¿CÓMO USAR EL PROGRAMA ISIS/DRAW?
H
ER
R
A
M
IE
N
TA
S
BIOQUÍMICA II
P O O O O CH O H CH2 CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH O H¿Cómo insertar las rutas metabólicas u objetos varios del IsisDraw en un
documento de Microsoft Word?
• Click Botón IZQUIERDO: activa la herramienta. Si
mantengo presionado
dice qué hacer con la herramienta
Veamos qué podemos hacer entonces...
• Una vez graficada ya sea una estructura, texto, flechas,
presionando el botón DERECHO del mouse se puede editar
el objeto (cambiar el color, tamaño, etc). Lo mismo, con
doble click botón IZQUIERDO.
¿Cómo utilizar las HERRAMIENTAS?
¿Para qué sirve?
Seleccionar un objeto, una molécula o texto.
Cambiar el tamaño de un objeto Mover un objeto
HERRAMIENTA DE SELECCIÓN
HERRAMIENTA DE ROTACIÓN
¿Para qué sirve?
Rotar una molécula en torno a uno de sus átomos.
BORRADOR
¿Para qué sirve?
Borrar un objeto, selección, estructura.
ÁTOMOS
¿Para qué sirve?
Crear, modificar un átomo
Puedo escribir el átomo o grupo funcional deseado
ENLACES
¿Para qué sirve?
Introducir enlaces entre átomos dándole la orientación adecuada Cambiar entre enlaces simples, dobles y triples
DISTINTOS TIPOS DE ENLACES
¿Para qué sirve?H
CH
3N
H
2HERRAMIENTA PARA PRODUCIR CADENAS CARBONADAS
¿Para qué sirve?Manteniendo presionado el botón izquierdo del mouse se pueden dibujar cadenas o estructuras carbonadas
HERRAMIENTA SIGNO “+”
No hay mucho que agregar en este caso...
HERRAMIENTA PARA DIBUJAR FLECHAS
¿Para qué sirve?Permite dibujar flechas de distinto tipo
Una vez graficada, si se hacen clicks sucesivos cambia en sentido de la flecha hacia un lado, el otro o ambos.
MAPA ÁTOMO POR ÁTOMO
¿Para qué sirve?Permite marcar (con números) determinados átomos en compuestos que participan de reacción química y también enlaces.
HERRAMIENTA PARA CONSTRUIR SECUENCIAS DE
NUCLEÓTIDOS O AMINOÁCIDOS
¿Para qué sirve?
Dibujar una secuencia de
aminoácidos (o nucleótidos) y darle “forma” C SH NH2 C SH R T H K S S G COOH C SH NH2 C SH R T H K S S G COOH
PARÉNTESIS
¿Para qué sirve?
Permite crear distintos tipos de paréntesis y modificarlos
TEXTO
¿Para qué sirve?
Introducir texto
LÍNEAS RECTAS, CURVAS, CONTINUAS
¿Para qué sirve?
Dibujar líneas rectas
Líneas rectas “quebradas” (con doble click termina)
ELIPSES, RECTÁNGULOS, ETC
¿Para qué sirve?
Gráfico de figuras geométricas
Hasta aquí fueron las herramientas, pero hay más…
¿Para qué sirve?
Abre la última página de moldes que utilizamos
¿Para qué sirve?
Vuelve a elegir el último molde que usamos
¿Para qué sirve?
Dibujar estructuras 3D de moléculas (3D) Introducir datos de compuestos (CALCULATE...) Una vez ingresada cadena de aa puedo transformarlo en fórmulas (SEQUENCE) O C C H CH2 C O O O OH Molecular Weight =132,07 Exact Mass =132 Molecular Formula =C4H4O5
Molecular Composition =C 36.38% H 3.05% O 60.57%
QUÍMICA
ANILLOS Y CICLOS “PREARMADOS”
¿Para qué sirve?Armar estructuras que contengan anillos partiendo de un molde preformado
Haciendo click en un átomo se adiciona el anillo elegido vía un enlace
Haciendo click en un enlace se adiciona el anillo elegido compartiendo los átomos que forman parte del enlace elegido
Eligiendo la opción de átomos puedo cambiar el carbono por un heteroátomo
N
Utilizando la herramienta puedo cambiar enlaces simples por dobles (o triples)
IMPORTANTE
CH3 CH2 CH2 CH2 CH3 C C C C C CH 3 CH2 CH2 CH2 CH3 CH3 CH2 CH 2 CH 2 CH3 CH3 C H CH2 CH2 CH3 CH3 C CH2 CH2 CH3Ejemplo de utilización de todas las herramientas
FMN CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2 C H O H CH2 P O O O O CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2 C H O H CH2 H H P O O O O FMNH2 2
Introduzcamos ahora en esta estructura los átomos de N
¿Cómo? ...los grupos ceto?
N N N N N N N N O O
Ahora debemos agregar todos los metilos que faltan en el anillo ¿Cómo?
1
2
1º Paso: Archivo nuevo de Word. Insertar Objeto de IsisDraw... Ahora click en TEMPLATES
Al hacer click en esa estructura y volver al archivo, al cliquear nuevamente
tendremos este anillo
CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH 2 C H O H CH2 P O O O O Objetivo Agregamos el H también N N NH N O O C H3 C H 3
Con las herramientas conocidas podemos agregar el CH2y el
–CHOH- que forma parte del R y crear el doble enlace
CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H 3 CH2 C H O H CH 2 P O O O O
Ahora, como lo que agregamos se repite lo duplicamos dos veces. ¿Cómo?
CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2
Entonces, agreguemos el lo que falta... ¿Cómo? CH O H CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H 3 CH 2 CH 2 CH O H CH O H CH O H N N NH N O O C H 3 C H3 CH2 P O O O O
Agreguemos ahora las flechas y el texto ¿Cómo? FM N C H O H C H O H N N N H N O O C H3 C H3 C H2 C H O H C H2 P O O O O C H O H C H O H N N N H N O O C H3 C H3 C H2 C H O H C H2 H H P O O O O FM N H 2 2 e-FMN CH2 CH O H CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2 P O O O O 2
e-Ahora duplicamos la molécula y la colocamos donde corresponde. Modificamos el texto necesario, agregamos
los H que faltan (para eso cambian de lugar un par de dobles enlaces) FMN FMNH2 CH2 CH O H CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2 P O O O O 2 e-CH2 CH O H CH O H CH O H N N NH N O O C H3 C H3 CH2 H H P O O O O
Ahora, Exit and Return to
Microsoft Word (y Update)
Si es necesario cambiar algo una vez en el Word, haciendo doble click accedemos nuevamente al
IsisDraw, modificamos y actualizamos .