 1.5 Año de estudios : 7º Ciclo (4º año)
1.6 Número de horas : 03 semanales Teórico-Prácticas 1.7 Prerequisitos :Genética Molecular y Bioinformática 1.8 Profesor Responsable
1.8.1 Profesor de teoría :Blgo. Jesús H. Córdova Santa Gadea 1.9 Horarios y ambientes :
1.9.1 Teoría : Jueves de 10-13, Aula 309 1.9.2 Practica : Jueves de 10-13, Aula 309 1.9.3 Seminarios : Jueves de 10-13, Aula 309
II SUMILLA
Se dan conocimientos básicos teórico-prácticos sobre la Sistemática Moderna como una metodología fundamental y se desarrolla el concepto de especie en base a relaciones filogenéticas como elemento sustantivo del desarrollo de la clasificación dentro de la Sistemática actual, subrayándose el carácter de ésta como disciplina integradora y generadora de conocimiento en otras disciplinas, tales como la Genética, Filogeografía, la Biogeografía Histórica y la Evolución de especies y biotas, así como ser uno de los pilares en los que descansan la Conservación de la Biodiversidad y el Desarrollo Sostenible.
III OBJETIVOS GENERALES Y ESPECÍFICOS
Al finalizar el curso, el alumno podrá comprender que los sistemas de clasificación son concepciones humanas de la naturaleza que permiten entenderla y utilizarla racionalmente, en la medida que tal clasificación refleje realidades naturales.
IV EVALUACIÓN
La evaluación es permanente. Considera hasta 02 exámenes cancelatorios (mayo y julio), controles de lectura-seminarios, monografías, pasos cortos, prácticas dirigidas y calificadas, intervenciones en clase y toda otra forma de evaluación que permita apreciar el progreso y esfuerzo del alumno.
NOTA FINAL = Nota Teoría + Nota Práct. Calificadas + Nota Seminario-Monografía + Intervención clases/4
V METODOLOGÍA
El curso consta de clases principalmente expositivo-interactivas ayudadas por material audiovisual y bibliografía, seminarios sobre análisis de temas, controles de lectura, prácticas dirigidas y calificadas y soluciones de problemas. Los seminarios enfatizan asuntos actuales de controversia, los que se discutirán bajo la modalidad de un moderador que evaluará rigurosamente la metodología y didáctica de los temas. Tanto en seminarios-presentaciones y monografías deberán incluirse todas las fuentes de información utilizadas.
VI PROGRAMACIÓN
Semana 1 26 de marzo Exposición general sobre el curso: Plan general de la asignatura: objetivos, bibliografía básica y evaluaciones.- Introducción: Orígenes y filosofía.- Nexo Sistemática-Filogenia-Evolución-Conservación-Desarrollo Sostenible.
Semana 2 2 de abril
Ciencias auxiliares para la Sistemática: Genética (mendeliana y de poblaciones), Macro-Morfología, Reproducción, Embriología, Etología y Biogeografía Comparadas.- Ecología.- Glosario básico.
Semana 3 9 de abril
Ciencias auxiliares para la Sistemática: Geología.- Vulcanismo.- Deriva Continental y Tectónica de Placas.- Orogenia.- Paleontología y Tafonomía.- Cronística.- Glosario básico.
Semana 4 16 de abril
Sistemática y Taxonomía: Ordenamiento y clasificación: Criterios.- Linneo, Nomenclatura y Sistema Natural.
Semana 5 23 de abril
Teoría de la Evolución Charles Darwin-Alfred R. Wallace: Parte 1.- Antecedentes y trascendencia.
Semana 6 30 de abril
Teoría de la Evolución de Charles Darwin: Parte 2.- Selección Natural-Especiación:
Controversia precoz.- J.G. Romanes.- Evolución como Árbol: E. Haeckel.- Críticas actuales.
Semana 7 7 de mayo
Principales Conceptos de Especie.- Neontológicos y Paleontológicos.- Conceptos biológico, filogenético, cladístico y el revisado o inclusivo. Calificativos de especies.- Por su
Morfología Externa: Alomórficas y Sinmórficas.- Por su Distribución Geográfica: Alopátrida, Simpátrida, Parapátrida.- Otros calificativos.
Semana 8 PRIMER EXAMEN. 14 de mayo
Semana 9 21 de mayo
Caracteres en Sistemática Moderna: definición y tipos.- Homología y Analogía.-
Plesiomorfías, Apomorfías y Autoapomorfías.- Homoplasias: Paralelismos, Convergencias y Reversiones.
Semana 10 28 de mayo
Codificación de caracteres para la aplicación de programas sobre Sistemática Moderna. Ventajas y limitaciones de los caracteres Macromorfológicos, Proteínicos y del DNA nuclear y Mitocondrial. Caracteres matrilineales y patrilineales. Reloj Molecular.
Semana 11 4 de junio
Cromosomas-Cariotipo como ejemplo de caracteres taxonómicos y filogenéticos en la Sistemática Moderna. Significado e importancia. Ventajas y limitaciones.
Semana 12 11 de junio
Bases para el establecimiento de relaciones entre especies y/o poblaciones. Escuelas Gradualista o Clásica, Fenética o Taxonomía Numérica y Cladística: características, ventajas y desventajas.-Sus productos los Dendrogramas: “Gradogramas”, Fenogramas y
Cladogramas.
Semana 13 18 de junio
Elementos de Cladística. Reconstrucción de filogenias en forma manual: Método de Hennig.-Cladograma de Consenso. Estadísticos para valoración de filogenias (CI y RI) y de sus vínculos (ramas-nodos): “Bootstrap”, “Marjory Rule” y “Jacknife”.
Semana 14 25 de junio Sistemática Moderna, Filogeografía y Biogeografía Histórica. Modelos de Evolución de Especies y Biotas: Dicotómicas y Reticuladas.- Aplicación en Conservación y Manejo.
Semana 15 2 de julio
Modelos de Especiación: Microevolutivos (Gradualismo Alopátrida, Parapátrida, Peripátrida) y Macroevolutivos (Saltacionismo Simpátrida-Estasipátrida, Alopátrida, Peripátrida). Cronística.- Evolución de Caracteres, Especies y Biotas.
Semana 16 SEGUNDO EXAMEN. 9 de julio Semana 17 EXAMEN SUSTITUTORIO. 16 de julio
- SEMINARIOS
:1.- Sistemática y Coevolución de especies.
2.- Especies filogenéticamente basales y Conservación de la Biodiversidad.
3.- Citogenética, Filogenia, clasificaciones naturales y conservación de la Biodiversidad. 4.- Cariotipos, Cladística, Taxonomía y Clasificación.
5.- Existencia de Especies crípticas: cromosomas y macromorfología. Problemas para evaluar la Biodiversidad.
6.- Significado filogenético y taxonómico de los híbridos interespecíficos. 7.- Importancia de los genes Hom/HOX en la evolución de las especies. 8.- Filogenias, Sistemática y Biogeografía Histórica.
9.- Sistemática moderna y Taxonomía de microorganismos. 10.- Importancia de la poliploidía en la evolución de las especies. 11.- El Syngameon y su ubicación taxonómica.
VII BIBLIOGRAFIA
1.- Alberch, P. 1985. Museum Collections and the Evolutionary Study of Growth and Development. Pp: 29-41, In: Museum Collections: Their Roles and Future in Biological Research (E. H. Miller, ed.). British Columbia Prov. Museum. Occ. Paper Nº 25, 222 pp. 2.- Baker, R. J. 1984. A sympatric cryptic species of mammal: A new species of Rhogessa (Chiroptera: Vespertilionidae). Syst. Zool. 33(2):178-183.
3.- Brooks, D.R. & McLennan, D.A. 1991. Phylogeny, Ecology and Behaviour. Univ. Chicago Press. 434 pp.
4.- Brooks, D. R., Mayden, R. L. & McLennan, D. A. 1992. Phylogeny and Biodiversity: Conserving our Evolutionary Legacy. TREE 6 (2):55-59.
5.- Brooks, D. R., J. N. Caira, T.R. Platt & Pritchard, M. R. 1984. Principles and methods of phylogenetic systematics: A Cladistics Workbook. The University of Kansas, Museum of Natural History. Special Publication 12: 1 92.
6.- Córdova, J. H. 1999. On Karyomorphs, Cladistics, and Taxonomic Status of the Bufo spinulosus group (Amphibia: Anura) in Peru. Stutt. Beit. Zur Naturkunde (Stuttgart-Germany) Serie A (Biologia), 28 pp.
7.- Córdova , J. H. & G. Lamas 1997. Citogenética, Filogenia, clasificaciones naturales y evolución de las especies. Alma Mater-UNMSM, 13-14: 95-111.
8.- Córdova, J. H. & J. Descailleaux 2005. El análisis cladístico preliminar de los cariotipos de cinco especies de Telmatobius y dos de Batrachophrynus no apoya su separación genérica.- Pp: 187-217. In : Estudios sobre las ranas andinas de los géneros Telmatobius y
Batrachophrynus (Anura: Leptodactylidae) (Lavilla, E. O. & De la Riva, I., eds.), Asociación
Herpetológica Española. Monografías de Herpetología 7. Valencia, Spain, 349 pp.
9.- Dobson, F. S. The use of Phylogeny in Behaviour and Ecology. Evolution 39 (6): 1384-1388.
10.- Dunn, G. &. Everitt., B. S 1982. An introduction to mathematical taxonomy. Cambridge University Press, Cambridge.
11.- Farris, J. S. 1988. Hennig86, version 1.5. Distributed by the author. Port Jefferson Station, N.Y.
12.- Hall, Barry G. 2001. A How To Manual for Molecular Biologísts. Sinauer Associates, Inc. 13.- Harvey, P.H., A.J.L.Brown, J.M. Smith & S.Nee 1996. New uses for new Phylogenies. Oxford University Press (Oxford) 349 pp.
14.- Harvey, J.S. & M.D. Pagel 1998. The Comparative Method in Evolutionary Biology. Oxford University Press, (Oxford) 239 pp.
15.- Hennig, W. 1966. Phylogenetic Systematics. University of Illinois Press: Urbana, Illinois.
16.- Hillis, D.M. & Moritz, C. 1990. Molecular systematics, Sinauer Associates, Inc. 17.- Hillis, D.M., Moritz, C., & B.K. Mable. 1996. Molecular systematics. 2da. Ed. Sinauer Associates, Inc.
18.- Kitching, l., P. L. Forey, C. J. Humphries & D. M. Williams. 1998. Cladistics, 2d. Edition. Oxford University Press: 228 pp.
19.- Lipscomb, D. 1994. Cladistic analysis using Hennig 86. George Washington University. 122 pp.
20.- Lipscomb, D. 1998. Basics of Cladistic Analysis. George Washington University. 75 pp. 21.- Pramuk, J.B. 2006. Phylogeny of Southameican Bufo (Anura : Bufonidae) inferred from combined evidence. Zool. Jour. Linnean Soc. 146: 407-452-
22.- Swofford, D. L. 1998. PAUP. Phylogenetic analysis using parsimony (and other methods). Version 4. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts.
23.- Schmid, M. Bogart, J. P. & S. B. Hedges. 2010. The Chromosomes of Terraranan Froigs. Cytogene. Genome Res.( Karger) 568 pp.
24.- Wegener, A. 1929 (1983). El origen de los continentes y de los océanos. Editorial Pirámide (Madrid), 230 pp.
25.- Wiley, E.0. 1981. Phylogenetics. The theory and Practice of Phylogenetic Systematics. John Wíley & Sons.
26.- Wiley, E. 0., D. Siegel Causey, D. R. Brooks, & V. A. Funk. 1991. The Compleat Cladist. A Primer of Phylogenefic procedures. The University of Kansas, Museum of Natural History, Special Publication 19: 1 158.
“Journals” sugeridos:
Annual Review of Ecology and Systematics Biological Journal of the Linnean Society Cladistics
Evolution
Journal of Molecular Evolution
Molecular Phylogenetics and Evolution
Systematic Biology (antes Systematic Zoology y Systematic Botany) TREE
“Journals On line” selectos: http://www.elsevier.nl http://apt.allenpress.com/aptonline/?request index html http://wwwjoumals.wiley.com/ http://www.blackwell.de/register/zeit_ver.htm http://www.idealibrary.com/servlet/useragent?func=showHome http://www.tandf.co.uk/sara/ http://fidelio.catchword.com/index.htm http://Iink,springer ny.com/ http://www.tnstate.edu/library/joumal/onjnbio.htm http://www.biologie.uni osnabrueck.de/etholdid/dgs/page4.html http://www.ng.hik.se/ mnato/ http://www.eurekalert.org http://connect.isihost.com/trial/CCC.cgi
(Mencionar solo la bibliografía que va a ser utilizada en el curso y accesible para el alumno; considerar textos, revistas y páginas web. Seguir pautas de Vancouver.
